異常スプライシングＲＮＡの網羅的同定とその意義の解明

• 研究課題/領域番号: 23510234
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 坂本 博 神戸大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (00187048)
• 研究分担者: 井上 邦夫 神戸大学, 大学院理学研究科, 教授 (40252415) ; 中井 謙太 東京大学, 医科学研究所, 教授 (60217643) ; 鈴木 穣 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: mRNA品質管理 / 生殖細胞 / エキソン連結部複合体 / 細胞質スプライシング / 線虫 / 異常スプライシング / 性決定遺伝子 / RNA品質管理 / 遺伝子 / 核酸 / ゲノム / 発現制御 / 性決定

研究概要

mRNA前駆体のスプライシング後のエキソン連結部に形成されるエキソン連結部複合体（EJC）の構成タンパク質であるY14の発現を阻害した線虫C. elegansでは、イントロンを含むスプライシング未完了RNAが細胞質に漏出することが明らかになった。さらに、これらのスプライシング未完了RNAの中には、細胞質において小胞体タンパク質IRE-1によってプロセシングを受けるものが存在することが示唆された。以上の結果は、Y14を含むEJC中核因子がイントロンを含むRNAの核外漏出を防ぐことによって、遺伝子発現の正確性を保証するゲートキーパーとしての新規機能を持つことを示唆している。

研究成果

• [雑誌論文] A specific set of EJC subunits is required for the nuclear retention of unspliced RNAs in C. elegans (2013)
  • 著者名/発表者名: Masami Shiimori, KunioInoue, Hiroshi Sakamoto
  • 雑誌名: Molecular and Cellular Biology 巻: Jan ; 33(2) 号: 2 ページ: 444-56
  • DOI: 10.1128/mcb.01298-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Developmental expression and evolution of muscle-specific microRNA s conserved in vertebrates. (2013)
  • 著者名/発表者名: Saori Tani, Shigehiro Kuralcu, Hiroshi Sakamoto, Kunio Inoue and Rie Kusakabe.
  • 雑誌名: Evolution & Development 巻: 15 号: 4 ページ: 293-304
  • DOI: 10.1111/ede.12039
  • 査読あり
• [雑誌論文] Translational inhibition by deadenylation-independent mechanisms is central to microRNA-mediated silencing in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Mishima, Y., Fukao, A., Kishimoto, T., Sakamoto, H., Fujiwara, T., Inoue, K.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 109 ページ: 1104-1109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional and direct interaction between the RNA binding protein HuD and active Akt1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, T., Fukao, A., Sasano, Y., Matsuzaki, H., Kikkawa, U., Imataka, A., Inoue, K., Endo, S., Sonenberg, N. Thoma, C., & Sakamoto, H.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 40 ページ: 1944-1953
  • 査読あり
• [雑誌論文] VAB-10 spectraplakin acts in cell and nuclear migration in Caenorhabditis elegans (2011)
  • 著者名/発表者名: Kim HS, Murakami R, Quintin S, Mori M, Ohkura K, Tamai KK, Labouesse M, Sakamoto H, Nishiwaki K.
  • 雑誌名: Development 巻: 138 ページ: 4013-4023
  • 査読あり
• [学会発表] 線虫C.elegansにおける生殖細胞形成に関与するクロモドメインタンパクMRG-1の局在機構の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 巳波孝至、高崎輝恒、坂本博
  • 学会等名: 関西地区線虫勉強会ジョイントミーティング
  • 発表場所: 関西学院大学梅田キャンパス
• [学会発表] MRG-1 acts as an epigenome interpreter of Lys36 methylation on histone H3 (2013)
  • 著者名/発表者名: Teruaki Takasaki, Thea Egelhofer, Andreas Rechtsteiner, Hiroshi Sakamoto, Susan Strome
  • 学会等名: The 19th International C.elegans Meeting
  • 発表場所: カリフォルニア大学ロサンゼルス校（アメリカ合衆国）
• [学会発表] 線虫C.elegans生殖細胞におけるスプライシング関連タンパク質リン酸化酵素SPK-1の機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 土橋匠、高崎輝恒、井上邦夫、坂本博
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2013
  • 発表場所: ラフォーレ修善寺 静岡県
• [学会発表] 線虫C.elegansにおけるRNAの輸送経路を決める機構の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 相澤理丞、井上邦夫、坂本博
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2013
  • 発表場所: ラフォーレ修善寺 静岡県
• [学会発表] 線虫C.elegansにおける生殖細胞形成に関与するクロマチンリモデリング因子群の局在機構の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 巳波孝至、高崎輝恒、井上邦夫、坂本博
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2013
  • 発表場所: ラフォーレ修善寺 静岡県
• [学会発表] 線虫C.elegans生殖細胞におけるスプライシング関連因子SPK-1の機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 土橋匠、高崎輝恒、井上邦夫、坂本博
  • 学会等名: 関西地区線虫勉強会ジョイントミーティング
  • 発表場所: 関西学院大学梅田キャンパス
• [学会発表] 線虫 EJC 中核因子 Y14はスプライシング未完了 RNA の核外輸送を防ぐ (2012)
  • 著者名/発表者名: 椎森仁美、井上邦夫、坂本博
  • 学会等名: 第14回日本 RNA 学会年会
• [学会発表] EJC core subunits have a novel gatekeeper function in mRNA quality control in the nematode C. elegans (2012)
  • 著者名/発表者名: Masami Shiimori, Kunio Inoue & Hiroshi Sakamoto
  • 学会等名: The 22th CDB Meeting - RNA Sciences in Cell and Developmental Biology II
  • 発表場所: 理研神戸CDB
• [学会発表] EJC core subunits have a novel gatekeeper function in mRNA quality control in the nematode C. elegans (2012)
  • 著者名/発表者名: Masami Shiimori, Kunio Inoue, Hiroshi Sakamoto
  • 学会等名: The 22th CDB Meeting - RNA Sciences in Cell and Developmental Biology II
  • 発表場所: 理化学研究所CDB、神戸市
• [学会発表] 線虫EJC中核因子Y１４はスプライシング未完了RNAの核外輸送を防ぐ (2012)
  • 著者名/発表者名: 椎森仁美、井上邦夫、坂本博
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東北大学百周年記念会館、仙台市
• [学会発表] 線虫 Y14はイントロンを含む未スプライシング RNA の核外輸送を防ぐ (2011)
  • 著者名/発表者名: 椎森仁美、井上邦夫、坂本博
  • 学会等名: RNA フロンティアミーティング2011
  • 発表場所: あいち健康プラザ
• [学会発表] Two EJC core subunits, Y14 and MAG-1, have a novel gatekeeper function in mRNA quality control in the nematode C. elegans (2011)
  • 著者名/発表者名: Masami Shiimori, Shunichi Wakabayashi, Yutaka Suzuki, Kenta Nakai, Kunio Inoue & Hiroshi Sakamoto
  • 学会等名: The16th annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: 京都国際会館
• [学会発表] Two EJC core subunits, Y14 and MAG-1, have a novel gatekeeper function in mRNA quality control in the nematode C. elegans (2011)
  • 著者名/発表者名: 椎森仁美
  • 学会等名: RNA2011 The16th annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: 京都国際会館
• [学会発表] 線虫Y14はイントロンを含む未スプライシングRNAの核外漏出を防ぐ (2011)
  • 著者名/発表者名: 椎森仁美
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2011
  • 発表場所: あいち健康プラザ
• [学会発表] 線虫Y14はイントロンを含む未スプライシングRNAの核外漏出を防ぐ (2011)
  • 著者名/発表者名: 坂本博
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会(招待講演)
  • 発表場所: 京都国際会館
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.edu.kobe-u.ac.jp/fsci-biol/faculty/sakamoto.html
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/