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コケ植物主要分類群の系統関係を明らかにするための葉緑体ゲノム系統学の展開

研究課題

研究課題/領域番号 23370045
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関広島大学

研究代表者

出口 博則  広島大学, 理学(系)研究科(研究院), 特任教授 (60117017)

研究分担者 山口 富美夫  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60244290)
坪田 博美  広島大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (10332800)
嶋村 正樹  広島大学, 大学院・理学研究科, 助教 (00432708)
榊原 恵子  広島大学, 大学院・理学研究科, 特任助教 (90590000)
連携研究者 倉林 敦  広島大学, 大学院・理学研究科, 助教 (00327701)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
18,590千円 (直接経費: 14,300千円、間接経費: 4,290千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2012年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
2011年度: 10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
キーワードコケ植物 / 葉緑体ゲノム / 分子系統 / 分類 / 進化 / 系統 / 分類学
研究概要

7種のセン類,2種のタイ類,1種のツノゴケ類を含む,10種類のコケ植物について,葉緑体ゲノムの全塩基配列を新たに決定した.これまで,セン類は,タイ類やツノゴケ類と比べ,葉緑体ゲノムの構造が大きく異なっていると考えられていたが,セン類の系統基部に位置する分類群では,タイ類やツノゴケ類と非常によく似た葉緑体ゲノム構造をもつことが分かった.進化を通じておきたいくつかの遺伝子の欠失イベントは,セン類の主要分類群の分岐順序を考える上で有効な系統マーカーとなることが示唆された。
高等植物の葉緑体で知られる,線状ゲノム分子,多量体ゲノム分子がコケ植物にも存在することを初めて明らかにした.

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 学会発表 (15件)

  • [学会発表] セン類ヨツバゴケとアリノオヤリの交雑に関する遺伝学的解析2013

    • 著者名/発表者名
      大西弥真人・ 山口富美夫・ 嶋村正樹
    • 学会等名
      日本蘚苔類学会第42回大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2013-08-06
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] クモノスゴケの葉緑体ゲノムの構造2013

    • 著者名/発表者名
      友岡秀文・ 嶋村正樹・ 山口富美夫・ 出口博則
    • 学会等名
      日本蘚苔類学会第42回大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2013-08-06
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] クモノスゴケの葉緑体ゲノムの構造2013

    • 著者名/発表者名
      友岡秀文・嶋村正樹・山口富美夫・出口博則
    • 学会等名
      日本蘚苔類学会第42回大会
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] セン類ヨツバゴケとアリノオヤリの交雑に関する遺伝学的解析2013

    • 著者名/発表者名
      大西弥真人・山口富美夫・嶋村正樹
    • 学会等名
      日本蘚苔類学会第42回大会
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] セン類イシヅチゴケの葉緑体ゲノム構造2012

    • 著者名/発表者名
      定光淳・ 嶋村正樹・ 榊原恵子・ 山口登美夫・ 出口博則
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路
    • 年月日
      2012-09-16
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] The complete chloroplast genome sequences of four early divergent mosses : Takakia lepidozioides (Takakiopsida) , Sphagnum palustre (Sphagnopsida) , Andreaea nivalis (Andreaeopsida) and Oedipodium griffithianum (Oedipodiopsida)2012

    • 著者名/発表者名
      Sadamitsu, A. , Kosugi, I. , Sakakibara, K. , Tsubota, H. , Yamaguchi, T. , Deguchi, H. & Shimamura, M
    • 学会等名
      Third International Symposium on Molecular Systematics of Bryophytes
    • 発表場所
      NY, USA
    • 年月日
      2012-06-16
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体遺伝子大規模データセットに基づくセン類の分子系統解析2012

    • 著者名/発表者名
      定光淳・ 坪田博美・ 嶋村正樹・ 榊原恵子・ 山口登美夫・ 出口博則
    • 学会等名
      日本植物分類学会第11回大会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2012-03-24
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] セン類イシヅチゴケの葉緑体ゲノム構造2012

    • 著者名/発表者名
      定光淳、嶋村正樹、榊原恵子、坪田博美、山口富美夫、出口博則
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The complete chloroplast genome sequences of four early divergent mosses: Takakia lepidozioides (Takakiopsida), Sphagnum palustre (Sphagnopsida), Andreaea nivalis (Andreaeopsida) and Oedipodium griffithianum (Oedpodiopsida).2012

    • 著者名/発表者名
      Sadamitsu, A., Kosugi, I., Sakakibara, K., Tsubota, H., Yamaguchi, T., Deguchi, H. & Shimamura, M.
    • 学会等名
      moss 2012
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体ゲノム構造からみたコケ植物セン類の系統関係2011

    • 著者名/発表者名
      定光淳・ 小杉一誠・ 嶋村正樹・ 山口富美夫・ 出口博則
    • 学会等名
      日本植物学会第75回大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2011-08-17
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] コケ植物セン類の葉緑体ゲノム構造の多様性2011

    • 著者名/発表者名
      小杉一誠・ 定光淳・ 嶋村正樹・ 山口富美夫・ 出口博則
    • 学会等名
      日本蘚苔類学会第40回大会
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      2011-08-09
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] コケ植物セン類の葉緑体ゲノム構造の多様性2011

    • 著者名/発表者名
      小杉一誠・定光淳・嶋村正樹・山口富美夫・出口博則
    • 学会等名
      日本蘚苔類学会第40回大会
    • 発表場所
      奈良県川上村
    • 年月日
      2011-08-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Phylogenetic position of the Takakiopsida (Bryophyta) inffered from comparative chloroplast genomics2011

    • 著者名/発表者名
      Sadamitsu, A., Shimamura, M., Yamaguchi, T., Deguchi, H.
    • 学会等名
      XVIII International Botanical Congress
    • 発表場所
      メルボルン,オーストラリア
    • 年月日
      2011-07-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Chloroplast genome sequencing of the moss, Andreaea nivalis2011

    • 著者名/発表者名
      Kosugi, I., Shimamura, M., Yamaguchi, T., Deguchi, H.
    • 学会等名
      XVIII International Botanical Congress
    • 発表場所
      メルボルン,オーストラリア
    • 年月日
      2011-07-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Chloroplast genome structure of a primitive moss, Sphagnum palustre (Bryophyta) : DNA sequencing and direct observation of single molecules2011

    • 著者名/発表者名
      Shimamura, M., Sadamitsu, A., Yamaguchi, T., Deguchi, H.
    • 学会等名
      XVIII International Botanical Congress
    • 発表場所
      メルボルン,オーストラリア
    • 年月日
      2011-07-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2019-12-27  

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