| 研究課題/領域番号 |
23510272
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(C)
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 研究分野 |
生物分子科学
|
|---|
| 研究機関 | 公益財団法人かずさＤＮＡ研究所 |
|---|
研究代表者 |
鈴木 秀幸 公益財団法人かずさＤＮＡ研究所, 産業基盤開発研究部, 主席研究員 (80276162)
|
|---|
| 連携研究者 |
尾形 善之 大阪府立大学, 大学院生命環境科学研究科, 准教授 (90446542)
明石 智義 日本大学, 生物資源科学部, 講師 (80328707)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2011 – 2013
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
|
| 配分額 *注記 |
5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2013年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2012年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
|
|---|
| キーワード | 遺伝子共発現ネットワーク解析 / EST解析 / DNAマイクロアレイ / 次世代シークエンサー / 転写因子 / アヤメ科植物 / イソフラボノイド生合成 / 不定根培養 / 遺伝子共発現ネットワーク / DNA マイクロアレイ |
|---|
| 研究概要 |
イソフラボノイド生合成経路に関与する転写因子の単離を目的として、イソフラボノイドを蓄積するアヤメ科植物であるジャーマンアイリス（Iris germanica）を対象に、次世代シークエンサーデータ（RNA-Seq）を用いてEST解析の整備を行った。また、ジャーマンアイリスの不定根培養細胞の時系列実験において、カスタムDNAアレイ解析を行った。さらに、ネットワークの描画トポロジーに注目して相関係数の閾値を自動的に決定する金平糖アルゴリズムによる遺伝子共発現ネットワーク解析ソフトを開発した。この解析ソフトを用いて、公開シロイヌナズナDNAアレイデータを用いて、ネットワーク解析の検証を行った。
|
