ＤＮＡの協同的分子認識機構解明のための電子相関効果を導入した量子化学解析法と応用

• 研究課題/領域番号: 23245005
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 物理化学
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 青木 百合子 九州大学, 総合理工学研究科(研究院), 教授 (10211690)
• 連携研究者: GU Feng Long 華南師範大学, 教授 (80404036) ; 今村 詮 広島大学, 名誉教授 (70076991)
• 研究協力者: Orimoto Yuuichi ; KORCHOWIEC Jacek ; MAKOWSKI Marcin ; KIRTMAN Bernie ; CHAMPAGNE Benoît ; SPRINGBORG Michael
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 49,270千円 (直接経費: 37,900千円、間接経費: 11,370千円); 2015年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円); 2014年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2013年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2012年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2011年度: 12,870千円 (直接経費: 9,900千円、間接経費: 2,970千円)
• キーワード: Elongation法 / 分子軌道法 / 電子相関 / 構造最適化 / DNA / ミスマッチ / バンド構造 / タンパク質 / 量子化学 / 電子状態 / 導電性 / Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ法 / ＤＮＡ / 塩基配列 / 局所状態密度

研究成果の概要

量子化学は1981年福井謙一の国内第一回ノーベル化学賞以来、コンピュータの進歩と共に大きく発展してきた。しかし、ペタスケールスパコンが発展した今ですら、大きな生体系になると膨大な計算時間を必要とする。代表者らのグループで高分子の電子状態計算のために開発してきた超高精度オーダー(N)計算法－高分子の電子状態の理論的重合法－Elongation法－を三次元生体高分子に効率よく適用可能となるよう一般化した（３D-ELG法）。これを協同現象解明に役立てるため局所的構造最適化、電子相関、励起状態等のアルゴリズムを３D-ELG法に導入し、DNAの構造解析やミスマッチ過程やバンド構造の解明などに適用した。

研究成果

• [国際共同研究] Jagiellonian University/Faculty of Chemistry(ポーランド)
• [国際共同研究] South China Normal University/Faculty of Chemistry&Environment(中国)
• [雑誌論文] An efficient unrestricted PCM-elongation method for large high-spin polymer/dendrimer systems (2016)
  • 著者名/発表者名: Xun Zhu, Yuuichi Orimoto, and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: Z. Phys. Chem. 巻: 印刷中 号: 5-7 ページ: 667-680
  • DOI: 10.1515/zpch-2015-0722
  • 査読あり
• [雑誌論文] Theoretical investigation of the pressure-induced insulator-to-metal-to-insulator transitions in one-dimensional bis(dimethylglyoximato) platinum(II), Pt(dmg)2 (2015)
  • 著者名/発表者名: Kai Liu, Yuuichi Orimoto, and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: Polyhedron 巻: 87 ページ: 141-146
  • DOI: 10.1016/j.poly.2014.11.013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ab initio O(N) elongation-counterpoise method for BSSE-corrected interaction energy analyses in biosystems (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuuichi Orimoto, Ryohei Yamamoto, Peng Xie, Kai Liu, Akira Imamura, and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: The Journal of Chemical Physics 巻: 142 号: 10 ページ: 104111-104111
  • DOI: 10.1063/1.4913931
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Intermediate electrostatic field for the accurate calculation of generalized elongation method (2015)
  • 著者名/発表者名: Kai Liu, Jacek Korchowiec, and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: ChemPhysChem 巻: in press 号: 7 ページ: 1551-1556
  • DOI: 10.1002/cphc.201402901
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Development of minimized mixing molecular orbital method for designing organic ferromagnets (2015)
  • 著者名/発表者名: Xun Zhu, and Yuriko Aok
  • 雑誌名: J. Comput. Chem. 巻: 36 号: 16 ページ: 1232-1239
  • DOI: 10.1002/jcc.23915
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interaction of OH- with Xylan and Its Hydrated Complexes: Structures and Molecular Dynamics Study Using Elongation Method (2015)
  • 著者名/発表者名: Lin Jin, Kai Liu, and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: J. Mol. Model. 巻: 21 号: 5
  • DOI: 10.1007/s00894-015-2666-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elongation method for electronic structure calculations of random DNA sequences (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuuichi Orimoto, Kai Liu, and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: J. Comput. Chem. 巻: 36 号: 28 ページ: 2103-2113
  • DOI: 10.1002/jcc.24047
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient prediction of high spin ground state stability in organic polyradicals under solvent effects (2015)
  • 著者名/発表者名: Xun Zhu, and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett. 巻: 637 ページ: 143-147
  • DOI: 10.1016/j.cplett.2015.07.060
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Development of minimized mixing molecular orbital method for designing organic ferromagnets (2015)
  • 著者名/発表者名: Xun Zhu and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: J. Comput. Chem. 巻: in press
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Reply to the Comment of Prof. Ladik on Peng Xie, Hiroyuki Teramae, Kai Liu, and Yuriko Aoki: “Electronic States of Mixed Base Pairs Systems of DNA and the Effect of Base Composition and Sequences on the Band Structures Using Screw Axis Translational Symmetry” (2014)
  • 著者名/発表者名: Peng Xie, Hiroyuki Teramae, Kai Liu, and Yuriko Aoki
  • 雑誌名: Int. J. Quantum Chem. 巻: 114 号: 4 ページ: 303-303
  • DOI: 10.1002/qua.24543
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Intermediate electrostatic field for the elongation method (2014)
  • 著者名/発表者名: Piotr Kuzniarowicz, Kai Liu, Yuriko Aoki, Feng Long Gu, Anna Stachowicz, and Jacek Korchowiec
  • 雑誌名: J. Mol. Model. 巻: 20 号: 6
  • DOI: 10.1007/s00894-014-2277-6
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Intermediate electrostatic field for the elongation method (2014)
  • 著者名/発表者名: P. Kuzniarowicz, K. Liu, Y. Aoki, F. L. Gu, A. Stachowicz, and J. Korchowiec
  • 雑誌名: J. Mol. Model. 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] An analytical approach to predict high-spin stability of conjugated hydrocarbon radical polymers using minimized mixing nonbonding molecular orbitals (2013)
  • 著者名/発表者名: X. Zhu and Y. Aoki
  • 雑誌名: Curr. Phys. Chem. 巻: 3(1) 号: 1 ページ: 99-112
  • DOI: 10.2174/1877946811303010014
  • 査読あり
• [雑誌論文] Three dimensional elongation method for large molecular calculations (2013)
  • 著者名/発表者名: K. Liu, L. Peng, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett. 巻: 560 ページ: 66-70
  • DOI: 10.1016/j.cplett.2012.12.046
  • 査読あり
• [雑誌論文] Electronic structures and molecular structures of polyynes (2013)
  • 著者名/発表者名: A. Imamura and Y. Aoki
  • 雑誌名: Int. J. Quantum Chem. 巻: 113(4) 号: 4 ページ: 423-427
  • DOI: 10.1002/qua.24244
  • 査読あり
• [雑誌論文] Electronic states of mixed base pairs systems of DNA and the effect of base composition and sequences on the band structures using screw axis translational symmetry (2013)
  • 著者名/発表者名: P. Xie, H. Teramae, K. Liu, and Y. Aoki
  • 雑誌名: Int. J. Quantum Chem. 巻: 113(4) 号: 4 ページ: 489-496
  • DOI: 10.1002/qua.24199
  • 査読あり
• [雑誌論文] An Efficient Local Molecular Dynamics Polymerization Simulation Combined with an Ab Initio MO Method (2013)
  • 著者名/発表者名: P. Xie, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 雑誌名: Materials 巻: 6(3) 号: 3 ページ: 870-885
  • DOI: 10.3390/ma6030870
  • 査読あり
• [雑誌論文] A modified localization scheme for the three-dimensional elongation method applied to large systems (2013)
  • 著者名/発表者名: K. Liu, Y. Yan, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett. 巻: 565 ページ: 143-147
  • DOI: 10.1016/j.cplett.2013.02.039
  • 査読あり
• [雑誌論文] Substituent Effects on Menshutkin-Type Reactions in the Gas Phase and Solutions: Theoretical Approach from the Orbital Interaction View (2013)
  • 著者名/発表者名: L. Jiang, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 雑誌名: J. Chem. Theory Comput. 巻: 9(9) 号: 9 ページ: 4035-4045
  • DOI: 10.1021/ct4006163
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stereoelectronic Effects in Menshutkin-Type SN2 Reactions: Theoretical Study Based on Through-Space/Bond Orbital Interaction Analysis (2013)
  • 著者名/発表者名: L. Jiang, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 雑誌名: J. Phys. Org. Chem. 巻: 26(11) 号: 11 ページ: 885-891
  • DOI: 10.1002/poc.3186
  • 査読あり
• [雑誌論文] Helical molecular orbitals around straight-chain polyyne oligomers as models for molecular devices (2013)
  • 著者名/発表者名: A. Imamura, and Y. Aoki
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett. 巻: 590 ページ: 136-140
  • DOI: 10.1016/j.cplett.2013.10.064
  • 査読あり
• [雑誌論文] Counter-ion effects of A- & B-type poly(dG)・poly(dC) and poly(dA)・poly(dT) DNA by elongation method (2012)
  • 著者名/発表者名: P.Xie, K.Liu, F.L.Gu, Y.Aoki
  • 雑誌名: Int.J.Quantum Chem. 巻: 112(1) 号: 1 ページ: 230-239
  • DOI: 10.1002/qua.23230
  • 査読あり
• [雑誌論文] An elongation method for large systems toward bio-systems (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Aoki and F. L. Gu
  • 雑誌名: Phys. Chem. Chem. Phys. 巻: 14(21) 号: 21 ページ: 7640-7668
  • DOI: 10.1039/c2cp24033e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Geometry Optimization for Large Systems by the Elongation Method (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Liu, J. Korchowiec, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 雑誌名: Theor. Chem. Acc. 巻: 131 号: 10
  • DOI: 10.1007/s00214-012-1277-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient algorithm for computing orbital energies within elongation method (2012)
  • 著者名/発表者名: O. Loboda, F. L. Gu, A. Pomogaeva, M. Makowski, and Y. Aoki
  • 雑誌名: International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering 2009(ICCMSE 2009) 巻: 1504（1） ページ: 544-547
  • DOI: 10.1063/1.4771755
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elongation Method for Linear Scaling (2012)
  • 著者名/発表者名: F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 雑誌名: International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering 2009(ICCMSE 2009) 巻: 1504（1） ページ: 167-175
  • DOI: 10.1063/1.4771712
  • 査読あり
• [雑誌論文] Generalized Elongation Method: From One-Dimension to Three-Dimension, International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering: Theory and Computation: Old Problems and New Challenge (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Aoki, and F. L. Gu
  • 雑誌名: International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering 2009(ICCMSE 2009) 巻: 1504（1） ページ: 647-650
  • DOI: 10.1063/1.4771778
  • 査読あり
• [雑誌論文] Band Structure of Polymer Extracted from Oligomer Calculations by Elongation Method and Its Applications to Nanosystems (2012)
  • 著者名/発表者名: A. Pomogaeva, M. Springborg, B. Kirtman, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 雑誌名: International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering 2009(ICCMSE 2009) 巻: 1504（1） ページ: 563-566
  • DOI: 10.1063/1.4771759
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sharp Increase in the (Hyper)polarizabilities of Quinoid Type Isonaphtothiophene (INT) Oligomers: A Quantum Chemical Insight (2012)
  • 著者名/発表者名: L. Jiang and Y. Aoki
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. A 巻: 116（51） 号: 51 ページ: 12492-12502
  • DOI: 10.1021/jp308681t
  • 査読あり
• [雑誌論文] An analytical approach to predict high-spin stability of conjugated hydrocarbon radical polymers using minimized mixing nonbonding molecular orbitals (2012)
  • 著者名/発表者名: X.Zhu, Y.Aoki
  • 雑誌名: Current Physical Chemistry 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient algorithm for computing orbital energies within elongation method (2012)
  • 著者名/発表者名: O.Loboda, F.L.Gu, A.Pomogaeva, M.Makowski, Y.Aoki
  • 雑誌名: International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering 2009, AIP Proceedings 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highly accurate O(N) method for delocalized systems (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Aoki, O.Loboda, K.Liu, M.A.Makowski, F.L.Gu
  • 雑誌名: Theor.Chem.Acc. 巻: 130(4-6) 号: 4-6 ページ: 595-608
  • DOI: 10.1007/s00214-011-1011-z
  • 査読あり
• [雑誌論文] Guidelines proposed for designing organic ferromagnets by using quantum chemical approach (2011)
  • 著者名/発表者名: S.Onitsuka, Y.Aoki
  • 雑誌名: Theor.Chem.Acc. 巻: 130(4-6) 号: 4-6 ページ: 789-806
  • DOI: 10.1007/s00214-011-1037-2
  • 査読あり
• [学会発表] Linear Scaling Method for Large Systems and its Applications to Nano-Bio Systems (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki
  • 学会等名: The 6th JCS International Symposium on Theoretical Chemistry (JCS-2015)
  • 発表場所: Bratislava (Slovak Republic)
  • 年月日: 2015-10-11
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Computational functional design of artificial DNAs: application of elongation method and through-space/bond interaction analysis (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuuichi Orimoto, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 第４２回国際核酸化学シンポジウム
  • 発表場所: イーグレ姫路 (兵庫県姫路市)
  • 年月日: 2015-09-23
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis and modeling of molecular interactions in halogen-bonded cocrystal (2015)
  • 著者名/発表者名: Wataru Mizukami, Ken Matsubara, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 51st Symposium on Theoretical Chemistry(STC2015)
  • 発表場所: Potsdam (Germany)
  • 年月日: 2015-09-20
  • 国際学会
• [学会発表] 開殻分安定スピン状態予測のための結合性最Mixing(NB-MM)MO-ELG法 (2015)
  • 著者名/発表者名: Xun Zhu, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 第９回分子化学討論会
  • 発表場所: 東京工業大学 (東京都目黒区)
  • 年月日: 2015-09-16
• [学会発表] 相互作解析によるハロゲン結合をベースとした共結晶成過程の理解 (2015)
  • 著者名/発表者名: Ken Matsubara, Wataru Mizukami, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 第９回分子化学討論会
  • 発表場所: 東京工業大学 (東京都目黒区)
  • 年月日: 2015-09-16
• [学会発表] 大規模原子分子系に向けた効率的Elongation法の展開と応用 (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki, Kai Liu, Wataru Mizukami, and Yuuichi Orimoto
  • 学会等名: 第９回分子化学討論会
  • 発表場所: 東京工業大学 (東京都目黒区)
  • 年月日: 2015-09-16
• [学会発表] 光電変換ワイヤの効率的理論設計法と応用 (2015)
  • 著者名/発表者名: Kouhei Kato, Yuuichi Orimoto, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 第９回分子化学討論会
  • 発表場所: 東京工業大学 (東京都目黒区)
  • 年月日: 2015-09-16
• [学会発表] 機能性人工核酸の理論的分子設計～導電性・強磁性・非線形光学特性～ (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuuichi Orimoto, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 第９回分子化学討論会
  • 発表場所: 東京工業大学 (東京都目黒区)
  • 年月日: 2015-09-16
• [学会発表] An efficient quantum chemical approach for material design (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki
  • 学会等名: 2015 International Symposium for Advanced Materials Research (ISAMR 2015)
  • 発表場所: Sun Moon Lake (Taiwan)
  • 年月日: 2015-08-16
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Theoretical design for NLO polymers (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki
  • 学会等名: 2015 International Symposium for Advanced Materials Research (ISAMR 2015)
  • 発表場所: Sun Moon Lake (Taiwan)
  • 年月日: 2015-08-16
  • 国際学会
• [学会発表] Highly efficient electronic structure calculations of biomaterials for their functional design (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuuichi Orimoto, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 2015 International Symposium for Advanced Materials Research (ISAMR 2015)
  • 発表場所: Sun Moon Lake (Taiwan)
  • 年月日: 2015-08-16
  • 国際学会
• [学会発表] Interaction of OH- with Xylan and Its Hydrated Complexes: Structures and Molecular Dynamics Study Using Elongation Method (2015)
  • 著者名/発表者名: Lin Jin, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 2015 International Symposium for Advanced Materials Research (ISAMR 2015)
  • 発表場所: Sun Moon Lake (Taiwan)
  • 年月日: 2015-08-16
  • 国際学会
• [学会発表] Elongation Method for Functional Design of Nano-Baio Systems (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki
  • 学会等名: The 15th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC)
  • 発表場所: Beijing (China)
  • 年月日: 2015-06-08
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Efficient NLO Calculations by Elongation Method (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki
  • 学会等名: The 15th International Congress of Quantum Chemistry (ICQC) Satellite Meeting
  • 発表場所: Nanjing (China)
  • 年月日: 2015-06-01
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 大規模原子分子系の機能設計のための高速高精度量子化学計算法-Elongation法-の開発 (2015)
  • 著者名/発表者名: 青木 百合子
  • 学会等名: 第12回稲盛フロンティア研究講演会
  • 発表場所: 九州大学伊都キャンパス稲盛財団記念館(福岡市)
  • 年月日: 2015-01-23
  • 招待講演
• [学会発表] A Quantum Chemical Study on Cathode Active Materials of Organic Radical-Molecules in Secondary Battery (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuki Furutani and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 16th Cross Straits Symposium on Energy, Environmental Science and Technology (CSS-EEST 16)
  • 発表場所: Jeju(Korea)
  • 年月日: 2014-11-13 – 2014-11-15
• [学会発表] Order-N electronic structure calculations of natural and artificial DNAs towards their functional design (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuuichi Orimoto, Yuki Kawamura, Kai Liu, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 第63回高分子討論会
  • 発表場所: 長崎大学文教キャンパス(長崎市)
  • 年月日: 2014-09-24 – 2014-09-26
• [学会発表] Development of ELG method for highly accurate molecular design and its applications to large systems (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki, Kai Liu, Xun Zhu, Ryota Tsutsui, and Yuuichi Orimoto
  • 学会等名: 第8回分子科学討論会
  • 発表場所: 広島大学東広島キャンパス(広島市)
  • 年月日: 2014-09-21 – 2014-09-24
• [学会発表] Theoretical functional design of artificial DNAs by O(N) elongation method and TS/TB interaction analysis (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuuichi Orimoto, Yuki Kawamura, Kai Liu, and Yuriko Aoki
  • 学会等名: 第8回分子科学討論会
  • 発表場所: 広島大学東広島キャンパス(広島市)
  • 年月日: 2014-09-21 – 2014-09-24
• [学会発表] Recent development of highly accurate linear scaling elongation method and its applications to large systems (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki
  • 学会等名: 2014 International Workshop on Frontiers of Theoretical and Computational Physics and Chemistry (WFTCPC 2014)
  • 発表場所: Quzhou(China)
  • 年月日: 2014-08-21 – 2014-08-24
  • 招待講演
• [学会発表] 含金属ヘテロナノチューブの電子状態と機能解析に向けたElongation法の応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: R. Tsutsui, K. Liu, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第14回高分子計算機科学研究会討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Elongation法による高分子の効率的構造最適化とNLO材料設計 (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Aoki, S. Abe, R. Tsutsui, K. Liu, and F. L. Gu
  • 学会等名: 第14回高分子計算機科学研究会討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Elongation法による磁性高分子設計と二次電池正極材料設計への応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Furutani, X. Zhu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第14回高分子計算機科学研究会討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Intermediate field for the elongation method (2013)
  • 著者名/発表者名: P. Kuzniarowicz, Y. Aoki, A. Stachowicz, and J. Korchowiec
  • 学会等名: Current Trends in Theoretical Chemistry VI
  • 発表場所: Krakow(Poland)
• [学会発表] Elongation method for efficient and accurate calculations of large systems and applications to DNA, proteins, and nanotubes towards material design (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Aoki
  • 学会等名: Current Trends in Theoretical Chemistry VI
  • 発表場所: Krakow(Poland)
  • 招待講演
• [学会発表] Functional properties and electronic states of metal included BN/C heteronanotubes by Elongation method (2013)
  • 著者名/発表者名: R. Tsutsui, K. Liu, Y. Orimoto, H. Honda, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第７回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Highly efficient analyses of I-M-I transition in quasi-1D metal complexes by elongation method (2013)
  • 著者名/発表者名: K. Liu, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第７回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Development of open-shell elongation method and its application to ferromagnetic material design (2013)
  • 著者名/発表者名: X. Zhu, K. Liu, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第７回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Through-space/bond interaction analysis on NLO properties enhancement of molecular switches (2013)
  • 著者名/発表者名: L. Jiang, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第７回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] An efficient searching of optimized geometries for proteins and DNA by ELG-OPT method (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Aoki, K. Liu, P. Xie, and Y. Orimoto
  • 学会等名: 第７回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Highly effcient O(N) calculations of natural and artificial DNAs by elongation method (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Orimoto, K. Liu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第７回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Functional design of natural and artificial nucleic acids via ab initio order-N elongation method: computional approaches (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Orimoto, K. Liu, and Y. Aoki
  • 学会等名: The 40th International Symposium on Nudeic Acids Chemistry
  • 発表場所: 神奈川
• [学会発表] A quantum chemical study on cathode active materials of organc radical-molecules in secondary battery (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Furutani, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 14th Cross Straits Symposium on Energy and Environmental Science and Technology (CSS-EEST 14)
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Functional properties of BN nanotubes by highly efficient Geometry optimization method (2013)
  • 著者名/発表者名: R. Tsutsui, K. Liu, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 14th Cross Straits Symposium on Energy and Environmental Science and Technology (CSS-EEST 14)
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Highly efficient quantum chemistry calculations of DNA for designing biomaterials (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Orimoto, P. Xie, K. Liu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 14th Cross Straits Symposium on Energy and Environmental Science and Technology (CSS-EEST 14)
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Insights into substituents and solvent effects on SN2 reaction by through space/bond interaction analysis (2013)
  • 著者名/発表者名: L. Jiang, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 14th Cross Straits Symposium on Energy and Environmental Science and Technology (CSS-EEST 14)
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] A new ab-initio molecular dynamics method for aperiodic bio-polymer: Elongation-MD (2012)
  • 著者名/発表者名: P. Xie, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 28th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Theoretical study of the solvent effects on functional donor-nanowire-acceptor systems by Elongation method with polarized continuum model (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Yang, Y. Orimoto, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 28th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Stereoelectronic effects in organic reactions: Theoretical study based on through-space/bond interaction analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: L. Jiang, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 28th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Hydration effects on DNA in water: theoretical ab initio study via elongation-PCM method (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Orimoto and Y. Aoki
  • 学会等名: 28th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Elongation geometry optimization method for bio-molecule within polarizable continuum model (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Liu and Y. Aoki
  • 学会等名: 28th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Theoretical study of solvent effects on spin-polarized molecular wire under electric field by open-shell Elongation method with the polarizable continuum model (2012)
  • 著者名/発表者名: X. Zhu, Y. Orimoto, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 28th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamic
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Theoretical study of one-dimensional metalloporphyrin array using elongation method (2012)
  • 著者名/発表者名: S. Abe, K. Liu, Y. Orimoto, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第６回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] High-efficient DNA electronic structure analysis by ab initio elongation method (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Orimoto, P. Xie, K. Liu, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第６回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Development of elongation optimization method and local vibrational analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Aoki, K. Liu, Y. Yan, Y. Orimoto, and F. L. Gu
  • 学会等名: 第６回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] A theoretical study on electronic structures of heteronanotubes by elongation method (2012)
  • 著者名/発表者名: R. Tsutsui, K. Liu, Y. Orimoto, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第６回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Elongation dynamics and local transition state search on reaction site (2012)
  • 著者名/発表者名: P. Xie, Y. Orimoto, K. Liu, Y. Yan, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第６回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Efficient serach for optimized geometry of whole system by elongation local optimization method (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Liu, Y. Orimoto, F. L. Gu, and Y. Aoki
  • 学会等名: 第６回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Highly accurate and efficient quantum chemical method for nano-bio functional designs (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Aoki
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Large-scale Computional Science and Engineering
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Highly accurate functional design of DNA/Nanotubes/Nanowires by efficient quantum chemical approach (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Aoki
  • 学会等名: 第六届国際理論化学、分子模擬和生命科学研討会
  • 発表場所: 広州(China)
  • 年月日: 2011-11-13
• [学会発表] Highly accurate functional design of DNA/Nanotubes/Nanowires by efficient quantum chemical approach (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Aoki
  • 学会等名: ICCMSE 2011
  • 発表場所: Halkidiki (Greece)
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] Theoretical analysis of polythiophene derivatives as high per formance photovoltaic cell (2011)
  • 著者名/発表者名: L.Jiang, S.Feng, Y.Aoki
  • 学会等名: The 3rd Aisan Symposium on Advanced Materials
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] Development of Elongation Geometry Optimization Method (2011)
  • 著者名/発表者名: L.kai, F.L.Gu, Y.Aoki
  • 学会等名: The 3rd Aisan Symposium on Advanced Materials
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] Molecular design for donor-nanowire-acceptor photoelectric conversion materials by using elongation method (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Yang, O.Lododa, F.L.Gu, Y.Aoki
  • 学会等名: The 3rd Aisan Symposium on Advanced Materials
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] Conductivity Analysis of DNA (2011)
  • 著者名/発表者名: X.Peng, F.L.Gu, Y.Aoki
  • 学会等名: The 3rd Aisan Symposium on Advanced Materials
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] Organic Ferromagnetic Materials Design with High-spin Stability Index by Quantum Chemical Approach (2011)
  • 著者名/発表者名: X.Zhu, F.L.Gu, Y.Aoki
  • 学会等名: The 3rd Aisan Symposium on Advanced Materials
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] NLO analysis of ladder-structure polydiacetylenes derivatives (2011)
  • 著者名/発表者名: L.Z.Kang, F.L.Gu, Y.Aoki
  • 学会等名: The 3rd Aisan Symposium on Advanced Materials
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2011-09-20
• [学会発表] Highly accurate linear scaling method-elongation method- and its applications to large systems (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Aoki, K.Liu, F.L.Gu
  • 学会等名: ISTCP-VII
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2011-09-06
• [学会発表] Electric structures and molecular structures of polyynes (2011)
  • 著者名/発表者名: A.Imamura, Y.Aoki
  • 学会等名: ISTCP-VII
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2011-09-03
• [学会発表] Development of Highly Accurate Elongation Method to Large Systems and its Application to Functional Designs (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Aoki
  • 学会等名: 4th JCS Symposium on Theoretical Chemistry
  • 発表場所: Conference Center of AS CR-Chateau Liblice (Czech Republic)(招待講演)
  • 年月日: 2011-05-18
• [図書] Calculations on Nonlinear Optical Properties for Large Systems:The Elongation Method (2015)
  • 著者名/発表者名: Feng Long Gu, Yuriko Aoki, Michael Springborg, and Bernard Kirtman
  • 総ページ数: 93
  • 出版者: SPRINGER BRIEFS IN MOLECULAR SCIENCE, ELECTRICAL AND MAGNETIC PROPERTIES OF ATOMS, MOLECULES, AND CLUSTERS, Springer International Publishing
• [図書] 「高分子ナノテクノロジーハンドブック～最新ポリマーABC技術を中心として～」第５編第２章 (2014)
  • 著者名/発表者名: 青木百合子, 今村詮
  • 出版者: 株式会社エヌ・ティー・エス
• [図書] Elongation法による巨大系の効率的電子状態・構造シミュレーション (2013)
  • 著者名/発表者名: 青木 百合子
  • 出版者: 日本シミュレーション学会
• [図書] Elongation Method for Delocalized Nano-wires (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Aoki and F. L. Gu
  • 出版者: Progress in Chemistry, Chinese Academy of Science
• [図書] Elongation Method for Delocalized Nano-wires (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuriko Aoki, Feng Long Gu
  • 出版者: Progress in Chemistry(In press)