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ヘテロクロマチン構造の確立と維持を制御する分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 23370004
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 遺伝・ゲノム動態
研究機関名古屋市立大学 (2012-2013)
独立行政法人理化学研究所 (2011)

研究代表者

中山 潤一  名古屋市立大学, システム自然科学研究科, 准教授 (60373338)

連携研究者 林 亜紀  独立行政法人理化学研究所, クロマチン動態研究チーム, 研究員 (80399534)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2013年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2012年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
2011年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
キーワード遺伝子 / 発現制御 / ヘテロクロマチン / RNA干渉 / 分裂酵母 / RNAi / ユビキチン化
研究概要

本研究では、真核生物の染色体機能やエピジェネティックな遺伝子発現制御に重要なヘテロクロマチンが、どのように確立・維持されるのか、そのメカニズムの解明を目指した。クロマチン研究の優れたモデルである分裂酵母を用いた遺伝学的なスクリーニングによって、新規RNAi関連因子としてErs1とDsh1を単離し、詳細な解析からそれらがRNAi経路のエフェクター複合体をリクルートし、siRNAの産生を促進することでヘテロクロマチン形成に関与している事を明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (46件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 12件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (22件) (うち招待講演 4件) 図書 (10件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Biochemical and structural properties of heterochromatin protein 1: understanding its role in chromatin assembly.2014

    • 著者名/発表者名
      Nishibuchi G, Nakayama J
    • 雑誌名

      J Biochem

      巻: 56 号: 1 ページ: 11-20

    • DOI

      10.1093/jb/mvu032

    • NAID

      40020124382

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Spt6 prevents transcription-coupled loss of posttranslationally modified histone H3.2013

    • 著者名/発表者名
      Kato H, Okazaki K, Iida T, Nakayama J, Murakami Y, Urano T.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 3 号: 1 ページ: 2186-2186

    • DOI

      10.1038/srep02186

    • NAID

      120006539377

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single Cell Visualization of Yeast Gene Expression Shows Correlation of Epigenetic Switching Between Multiple Heterochromatic Regions Through Multiple Generations2013

    • 著者名/発表者名
      Yasunobu Mano, Tetsuya J. Kobayashi, Jun-ichi Nakayama, Hiroyuki Uchida, Masaya Oki
    • 雑誌名

      Plos Biology

      巻: 11 号: 7 ページ: e1001601-e1001601

    • DOI

      10.1371/journal.pbio.1001601

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] C-terminus of the Sgf73 subunit of SAGA and SLIK is important for retention in the larger complex and for heterochromatin boundary function.2013

    • 著者名/発表者名
      Kamata K, Hatanaka A, Goswami G, Shinmyozu K, Nakayama JI, Urano T, Hatashita M, Uchida H, Oki M.
    • 雑誌名

      Genes cells

      巻: 9 号: 9 ページ: 823-837

    • DOI

      10.1111/gtc.12075

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ヘテロクロマチン構造の形成とRNAサイレンシング2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 85 ページ: 565-570

    • NAID

      10031190087

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel RNAi protein, Dsh1, assembles RNAi machinery on chromatin to amplify heterochromatic siRNA2012

    • 著者名/発表者名
      Kawakami K, Hayashi A, Nakayama J, & Murakami Y
    • 雑誌名

      Genes Dev

      巻: 26 号: 16 ページ: 811-1824

    • DOI

      10.1101/gad.190272.112

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intrinsic Nucleic Acid-Binding activity of Chp1 Chromodomain Is Required for Heterochromatic Gene Silencing2012

    • 著者名/発表者名
      Ishida M, Shimojo H, Hayashi A, Kawaguchi R, Ohtani Y, Uegaki K, Nishimura Y, Nakayama J
    • 雑誌名

      Mol Cell

      巻: 47 号: 2 ページ: 228-241

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2012.05.017

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two different RFC proteins, Ctf18 and RFC1 separately control PCNA-CRL4Cdt2-mediated Cdt1 proteolysis during S phase and following UV-irradiation2012

    • 著者名/発表者名
      Shiomi Y, Ishii T, Hayashi A, Shinmyozu K, Nakayama J, Sugasawa K, & Nishitani H
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol

      巻: 32 号: 12 ページ: 2279-88

    • DOI

      10.1128/mcb.06506-11

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Heterochromatin protein 1 homologue Swi6 acts in concert with Ers1 to regulate RNAi-directed heterochromatin assembly2012

    • 著者名/発表者名
      Hayashi, A., Ishida, M., Kawaguchi, R., Urano, T., Murakami, Y., Nakayama, J-I.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: (印刷中) 号: 16 ページ: 6159-64

    • DOI

      10.1073/pnas.1116972109

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA and epigenetic silencing : Insight from fission yeast2012

    • 著者名/発表者名
      Derek Goto
    • 雑誌名

      Development, Growth & Differentiation

      巻: 54 号: 1 ページ: 129-141

    • DOI

      10.1111/j.1440-169x.2011.01310.x

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fub1p, a novel protein isolated by boundary screening, binds the proteasome complex2011

    • 著者名/発表者名
      Hatanaka A, Chen B, Sun JQ, Mano Y, Funakoshi M, Kobayashi H, Ju Y, Mizutani T, Shinmyozu K, Nakayama J, Miyamoto K, Uchida H, & Oki M
    • 雑誌名

      Genes Genet Syst

      巻: 86 ページ: 305-314

    • NAID

      10030209843

    • URL

      https://www.jstage.jst.go.jp/article/ggs/86/5/86_5_305/_article

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Roles of fission yeast Grc3 protein in ribosomal RNA processing and heterochromatic gene silencing2011

    • 著者名/発表者名
      Jun-ichi Nakayama
    • 雑誌名

      The Journal of biological chemistry

      巻: 286 号: 17 ページ: 15391-402

    • DOI

      10.1074/jbc.m110.201343

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fub1p, a novel protein isolated by boundary screening, binds the proteasome complex2011

    • 著者名/発表者名
      Hatanaka A, Chen B, Sun J-Q, Mano Y, Funakoshi M, Kobayashi H, Ju Y, Mizutani T, Shimyozu K, Nakayama J, Miyamoto K, Uchida H, Oki M
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 86 号: 5 ページ: 305-314

    • DOI

      10.1266/ggs.86.305

    • NAID

      10030209843

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Posttranslational modifications of HP1 regulate its function in heterochromatin formation2014

    • 著者名/発表者名
      中山潤 一
    • 学会等名
      Keystone Symposia "Chromatin mechanisms and cell physiology"
    • 発表場所
      Oberstdorf Haus(ドイツ, オーベルストドルフ)
    • 年月日
      2014-03-25
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ヘテロクロマチンタンパク質HP1 による高次クロマチン構造形成の分子機構2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      平成25年度遺伝研研究会
    • 発表場所
      国立遺伝学研究所(静岡県三島市)
    • 年月日
      2013-10-17
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ヘテロクロマチンタンパク質HP1 による高次クロマチン構造形成のメカニズム2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2013-09-12
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Roles of chromodomain proteins in higher-order chromatin assembly2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      エピジェネティクス国際シンポジウム
    • 発表場所
      グランディア芳泉(福井県あわら市)
    • 年月日
      2013-09-02
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 分裂酵母ヘテロクロマチン形成におけるChp1 の役割2012

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第29回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      ホテルニュー水戸屋(仙台市)
    • 年月日
      2012-01-26
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 分裂酵母ヘテロクロマチン形成におけるChp1の役割2012

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第29回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      仙台市
    • 年月日
      2012-01-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ヒストン脱メチル化酵素RBP2 と相互作用する因子の探索と転写調節における役割の解明2012

    • 著者名/発表者名
      西淵剛平
    • 学会等名
      第6回エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      学術総合センター(東京都千代田区)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ヒストン脱メチル化酵素RBP2 と相互作用する因子の探索と転写調節における役割の解明2012

    • 著者名/発表者名
      西淵剛平
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 分裂酵母の遺伝子サイレンシングにおけるクロモドメインタンパク質の役割2012

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 分裂酵母の遺伝子サイレンシングにおけるクロモドメインタンパク質の役割2012

    • 著者名/発表者名
      中山 潤一
    • 学会等名
      第35回 日本分子生物学会年
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒストン脱メチル化酵素RBP2と相互作用する因子の探索と転写調節における役割の解明2012

    • 著者名/発表者名
      西淵 剛平
    • 学会等名
      第35回 日本分子生物学会年
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ヒストン脱メチル化酵素RBP2と相互作用する因子の探索と転写調節における役割の解明2012

    • 著者名/発表者名
      西淵 剛平
    • 学会等名
      第6回 エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      学術総合センター(東京都千代田区)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Roles of chromodomain proteins in higher-order chromatin assembly2011

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Roles of chromodomain proteins in higher-order chromatin assembly2011

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜市(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 高次クロマチン構造の形成と維持の分子機構2011

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第62回染色体学会年会
    • 発表場所
      神奈川大学(神奈川県平塚市)
    • 年月日
      2011-11-12
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 高次クロマチン構造の形成と維持の分子機構2011

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第62回染色体学会年会
    • 発表場所
      横浜市(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Roles of chromodomain proteins in RNAi-directed heterochromatin assembly2011

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第6回国際分裂酵母学会
    • 発表場所
      ボストン(アメリカ)
    • 年月日
      2011-06-30
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Roles of chromodomain proteins in RNAi-directed heterochromatin assembly2011

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第6回国際分裂酵母学会
    • 発表場所
      ボストン(アメリカ)(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-30
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Roles of chromodomain proteins in higher-order chromatin assembly

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      エピジェネティクス国際シンポジウム
    • 発表場所
      グランディア芳泉(福井県あわら市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヘテロクロマチンタンパク質HP1による高次クロマチン構造形成のメカニズム

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      第86回 日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヘテロクロマチンタンパク質HP1による高次クロマチン構造形成の分子機構

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      平成25年度遺伝研研究会
    • 発表場所
      国立遺伝学研究所(静岡県三島市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Posttranslational modifications of HP1 regulate its function in heterochromatin formation

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 学会等名
      Keystone Symposia "Chromatin mechanisms and cell physiology"
    • 発表場所
      Oberstdorf Haus(ドイツ、オーベストドルフ)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] エピジェネティクスキーワード事典2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一, 他
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] エピジェネティクス2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一, 他
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] 染色体と細胞核のダイナミクス2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一, 他
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] ヘテロクロマチン構造の形成とサイレンシング2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤 一
    • 出版者
      日本生化学会生化学
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] 染色体と細胞核のダイナミクス(第6章 ヘテロクロマチン)2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 総ページ数
      15
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] エピジェネティクス(第4章 ヒストンのアセチル化制御)2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 総ページ数
      17
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] エピジェネティクスキーワード事典(第5章ヒストンのアセチル化)2013

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 総ページ数
      9
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] 実験医学2012年9月号「ヘテロクロマチン構造からみる非コードDNA と染色体」2012

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] ヘテロクロマチンタンパク質HP12011

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 出版者
      生体の科学
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] 高次クロマチン構造とノンコーディングRNA2011

    • 著者名/発表者名
      中山潤一
    • 出版者
      秀潤社, 細胞工学
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~jnakayam/

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2011-04-06   更新日: 2019-07-29  

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