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国際標準SNPシステムの構築に基づくアジア在来家畜集団の遺伝的多様性解析と保全策

研究課題

研究課題/領域番号 23380165
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用動物科学
研究機関神戸大学

研究代表者

万年 英之  神戸大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (20263395)

研究分担者 笹崎 晋史  神戸大学, 大学院・農学研究科, 准教授 (50457115)
西堀 正英  広島大学, 大学院・生物圏科学研究科, 准教授 (80237718)
下桐 猛  鹿児島大学, 農学部, 准教授 (40315403)
本多 健  神戸大学, 大学院・農学研究科, 助教 (10432551)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
18,590千円 (直接経費: 14,300千円、間接経費: 4,290千円)
2013年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2012年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2011年度: 9,750千円 (直接経費: 7,500千円、間接経費: 2,250千円)
キーワードアジア / 在来家畜 / SNP / ゲノム / 遺伝的多様性 / 多様性
研究概要

本課題では、国際標準となりうるSNPシステムをウシ、ブタ、ニワトリおよびヤギにおいて構築し、アジア在来家畜に対する遺伝的多様性解析を目的とした。最終的に、ウシでは121SNP、ブタでは101SNP、ニワトリでは76SNP、ヤギでは58SNPからなるSNPシステムを構築した。このSNPシステムを用いてアジア在来4家畜種の遺伝的多様性解析を行った結果、品種や地域分岐、遺伝的混在程度を明らかにし、アジア在来家畜の遺伝的多様性維持には、本研究で示したような遺伝的指標を用いて評価される地域・希少系統を保持することが重要であるとの結論を得た。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2014 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 12件) 学会発表 (17件)

  • [雑誌論文] Identification of quantitative trait loci affecting economic traits based on divergently selected regions between beef and dairy cattle2013

    • 著者名/発表者名
      Yamaji K, Hosokawa D, Ishii AI, Oyama K, Mannen H, Sasazaki S
    • 雑誌名

      Livestock Science

      巻: 155 号: 2-3 ページ: 180-185

    • DOI

      10.1016/j.livsci.2013.05.017

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic diversity and structure in Asian native goat analyzed by newly-developed SNP markers2013

    • 著者名/発表者名
      Lin BZ, Kato T, Kaneda M, Matsumoto H, Sasazaki S, Mannen H
    • 雑誌名

      Anim. Sci. J

      巻: 84(8) 号: 8 ページ: 579-584

    • DOI

      10.1111/asj.12039

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular phylogeography and genetic diversity of East Asian goats2013

    • 著者名/発表者名
      Lin BZ, Odahara S, Ishida M, Kato T, Sasazaki S, Nozawa K, Mannen H
    • 雑誌名

      Anim Genet

      巻: 44(1) 号: 1 ページ: 79-85

    • DOI

      10.1111/j.1365-2052.2012.02358.x

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 兵庫県黒毛和種肥育集団における経済形質関連遺伝子の効果2013

    • 著者名/発表者名
      大倉一輝・秋山敬孝・吉田恵実・福島護之・岩本英治・岡章生・松本大和・笹崎晋史・大山憲二・万年英之
    • 雑誌名

      日本畜産学会報

      巻: 84 ページ: 157-162

    • NAID

      10031177467

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic diversity of Myanmar and Indonesia native chickens together with two jungle fowl species by using 102 indels polymorphisms.Asian-Aust2012

    • 著者名/発表者名
      Maw AA, T. Shimogiri, Riztyan, K. Kawabe, Y. Kawamoto, S. Okamoto
    • 雑誌名

      J. Anim. Sci

      巻: 25(7) 号: 7 ページ: 927-934

    • DOI

      10.5713/ajas.2011.11511

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DigiTag2 法を用いたブタSNPs 解析システムの構築とその分子系統解析への応用2012

    • 著者名/発表者名
      西堀正英, 澤田裕紀子, 庭田 悟, 下桐 猛, 安江 博
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 20 ページ: 17-20

    • URL

      http://dnapol.umin.jp/

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The SNPs in the ACACA gene are effective on fatty acid composition in Holstein milk.2012

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto H, Sasaki K, Bessho T, Kobayashi E, Abe T, Sasazaki S, Oyama K, Mannen H
    • 雑誌名

      Mol Biol Rep

      巻: 39 号: 9 ページ: 8637-8644

    • DOI

      10.1007/s11033-012-1718-5

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic diversity of Myanmar and Indonesia native chickens together with two jungle fowl species by using 102 indels polymorphisms2012

    • 著者名/発表者名
      Maw AA, Shimogiri T, Riztyan, Kawabe K, Kawamoto Y, Okamoto S
    • 雑誌名

      Asian-Australasian Journal of Animal Science

      巻: 25 ページ: 927-934

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DigiTag2法を用いたブタSNPs解析システムの構築とその分子系統解析への応用2012

    • 著者名/発表者名
      西堀正英・澤田裕紀子・庭田 悟・下桐 猛・安江 博
    • 雑誌名

      DNA 多型

      巻: 20 ページ: 17-20

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of divergently selected regions between Japanese Black and Holstein cattle using bovine 50k SNP array2012

    • 著者名/発表者名
      Hosokawa D, Ishii A, Yama j i K, Sasazaki S, Oyama K, Mannen H
    • 雑誌名

      Animal Science Journal

      巻: 83 号: 1 ページ: 7-13

    • DOI

      10.1111/j.1740-0929.2011.00927.x

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Allele Frequencies of gene polymorphisms related to economic trait in Bos taurus and Bos indicus cattle breeds2011

    • 著者名/発表者名
      Kaneda M, Lin BZ, Sasazaki S, Oyama K, Mannen H
    • 雑誌名

      Animal Science Journal

      巻: 82 号: 6 ページ: 717-721

    • DOI

      10.1111/j.1740-0929.2011.00910.x

    • NAID

      10030566664

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of discrimination markers between Japanese domestic and imported beef2011

    • 著者名/発表者名
      Sasazaki S, Hosokawa D, Ishihara R, Aihara H, Oyama K, Mannen H
    • 雑誌名

      Anim. Sci. J

      巻: 82 号: 1 ページ: 67-72

    • DOI

      10.1111/j.1740-0929.2010.00820.x

    • NAID

      10030375399

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Genetic diversity and relationship among 16 Asian and European cattle populations using 121 autosomal SNPs genotypes by the DigiTag2 assay2014

    • 著者名/発表者名
      Yonesaka R, Sasazaki S, Yasue H, Niwata S, Mukai F, Mannen H
    • 学会等名
      34th International Conference on Animal Genetics
    • 発表場所
      Xian, China
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Paternal genetic structure of Asian goats using SRY gene2014

    • 著者名/発表者名
      Waki A, Sasazaki S, Kobayashi E, Mannen H
    • 学会等名
      34th International Conference on Animal Genetics
    • 発表場所
      Xian, China
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Genetic diversity and relationship among 16 Asian and European cattle populations using 121 autosomal SNPs genotypes by the DigiTag2 assay2014

    • 著者名/発表者名
      Yonesaka R, Sasazaki S, Yasue H, Niwata S, Mukai F, Mannen H
    • 学会等名
      34nd International Conference on Animal Genetics
    • 発表場所
      Xian, China
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] SRY 遺伝子を用いたアジア在来家畜ヤギの多様性解析2013

    • 著者名/発表者名
      脇 愛生, 笹崎晋史, 万年 英之
    • 学会等名
      第116回日本畜産学会大会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2013-03-30
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] DigiTag2 法を用いたブタおよびイノシシのSNP 解析システムの構築とその分子系統解析2012

    • 著者名/発表者名
      浜田秀一, 大西諒貴, 庭田悟, 下桐猛, 小林栄治, 安江博, 西堀正英
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2012-10-06
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実績報告書
  • [学会発表] プーリング法を用いた高密度SNP解析による黒毛和種閉鎖集団の遺伝的多様性の評価2012

    • 著者名/発表者名
      加藤大樹・松本大和・笹崎晋史・秋山敬孝・吉田恵実・福島護之・万年英之
    • 学会等名
      第115回日本畜産学会大会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 年月日
      2012-03-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 分子遺伝学から見たアジア在来牛の起源・系統史研究2012

    • 著者名/発表者名
      万年英之
    • 学会等名
      日本動物遺伝育種学会・在来家畜研究会合同シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Genetic diversity and structure in goat analyzed by newly-developed SNPs2012

    • 著者名/発表者名
      Mannen H, Lin BZ, Kato T, Kaneda M, Matsumoto M, Sasazaki S
    • 学会等名
      33rd International Conference on Animal Genetics
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Evaluation of genetic diversity in Japanese Black cattle population using SNP-MaP strategy2012

    • 著者名/発表者名
      Kato T, H Matsumoto, S Sasazaki, T Akiyama, M Fukushima, E Yoshida, T Nomura, H Mannen
    • 学会等名
      33rd International Conference on Animal Genetics
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Genotyping of genes responsible for 7 defective traits in Japanese Black by the DigiTag2 assay2012

    • 著者名/発表者名
      Yasue H, Shimogiri T, Niwata S, Nishibori M, Mannen H
    • 学会等名
      33rd International Conference on Animal Genetics
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Genotyping of genes responsible for 7 defective traits in Japanese Black by the DigiTag2 assay2012

    • 著者名/発表者名
      Yasue Y, Shimogiri T, Niwata S, Nishibori M, Mannen H
    • 学会等名
      International Society of Animal Genetics
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Genetic diversity and structure in goat analyzed by newly-developed SNPs2012

    • 著者名/発表者名
      Mannen H, B.Z. Lin, T. Kato, M. Kaneda, H. Matsumoto, S. Sasazaki
    • 学会等名
      International Society of Animal Genetics
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 兵庫県黒毛和種肥育集団における経済形質関連遺伝子の遺伝構造2011

    • 著者名/発表者名
      大倉一輝、松本大和、秋山敬孝、吉田恵実、福島護之、笹崎晋史、万年英之
    • 学会等名
      第12回日本動物遺伝育種学会大会
    • 発表場所
      広島大学(広島県)
    • 年月日
      2011-11-19
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] DigiTag2アッセイを用いたウシ個体識別及び親子鑑定システムの確立2011

    • 著者名/発表者名
      梶山亮介, 原 和弘, 笹崎 晋史, 松本 大和, 安江博, 向井文雄, 万年英之
    • 学会等名
      第61回関西畜産学会大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2011-09-12
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] DigiTag2アッセイを用いたウシ個体識別及び親子鑑定システムの確立2011

    • 著者名/発表者名
      梶山亮介・原和弘・笹崎晋史・松本大和・安江博・向井文雄・万年英之
    • 学会等名
      第61回関西畜産学会大会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県)
    • 年月日
      2011-09-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 黒毛和種閉鎖集団における形質関連遺伝子頻度の経時的変化2011

    • 著者名/発表者名
      加藤大樹・松本大和・笹崎晋史・秋山敬孝・吉田恵実・福島護之・万年英之
    • 学会等名
      第61回関西畜産学会大会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県)
    • 年月日
      2011-09-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Development of DNA markers associated with beef quality2011

    • 著者名/発表者名
      Mannen, H.
    • 学会等名
      The Role of Agriculture and Natural Resources on Global Changes
    • 発表場所
      Chiang Mai, Thailand(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-04-06   更新日: 2019-07-29  

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