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理論収率を飛躍的に革新する代謝経路の分断と再構築

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ2279
補助金の研究課題番号 22J21878 (2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2022)
応募区分国内
審査区分 小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
研究機関神戸大学

研究代表者

野中 大輔  神戸大学, 工学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2024年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2023年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2022年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード代謝経路の分断 / 1,2-プロパンジオール / レスベラトロール / PMPE
研究開始時の研究の概要

微生物を用いた化学物質の生産では、目的の化合物へ向かうべき炭素が菌体増殖によって奪われるということが課題として挙げられている。本研究では、代謝経路を分断することによって菌体増殖への炭素の漏出を回避し、物質生産と菌体増殖のバランスの最適化を行うことによってグルコースとキシロースから目的の化合物(1,2-プロパンジオール、レスベラトロール)を高収率で生産する技術の開発を目指す。

研究実績の概要

今年度は、昨年度に作製した目的生産物(1,2-プロパンジオール及びレスベラトロール)それぞれに対応する代謝経路分断株を使用し、更なる代謝改変を行うことでその生産能の強化に取り組んだ。1,2-プロパンジオール生産において、大腸菌が持たない他の微生物のキシロース資化経路であるDahms経路とWeimberg経路のそれぞれを代謝分断株に導入し、キシロース資化経路の違いが1,2-プロパンジオールの生産に与える影響を調べた。また、キシロースを消費する過程において蓄積してしまうキシロン酸の利用を酵素の過剰発現により促進させ、好気条件における1,2-プロパンジオールの生産量を増加させることを試みた。さらに、この株に対して1,2-プロパンジオール合成経路を強化することや目的でない物質へと変換されてしまう経路を遺伝子破壊により遮断することで、1,2-プロパンジオールの生産量と収率の増加を試みた。レスベラトロールにおいては、代謝経路分断株に対してDahms経路とレスベラトロール合成経路を導入することにより、昨年度レスベラトロールの生産を確認している。本年度はレスベラトロール生産に必要な遺伝子の発現を調節することによりレスベラトロール生産量を増加させることを試みた。また、レスベラトロール合成に必要となるマロニルCoA供給を増加させるために、その前駆体であるアセチルCoA合成能力の強化を目的としてそれに関与する遺伝子の過剰発現を試みた。以上の戦略により、1,2-プロパンジオール及びレスベラトロールそれぞれにおいて、生産量および収率を増加させることに成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

グルコースとキシロースの利用それぞれに対して代謝工学的アプローチを行った。その結果、目的化合物である1,2-プロパンジオール及びレスベラトロールの生産量を増加させることに成功しており、おおむね順調に進展していると判断した。

今後の研究の推進方策

各化合物生産の研究において得られた知見から、目的化合物の更なる生産量増加を試みる。また、これまでの知見をもとに、分断後の各基質の代謝を制御することにより他の化合物を高生産可能な大腸菌株の構築を試みる。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Hydroxybenzoic Acid Production Using Metabolically Engineered Corynebacterium glutamicum2023

    • 著者名/発表者名
      Doke Misa、Kishida Mayumi、Hirata Yuuki、Nakano Mariko、Horita Mayo、Nonaka Daisuke、Mori Yutaro、Fujiwara Ryosuke、Kondo Akihiko、Noda Shuhei、Tanaka Tsutomu
    • 雑誌名

      Synthetic Biology and Engineering

      巻: 1 号: 2 ページ: 1-9

    • DOI

      10.35534/sbe.2023.10010

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Caffeic acid production from glucose using metabolically engineered Escherichia coli2023

    • 著者名/発表者名
      Sakae Kosuke、Nonaka Daisuke、Kishida Mayumi、Hirata Yuuki、Fujiwara Ryosuke、Kondo Akihiko、Noda Shuhei、Tanaka Tsutomu
    • 雑誌名

      Enzyme and Microbial Technology

      巻: 164 ページ: 110193-110193

    • DOI

      10.1016/j.enzmictec.2023.110193

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] G6P-capturing molecules in the periplasm of Escherichia coli accelerate the shikimate pathway2022

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara, R., Nakano, M., Hirata, Y., Otomo, C., Nonaka, D., Kawada, S., Nakazawa, H., Umetsu, M., Shirai, T., Noda, S.*, Tanaka, T.*, Kondo, A.
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering

      巻: 72 ページ: 68-81

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2022.03.002

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 大腸菌の代謝経路の分断による有用化合物生産技術の開発2023

    • 著者名/発表者名
      野中大輔、藤原良介、近藤昭彦、田中勉
    • 学会等名
      化学工学会 第54回秋季大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 代謝経路を分断した大腸菌による物質生産技術の開発2023

    • 著者名/発表者名
      野中大輔、藤原良介、近藤昭彦、田中勉
    • 学会等名
      酵素工学研究会 第90回講演会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] High yield bioproduction from glucose and xylose in "PMPE" E.coli strains2023

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Nonaka, Ryosuke Fujiwara, Tsutomu Tanaka
    • 学会等名
      European Biotechnology Congress 2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 有用化学物質の高収率生産に向けた代謝経路の分断2023

    • 著者名/発表者名
      野中大輔、藤原良介、近藤昭彦、田中勉
    • 学会等名
      化学工学会 第88年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 炭素源の有効利用を指向した目的別代謝改変技術の開発2022

    • 著者名/発表者名
      野中大輔、藤原良介、近藤昭彦、田中勉
    • 学会等名
      酵素工学研究会 第87回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Efficient sugar utilization strategy for high-yield chemical production in engineered E.coli2022

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Nonaka、Ryosuke Fujiwara、Akihiko Kondo,Tsutomu Tanaka
    • 学会等名
      Active Enzyme Molecule 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 代謝経路を切り分けることによる高収率生産技術の開発2022

    • 著者名/発表者名
      野中大輔、藤原良介、近藤昭彦、田中勉
    • 学会等名
      化学工学会 第53回秋季大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Separating metabolic pathways for efficient valuable chemical productions in Escherichia coli2022

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Nonaka、Ryosuke Fujiwara、Akihiko Kondo,Tsutomu Tanaka
    • 学会等名
      The 27th Young Asian Biological Engineers’ Community
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2022-04-28   更新日: 2024-12-25  

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