メタゲノム遺伝子の網羅的発現を目指した大腸菌宿主の開発

• 研究課題/領域番号: 23380197
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 環境農学
• 研究機関: 独立行政法人産業技術総合研究所
• 研究代表者: 宮崎 健太郎 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 研究グループ長 (60344123)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 19,890千円 (直接経費: 15,300千円、間接経費: 4,590千円); 2013年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円); 2012年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円); 2011年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
• キーワード: メタゲノム / バイオテクノロジー / 大腸菌 / ゲノム育種 / リボソーム工学 / 16S rRNA / 翻訳 / リボソーム / 宿主 / 機能改変 / 遺伝子発現 / 異宿主発現 / レポーターアッセイ / 翻訳開始因子 / 発現バイアス / 進化工学 / 開始コドン

研究概要

本課題では、様々な微生物由来の遺伝子を均等発現する大腸菌宿主を創成することを目標に、開始コドンやORF内部の翻訳律速要因の特定と、翻訳開始因子IF3、リボソームの改良による発現改良を試みた。その結果、異種IF3等による開始コドン変異体の発現亢進、16S rRNA置換変異により創成された変異リボソームを含む大腸菌により、翻訳特性を改変できることを見出した。今後は,実メタゲノムを用いたスクリーニングに応用展開していく予定である。

研究成果

• [雑誌論文] Bacterial cellular engineering by genome editing and gene silencing (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakashima N, Miyazaki K
  • 雑誌名: Int J Mol Sci 巻: 15 ページ: 2773-2793
  • 査読あり
• [雑誌論文] 16S rRNAの「水平伝播」-異種16S rRNAによる遺伝的相補- (2014)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 佐藤 允治, 宮崎 健太郎
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: 52-2 ページ: 70-72
• [雑誌論文] New insights into the catalytic active-site structure of multicopper oxidases. (2014)
  • 著者名/発表者名: Komori H, Sugiyama R, Kataoka K, Miyazaki K, Higuchi Y, Sakurai T
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 巻: 70 号: 3 ページ: 772-779
  • DOI: 10.1107/s1399004713033051
  • NAID: 120005451980
  • 査読あり
• [雑誌論文] 16SrRNAの「水平伝播」―異種16SrRNAによる遺伝的相補― (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎、佃 美雪、佐藤 允治
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: 52 ページ: 70-72
  • 査読あり
• [雑誌論文] Revisiting bacterial phylogeny : Natural and experimental evidence for horizontal gene transfer of 16S rRNA (2013)
  • 著者名/発表者名: Kitahara K, Miyazaki K
  • 雑誌名: Mob Genet Elements 巻: 3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metagenomic screening for aromatic compound-responsive transcriptional regulators (2013)
  • 著者名/発表者名: Uchiyama T, Miyazaki K
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of a novel β-glucosidase from a compost microbial metagenome with strong transglycosylation activity (2013)
  • 著者名/発表者名: Uchiyama T, Miyazaki K, Yaoi K
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 288 ページ: 18325-18334
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cloning, expression and characteristics of a novel alkalistable and thermostable xylanase encoding gene (mxyl) retrieved from compost-soil metagenome (2013)
  • 著者名/発表者名: Verma D, Kawarabayasi Y, Miyazaki K, Satyanarayana T
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Directed evolution study unveiling key sequence factors that affect translation efficiency in Escherichia coli (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsukuda M, Miyazaki K
  • 雑誌名: J Biosci Bioeng 巻: 116 ページ: 540-545
  • NAID: 110009685200
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA fragmentation caused by an overdose of Zeocin (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsukuda M, Miyazaki K
  • 雑誌名: J Biosci Bioeng 巻: 116 ページ: 644-646
  • NAID: 110009685220
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meeting Report : 1st International Functional Metagenomics Workshop (2013)
  • 著者名/発表者名: Engel K, Ashby D, Brady SF, Cowan DA, Doemer J, Edwards EA, Fiebig K, Martens EC, McCormac D, Mead DA, Miyazaki K, Moreno-Hagelsieb G, O'Gara F, Reid A, Rose DR, Simonet P, Sjöling S, Smalla K, Streit WR, Tedman-Jones J, Valla S, Wellington EMH, Wu C-C, Liles MR, Neufeld JD, Sessitsch A, Charles TC
  • 雑誌名: St. Jacobs, Ontario, Canada. Stand Genomic Sci 巻: 8 ページ: 106-111
• [雑誌論文] Metagenomic screening for aromatic compound-responsive transcriptional regulators. (2013)
  • 著者名/発表者名: Uciyama T, Miyazaki K
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 8 号: 9 ページ: e75795-e75795
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0075795
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA fragmentation caused by an overdose of Zeocin. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsukuda M, Miyazaki K
  • 雑誌名: J Biosci Bioeng 巻: 116 号: 5 ページ: 644-646
  • DOI: 10.1016/j.jbiosc.2013.05.004
  • NAID: 110009685220
  • 査読あり
• [雑誌論文] Directed evolution study unveiling key sequence factors that affect translation. efficiency in Escherichia coli. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsukuda M, Miyazaki K
  • 雑誌名: J Biosci Bioeng 巻: 116 号: 5 ページ: 540-545
  • DOI: 10.1016/j.jbiosc.2013.05.013
  • NAID: 110009685200
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of a novel β-glucosidase from a compost microbial metagenome with strong transglycosylation activity. (2013)
  • 著者名/発表者名: Uchiyama T, Miyazaki K, Yaoi K
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 288 号: 25 ページ: 18325-18334
  • DOI: 10.1074/jbc.m113.471342
  • 査読あり
• [雑誌論文] Direct electron transfer to a metagenome-derived laccase fused to affinity tags near the electroactive copper site. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsujimura S, Asahi M, Goda-Tsutsumi M, Shirai O, Kano K, Miyazaki K
  • 雑誌名: Phys Chem Chem Phys 巻: 15 号: 47 ページ: 20585-20589
  • DOI: 10.1039/c3cp53096e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meeting Report: 1st International Functional Metagenomics Workshop May 7–8, 2012, St. Jacobs, Ontario, Canada (2013)
  • 著者名/発表者名: Engel K, Ashby D, Brady SF, Cowan DA, Doemer J, Edwards EA, Fiebig K, Martens EC, McCormac D, Mead DA, Miyazaki K, Moreno-Hagelsieb G, O'Gara F, Reid A, Rose DR, Simonet P, Sjöling S, Smalla K, Streit WR, Tedman-Jones J, Valla S, Wellington EMH, Wu C-C, Liles MR, Neufeld JD, Sessitsch A, Charles TC
  • 雑誌名: Standards in Genomic Sciences 巻: 8 号: 1 ページ: 106-111
  • DOI: 10.4056/sigs.3406845
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cloning, expression and characteristics of a novel alkalistable and thermostable xylanase encoding gene (Mxyl) retrieved from compost-soil metagenome. (2013)
  • 著者名/発表者名: Verma D
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 8 号: 1 ページ: e52459-e52459
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0052459
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutational robustness of 16S ribosomal RNA, shown by experimental horizontal gene transfer in Escherichia coli (2012)
  • 著者名/発表者名: Kitahara K, Yasutake Y, Miyazaki K
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: 109 ページ: 19200-19225
  • 査読あり
• [雑誌論文] リボソームに翻訳以外の機能を発見 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 雑誌名: 産総研TODAY 巻: 12 ページ: 20-20
• [雑誌論文] Mutational robustness of 16S ribosomal RNA, shown by experimental horizontal gene transfer in Escherichia coli. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kitahara K
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: 109 号: 47 ページ: 19220-19225
  • DOI: 10.1073/pnas.1213609109
  • 査読あり
• [雑誌論文] リボソームに翻訳以外の機能がある ―リボヌクレアーゼ作用阻害 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎健太郎
  • 雑誌名: 生体の科学 巻: 63 ページ: 356-357
• [雑誌論文] リボソームに翻訳以外の機能を発見：16S rRNA ヘリックス41によるリボヌクレアーゼT2の阻害 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎健太郎
  • 雑誌名: 産総研TODAY 巻: 12 ページ: 20-20
• [雑誌論文] Specific inhibition of bacterial RNase T2 by helix 41 of 16S ribosomal RNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Kitahara K, Miyazaki K
  • 雑誌名: Nat Commun 巻: 2 号: 1 ページ: 549-549
  • DOI: 10.1038/ncomms1553
  • 査読あり
• [雑誌論文] メタゲノムからの有用酵素の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 雑誌名: 月刊 Bio Industry 巻: 28 ページ: 32-38
• [雑誌論文] メタゲノムからの有用酵素の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎健太郎
  • 雑誌名: 月刊BioIndustry 巻: 28 ページ: 32-38
• [学会発表] Ribosomal RNA の人工水平伝播による大腸菌宿主デザイン (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 日本農芸化学会大会 2014
  • 発表場所: 神奈川県
  • 年月日: 2014-03-29
• [学会発表] メタゲノム手法は培養法を凌駕するのか : 遺伝子資源取得に際しての手法間の比較 (2014)
  • 著者名/発表者名: 末永 光, 水田 志織, 宮崎 健太郎, 矢追 克郎
  • 学会等名: 日本農芸化学会2014年度大会
  • 発表場所: 神奈川県
  • 年月日: 2014-03-28
• [学会発表] 腸内細菌目の16S rRNAの網状進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 允治, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第8回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2014-03-07
• [学会発表] Functional metagenomics and Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: Kasetsart university Seminar
  • 発表場所: Bangkok, Thailand
  • 年月日: 2014-02-21
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: AMBC2014
  • 発表場所: Bangkok, Thailand
  • 年月日: 2014-02-20
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 学会等名: AMBC 2014
  • 発表場所: Bangkok International Trade & Exhibition Centre (Bangkok, Thailand)
  • 招待講演
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 学会等名: Kasetsart University Seminar
  • 発表場所: Kasetsart University (Bangkok,Thailand)
  • 招待講演
• [学会発表] メタゲノム手法は培養法を凌駕するのか:遺伝子資源取得に際しての手法間の比較 (2014)
  • 著者名/発表者名: 末永 光、水田 志織、宮崎 健 太郎、矢追 克郎
  • 学会等名: 日本農芸化学会2014年度大会
  • 発表場所: 明治大学（神奈川県川崎市）
• [学会発表] リボソーマルRNAの人工水平伝播による大腸菌宿主デザイン (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健 太郎
  • 学会等名: 日本農芸化学会2014年度大会
  • 発表場所: 明治大学（神奈川県川崎市）
  • 招待講演
• [学会発表] 腸内細菌目の16S rRNAの網状進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 允治、宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第8回 日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学（東京都世田谷区）
• [学会発表] Ribosomal RNA の人工水平伝播による大腸菌宿主デザイン (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 産業微生物の力を深化させる日本の技～育種の最前線～ 我が国独自の起点・技術から
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2013-12-17
• [学会発表] アンチセンス RNA を用いた新規カウンターセレクション技術の開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 中島 信孝, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 細胞を創る研究会 6.0
  • 発表場所: 山形県
  • 年月日: 2013-11-14
• [学会発表] Ribosomal RNAの人工水平伝播による大腸菌宿主デザイン (2013)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 細胞を創る研究会 6.0
  • 発表場所: 山形県
  • 年月日: 2013-11-14
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2013)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: CBI学会2013年大会
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2013-10-28
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: Enzyme Engineering XXII Conference
  • 発表場所: 富山県
  • 年月日: 2013-09-24
• [学会発表] リボソーム工学に基づく大腸菌の宿主機能改変 (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第65回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 広島県
  • 年月日: 2013-09-19
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 2013 SIMB Annual Meeting
  • 発表場所: San Diego, USA
  • 年月日: 2013-08-12
• [学会発表] 大腸菌への遺伝子水平伝播実験により示された 16S rRNA の種間和合性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 北原 圭, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第10回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 静岡県
  • 年月日: 2013-06-20
• [学会発表] 系統ネットワーク法で見る腸内細菌目 16S rRNA の網状進化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 允治, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第2回リボソームミーティング
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2013-03-26
• [学会発表] 16S rRNA 置換変異による大腸菌宿主改良 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第2回リボソームミーティング
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2013-03-26
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 学会等名: 2013 SIMB Annual Meeting
  • 発表場所: Hotel Sheraton (San Diego, USA)
  • 招待講演
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 学会等名: Enzyme Engineering XI Conference
  • 発表場所: 富山国際会議場（富山県富山市）
• [学会発表] 大腸菌への遺伝子水平伝播実験により示された16SrRNAの種間和合性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 北原 圭、宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第10回 21世紀大腸 菌研究会
  • 発表場所: ホテル大観（静岡県伊豆市）
• [学会発表] 枯草菌グルコマンナンオペロンを利用したセルラーゼの探索方法 (2013)
  • 著者名/発表者名: 劉 生浩, 五十嵐一暁, 尾崎克也, 矢追 克郎, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第27回セルラーゼ研究会
  • 発表場所: 花王霞ヶ浦研修所（茨城県稲敷郡）
• [学会発表] 生成物阻害を受けないβ―グルコシダーゼの性状解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 内山拓, 宮崎 健太郎, 矢追 克郎
  • 学会等名: 第27回セルラーゼ研究会
  • 発表場所: 花王霞ヶ浦研修所（茨城県稲敷郡）
• [学会発表] メタゲノム由来新規β―グルコシダーゼの性状解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 内山拓, 宮崎 健太郎, 矢追 克郎
  • 学会等名: 日本応用糖質科学会平成25年度大会
  • 発表場所: 鹿児島大学（鹿児島県鹿児島市）
• [学会発表] Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery (2013)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪、宮崎 健太郎
  • 学会等名: CBI学会2013年大会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京都江戸川区）
• [学会発表] アンチセンスRNAを用いた新規カウンターセレクション技術の開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪、中島 信孝、宮崎 健太郎
  • 学会等名: 細胞を創る研究会6.0
  • 発表場所: 慶応大学（山形県鶴岡市）
• [学会発表] RibosomalRNAの人工水平伝播による大腸菌宿主デザイン (2013)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪、宮崎 健太郎
  • 学会等名: 細胞を創る研究会6.0
  • 発表場所: 慶応大学（山形県鶴岡市）
• [学会発表] Ribosomal RNAの人工水平伝播による大腸菌宿主デザイン (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: バイオインダストリー協会シンポジウム 産業微生物の力を深化させる日本の技～育種の最前線～ 我が国独自の起点・技術から
  • 発表場所: 東京大学（東京都文京区）
  • 招待講演
• [学会発表] リボソーム工学に基づく大腸菌の宿主機能改変 (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第65回 日本生物工学会大会
  • 発表場所: 広島国際会議場（広島県広島市）
  • 招待講演
• [学会発表] 系統ネットワーク法で見る腸内細菌目16S rRNAの網状進化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐藤允治
  • 学会等名: 第2回リボソームミーティング
  • 発表場所: 東京農工大学（東京都）
• [学会発表] 16S rRNA置換変異による大腸菌宿主改良 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佃美雪
  • 学会等名: 第2回リボソームミーティング
  • 発表場所: 東京農工大学（東京都）
• [学会発表] メタゲノム由来新奇βーグルコシダーゼの性状解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 内山拓
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学（宮城県）
• [学会発表] β-グルコシダーゼのグルコース阻害耐性と基質特異性における構造基盤 (2013)
  • 著者名/発表者名: 城俊徳
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学（宮城県）
• [学会発表] 16S rRNA の置換変異による大腸菌宿主デザイン (2012)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 「細胞を創る」研究会 5.0
  • 発表場所: 神奈川県
  • 年月日: 2012-11-21
• [学会発表] メタゲノムからの有用遺伝子探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 次世代シーケンス東京セミナー・メタゲノムセミナー
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2012-10-25
• [学会発表] 16SリボソームRNAのへリックス41はリボヌクレアーゼIの特異的インヒ ビターである (2012)
  • 著者名/発表者名: 北原 圭, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第9回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 滋賀県
  • 年月日: 2012-06-21
• [学会発表] Functional screening strategy (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: International Functional Metagenomics Workshop
  • 発表場所: Waterloo, Canada
  • 年月日: 2012-05-07
• [学会発表] Functional screening strategy (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎健太郎
  • 学会等名: International Functional Metagenomics Workshop
  • 発表場所: Stone Crock（カナダ）
  • 招待講演
• [学会発表] メタゲノムからの有用遺伝子探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎健太郎
  • 学会等名: 次世代シーケンス東京セミナー・メタゲノムセミナー
  • 発表場所: 秋葉原UDX（東京都）
  • 招待講演
• [学会発表] 16SリボソームRNA のへリックス41はリボヌクレアーゼ I の特異的インヒビターである (2012)
  • 著者名/発表者名: 北原圭
  • 学会等名: 第9回 21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 長浜バイオ大学（滋賀県）
• [学会発表] メタゲノム由来GH1β-グルコシダーゼTd-2F2のグルコース阻害耐性の構造基盤 (2012)
  • 著者名/発表者名: 城俊徳
  • 学会等名: 日本応用糖質科学会平成24年度大会
  • 発表場所: 東京農工大学（東京都）
• [学会発表] 16S rRNAの置換変異による大腸菌宿主デザイン (2012)
  • 著者名/発表者名: 佃美雪
  • 学会等名: 「細胞を創る」研究会5.0
  • 発表場所: 東京工業大学（神奈川県）
• [学会発表] メタゲノムからの酵素探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神奈川県
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] メタゲノムからの酵素探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎健太郎
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)(招待講演)
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] リボソーム改変を起点とした微生物システム機能の理解に向けて (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第10回微生物研究会
  • 発表場所: 千葉県
  • 年月日: 2011-11-12
• [学会発表] Diversification of cellular phenotype through ribosome engineering in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 北原 圭, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第10回微生物研究会
  • 発表場所: 千葉県
  • 年月日: 2011-11-12
• [学会発表] Diversification of cellular phenotype through ribosome engineering in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃美雪
  • 学会等名: 微生物研究会
  • 発表場所: 千葉大学(千葉県)
  • 年月日: 2011-11-12
• [学会発表] リボソーム改変を起点とした微生物システム機能の理解に向けて (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎健太郎
  • 学会等名: 微生物研究会
  • 発表場所: 千葉大学(千葉県)(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-12
• [学会発表] Creation and evolution of insertional fusion protein (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 細胞を創る研究会 4.0
  • 発表場所: 大阪府
  • 年月日: 2011-10-28
• [学会発表] Diversification of cellular phenotype through ribosome engineering in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 北原 圭, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 細胞を創る研究会4.0
  • 発表場所: 大阪府
  • 年月日: 2011-10-27
• [学会発表] Diversification of cellular phenotype through ribosome engineering in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃美雪
  • 学会等名: 細胞を創る研究会4.0
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター(大阪府)
  • 年月日: 2011-10-27
• [学会発表] Diversification of cellular phenotype through ribosome engineering in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 北原 圭, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: International Symposium on SYNTHESIZING LIFE AND BIOLOGICAL SYSTEMS
  • 発表場所: 大阪府
  • 年月日: 2011-10-25
• [学会発表] Diversification of cellular phenotype through ribosome engineering in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃美雪
  • 学会等名: International Symposium On Synthesizing Life and Biological Systems
  • 発表場所: 千里ライフサイエンスセンター(大阪府)
  • 年月日: 2011-10-25
• [学会発表] PIGEX 法のハイスループット化の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 内山 拓, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 日本生物工学会大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] メタゲノムを活用した新規酵素の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 日本生物工学会
  • 発表場所: 愛知県
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] PIGEX法のハイスループット化の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 内山拓
  • 学会等名: 日本生物工学会
  • 発表場所: 東京農工大学(東京都)
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] メタゲノムを活用した新規酵素の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮崎健太郎
  • 学会等名: 日本生物工学会
  • 発表場所: 東京農工大学(東京都)(招待講演)
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] 進化工学手法による異種蛋白質発現における翻訳律速因子の同定と発現効率化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃 美雪, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 日本蛋白質科学会
  • 発表場所: 大阪府
  • 年月日: 2011-06-08
• [学会発表] 進化工学手法による異種蛋白質発現における翻訳律速因子の同定と発現効率化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃美雪
  • 学会等名: 日本蛋白質科学会
  • 発表場所: ホテル阪急(大阪府)
  • 年月日: 2011-06-08
• [学会発表] 進化工学的手法による異種蛋白質発現における発現律速因子の同定と発現効率化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 美雪, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 第8回2世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 長野県
  • 年月日: 2011-05-19
• [学会発表] 進化工学的手法による異種蛋白質発現における発現律速因子の同定と発現効率化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佃美雪
  • 学会等名: 21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: ホテル木曽路(長野県)
  • 年月日: 2011-05-19
• [学会発表] 大腸菌翻訳開始因子 IF3 の遺伝子欠損株の作成 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岡本 玲亜, 宮崎 健太郎
  • 学会等名: 21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 長野県
  • 年月日: 2011-05-18
• [学会発表] 大腸菌翻訳開始因子IF3の遺伝子欠損株の作成 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岡本玲亜
  • 学会等名: 21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: ホテル木曽路(長野県)
  • 年月日: 2011-05-18
• [図書] Encyclopedia of Metagenomics, extradiol dioxygenases retrieved from the metagenome (2014)
  • 著者名/発表者名: Suenaga H, Miyazaki K
  • 出版者: Springer
• [図書] Diversity and Evolution of Aromatic Degradation Pathway Enzymes in an Activated Sludge (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 総ページ数: 16
  • 出版者: Springer Japan
• [図書] 進化分子工学の最前線, 生物種を超えた 16S rRNA 遺伝子の機能相補性の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 出版者: NTS
• [図書] Extradiol dioxygenases retrieved from the metagenome (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 総ページ数: 5
  • 出版者: Springer-Verlag Berlin Heidelberg
• [図書] 生体の科学, リボソームに翻訳以外の機能がある -リボヌクレアーゼ作用阻害 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 出版者: 医学書院
• [図書] 生命システム工学, 遺伝子資源の多様化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 生命システム工学, 進化分子工学の事始 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮崎 健太郎
  • 出版者: 化学同人
• [図書] METAGENOMICS and its applications in agriculture, biomedicine, and environmental studies, Exploring microbial community for novel genetic resources by activity-based screening of a metagenomic library (2011)
  • 著者名/発表者名: Suenaga H, Miyazaki K
  • 出版者: Nova Science Publishers
• [図書] Methods in Enzymology, MEGAWHOP Cloning : A method of creating random mutagenesis libraries via megaprimer PCR of whole plasmids (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 出版者: Elsevier
• [図書] Metagenomics : Current Innovations and Future Trends, Escherichia coli host engineering for efficient enzyme discovery from metagenome (2011)
  • 著者名/発表者名: Hosokawa-Okamoto R, Miyazaki K
  • 出版者: Horizon Press
• [図書] Handbook of Molecular Microbial Ecology II : Metagenomics in Different Habitats, Novel aromatic degradation pathway genes and their organization as revealed by metagenomic analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 出版者: Wiley/Blackwell
• [図書] Biodegradative Bacteria, Diversity and evolution of aromatic degradation pathway enzymes in an activated sludge (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki K
  • 出版者: Springer
• [図書] Handbok of Molecular Microbial EcologyI : Metagenomics in Diferent Habitat (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki, K.
  • 総ページ数: 11
  • 出版者: Wiley/Blackwell
• [図書] Methods in Enzymology Series. Synthetic Biology : Methods for Building and Programming Life (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki, K.
  • 総ページ数: 8
  • 出版者: Elsevier
• [図書] Metagenomics : Current Innovations and Future Trends (2011)
  • 著者名/発表者名: Okamoto-Hosokawa, R.
  • 総ページ数: 12
  • 出版者: Horizon Press
• [図書] Metagenomics andits aplications in agriculture, biomedicine, and environmental studies (2011)
  • 著者名/発表者名: Suenaga, H.
  • 総ページ数: 13
  • 出版者: Nova Science Publisher
• [備考]
  • URL: https://staff.aist.go.jp/miyazaki-kentaro/group/index.html
• [備考]
  • URL: https://unit.aist.go.jp/bpri/bpri-synthe/index.html
• [備考] 産総研 生物プロセス研究部門 合成生物工学研究グループ
  • URL: https://staff.aist.go.jp/miyazaki-kentaro/group/index.html
• [備考] 合成生物工学研究グループ【生物プロセス研究部門】
  • URL: https://unit.aist.go.jp/bpri/bpri-synthe/
• [備考] 生物種を越えた16S rRNA遺伝子の機能相補性を確認
  • URL: http://www.aist.go.jp/aist_j/press_release/pr2012/pr20121030/pr20121030.html
• [備考]
  • URL: http://staff.aist.go.jp/miyazaki-kentaro/group/index.html
• [産業財産権] 新規なカウンターセレクション法 (2013)
  • 発明者名: 佃 美雪, 中島 信孝, 宮崎 健太郎
  • 権利者名: 佃 美雪, 中島 信孝, 宮崎 健太郎
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2013-226229
  • 出願年月日: 2013-10-31
• [産業財産権] 酵素遺伝子スクリーニング法 (2013)
  • 発明者名: 内山拓, 宮崎 健太郎
  • 権利者名: 内山拓, 宮崎 健太郎
  • 産業財産権種類: 特許
  • 取得年月日: 2013-11-01
• [産業財産権] 翻訳特性の改変された大腸菌 (2013)
  • 発明者名: 宮崎健太郎、佃美雪
  • 権利者名: 産業技術総合研究所
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2013-03-13
  • 外国
• [産業財産権] 翻訳特性の改変された大腸菌 (2012)
  • 発明者名: 宮崎 健太郎, 佃 美雪
  • 権利者名: 宮崎 健太郎, 佃 美雪
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2012-102128
  • 出願年月日: 2012-04-27
• [産業財産権] 翻訳特性の改変された大腸菌 (2012)
  • 発明者名: 宮崎 健太郎, 佃 美雪
  • 権利者名: 宮崎 健太郎, 佃 美雪
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2012-03-16
  • 外国
• [産業財産権] 翻訳特性の改変された大腸菌 (2012)
  • 発明者名: 宮崎健太郎、佃美雪
  • 権利者名: 産業技術総合研究所
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2012-102128
  • 出願年月日: 2012-04-27
• [産業財産権] 翻訳特性の改変された大腸菌 (2012)
  • 発明者名: 宮崎健太郎, 佃美雪
  • 権利者名: 独立行政法人産業技術総合研究所
  • 出願年月日: 2012-03-16
  • 外国