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Swine PathoScan法を用いたタイ・ベトナムでの豚感染症の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 22KK0096
研究種目

国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))

配分区分基金
審査区分 中区分42:獣医学、畜産学およびその関連分野
研究機関京都大学

研究代表者

中川 一路  京都大学, 医学研究科, 教授 (70294113)

研究分担者 遠矢 真理  国立医薬品食品衛生研究所, 食品衛生管理部, 主任研究官 (20804694)
関崎 勉  京都大学, 医学研究科, 研究員 (70355163)
研究期間 (年度) 2022-10-07 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円)
2025年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2024年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2023年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2022年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードブタレンサ球菌 / Swine PathoScan法 / ファージディスプレイ / 感染症 / ファージ / タイ / ベトナム
研究開始時の研究の概要

本研究では、我々が開発を進めている豚の感染歴を一度に解析できるSwine PathoScan法を用いて、養豚で問題となる様々な病原体の感染実態を網羅的にかつ経時的に解析し、感染症の全体像、すなわち個別の農場内での感染状況の遷移、および他農場間での感染拡大の実態を明らかとする。タイ・ベトナム地域は養豚の盛んな地域であると同時に、感染症が多く発生していること、日本と比べると養豚規模が小さいこと、各地に衛生試験所が配置されており飼育頭数が管理されていることから、養豚で問題となる様々な感染症に対する感染の実態を網羅的にかつ経時的に比較解析が行いやすい。

研究実績の概要

養豚現場における感染実態の把握は、畜産業において非常に重要な課題である。個々の病原体の検出や、血清を用いた感染歴の検出については、これまでに数多くの方法が考案され臨床の現場で使用されている。ただし、これらは個別の病原体に特化した検出方法であり、感染症の全体像、すなわち、「その動物がこれまで(もしくは現在)どのような感染症に罹患した(している)のか」を総括的に判断することは困難である。豚の病原体の検出については、細菌であれば培養検査による細菌学的及び生化学的性状試験やPCR法による遺伝子検出と型別、ウイルスであれば、PCR法やRT-PCR法、あるいは血清を用いたELISA法などが用いられている。これらの方法は、①個別の病原体を高感度に検出することが可能であるが、感染症の全体像を把握することは難しい、②コスト面からも全ての病原体に対して検査はできない、③感染の急性期で病原体が患畜に存在している場合は検出が可能であるが、すでに症状が消退している場合には、過去の感染歴を類推することは病原体検出法では不可能である、と主に三つの問題が挙げられる。また、血清診断ではELISA法やラテックス凝集反応法、ゲル内沈降反応法等が用いられているが、個別の抗原により反応性が異なり、個々の病原体に対して別々の検査を行う必要がある。そこで現在、我々は上述の問題を解決するために、家畜伝染病、届出伝染病に含まれる病原体の感染履歴を網羅的に定量化が可能なSwine PathoScan法の開発を行っている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

M13ファージを用いて現在Swine PathoScan法として、その開発を進めている。現在、家畜伝染病と届出伝染病に含まれる病原体のウイルス20種、細菌5種、寄生虫1種についてのファージライブラリーの作製は終了しており、予備実験でも10ulの豚血清であっても検出できることを確認した。本年度は、ほぼすべてのファージライブラリーの作成を終了しており、270種のファージライブラリーを構築した。

今後の研究の推進方策

タイ・ベトナムおよび日本の養豚場から各生育ステージ(授乳期、ほ乳期、生育期)の豚より血液を採取する。(国立衛研・遠矢、 京大・関崎)タイ・ベトナム では、Dr. Meekhanon, Dr. Nguyenの協力を仰ぎ、各地の農場試験所を介して、農場に赴いて血液サンプルを採取する。また、聞き取り調査によりワクチンや飼料を用いた抗菌剤の使用についても情報を収集する。血液サンプルは、直接は日本国内に持ち込めないため、研究協力者の所属機関であるタイ・カセサート大学 獣医学部、ベトナム・ノンラム大学獣医学部で処理を行う。

報告書

(2件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 1件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] カセサート大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] ノンラム大学(ベトナム)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Rab41-mediated ESCRT machinery repairs membrane rupture by a bacterial toxin in xenophagy2023

    • 著者名/発表者名
      Nozawa Takashi、Toh Hirotaka、Iibushi Junpei、Kogai Kohei、Minowa-Nozawa Atsuko、Satoh Junko、Ito Shinji、Murase Kazunori、Nakagawa Ichiro
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 6230-6230

    • DOI

      10.1038/s41467-023-42039-2

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Group A Streptococcus cation diffusion facilitator proteins contribute to immune evasion by regulating intracellular metal concentrations2023

    • 著者名/発表者名
      Aikawa Chihiro、Shimizu Akihide、Nakakido Makoto、Murase Kazunori、Nozawa Takashi、Tsumoto Kouhei、Nakagawa Ichiro
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 676 ページ: 141-148

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2023.07.052

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Targeting hemoglobin receptors IsdH and IsdB of Staphylococcus aureus with a single VHH antibody inhibits bacterial growth2023

    • 著者名/発表者名
      Valenciano-Bellido Sandra、Caaveiro Jose M.M.、Nakakido Makoto、Kuroda Daisuke、Aikawa Chihiro、Nakagawa Ichiro、Tsumoto Kouhei
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 9 ページ: 104927-104927

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.104927

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Anti-InlA single-domain antibodies that inhibit the cell invasion of Listeria monocytogenes2023

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Taichi、Nagatoishi Satoru、Yamawaki Tsukushi、Nozawa Takashi、Matsunaga Ryo、Nakakido Makoto、Caaveiro Jose M.M.、Nakagawa Ichiro、Tsumoto Kouhei
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 10 ページ: 105254-105254

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.105254

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Clonal Expansion of Multidrug-Resistant <i>Streptococcus dysgalactiae</i> Subspecies <i>equisimilis</i> Causing Bacteremia, Japan, 2005?20212023

    • 著者名/発表者名
      Shinohara Koh、Murase Kazunori、Tsuchido Yasuhiro、Noguchi Taro、Yukawa Satomi、Yamamoto Masaki、Matsumura Yasufumi、Nakagawa Ichiro、Nagao Miki
    • 雑誌名

      Emerging Infectious Diseases

      巻: 29 号: 3 ページ: 528-539

    • DOI

      10.3201/eid2903.221060

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequences of Three Streptococcus ruminantium Strains Obtained from Endocarditis Lesions of Cattle in Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Nomoto Ryohei、Ishida-Kuroki Kasumi、Tohya Mari、Nakagawa Ichiro、Sekizaki Tsutomu
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 11 号: 5 ページ: 01248-21

    • DOI

      10.1128/mra.01248-21

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete genome sequences of four Streptococcus parasuis strains obtained from saliva of domestic pigs in Japan.2022

    • 著者名/発表者名
      Nomoto R, Ishida-Kuroki K, Nakagawa I, Sekizaki T
    • 雑誌名

      Microbiol Resour Announc

      巻: 11 号: 2 ページ: 01245-21

    • DOI

      10.1128/mra.01245-21

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Guanylate-Binding Protein 1 Regulates Infection-Induced Autophagy through TBK1 Phosphorylation.2022

    • 著者名/発表者名
      Miyako Hikichi, Hirotaka Toh, Atsuko Minowa-Nozawa, Takashi Nozawa, Ichiro Nakagawa.
    • 雑誌名

      Cell Microbiol

      巻: 2022 ページ: 1-18

    • DOI

      10.1155/2022/8612113

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genomic dissection of the Vibrio cholerae O-serogroup global reference strains: reassessing our view of diversity and plasticity between two chromosomes2022

    • 著者名/発表者名
      Murase Kazunori、Arakawa Eiji、Izumiya Hidemasa、Iguchi Atsushi、Takemura Taichiro、Kikuchi Taisei、Nakagawa Ichiro、Thomson Nicholas R.、Ohnishi Makoto、Morita Masatomo
    • 雑誌名

      Microbial Genomics

      巻: 8 号: 8 ページ: 860-860

    • DOI

      10.1099/mgen.0.000860

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 液-液相分離体ストレス顆粒を介した生体防御システム2023

    • 著者名/発表者名
      野澤孝志、野澤敦子、村瀬一典、中川一路
    • 学会等名
      第34回日本生体防御学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Rab GTPase ネットワークが制御する細胞内膜輸送経路と細菌感染2023

    • 著者名/発表者名
      野澤 孝志,村瀬 一典,中川 一路
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] TBC1D18 regulates exocytic and endocytic trafficking of the invading Group A Streptococcus2023

    • 著者名/発表者名
      野澤 敦子,野澤 孝志,中川 一路
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 自然免疫シグナル伝達因子 STING が制御するリソソーム分解経路の解析2023

    • 著者名/発表者名
      飯伏 純平,野澤 孝志,中川 一路
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
  • [学会発表] A 群レンサ球菌の表層蛋白質の機能を阻害する抗体の探索2023

    • 著者名/発表者名
      山脇 つくし,中木戸 誠,相川 知宏,Jose Caaveiro,中川 一路,津本 浩平
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
  • [学会発表] A 群レンサ球菌の金属恒常性タンパク質 AdcAII は亜鉛の獲得と病原性に必要である2023

    • 著者名/発表者名
      相川 知宏,清水 玲秀,村瀬 一典,野澤 孝志,中川 一路
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌由来の細胞外小胞が A 群レンサ球菌に与える生物学的影響2023

    • 著者名/発表者名
      河岸 優,村瀬 一典,中川 一路
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Genome diversity of Streptococcus dysgalactiae and the evolutional process with host switching2023

    • 著者名/発表者名
      村瀬 一典,柘植 亮佑,中川 一路
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Cytokine-induced FBXO2 directs xenophagy against Group A Streptococcus in endothelial cells2023

    • 著者名/発表者名
      Min Wu,野澤孝志,中川一路
    • 学会等名
      第96回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] A hydroxamic acid derivative identified by biophysical technologies suppresses Streptococcus infections2022

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa I., Nakakido M., Aikawa C., Shimomura T., Hoshino M., Nagatoishi S., Tsumoto K
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC10)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A 群レンサ球菌によるオートファゴソーム膜傷害とその修復機構2022

    • 著者名/発表者名
      中川一路
    • 学会等名
      第52回レンサ球菌シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 大腸菌が産生する細胞外小胞を介した A 群レンサ球菌の細胞分裂障害2022

    • 著者名/発表者名
      河岸優、村瀬一典、中川一路
    • 学会等名
      第52回レンサ球菌シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] A 群レンサ球菌の膜孔形成毒素によるゼノファジー回避機構と宿主膜修復 機構の解析2022

    • 著者名/発表者名
      野澤孝志、中川一路
    • 学会等名
      第33回日本生体防御学会学術総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] A 群レンサ球菌によるゴルジ体の断片化は宿主細胞の膜輸送経路を破綻し サイトカインの分泌を低下させる2022

    • 著者名/発表者名
      飯伏純平、野澤孝志、中川一路
    • 学会等名
      第33回日本生体防御学会学術総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌由来の細胞外小胞がA群レンサ球菌に与える生物学的影響2022

    • 著者名/発表者名
      河岸優、村瀬一典、中川一路
    • 学会等名
      第75回日本細菌学会関西支部会学術総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] MntEを介した菌体内の金属ホメオスタシスの維持はA群レンサ球菌の生育や 病原性に寄与する2022

    • 著者名/発表者名
      清水玲秀, 相川知宏, 村瀬一典, 野澤孝志, 中川一路
    • 学会等名
      第75回日本細菌学会関西支部会学術総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Rab GTPase ネットワークが制御する細胞内膜輸送経路と細菌感染2022

    • 著者名/発表者名
      野澤 孝志,村瀬 一典,中川 一路
    • 学会等名
      第75回日本細菌学会関西支部会学術総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [図書] 耳鼻咽喉科 薬物治療ベッドサイドガイド2023

    • 著者名/発表者名
      藤枝重治、大森孝一
    • 総ページ数
      350
    • 出版者
      中山書店
    • ISBN
      9784521749556
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [図書] 治療の可能性が広がる 抗体医薬2022

    • 著者名/発表者名
      津本 浩平
    • 総ページ数
      231
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758104074
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [図書] 月刊 細胞 2022年9月号 細菌の逆襲 20222022

    • 著者名/発表者名
      鈴木 仁人
    • 総ページ数
      80
    • 出版者
      ニューサイエンス
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 京都大学大学院医学研究科微生物感染症学分野

    • URL

      http://www.bac.med.kyoto-u.ac.jp

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2022-10-11   更新日: 2024-12-25  

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