• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

RNAとタンパク質の相互作用を用いたヒト細胞運命制御システムの構築

研究課題

研究課題/領域番号 23221011
研究種目

基盤研究(S)

配分区分補助金
研究分野 ケミカルバイオロジー
研究機関京都大学

研究代表者

井上 丹  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (40114855)

研究分担者 斎藤 博英 (齊藤 博英)  京都大学, iPS細胞研究所, 教授 (20423014)
連携研究者 樫田 俊一  京都大学, 大学院生命科学研究科
遠藤 慧  京都大学, iPS細胞研究所, 博士研究員 (40626074)
藤田 祥彦  京都大学, 大学院生命科学研究科, 助教 (80192730)
原 知明  京都大学, 大学院生命科学研究科
大野 博久  京都大学, 大学院生命科学研究科, 博士研究員
佐川 文彦  京都大学, 大学院生命科学研究科, 技術員
大内 将司  京都大学, 大学院生命科学研究科, 博士研究員 (20422412)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
110,890千円 (直接経費: 85,300千円、間接経費: 25,590千円)
2014年度: 31,590千円 (直接経費: 24,300千円、間接経費: 7,290千円)
2013年度: 31,590千円 (直接経費: 24,300千円、間接経費: 7,290千円)
2012年度: 31,590千円 (直接経費: 24,300千円、間接経費: 7,290千円)
2011年度: 16,120千円 (直接経費: 12,400千円、間接経費: 3,720千円)
キーワードRNP / シンセティックバイオロジー / バイオナノテクノロジー
研究成果の概要

ヒト細胞内の信号伝達経路による遺伝子発現ネットワークを自在に変換する新手法としてタンパク質応答型のshRNAスイッチを構築した。タンパク質応答型のスイッチによる翻訳制御の手法に、フィードバック制御などを導入することに成功した。新しいタンパク質応答型のスイッチに使用することができる人工のRNPモジュールを作成した。任意のmRNAの翻訳をONにする新しいONスイッチの開発を行った。
RNPから構成される三角形のデバイスが、ステレオケミカルにヒト細胞表面レセプターの集合を制御し、それにより信号伝達を定量的に制御できることを証明した。同研究の進展に必要な関連する新技術を開発した。

評価記号
検証結果 (区分)

A

評価記号
評価結果 (区分)

A: 当初目標に向けて順調に研究が進展しており、期待どおりの成果が見込まれる

報告書

(8件)
  • 2015 研究進捗評価(検証) ( PDF )
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書   研究概要(研究進捗評価) ( PDF )   研究進捗評価(評価結果) ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 13件、 オープンアクセス 6件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] A purification method for a molecular complex in which a scaffold molecule is fully loaded with heterogeneous molecules2015

    • 著者名/発表者名
      Shoji Ohuchi, Fumihiko Sagawa, Tan Inoue
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 10 号: 3 ページ: e0120576-e0120576

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0120576

    • NAID

      120005615650

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Designed regular tetragon-shaped RNA-protein complexes with RPL1 for bionanotechnology and synthetic biology2015

    • 著者名/発表者名
      Hirohisa Ohno, Tan Inoue
    • 雑誌名

      ACS nano

      巻: x

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Stereo-specific azimuth adjustment of a protein at the tip of an RNA using the circular permutation technique2015

    • 著者名/発表者名
      Shoji Ohuchi, Fumihiko Sagawa, Tan Inoue
    • 雑誌名

      ACS nano letter

      巻: x

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A trifunctional, triangular RNA-protein complex2015

    • 著者名/発表者名
      Shoji Ohuchi, Fumihiko Sagawa, Tan Inoue
    • 雑誌名

      FEBS letters

      巻: x

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Cell-surface receptor control that depends on the size of a synthetic equilateral-triangular RNA-protein complex2014

    • 著者名/発表者名
      1.Yoshihiko Fujita, Tan Inoue
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 4 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/srep06422

    • NAID

      120005575182

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Synthetic RNA–Protein Nanostructures and Their Potential Applications2014

    • 著者名/発表者名
      Hirohisa Ohno
    • 雑誌名

      RNA Nanotechnology and Therapeutics

      巻: 未定

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] A versatile cis-acting inverter module for synthetic translational switches2013

    • 著者名/発表者名
      Kei Endo et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 4 号: 1 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1038/ncomms3393

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Directed evolution of a synthetic RNA-protein module to create a new translational switch.2013

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Hara
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 37 ページ: 3833-3835

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative and simultaneous translational control of distinct mammalian mRNAs2013

    • 著者名/発表者名
      Kei Endo
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: Epub ページ: 1-12

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Directed evolution of a synthetic RNA-protein module to create a new translational switch2013

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Hara, Hirohide Saito and Tan Inoue
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: Epub

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-dimensionally designed protein-responsive RNA devices for cell signaling regulation,2012

    • 著者名/発表者名
      Shunnichi Kashida
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 40 ページ: 9369-9378

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-dimensionally designed protein-responsive RNA devices for cell signaling regulation2012

    • 著者名/発表者名
      Shunnichi Kashida, Tan Inoue and Hirohide Saito
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 40 ページ: 9369-9378

    • NAID

      120004920410

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Self-replication reactions dependent on tertiary interaction motifs in an RNA ligase ribozyme.2012

    • 著者名/発表者名
      Ohmori R, Saito H, Ikawa Y, Fujita Y, Inoue T.
    • 雑誌名

      J. Mol. Evol.

      巻: 73 ページ: 221-229

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Feedback Control of Protein Expression in Mammalian Cells by Tunable Synthetic Translational Inhibition2012

    • 著者名/発表者名
      James A. Stapleton, Kei Endo, Yoshihiko Fujita, Karin Hayashi, Masahiro Takinoue, Hirohide Saito, and Tan Inoue
    • 雑誌名

      ACS Synthetic Biology

      巻: 1 ページ: 83-88

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Purification of a triangular RNA-protein complex fully loaded with an RNA-binding protein by sequential affinity elimination.2014

    • 著者名/発表者名
      Shoji Ohuchi
    • 学会等名
      The 41st Symposimum on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      Kitakyushu International Conference Center, Kitakyushu, Japan
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RNP ナノ構造による細胞表面レセプターの信号制御2014

    • 著者名/発表者名
      藤田 祥彦
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      京都市 国立京都国際会館
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Size Dependent Regulation of Apoptosis with a Series of Equilateral-Triangular Shaped RNA-protein Complexes2014

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Fujita
    • 学会等名
      DNA20
    • 発表場所
      Kyoto University, Kyoto
    • 年月日
      2014-09-22 – 2014-09-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Square-shaped nanostructures made with RNA-protein interacting module2014

    • 著者名/発表者名
      Hirohisa Ohno
    • 学会等名
      DNA20
    • 発表場所
      Kyoto University, Kyoto
    • 年月日
      2014-09-22 – 2014-09-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] In vitro selection of promoter sequences employing a hairpin-shaped DNA and a streptavidin-binding aptamer

    • 著者名/発表者名
      Shoji Ouchi
    • 学会等名
      Federation of European Biochemical Societies Congress 2013
    • 発表場所
      St Petersburg (ロシア)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Fine-tuning of the orientation and positioning of L7Ae RNA-binding protein on the triangular RNA

    • 著者名/発表者名
      Shoji Ouchi
    • 学会等名
      40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 三次元分子デザイン:蛋白質に応答する人工RNAデバイスの構築

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 学会等名
      分子ロボティックス研究会
    • 発表場所
      京都大学 吉田キャンパス
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 三次元分子デザイン:蛋白質に応答する人工RNAデバイスの構築

    • 著者名/発表者名
      斉藤博英
    • 学会等名
      分子ロボティックス研究会6月定例会
    • 発表場所
      京都大学 吉田キャンパス
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

URL: 

公開日: 2011-06-18   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi