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遠隔ゲノム部位間の相互作用におけるII型DNAトポイソメラーゼの役割

研究課題

研究課題/領域番号 23310133
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 ゲノム生物学
研究機関岡山大学

研究代表者

筒井 研  岡山大学, 医歯(薬)学総合研究科, 名誉教授 (70108158)

研究分担者 宮地 まり  岡山大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (50349255)
細谷 修  岡山大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (90304310)
佐野 訓明  岡山大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (00294405)
筒井 公子  岡山大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (70144748)
桑野 良三  新潟大学, 脳研究所, 教授 (20111734)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
20,410千円 (直接経費: 15,700千円、間接経費: 4,710千円)
2013年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
2011年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円)
キーワード遺伝子 / ゲノム / 酵素 / 発現制御 / 発生・分化 / 発生 / 分化
研究概要

本研究では、神経細胞の終末分化過程でトポイソメラーゼIIβ(トポIIβ)とSP120が標的とするゲノム部位を、新世代シークエンサーで網羅的に同定することによって、この時期に特徴的な遺伝子発現の調節機構を探り、以下の結果を得た。①トポIIβは一群の遺伝子の転写を、促進と抑制の両方向に調節している。②トポIIβが制御する遺伝子は特徴あるゲノムポジションを占めている。③トポIIβの作用点の一つ(Ts3)は終末分化における遺伝子発現で重要な役割を持つことが示唆された。④Ts3と重なるSP120結合サイトは核内の共局在部位としても同定された。⑤Ts3はトポIIβを介する遠隔相互作用部位そのものである。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (30件) (うち招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] The CENP-O complex requirement varies among different cell types.2014

    • 著者名/発表者名
      Kagawa, N., Hori, T., Hoki, Y., Hosoya, O., Tsutsui, K., Saga, Y., Sado, T., and *Fukagawa, T.
    • 雑誌名

      Chrom. Research

      巻: in press 号: 3 ページ: 293-303

    • DOI

      10.1007/s10577-014-9404-1

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Behavior tests and immunohistochemical retinal response analyses in RCS rats with subretinal implantation of Okayama-University-type retinal prosthesis2013

    • 著者名/発表者名
      Alamusi, Matsuo T., Hosoya O., Tsutsui K.M., Uchida T
    • 雑誌名

      Journal of Artificial Organs

      巻: 16 号: 3 ページ: 343-351

    • DOI

      10.1007/s10047-013-0697-1

    • NAID

      120005526620

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Resveratrol Inhibited Hydroquinone-induced Cytotoxicity in Mouse Primary Hepatocytes.2012

    • 著者名/発表者名
      (Wang DH), Otsuki Y, Fujita H, Miyazaki M, Yie Q, Tsutsui K, Sano K, Masuoka N, Ogino K.
    • 雑誌名

      Int J Environ Res & Public Health

      巻: 9 号: 9 ページ: 3354-3364

    • DOI

      10.3390/ijerph9093354

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear protein LEDGF/p75 recognizes supercoiled DNA by a novel DNA-binding domain2011

    • 著者名/発表者名
      Tsutsui, K.M., Sano, K., Hosoya, O., Miyamoto, T., Tsutsui, K
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 39 (12) ページ: 5067-5081

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear protein LEDGF/p75 recognizes supercoiled DNA by a novel DNA-binding domain2011

    • 著者名/発表者名
      Tsutsui, K.M.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 39 ページ: 5067-5081

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] II 型DNA トポイソメラーゼの核内動態と遺伝子制御 (シンポジウム : 細胞核内構造体の構築原理と高次生命機能)2013

    • 著者名/発表者名
      筒井研
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA トポイソメラーゼIIβによる遺伝子制御と核構造2013

    • 著者名/発表者名
      古田良平
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] II型DNAトポイソメラーゼの核内動態と遺伝子制御 (シンポジウム:細胞核内構造体の構築原理と高次生命機能)2013

    • 著者名/発表者名
      筒井 研
    • 学会等名
      第86回 日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] SBP75の選択的DNA高次構造認識2013

    • 著者名/発表者名
      佐野訓明、山崎和彦、筒井公子、筒井 研
    • 学会等名
      第86回 日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβのC末端領域による酵素反応制御機構の解析2013

    • 著者名/発表者名
      河野真二、加藤佑梨、小野田彰久、木山和子、池田正五、筒井公子、筒井 研
    • 学会等名
      第86回 日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβによる遺伝子制御と核構造2013

    • 著者名/発表者名
      古田良平、宮地まり、佐野訓明、細谷 修、筒井公子、筒井 研
    • 学会等名
      第36回 日本分子生物学会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] II型DNAトポイソメラーゼによる神経特異的遺伝子の発現制御機構2013

    • 著者名/発表者名
      宮地まり、佐野訓明、古田良平、細谷 修、筒井公子、筒井 研
    • 学会等名
      第12回 細胞核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      ホテルおかだ(神奈川県足柄下郡箱根町)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] DNA 高次構造と遺伝子発現制御バイオメディカル研究部門セミナー2012

    • 著者名/発表者名
      筒井研
    • 発表場所
      産業技術総合研究所(筑波
    • 年月日
      2012-12-26
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA トポイソメラーゼIIβによる遠隔ゲノム部位間の相互作用と遺伝子発現制御2012

    • 著者名/発表者名
      古田良平
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡(福岡県)
    • 年月日
      2012-12-11
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Induced Expression of Neuroal Genes in Terminal Differentiation : Essential Roles of DNA Topoisomerase Iibeta2012

    • 著者名/発表者名
      Tsutsui, K.M
    • 学会等名
      BIT's 3rd Annual World Congress of NeuroTalk-2012
    • 発表場所
      Beijing International Convention Center, Beijing, China
    • 年月日
      2012-05-20
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Induced Expression of Neuroal Genes in Terminal Differentiation: Essential Roles of DNA Topoisomerase IIbeta.2012

    • 著者名/発表者名
      Tsutsui, K.M., Miyaji, M., Sano, K., Furuta, R., Tsutsui, K.
    • 学会等名
      BIT’s 3rd Annual World Congress of NeuroTalk-2012.
    • 発表場所
      Beijing International Convention Center, Beijing, China
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RG-domain of hnRNP U/SAF-A/SP120 is Essential for Its MAR-specific DNA-binding Activity.2012

    • 著者名/発表者名
      Miyaji, M., Furuta, R., Tsutsui, K.M., Tsutsui, K.
    • 学会等名
      BIT’s 3rd Annual World Congress of NeuroTalk-2012.
    • 発表場所
      Beijing International Convention Center, Beijing, China
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] DNA Topoisomerase IIbeta Mediates Distal Genomic Interactions in Terminal differentiation of Neurons.2012

    • 著者名/発表者名
      Furuta, R., Miyaji, M., Sano, K., Tsutsui, K.M., Tsutsui, K.
    • 学会等名
      BIT’s 3rd Annual World Congress of NeuroTalk-2012.
    • 発表場所
      Beijing International Convention Center, Beijing, China
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβはC末端領域にある新規ドメインを介してRNAにより制御されている2012

    • 著者名/発表者名
      小野田彰久、木山和子、細谷修、佐野訓明、筒井 研、筒井公子
    • 学会等名
      第35回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡(福岡県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβによる遠隔ゲノム部位間の相互作用と遺伝子発現制御2012

    • 著者名/発表者名
      古田良平、宮地まり、佐野訓明、筒井公子、筒井研
    • 学会等名
      第35回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡(福岡県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] SP120/SAF-A/hnRNP UのMAR認識機構とDNA構造変化2012

    • 著者名/発表者名
      宮地 まり、古田良平、筒井公子、筒井研
    • 学会等名
      第35回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡(福岡県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] II型トポイソメラーゼによる遠隔ゲノム部位間の相互作用2012

    • 著者名/発表者名
      古田良平、宮地まり、佐野訓明、筒井公子、筒井 研
    • 学会等名
      第30回 染色体ワークショップ・第11回 細胞核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] II型トポイソメラーゼによる核内構造変化と遺伝子発現制御2012

    • 著者名/発表者名
      宮地まり、古田良平、佐野訓明、細谷 修、筒井公子、筒井 研
    • 学会等名
      第30回 染色体ワークショップ・第11回 細胞核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 人工合成ペプチドの超らせんDNAへの選択的結合2011

    • 著者名/発表者名
      佐野訓明
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2011-12-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβのRNAによる活性調節と核内局在変化2011

    • 著者名/発表者名
      木山和子
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 核マトリックスタンパク質SP120/SAF-A/hnRNP Uの新たなMAR特異的DNA結合領域の同定2011

    • 著者名/発表者名
      宮地まり
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 網膜視細胞の終末分化におけるDNAトポイソメラーゼIIβの役割2011

    • 著者名/発表者名
      細谷修
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] DNAトポイソメラーゼIIβによる遠隔ゲノム部位間の相互作用2011

    • 著者名/発表者名
      古田良平
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] トポイソメラーゼIIβは離れたゲノム部位の間ではたらくか2011

    • 著者名/発表者名
      古田良平
    • 学会等名
      第10回細胞核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      北広島、北海道
    • 年月日
      2011-10-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptional Induction of Neuronal Genes by Targeted Action of DNA Topoisomerase Iiβ2011

    • 著者名/発表者名
      Tsutsui, K.
    • 学会等名
      Advances in DNA Topoisomerase and Chromosome Dynamics
    • 発表場所
      Academia Sinica (Taipei)
    • 年月日
      2011-10-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] hnRNP UはXist RNA局在制御を通じてX染色体不活性化に関与する2011

    • 著者名/発表者名
      長谷川優子
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都市)(シンポジウム)
    • 年月日
      2011-09-21
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Regulatory roles of DNA topoisomerase IIβin the developing cerebellar neurons2011

    • 著者名/発表者名
      Tsutsui, K.M.
    • 学会等名
      Fourth International Congress of the Society for Research on the Cerebellum
    • 発表場所
      東京大学山上会館(東京都)
    • 年月日
      2011-09-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptional Induction of Neuronal Genes by Targeted Action of DNA Topoisomerase II・2011

    • 著者名/発表者名
      Tsutsui, K.M.
    • 学会等名
      Advances in DNA Topoisomerase and Chromosome Dynamics
    • 発表場所
      Academia Sinica, Taipei, Taiwan
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA トポイソメラーゼIIβによる遠隔ゲノム部位間の相互作用2011

    • 著者名/発表者名
      古田良平
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA高次構造と遺伝子発現制御

    • 著者名/発表者名
      筒井 研
    • 学会等名
      バイオメディカル研究部門セミナー
    • 発表場所
      産業技術総合研究所(茨城県)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Catalase gene mutant mice; Acatalasemic and hypocatalasemin mice. In “Advances in Medicine and Biology”2013

    • 著者名/発表者名
      Wang, D.H., Ogino, K., Tsutsui, K., Sano, K., Masuoka, N., Sugiyama, H., Miyazaki, M., Fujita, H., Taketa, K., Ogata, M.
    • 出版者
      NOVA Science publishers, Inc., New York
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://nbgp.med.okayama-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://nbgp.med.okayama-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [産業財産権] 負の超らせんDNA 結合ドメイン2013

    • 発明者名
      筒井研,他3名
    • 権利者名
      国立大学法人, 岡山大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 取得年月日
      2013-09-27
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2019-07-29  

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