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クロマチン構造変換に導く核内受容体関連蛋白質の構造基盤

研究課題

研究課題/領域番号 23247016
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関公益財団法人国際高等研究所

研究代表者

森川 耿右  公益財団法人国際高等研究所, チーフリサーチフェロー (80012665)

連携研究者 津中 康央  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 特任講師 (40551552)
深川 竜郎  国立遺伝学研究所, 分子遺伝研究系, 教授 (60321600)
安藤 敏夫  金沢大学, 数物科学系, 教授 (50184320)
真柳 浩太  九州大学, 生体防御医学研究所, 助教 (50418571)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
48,490千円 (直接経費: 37,300千円、間接経費: 11,190千円)
2013年度: 15,340千円 (直接経費: 11,800千円、間接経費: 3,540千円)
2012年度: 15,600千円 (直接経費: 12,000千円、間接経費: 3,600千円)
2011年度: 17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
キーワード核内受容体 / クロマチン / 構造生物学 / 発現制御
研究概要

環境変化に応答する遺伝子発現制御機構の最上流に位置する核内受容体について、真核生物のクロマチンの基本構成単位であるヌクレオソームとの相互作用の構造基盤を得ることを目的として研究を行った。その結果、ヌクレオソームが強い障壁として働き、核内受容体の標的配列への特異的な結合が妨げられることが判明した。この事実は、核内受容体と応答配列の結合には、クロマチンリモデリングが必須であることを示唆している。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (12件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Mutational and Structural Analyses of Caldanaerobius polysaccharolyticus Man5B Reveal Novel Active Site Residues for Family 5 Glycoside Hydrolases2013

    • 著者名/発表者名
      Takuji Oyama, George E Schmitz, Dylan Dodd, Yejun Han, Alanna Burnett, Naoko Nagasawa, Roderick I Mackie, Haruki Nakamura, Kosuke Morikawa, & Isaac Cann
    • 雑誌名

      PLoS ONE.

      巻: 8 号: 11 ページ: e80448-e80448

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0080448

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phosphorylation-coupled Intramolecular Dynamics of Unstructured Regions in Chromatin Remodeler FACT2013

    • 著者名/発表者名
      M.Hashimoto, N.Kodera, Y.Tsunaka, M.Oda, M.Tanimoto, T.Ando, K.Morikawa, and S.Tate
    • 雑誌名

      Biophys. J.

      巻: 104 号: 10 ページ: 2222-2234

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2013.04.007

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 生体内代謝をモニターする転写システム : 核内受容体 PPARγによる転写を介した代謝ネットワーク間のクロストーク2013

    • 著者名/発表者名
      白木拓磨, 和久剛, 森川耿右
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 第85巻 ページ: 749-761

    • NAID

      10031202187

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Design and synthesis of a series of a-benzyl phenylpropanoic acid-type peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) gamma partial agonists with improved a queous solubility.2013

    • 著者名/発表者名
      Masao Ohashi, et.al.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med Chem.

      巻: 21 号: 8 ページ: 2319-2332

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2013.02.003

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 生体内代謝をモニターする転写システム:核内受容体PPARγによる転写を介した代謝ネットワーク間のクロストーク2013

    • 著者名/発表者名
      白木 拓磨, 和久 剛, 森川 耿右
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 85 ページ: 749-761

    • NAID

      10031202187

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] "CENP-T-W-S-X Forms a Unique Centromeric Chromatin Structure with a Histone-like Fold."2012

    • 著者名/発表者名
      Nishino T, Takeuchi K, Gascoigne, KT, Suzuki A, Hori T, Oyama T, Morikawa K, Cheeseman IM, Fukagawa T
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 148 号: 3 ページ: 487-501

    • DOI

      10.1016/j.cell.2011.11.061

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure-based mutational study of an archaeal DNA ligase towards improvement of ligation activity.2012

    • 著者名/発表者名
      Tanabe, M.
    • 雑誌名

      ChemBioChem.

      巻: 13 号: 17 ページ: 2575-2582

    • DOI

      10.1002/cbic.201200336

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bidirectional fluorescence properties of pyrene-based peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) α/δ dual agonist.2012

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Ban 他7名
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 20 号: 11 ページ: 3460-3464

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2012.04.015

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] "Spindle microtubules generate tension-dependent changes in the distribution of inner kinetochore proteins."2011

    • 著者名/発表者名
      Suzuki A, Hori T, Nishino T, Usukura J, Miyagi A, Morikawa K, Fukagawa T
    • 雑誌名

      J. Cell Biol

      巻: 193 号: 1 ページ: 125-140

    • DOI

      10.1083/jcb.201012050

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Architectures of archaeal GINS complexes, essential DNA replication initiation factors2011

    • 著者名/発表者名
      Takuji Oyama, Sonoko Ishino, Seiji Fujino, Hiromi Ogino, Tsuyoshi Shirai, Kouta Mayanagi, Mihoko Saito, Naoko Nagasawa, Yoshizumi Ishino, & Kosuke Morikawa
    • 雑誌名

      BMC Biol.

      巻: 9 号: 1 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1006/jsbi.1999.4174

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detecting structural similarity of ligand interactions in the lipid metabolic system including enzymes, lipid-binding proteins and nuclear receptors2011

    • 著者名/発表者名
      Clara Shionyu-Mitsuyama, Tsuyoshi Waku, Takuma Shiraki, Takuji Oyama, Tsuyoshi Shirai, & Kosuke Morikawa
    • 雑誌名

      Protein Eng Des Sel.

      巻: 24 号: 4 ページ: 397-403

    • DOI

      10.1093/protein/gzq121

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Architectures of archaeal GINS complexes, essential DNA replication initiation factors2011

    • 著者名/発表者名
      Oyama, T., et al
    • 雑誌名

      BMC Biology

      巻: 9 号: 1 ページ: 28-28

    • DOI

      10.1186/1741-7007-9-28

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structural basis for the activation of the nuclear receptor, PPARgamma, by fatty acid-and serotonin metabolites2012

    • 著者名/発表者名
      和久剛、白木琢磨、大山拓次、塩生くらら、森川耿右
    • 学会等名
      第85回日本生化学大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場マリンメッセ福岡
    • 年月日
      2012-12-15
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] in-cell NMRを用いた脂肪酸結合タンパク質FABP4の機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      森戸昭等、猪股晃介、森川耿右、杤尾豪人、白川昌宏
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会トーク
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 核内受容体PPARγリガンド結合ドメインと含窒素6員環を持つPPARγ特異的アゴニストの複合体結晶構造2011

    • 著者名/発表者名
      大山拓次、和久剛、大橋雅生、宮地弘幸、森川耿右
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会ポスター
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 核内受容体 PPARγの機能解析 : 分子生物学的アプローチと生化学的アプローチ2011

    • 著者名/発表者名
      白木拓磨、五十嵐和彦、森川耿右
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      国立京都国際会館
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 核内受容体PPARγの機能解析:分子生物学的アプローチと生化学的アプローチ2011

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨、五十嵐和彦、森川耿右
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      国立京都国際会館(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 単粒子解析によるDNA複製の制御機構の研究2011

    • 著者名/発表者名
      真柳浩太、清成信一、西田洋一、齊藤美保子、神田大輔、石野良純、白井剛、森川耿右
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会ポスター
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク
    • 年月日
      2011-06-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 核内受容体PPARγリガンド結合ドメインと新規PPARγ特異的アゴニストの複合体結晶構造2011

    • 著者名/発表者名
      大山拓次、和久剛、大橋雅生、宮地弘幸、森川耿右
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会ポスター
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク
    • 年月日
      2011-06-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 脊椎動物動原体構成因子CENP-S/X、CENP-T/W複合体の構造細胞生化学と溶液動態解析2011

    • 著者名/発表者名
      西野達哉、鈴木應志、竹内康造、堀哲也、宮城篤、大山拓次、森川耿右、深川竜郎
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会ポスター
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク
    • 年月日
      2011-06-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 脂質結合系のタンパク質構造の共進化2011

    • 著者名/発表者名
      塩生くらら、和久剛、白木琢磨、大山拓次、白井剛、森川耿右
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会ワークショップ
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク
    • 年月日
      2011-06-07
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 脂質結合系のタンパク質構造の共進化2011

    • 著者名/発表者名
      塩生くらら、和久剛, 白木琢磨、大山拓次, 白井剛、森川耿右
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会ワークショップ
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for the activation of the nuclear receptor, PPARgamma, by fatty acid-and serotonin metabolites.

    • 著者名/発表者名
      Waku, T., Shiraki, T., Oyama, T., Shionyu, C. & Morikawa, K.
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡、福岡
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The Synergistic Stimulation of the MCM Activity by Cdc6/Orc1 and GINS Homotetramer from the Archaeon,Thermoplasma Acidophilum.

    • 著者名/発表者名
      2. Ogino, H., Ishino, S., Mayanagi, K., Oyama, T., Shiraki, T., Morikawa, K., Haugland, G. T., Birkeland, N-K. & Ishino, Y.
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡、福岡
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2023-03-16  

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