貝殻形態の異質性にかかるバイアスの評価と不偏な形態空間の探索

• 研究課題/領域番号: 23540549
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 層位・古生物学
• 研究機関: 静岡大学
• 研究代表者: 生形 貴男 静岡大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (00293598)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2013年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2011年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
• キーワード: 異質性 / 形態空間 / 形態測定学 / 理論形態学 / 多様性 / サンプリングバイアス

研究概要

形態的な多様性（異質性）の評価は，形態を表すパラメターが張る空間（形態空間）中における計測データの広がりによって評価されてきた．しかしながら，こうして見積もられる異質性は，解析手法に関係した様々な原因によって容易に偏る．本研究課題では，形の定量化の仕方や異質性の評価方法に関する基礎研究を進め，形態測定学的手法や異質性の尺度などの改良・新開発を行った．また，新たに考案した異質性尺度が，大量絶滅とその後の回復における選択圧の様式の評価に使える可能性を示した．

研究成果

• [雑誌論文] Wavelet analysis of ammonoid sutures (2014)
  • 著者名/発表者名: Ubukata, T., Tanabe, K., Shigeta, Y., Maeda, H & Mapes, R. H
  • 雑誌名: Paleontologica Electronica 巻: vol.17, 1.9A
  • URL: http://palaeo-electronica.org/content/2014/678-wavelet-analysis-of-sutures
  • 査読あり
• [雑誌論文] Wavelet analysis of ammonoid sutures (2014)
  • 著者名/発表者名: Ubukata, T., Tanabe, K., Shigeta, Y., Maeda, H. & Mapes, R. H.
  • 雑誌名: Palaeontologica Electronica 巻: 17
  • 査読あり
• [雑誌論文] Late Cretaceous record of large soft-bodied coleoids based on lower jaw remains from Hokkaido, Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Tanabe, K., Misaki, A. & Ubukata, T.
  • 雑誌名: Acta Palaeontologica Polonica 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional constraints on coiling geometry and aperture inclination in gastropods. (2012)
  • 著者名/発表者名: Noshita, K., Asami, T., Ubukata, T. (Noshita, K.)
  • 雑誌名: Paleobiology 巻: 38 ページ: 322-334
  • DOI: 10.5061/DRYAD.6MK023C0
  • 査読あり
• [雑誌論文] 化石表面形状の3 次元形態測定学 : イノセラムスの殻形態を例として (2012)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 雑誌名: 化石 巻: no.91 ページ: 1-2
  • NAID: 110009436881
  • URL: http://www.mediafire.com/?7gijcojaln4rtza
  • 査読あり
• [雑誌論文] 古生物異質性変動の復元に向けて：地球生命史研究の新展開 (2012)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 雑誌名: 月刊海洋 巻: 44 ページ: 287-292
• [雑誌論文] 生物のかたちの測定と比較 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 雑誌名: 化石 巻: 89 ページ: 39-54
  • NAID: 110008593539
  • 査読あり
• [学会発表] 豊富度と非類似度の比較から見たペルム紀アンモノイドの形態的異質性変動 (2013)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地質学会第119年学術大会
  • 発表場所: 東北大学, 仙台
  • 年月日: 2013-09-16
• [学会発表] 形態的差異や形態的多様性の評価の手法依存性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本数理生物学会第23回大会
  • 発表場所: 静岡大学, 浜松
  • 年月日: 2013-09-11
• [学会発表] 形態空間における形の豊富さの測度 (2013)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2013年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ国際会議場, 千葉
  • 年月日: 2013-05-24
• [学会発表] 形態的豊富度・均等度を表す異質性尺度 (2013)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会第162会例会
  • 発表場所: 横浜国立大学, 横浜
  • 年月日: 2013-01-26
• [学会発表] 古生物の系統的多様度による形態的多様性の標準化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地質学会第119年学術大会
  • 発表場所: 大阪府立大学, 堺
  • 年月日: 2012-09-15
• [学会発表] A three-dimensional morphometric method for bivalve shell form (2012)
  • 著者名/発表者名: Ubukata, T
  • 学会等名: The 34th International Geological Congress
  • 発表場所: Brisbane Convention & Exhibition Center, Brisbane
  • 年月日: 2012-08-09
• [学会発表] 異質性評価における系統サイズ効果:貝殻形態の例 (2012)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会2012年年会
  • 発表場所: 名古屋大学, 名古屋
  • 年月日: 2012-06-30
• [学会発表] 貝殻の異質性の綱を越えた比較は可能か (2012)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2012年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ国際会議場, 千葉
  • 年月日: 2012-05-23
• [学会発表] 描くためのモデルから測るためのツールへ : 巻貝の形態空間解析が低調な理由とその解決策 (2012)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会第161会例会
  • 発表場所: 群馬県立博物館, 冨岡
  • 年月日: 2012-01-21
• [学会発表] 描くためのモデルから測るためのツールへ：巻貝の形態空間解析が低調な理由とその解決策 (2012)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会第161会例会
  • 発表場所: 群馬県立博物館（富岡市）
• [学会発表] 貝殻形状の理論形態空間における疑似連関 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地質学会第118年学術大会
  • 発表場所: 茨城大学, 水戸
  • 年月日: 2011-09-11
• [学会発表] アンモノイドの殻断面形状における個体発生変異の輪郭形態測定学 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本進化学会2011年大会
  • 発表場所: 京都大学, 京都
  • 年月日: 2011-07-30
• [学会発表] 形は変わるが成長率パターンは? : アンモノイドの殻形態と殻口マップの個体発生変異 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会2011年年会
  • 発表場所: 金沢大学, 金沢
  • 年月日: 2011-07-03
• [学会発表] 理論形態空間の限界:パラメター同士の非直交性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2011年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ国際会議場, 千葉
  • 年月日: 2011-05-22
• [学会発表] 理論形態空間の限界：パラメター同士の非直交性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2011年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ（千葉市）
• [学会発表] 形は変わるが成長率パターンは?：アンモノイドの殻形態と殻口マップの個体発生変異 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会2011年年会
  • 発表場所: 金沢大学（金沢市）
• [学会発表] 貝殻形状の理論形態空間における疑似連関 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地質学会第118年学術大会
  • 発表場所: 茨城大学（水戸市）
• [学会発表] アンモノイドの殻断面形状における個体発生変異の輪郭形態測定学 (2011)
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本進化学会2011年大会
  • 発表場所: 京都大学（京都市）
• [学会発表] 形態空間における形の豊富さの速度
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2013年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ（千葉県）
• [学会発表] 地質年代単元の長さの違いが古生物多様性評価に及ぼす影響
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会2013年年会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本県）
• [学会発表] 形態的差異や形態的多様性の評価の手法依存性
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本数理生物学会第23回大会
  • 発表場所: 静岡大学（静岡県）
• [学会発表] 豊富度と非類似度の比較から見たペルム紀アンモノイドの形態的異質性変動
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地質学会第119年学術大会
  • 発表場所: 東北大学（宮城県）
• [学会発表] 貝殻の異質性の綱を越えた比較は可能か
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2012年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ国際会議場（千葉県）
• [学会発表] 異質性評価における系統サイズ効果：貝殻形態の例
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会2012年年会
  • 発表場所: 名古屋大学（愛知県）
• [学会発表] 分類学的多様度指数から見た蝦夷層群産アンモノイドの多様性
  • 著者名/発表者名: 山下修平・生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会2012年年会
  • 発表場所: 名古屋大学（愛知県）
• [学会発表] A three-dimensional morphometric method for bivalve shell form
  • 著者名/発表者名: Ubukata T.
  • 学会等名: The 34th International Geological Congress
  • 発表場所: Brisbane, Australia
• [学会発表] 古生物の系統的多様度による形態的多様性の標準化
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本地質学会第119年学術大会
  • 発表場所: 大阪府立大学（大阪府）
• [学会発表] 形態的豊富度・均等度を表す異質性尺度
  • 著者名/発表者名: 生形貴男
  • 学会等名: 日本古生物学会第162会例会
  • 発表場所: 横浜国立大学（神奈川県）
• [図書] 東大古生物学 : 化石から見る生命史, 第5 章理論形態学(分担執筆) (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐々木猛智・伊藤泰弘, 編
  • 出版者: 東海大学出版会
• [図書] 東大古生物学：化石から見る生命史 (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐々木猛智・伊藤泰弘編
  • 総ページ数: 390
  • 出版者: 東海大学出版会
• [図書] 進化学事典 (2012)
  • 著者名/発表者名: 日本進化学会編（分担執筆）
  • 総ページ数: 975
  • 出版者: 共立出版