大規模エピゲノム解析に基づく革新的消化器癌診断法の開発

• 研究課題/領域番号: 23240129
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 腫瘍診断学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 今井 浩三 東京大学, 医科学研究所, 特任教授 (60117603)
• 研究分担者: 鈴木 拓 札幌医科大学, 医学部, 教授 (20381254) ; 谷口 博昭 東京大学, 医科学研究所, 特任准教授 (90563289)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 49,400千円 (直接経費: 38,000千円、間接経費: 11,400千円); 2013年度: 14,300千円 (直接経費: 11,000千円、間接経費: 3,300千円); 2012年度: 14,300千円 (直接経費: 11,000千円、間接経費: 3,300千円); 2011年度: 20,800千円 (直接経費: 16,000千円、間接経費: 4,800千円)
• キーワード: 胃癌 / 大腸癌 / 肝癌 / エピゲノム / ＤＮＡメチル化 / バイオマーカー / がん / マイクロＲＮＡ / 癌 / ゲノム / トランスレーショナルリサーチ / マイクロアレイ / 臨床 / マクロアレイ

研究概要

大腸癌細胞のエピゲノムおよびトランスクリプトームを解析することで、エピジェネティックに不活化されたマイクロRNA遺伝子を同定した。大腸前癌病変および早期癌のエピゲノム・ゲノム解析を行うことで、早期発見マーカー候補となりうるDNAメチル化異常を同定した。さらに大腸癌前癌病変における内視鏡所見、病理所見、DNAメチル化異常の間の新たな相関を明らかにした。また胃癌背景胃粘膜におけるエピゲノム解析から、胃癌リスクマーカー候補となるDNAメチル化異常を同定した。原発性肝癌におけるエピゲノム異常解析から、新たな癌特異的DNAメチル化異常を複数同定した。

研究成果

• [雑誌論文] Mesenchymal stem cells cancel azoxymethane-induced tumor initiation (2014)
  • 著者名/発表者名: Nasuno M, Arimura Y, Nagaishi K, Isshiki H, Onodera K, Nakagaki S, Watanabe S, Idogawa M, Yamashita K, Naishiro Y, Adachi Y, Suzuki H, Fujimiya M, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: Stem Cells 巻: 32 号: 4 ページ: 913-925
  • DOI: 10.1002/stem.1594
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Aberrant methylation of microRNA-34b/c is a predictive marker of metachronous gastric cancer risk (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki R, Yamamoto E, Nojima M, Maruyama R, Yamano HO, Yoshikawa K, Kimura T, Harada T, Ashida M, Niinuma T, Sato A, Nosho K, Yamamoto H, Kai M, Sugai T, Imai K, Suzuki H, Shinomura Y
  • 雑誌名: J Gastroenterol 巻: ([Epub ahead of print)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Conditioned mesenchymal stem cells produce pleiotropic gut trophic factors (2014)
  • 著者名/発表者名: Watanabe S, Arimura Y, Nagaishi K, Isshiki H, Onodera K, Nasuno M, Yamashita K, Idogawa M, Naishiro Y, Murata M, Adachi Y, Fujimiya M, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: J Gastroenterol 巻: 49 号: 2 ページ: 270-282
  • DOI: 10.1007/s00535-013-0901-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] The effect of IGF-I receptor blockade for human esophageal squamous cell carcinoma and adenocarcinoma (2014)
  • 著者名/発表者名: Adachi Y, Ohashi H, Imsumran A, Yamamoto H, Matsunaga Y, Taniguchi H, Nosho K, Suzuki H, Sasaki Y, Arimura Y, Carbone DP, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: Tumour Biol 巻: 35 号: 2 ページ: 973-985
  • DOI: 10.1007/s13277-013-1131-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylation of a panel of microRNA genes is a novel biomarker for detection of bladder cancer (2013)
  • 著者名/発表者名: Shimizu T, Suzuki H, Nojima M, Kitamura H, Yamamoto E, Maruyama R, Ashida M, Hatahira T, Kai M, Masumori N, Tokino T, Imai K, Tsukamoto T, Toyota M
  • 雑誌名: Eur Urol 巻: 63 号: 6 ページ: 1091-1100
  • DOI: 10.1016/j.eururo.2012.11.030
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association between genomic alterations and metastatic behavior of colorectal cancer identified by array-based comparative genomic hybridization. (2013)
  • 著者名/発表者名: Sawada T, Yamamoto E, Suzuki H
  • 雑誌名: Genes Chromosomes Cancer 巻: 52(2) 号: 2 ページ: 140-9
  • DOI: 10.1002/gcc.22013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cancer detection by ubiquitin carboxyl-terminal esterase L1 methylation in pancreatobiliary fluids (2013)
  • 著者名/発表者名: Kato N, Yamamoto H, Adachi Y, Ohashi H, Taniguchi H, Suzuki H, Nakazawa M, Kaneto H, Sasaki S, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: World J Gastroenterol 巻: 19(11) 号: 11 ページ: 1718-1727
  • DOI: 10.3748/wjg.v19.i11.1718
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characteristics of Japanese inflammatory bowel disease susceptibility loci (2013)
  • 著者名/発表者名: Arimura Y, Isshiki H, Onodera K, Nagaishi K, Yamashita K, Sonoda T, Matsumoto T, Takahashi A, Takazoe M, Yamazaki K, Kubo M, Fujimiya M, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: J Gastroenterol 巻: (Epub ahead of print)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aberrant methylation of microRNA-34b/c is a predictive marker of metachronous gastric cancer risk. (2013)
  • 著者名/発表者名: Suzuki R, Yamamoto E, Nojima M, Maruyama R, Yamano HO, Yoshikawa K, Kimura T, Harada T, Ashida M, Niinuma T, Sato A, Nosho K, Yamamoto H, Kai M, Sugai T, Imai K, Suzuki H, Shinomura Y.
  • 雑誌名: J Gastroenterol 巻: Epub ahead of print
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characteristics of Japanese inflammatory bowel disease susceptibility loci. (2013)
  • 著者名/発表者名: Arimura Y, Isshiki H, Onodera K, Nagaishi K, Yamashita K, Sonoda T, Matsumoto T, Takahashi A, Takazoe M, Yamazaki K, Kubo M, Fujimiya M, Imai K, Shinomura Y.
  • 雑誌名: J Gastroenterol 巻: Epub ahead of print
  • 査読あり
• [雑誌論文] Upregulation of miR-196a and HOTAIR drive malignant character in gastrointestinal stromal tumors (2012)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Niinuma
  • 雑誌名: Cancer research 巻: 72 号: 5 ページ: 1126-36
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-11-1803
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel pit pattern identifies the precursor of colorectal cancer derived from sessile serrated adenoma. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kimura T, Yamamoto E, Yamano HO.
  • 雑誌名: Am J Gastroenterol. 巻: 107(3) 号: 3 ページ: 460-9
  • DOI: 10.1038/ajg.2011.457
  • 査読あり
• [雑誌論文] Emerging links between epigenetic alterations and dysregulation of noncoding RNAs in cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Maruyama R, Suzuki H, Yamamoto E, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: Tumour Biol 巻: 33 号: 2 ページ: 277-85
  • DOI: 10.1007/s13277-011-0308-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aberrant Methylation of RASGRF1 Is Associated with an Epigenetic Field Defect and Increased Risk of Gastric Cancer. (2012)
  • 著者名/発表者名: Takamaru H, Yamamoto E, Suzuki H.
  • 雑誌名: Cancer Prev Res (Phila) 巻: 5(10) 号: 10 ページ: 2012-2012
  • DOI: 10.1158/1940-6207.capr-12-0056
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Dissection of Premalignant Colorectal Lesions Reveals Early Onset of the CpG Island Methylator Phenotype. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto E, Suzuki H, Yamano HO
  • 雑誌名: Am J Pathol 巻: 181(5) 号: 5 ページ: 1847-61
  • DOI: 10.1016/j.ajpath.2012.08.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Model of translational cancer research in multiple myeloma (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasui H, Ishida T, Maruyama R, Nojima M, Ikeda H, Suzuki H, Hayashi T, Shinomura Y, Imai K
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 103 号: 11 ページ: 1907-1912
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2012.02384.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of DNA methylation identifies novel cancer-related genes in hepatocellular carcinoma (2012)
  • 著者名/発表者名: Shitani M, Sasaki S, Akutsu N, Takagi H, Suzuki H, Nojima M, Yamamoto H, Tokino T, Hirata K, Imai K, Toyota M, Shinomura Y
  • 雑誌名: Tumour Biol 巻: 33 号: 5 ページ: 1307-1317
  • DOI: 10.1007/s13277-012-0378-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Insulin-like growth factor receptor expression is associated with aggressive phenotypes and has therapeutic activity in biliary tract cancers. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ohashi H
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 103 号: 2 ページ: 252-261
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2011.02138.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Silencing of the Kruppel-like factor 2 by the histone methyltransferase EZH2 in human cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi H, Jacinto F.V., Villanueva A, Fernandez AF, Yamamoto H, Carmona F.J, Puertas S, Marquez VE, Shinomura Y, Imai K, and Esteller M
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 31 号: 15 ページ: 1988-1994
  • DOI: 10.1038/onc.2011.387
  • 査読あり
• [雑誌論文] Possible involvement of Wnt11 in colorectal cancer progression (2011)
  • 著者名/発表者名: ishioka M, Ueno K, Hazama S, et al
  • 雑誌名: Mol Carcinog 巻: 10 号: 3 ページ: 207-217
  • DOI: 10.1002/mc.21845
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide profiling of chromatin signatures reveals epigenetic regulation of microRNA genes in colorectal cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki H
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 71 号: 17 ページ: 5646-5658
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-11-1076
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic alteration of DNA in mucosal wash fluid predicts invasiveness of colorectal tumors (2011)
  • 著者名/発表者名: Seiko Kamimae
  • 雑誌名: Cancer prevention research 巻: 4 号: 5 ページ: 674-83
  • DOI: 10.1158/1940-6207.capr-10-0214
  • 査読あり
• [雑誌論文] The efficacy of IGF-I receptor monoclonal antibody against human gastrointestinal carcinomas is independent of k-ras mutation status (2011)
  • 著者名/発表者名: Ii M, Li H, Adachi Y, Yamamoto H, Ohashi H, Taniguchi H, Arimura Y, Carbone DP, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 巻: 17 号: 15 ページ: 5048-5059
  • DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-10-3131
  • 査読あり
• [雑誌論文] Co-expression of laminin β3 and γ2 chains and epigenetic inactivation of laminin α3 chain in gastric cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Ii M, Yamamoto H, Taniguchi H, Adachi Y, Nakazawa M, Ohashi H, Tanuma T, Sukawa Y, Suzuki H, Sasaki S, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: Int J Oncol 巻: 39 ページ: 593-599
• [雑誌論文] Interferon-α/β and anti-fibroblast growth factor receptor 1 monoclonal antibody suppress hepatic cancer cells in vitro and in vivo (2011)
  • 著者名/発表者名: Sasaki S., et al
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6 号: 5 ページ: e19618-e19618
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0019618
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic inactivation of calcium-sensing receptor in colorectal carcinogenesis (2011)
  • 著者名/発表者名: Hizaki K, Yamamoto H, Taniguchi H, Adachi Y, Nakazawa M, Tanuma T, Kato N, Sukawa Y, Sanchez JV, Suzuki H, Sasaki S, Imai K, Shinomura Y
  • 雑誌名: Mod Pathol 巻: 24 号: 6 ページ: 876-884
  • DOI: 10.1038/modpathol.2011.10
  • 査読あり
• [雑誌論文] A DNA methylation fingerprint of 1628 human samples (2011)
  • 著者名/発表者名: Fernandez AF, Assenov Y, Martin-Subero JI, Balint B, Siebert R, Taniguchi H, Yamamoto H, Hidalgo M, Tan AC, Galm O, Ferrer I, Sanchez-Cespedes M, Villanueva A, Carmona J, Sanchez-Mut JV, Berdasco M, Moreno V, Capella G, Monk D, Ballestar E, Ropero S, Martinez R, Sanchez-Carbayo M, Prosper F, Agirre X, Fraga MF, Grana O, Perez-Jurado L, Mora J, Puig S, Prat J, Badimon L, Puca AA, Meltzer SJ, Lengauer T, Bridgewater J, Bock C, Esteller M
  • 雑誌名: Genome Res 巻: 22(2) 号: 2 ページ: 407-19
  • DOI: 10.1101/gr.119867.110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Co-expression of laminin β3 and γ2 chains and epigenetic inactivation of laminin α3 chain in gastric cancer. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ii M
  • 雑誌名: Int J Oncol 巻: 39(3) ページ: 593-599
  • DOI: 10.3892/ijo.2011.1048
  • 査読あり
• [学会発表] ヒストンメチル化酵素分子の発現亢進による乳癌細胞の悪性形質獲得とその臨床応用 (2013)
  • 著者名/発表者名: 谷口博昭、山本博幸、伊東文生、今井浩三
  • 学会等名: 第33回日本分子腫瘍マーカー研究会
  • 発表場所: 横浜市
  • 年月日: 2013-10-02
• [学会発表] ヒストンメチル化酵素分子の発現亢進による乳癌細胞の悪性形質獲得 (2013)
  • 著者名/発表者名: 谷口博昭、山本博幸、越川直彦、清木元治、今井浩三
  • 学会等名: 第22回日本がん転移学会学術集会
  • 発表場所: 松本市
  • 年月日: 2013-07-11
• [学会発表] マイクロRNA 遺伝子のエピジェネティクス異常と臨床応用 (2013)
  • 著者名/発表者名: 鈴木拓,山本英一郎,丸山玲緒,鈴木 亮,清水崇,原田拓,山野泰穂,野島正寛,高塚伸太朗,新沼猛、甲斐正広,篠村恭久,今井浩三
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜市
• [学会発表] マイクロRNA遺伝子のエピジェネティクス異常と臨床応用 (2013)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 拓、丸山玲緒、鈴木 亮、清水 崇、原田 拓、山野泰穂、野島正寛、高塚伸太朗、新沼 猛、甲斐正広、篠村恭久、今井浩三
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] ヒストンメチル化酵素分子の発現亢進による乳癌細胞の悪性形質獲得 (2013)
  • 著者名/発表者名: 谷口博昭、山本博幸、今井浩三
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] ヒストンメチル化酵素分子の発現亢進による乳癌細胞の悪性形質獲得とその臨床応用 (2013)
  • 著者名/発表者名: 谷口博昭、山本博幸、伊東文生、今井浩三
  • 学会等名: 第33回日本分子腫瘍マーカー研究会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] ヒストンメチル化酵素分子の発現亢進による乳癌細胞の悪性形質獲得 (2013)
  • 著者名/発表者名: 谷口博昭、山本博幸、越川直彦、清木元治、今井浩三
  • 学会等名: 第22回日本がん転移学会学術集会
  • 発表場所: ホテルブエナビスタ松本
• [学会発表] ヒストンメチル化酵素分子の発現亢進による乳癌細胞の悪性形質獲得 (2012)
  • 著者名/発表者名: 谷口博昭,山本博幸,今井浩三
  • 学会等名: 72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜市
• [備考] 東京大学医科学研究所附属病院 抗体・ワクチンセンター
  • URL: http://www.nctimsut.org/
• [備考] 東京大学医科学研究所附属病院 抗体・ワクチンセンター
  • URL: http://www.nctimsut.org/