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表現型可塑性:生態学と分子発生学の統合的研究

研究課題

研究課題/領域番号 23247004
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生態・環境
研究機関北海道大学

研究代表者

西村 欣也  北海道大学, 水産科学研究科(研究院), 准教授 (30222186)

研究分担者 三浦 徹  北海道大学, 地球環境科学研究院, 准教授 (00332594)
岸田 治  北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 准教授 (00545626)
道前 洋史  北里大学, 薬学部, 助教 (70447069)
北野 准 (北野 潤)  国立遺伝学研究所, 集団遺伝学研究系, 教授 (80346105)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
28,080千円 (直接経費: 21,600千円、間接経費: 6,480千円)
2015年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2014年度: 7,930千円 (直接経費: 6,100千円、間接経費: 1,830千円)
2013年度: 8,450千円 (直接経費: 6,500千円、間接経費: 1,950千円)
2012年度: 9,100千円 (直接経費: 7,000千円、間接経費: 2,100千円)
キーワードエゾサンショウウオ / 表現型可塑性 / トランスクリプトーム解析 / 表現型多形 / ゲノム / トランスくリプトーム解析 / 幾何学的形態解析 / 形態 / 地域集団 / 表現型多型 / 幾何学的形態計測解析 / トランスクリプトーム / 次世代シーケンサー
研究成果の概要

北海道の固有種であるエゾサンショウウオ(Hynobius retardatus)の幼生は、捕食者生物、餌生物、同種幼生の存在に呼応して生態学的機能を有する表現型可塑性を示す。そのため、進化生態学、発生生物学を融合する研究の優れたモデル生物である。
本研究では、エゾサンショウウオ幼生が捕食者生物存在下、餌生物存在下で可塑的に発現される形態変化について、幾何学的形態解析法を用いて定量的に明らかにし、その分子発生学的メカニズムを調べる出発点として形態変化と関連するゲノム情報の探索を行った。さらに、生息域全域を網羅する5地域集団間で、表現型可塑性に伴う形態変化の反応規範と、遺伝マーカーの変異を調べた。

報告書

(6件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2015 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 謝辞記載あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Development and characterization of 12 micro satellite markers for the Hokkaido salamander (Hynobius retardatus).2015

    • 著者名/発表者名
      Matsunami, M., Igawa, T., Nozawa, M., Michimae, H., Miura, T., and Nishimura, K.
    • 雑誌名

      Current Herpetology

      巻: 23 ページ: 177-181

    • NAID

      130005095175

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Transcriptome analysis of predator- and prey-induced phenotypic plasticity in the Hokkaido salamander (Hynobius retardatus).2015

    • 著者名/発表者名
      Matsunami, M., Kitano, J., Kishida, O., Michimae, H., Miura, T., and Nishimura, K.
    • 雑誌名

      Molecular Ecology

      巻: 24 ページ: 3064-3076

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Gene expression profiles in Rana pirica tadpoles following exposure to a predation threat.2015

    • 著者名/発表者名
      Mori, T., Yanagisawa, Y, Kitani Y., Sugiyama, M., Kishida, O., and Nishimura, K.
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 16 ページ: 258-274

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Histological and MS spectrometric analyses of the modified tissue of bulgy form tadpoles induced by salamander predation2012

    • 著者名/発表者名
      Tsukasa Mori
    • 雑誌名

      Biology Open

      巻: 15 号: 4 ページ: 308-317

    • DOI

      10.1242/bio2012604

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Integrative Shape Variations in Phenotypic Plasticity2015

    • 著者名/発表者名
      Kinya Nishimura
    • 学会等名
      ヨーロッパ進化生物学会
    • 発表場所
      ローザンヌ (スイス)
    • 年月日
      2015-08-09
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Adaptive dynamics in infinite-dimensional trait spaces with constraints2014

    • 著者名/発表者名
      Kinya Nishimura
    • 学会等名
      JSMB/SMB (日本数理生物学会/アメリカ数理生物学会) 合同大会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪府・大阪市)
    • 年月日
      2014-07-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Modularity of polyphonic developmental reaction norm2013

    • 著者名/発表者名
      Kinya Nishimura
    • 学会等名
      European Society of Evolutionary Biology
    • 発表場所
      Lisbon, Portugal
    • 年月日
      2013-08-19 – 2013-08-24
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptome analysis of predator- and prey-induced phenotypic plasticity in the Hokkaido Salamander (Hynobius retardants)2013

    • 著者名/発表者名
      Matsunami, M., Kishida, O., Kitano, J., Michimae, H., Miura, T., and Nishimura, K.
    • 学会等名
      European Society of Evolutionary Biology
    • 発表場所
      Lisbon, Portogal
    • 年月日
      2013-08-19
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Preconditioned reaction norm of developmental phenotypic plasticity2011

    • 著者名/発表者名
      Nishimura, K.
    • 学会等名
      ヨーロッパ進化学会
    • 発表場所
      チュービンゲン大学 (ドイツ)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] エゾサンショウウオ幼生の可塑的形態の形態測定学的分析

    • 著者名/発表者名
      西村欣也
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      静岡県国際会議場 (静岡県静岡市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で明らかになったエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子基盤

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      静岡県国際会議場 (静岡県静岡市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析で明らかになったエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      第4回生命情報科学若手の会
    • 発表場所
      基礎生物学研究所 (愛知県岡崎市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] トランスクリプトーム解析によるエゾサンショウウオの表現型可塑性の分子機構の解明

    • 著者名/発表者名
      松波雅俊
    • 学会等名
      ゲノム・遺伝子相関研究会
    • 発表場所
      エクシブ琵琶湖 (滋賀県米原市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2013-05-15   更新日: 2019-07-29  

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