| 研究課題/領域番号 |
22KJ2423
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| 補助金の研究課題番号 |
22J11077 (2022)
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| 研究種目 |
特別研究員奨励費
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| 配分区分 | 基金 (2023)
補助金 (2022) |
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| 応募区分 | 国内 |
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| 審査区分 |
小区分43050:ゲノム生物学関連
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| 研究機関 | 九州大学 |
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研究代表者 |
吉田 竜星 九州大学, 薬学府, 特別研究員(DC2)
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| 研究期間 (年度) |
2023-03-08 – 2024-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2023年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2022年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
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| キーワード | DnaA / 染色体DNA複製 / 複合体動態 / ヘリカーゼ装着 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
染色体DNA複製は複製起点から両方向に開始される。この基本的な原理がどのような分子機構によって支えられているのかは未だ解明されていない。その原因としては複製開始複合体が高次で動的な動態をもつため解析が困難であったことが大きい。しかしながら大腸菌では近年、複製開始複合体の高次構造解明が大きく進歩したことで、複製開始複合体が機能の異なる左側と右側の二つのサブ複合体から構成されることが明らかになった。また、左側複合体が複製起点の二重鎖DNAを一本鎖化する分子機構までが解明された。本研究では、複製開始複合体が一本鎖化したDNA部位へと複製ヘリカーゼを両方向に装着するまでの分子動態を解析する。
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| 研究実績の概要 |
染色体DNA複製は染色体上の複製起点領域から両方向に開始される。この基本的な原理がどのような分子機構によって支えられているのかは未だ解明されていない。その原因としては開始因子DnaAを主とする複製開始複合体が高次で動的な動態をもつため分子メカニズムの解析が困難であったことが大きい。しかしながら大腸菌では近年、染色体複製起点領域に形成される複製開始複合体の高次構造解明が大きく進歩したことで、複製開始複合体が機能の異なる左側と右側の二つのサブ複合体から構成されることが明らかになった。また、左側複合体が複製起点の二重鎖DNAを一本鎖化する分子機構までが解明された。本研究では、この新たな進展を大いに活用して、複製開始複合体が一本鎖化したDNA部位へと複製ヘリカーゼを両方向に装着するまでの分子動態を解析する。2年計画の初年度である2022年度においては、まず左側・右側DnaAサブ複合体のそれぞれと複製ヘリカーゼとの相互作用を解析するため多様な変異oriCプラスミドなどを構築した。これらを多様な変異DnaAタンパク質や複製ヘリカーゼタンパク質と試験管内で組み合わせ、DnaAのプロトマーレベルで生化学的に複製ヘリカーゼ装着活性を解析した。また、これらの結果は染色体oriCに同様の変異をもつ大腸菌変異株を用いた遺伝学的解析によっても検証した。さらに、左側・右側DnaAサブ複合体が互いに相互作用するかについても生化学的に検証した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
本年度は、①複製ヘリカーゼとDnaA高次複合体の相互作用と②DnaAサブ複合体間相互作用について解析し、①や②で明らかにした相互作用が複製ヘリカーゼ装着にどのように機能するのかを解析する予定であった。①複製ヘリカーゼとDnaA高次複合体の相互作用については、DnaAプロトマー特異的に複製ヘリカーゼとの相互作用を減弱する変異を加えることで、複製ヘリカーゼとの相互作用に重要な可能性のあるDnaAプロトマーをいくつか特定した。②DnaAサブ複合体間相互作用については、Pulldown実験によりこれらが相互作用しうるか検証した。また、来年度解析予定であった、複製ヘリカーゼがDnaAサブ複合体間相互作用に与える影響についても解析を行った。①や②で明らかにした相互作用が複製ヘリカーゼ装着にどのような機能するかについてはフットプリント解析系の構築を進めている。これらのことから全体的には、研究は順調に進んでいると考えており、今後も計画通り解析を進めていきたい。
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| 今後の研究の推進方策 |
これまでほぼ順調に研究進展しているので2023年度は当初予定した通りに推進する。②DnaAサブ複合体間相互作用をより詳細に解析するとともに、③DnaA高次複合体依存的な複製ヘリカーゼ間相互作用の解析に進みたいと考えている。①～③で見出した相互作用がどのように複製ヘリカーゼ装着に機能しているかについてもフットプリント解析を行う。今後は両方向の複製ヘリカーゼ装着の検出により詳細な解析を行うため、現在使用している過マンガン酸以外にもDMSやP1ヌクレアーゼといった他の試薬を用いたフットプリント解析と組み合わせて解析を行っていく予定である。①複製ヘリカーゼとDnaA高次複合体の相互作用についてもまだ未解析のDnaAプロトマーについて解析を進めようと考えている。
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