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転写制御因子を標的とした核酸型分解誘導剤の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ2565
補助金の研究課題番号 21J23036 (2021-2022)
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分基金 (2023)
補助金 (2021-2022)
応募区分国内
審査区分 小区分47010:薬系化学および創薬科学関連
研究機関横浜市立大学

研究代表者

永沼 美弥子  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2023年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2022年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2021年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワードユビキチンプロテアソームシステム / PROTAC / 転写因子 / デコイ核酸 / 核酸修飾 / 細胞膜透過性ペプチド(CPP) / プロテインノックダウン / ユビキチン-プロテアソームシステム / エストロゲン受容体α
研究開始時の研究の概要

近年、PROTACに代表されるタンパク質分解薬の開発研究が盛んに行われている。しかしながら、がんなどに関与している転写因子の中には、最適なリガンドが存在しないものも多く、従来の低分子型PROTACのデザインが困難である。そこで本研究では、汎用性のある転写因子を標的としたPROTAC開発を行うため、標的リガンドにデコイ核酸を用いた手法を開発した。ERαを転写因子のモデルとしたPROTACを設計・合成し、各種活性評価を行うことでコンセプトを実証した。開発したPROTACについて構造最適化を行うことでより活性の高い分子の開発を目指す。本研究によりPROTACの治療効果拡大への貢献が期待できる。

研究実績の概要

タンパク質分解標的キメラ(PROTAC)を用いた化学的タンパク質ノックダウン技術は、内因性ユビキチン-プロテアソーム系(UPS)をハイジャックして疾患関連タンパク質を分解する強力な戦略である。近年、最適な低分子リガンドが存在しないタンパク質へPROTACを適応するため、標的リガンドにオリゴヌクレオチドを利用したPROTACが開発されてきた。核酸型PROTACは、POIに対する結合配列が明らかであれば、容易にリガンド設計・合成が可能であるという利点があり、疾患に関与しているにも関わらず、最適なリガンドが存在しない転写因子(TF)などのタンパク質に対する適応が期待できる。
我々は、本研究においてエストロゲン受容体α(ERα)をTFのモデルとしたデコイ核酸型PROTACとして、LCL-ER(dec)を開発した。LCL-ER(dec)は結合配列、E3リガーゼ、UPS依存的にERα分解活性を示し、転写因子分解誘導剤としての有用性が示された。
しかし、これまでに開発されたデコイ型PROTACのほとんどは、天然のDNA配列を利用しており、生体内のヌクレアーゼにより分解されることが懸念される。また、いくつか報告されているデコイ核酸型PROTACはいずれも、細胞内にトランスフェクションにより導入されているため臨床応用に適していない。そこで本研究では、LCL-ER(dec)に対して化学的安定性の向上を志向して、構造安定化を狙ったT4ループ構造の導入およびホスホロチオエート修飾核酸を導入したPROTACを開発した。さらに、デコイ核酸型PROTACのもう一つの課題である細胞膜透過性の低さに対しては、細胞膜透過性ペプチド(CPP)を利用した細胞内導入を検討した。本年度は、デコイ核酸に対しての修飾および細胞内導入ユニットを連結した分子の設計・合成および、物性と各種活性評価を行った。

報告書

(3件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 3件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] National Sun Yat-sen University(台湾)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] Development of DNA Aptamer-Based PROTACs That Degrade the Estrogen Receptor.2023

    • 著者名/発表者名
      Tsujimura H, Naganuma M, Ohoka N, Inoue T, Naito M, Tsuji G, Demizu Y.
    • 雑誌名

      ACS Med Chem Lett.

      巻: 14 号: 6 ページ: 827-832

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.3c00126

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Development of decoy oligonucleotide-warheaded chimeric molecules targeting STAT32023

    • 著者名/発表者名
      Shih Po-Chang、Naganuma Miyako、Tsuji Genichiro、Demizu Yosuke、Naito Mikihiko
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 95 ページ: 117507-117507

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2023.117507

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Optimization of Decoy Oligonucleotide-Based PROTAC That Degrades the Estrogen Receptor.2023

    • 著者名/発表者名
      Naganuma M, Ohoka N, Tsuji G, Inoue T, Naito M, Demizu Y.
    • 雑誌名

      Bioconjug Chem.

      巻: 34 号: 10 ページ: 1780-1788

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.3c00332

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Current Status of Oligonucleotide-Based Protein Degraders2023

    • 著者名/発表者名
      Po-Chang Shih, Miyako Naganuma, Yosuke Demizu, Mikihiko Naito
    • 雑誌名

      Pharmaceutics

      巻: 15 号: 3 ページ: 765-765

    • DOI

      10.3390/pharmaceutics15030765

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Recent Advances in PROTAC Technology Toward New Therapeutic Modalities2022

    • 著者名/発表者名
      Yokoo Hidetomo、Naganuma Miyako、Oba Makoto、Demizu Yosuke
    • 雑誌名

      Chemistry & Biodiversity

      巻: 19 号: 11 ページ: 134-139

    • DOI

      10.1002/cbdv.202200828

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of Chimeric Molecules That Degrade the Estrogen Receptor Using Decoy Oligonucleotide Ligands2021

    • 著者名/発表者名
      Naganuma M, Ohoka N, Tsuji G, Tsujimura H, Matsuno K, Inoue T, Naito M, Demizu Y.
    • 雑誌名

      ACS Med Chem Lett.

      巻: 13 号: 1 ページ: 134-139

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.1c00629

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 化学的安定性の向上を志向したデコイ核酸型PROTACの開発2023

    • 著者名/発表者名
      永沼美弥子,大岡伸通,辻厳一郎,内藤幹彦,井上貴雄,出水庸介
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 化学的安定性の向上を志向したデコイ核酸型PROTACの開発2023

    • 著者名/発表者名
      1)永沼美弥子,大岡伸通,辻厳一郎,内藤幹彦,井上貴雄,出水庸介
    • 学会等名
      第27回日本がん分子標的治療学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 生体内安定性の向上を志向したデコイ核酸型PROTACの創製2023

    • 著者名/発表者名
      永沼美弥子,大岡伸通,辻厳一郎,内藤幹彦,井上貴雄,出水庸介
    • 学会等名
      日本薬学会第143回年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 標的リガンドにオリゴヌクレオチドを応用したPROTACの創製2022

    • 著者名/発表者名
      永沼美弥子,大岡伸通,辻厳一郎,松野研司,内藤幹彦,井上貴雄,出水庸介
    • 学会等名
      第39回メディシナルケミストリーシンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] デコイ核酸をリガンドとしたエストロゲン受容体分解誘導分子の創製2022

    • 著者名/発表者名
      永沼美弥子,大岡伸通,辻厳一郎,松野研司,内藤幹彦,井上貴雄,出水庸介
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会第16回年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Development of Chimeric Molecules that Degrade the Estrogen Receptor Using Decoy Oligonucleotide Ligands2022

    • 著者名/発表者名
      Miyako Naganuma, Nobumichi Ohoka, Genichiro Tsuji, Kenji Matsuno, Mikihiko Naito, Takao Inoue, Yosuke Demizu
    • 学会等名
      ISNAC2022(第49回国際核酸化学シンポジウム)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] デコイ核酸をリガンドとしたエストロゲン受容体分解誘導分子の開発2022

    • 著者名/発表者名
      永沼美弥子,大岡伸通,辻村はるな,松野研司,内藤幹彦,井上貴雄,辻厳一郎,出水庸介
    • 学会等名
      日本薬学会第142回年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] デコイ核酸をリガンドとしたエストロゲン受容体分解誘導剤の創製2021

    • 著者名/発表者名
      永沼美弥子,大岡伸通,松野研司,内藤幹彦,井上貴雄,辻厳一郎,出水庸介
    • 学会等名
      新学術領域研究「ケモユビキチン」第4回若手主体発表会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0968089623003553?via%3Dihub

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

URL: 

公開日: 2021-05-27   更新日: 2024-12-25  

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