| 研究課題/領域番号 |
23300084
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
感性情報学・ソフトコンピューティング
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| 研究機関 | 東京工業大学 |
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研究代表者 |
山村 雅幸 東京工業大学, 総合理工学研究科(研究院), 教授 (00220442)
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| 連携研究者 |
坂本 健作 独立行政法人理化学研究所, チームリーダー (50240685)
染谷 博司 東海大学, 情報理工学部, 講師 (00333518)
小宮 健 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助教 (20396790)
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| 研究期間 (年度) |
2011-04-01 – 2014-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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| 配分額 *注記 |
20,410千円 (直接経費: 15,700千円、間接経費: 4,710千円)
2013年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2012年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2011年度: 10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円)
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| キーワード | ウェットGA / 進化計算 / タンパク質工学 / 最適化 / 高度並列GA / ウェットＧＡ / 高度並列ＧＡ |
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| 研究概要 |
生命にアイデアを得た進化計算の応用を通じて培われた探索戦略を分子上に実装したウェットGA を提案し、タンパク質tyrRS の基質改変をテストベッドとして、12 世代の理想的な集団分布の推移を実現した。適応度地形の特徴をモデル化し、探索が１つの局所解からはじめられる進化計算の効果的な世代交代モデルに従って実際に進化させた。各世代の変異体のシーケンスを全解読し、変異の蓄積分布を分析した。並列度の高い計算機アーキテクチャーを前提とした新しい進化計算の理論を考案した。
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