薬剤耐性菌の院内伝播を食い止めるには伝播経路の遮断が不可欠である。しかしながら、現行の院内検査体制ではその伝播経路を可視化することはできず、根拠の乏しい院内感染対策にとどまっている。本研究では、薬剤耐性菌が検出される度に逐次的に全ゲノム解析を行うことで菌株間の遺伝的関連性を迅速に明らかにすることができる解析プラットフォームを構築する。逐次全ゲノム解析には初期費用が低く、運転規模が小さく、かつリアルタイムにデータを出力するナノポア型シークエンサーを活用する。タイムリーな院内伝播のフィードバックを可能にする本プラットフォームは、根拠のある適切な院内感染対策への活用が期待される。
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