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アンチセンスプローブを用いた生きた細胞のmRNAイメージング

研究課題

研究課題/領域番号 23570207
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関東京大学

研究代表者

岡部 弘基  東京大学, 薬学研究科(研究院), 助教 (20455398)

連携研究者 船津 高志  東京大学, 大学院薬学系研究科, 教授 (00190124)
研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2011年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードRNA / イメージング / 生細胞 / mRNA / アンチセンスプローブ / 蛍光イメージング
研究概要

本研究では、線形アンチセンスプローブを用いたmRNAのイメージングにより翻訳調節や分解の解析を目指した。まず、生細胞内でプローブが優れた結合カイネティクスを有することを発見し、ストレスを受けた際に内在性mRNAが速やかにストレス顆粒へ局在化する過程を観察した。続いて、任意のmRNAに対するプローブ開発を行った。まず、mRNAの予測二次構造を参考にして設計したプローブに対し、細胞内拡散に着目してmRNAとの結合を定量的に評価した結果、標的mRNAと結合しうる複数のプローブを得た。さらに、プローブの結合率や解離定数を定量化し、内在性GAPDH mRNAのイメージングと発現量の定量解析を行った。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (55件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (45件) (うち招待講演 19件) 図書 (6件)

  • [雑誌論文] Intracellular temperature mapping with a fluorescent polymeric thermometer and fluorescence lifetime imaging microscopy2012

    • 著者名/発表者名
      K. Okabe, N. Inada, C. Gota, Y. Harada, T. Funatsu, S. Uchiyama.
    • 雑誌名

      Nat. Commun.

      巻: 3 ページ: 705-705

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NanoPARCEL : a method for controlling cellular behavior with external light2012

    • 著者名/発表者名
      S. Murayama, B. Su, K. Okabe, A. Kishimura, M. Osada, M. Miura, T. Funatsu, K. Kataoka, M. Kato.
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 48 ページ: 8380-8382

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Environment-sensitive fluorophores with benzothiadiazole and benzoselenadiazole structures as candidate components of a fluorescent polymeric thermometer2012

    • 著者名/発表者名
      S. Uchiyama, K. Kimura, C. Gota, K. Okabe, K. Kawamoto, N. Inada, T. Yoshihara, S. Tobita.
    • 雑誌名

      Chemistry

      巻: 18 ページ: 9552-9563

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic association-dissociation and harboring of endogenous mRNAs in stress granules2011

    • 著者名/発表者名
      J. Zhang, K. Okabe, T. Tani, T. Funatsu.
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 124 ページ: 4087-4095

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Real-time monitoring of mRNA decay in living cells2014

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基,原田慶恵,船津高志
    • 学会等名
      Biophysical Society 58th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Francisco, CA(米国)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Super-resolution fluorescence imaging reveals nanoscale organization of stress granule2014

    • 著者名/発表者名
      菅原皓,岡部弘基,坂本明彦,船津高志
    • 学会等名
      Biophysical Society 58th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Francisco, CA(米国)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Real-time monitoring of mRNA decay in living cells2014

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基、原田慶恵、船津高志
    • 学会等名
      Biophysical Society 58th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Fransisco, CA(米国)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Super-resolution fluorescence imaging reveals nanoscale organization of stress granule2014

    • 著者名/発表者名
      菅原皓、岡部弘基、坂本明彦、船津高志
    • 学会等名
      Biophysical Society 58th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Fransisco, CA(米国)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 生細胞内の温度イメージング2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第17回酸素ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      弘前大学(弘前市)
    • 年月日
      2013-08-03
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生細胞内の温度計測2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第90回日本生理学会大会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(江戸川区)
    • 年月日
      2013-03-27
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Imaging of Temperature in a Living Cell2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      RSC Publishing-iCeMS Joint International Symposium Cell-Material Integration and Biomaterials Science
    • 発表場所
      京都大学(京都市)
    • 年月日
      2013-03-19
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] IMAGING OF TEMPERATURE DISTRIBUTION IN A LIVING CELL2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      Biophysical Society 57th Annual Meeting
    • 発表場所
      Philadelphia, PA, USA
    • 年月日
      2013-02-04
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 定量的蛍光イメージングによる細胞機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第3回NMMSセミナー
    • 発表場所
      東京大学(文京区)
    • 年月日
      2013-01-31
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生きた細胞内の温度イメージング2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      分子化学研究所所長招聘研究会「2020年の光分子科学を語る」
    • 発表場所
      分子科学研究所(岡崎市)
    • 年月日
      2013-01-23
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Imaging of temperature in a living cell using a fluorescent polymeric thermometer and fluorescence lifetime imaging microscopy2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基,内山聖一,稲田のりこ,原田慶恵,船津高志
    • 学会等名
      19th International Workshop on "Single Molecule Spectroscopy and Ultrasensitive Analysis in the Life Sciences"
    • 発表場所
      Berlin, Germany
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 生細胞内におけるmicroRNAのイメージング2013

    • 著者名/発表者名
      石河敏成,岡部弘基,船津高志
    • 学会等名
      日本バイオイメージング学会第22回学術集会
    • 発表場所
      東京大学(文京区)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Real-Time Monitoring of mRNA Decay in Living Cells2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      International Symposium on Nanomedicine Molecular Science 2013 (NMMS2013)
    • 発表場所
      東京大学(文京区)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 超解像イメージングにより明らかとなったストレス顆粒内mRNAの詳細分布2013

    • 著者名/発表者名
      菅原皓,岡部弘基,坂本明彦,船津高志
    • 学会等名
      日本生物物理学会第51回年会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 生細胞内におけるmicroRNAのイメージング2013

    • 著者名/発表者名
      石河敏成,岡部弘基,船津高志
    • 学会等名
      日本生物物理学会第51回年会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Real-Time Monitoring of mRNA Decay in Living Cells2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      International Symposium on Nanomedicine Molecular Science 2013 (NMMS2013)
    • 発表場所
      東京大学山上会館(文京区)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 超解像イメージングにより明らかとなったストレス顆粒内mRNAの詳細分布2013

    • 著者名/発表者名
      菅原皓、岡部弘基、坂本明彦、船津高志
    • 学会等名
      日本生物物理学会第51回年会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 生細胞内におけるmicroRNAのイメージング2013

    • 著者名/発表者名
      石河敏成、岡部弘基、船津高志
    • 学会等名
      日本生物物理学会第51回年会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 生細胞内におけるmicroRNAのイメージング2013

    • 著者名/発表者名
      石河敏成、岡部弘基、船津高志
    • 学会等名
      日本バイオイメージング学会第22回学術集会
    • 発表場所
      東京大学薬学部講堂(文京区)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 生きた細胞内の温度イメージング2012

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡市)
    • 年月日
      2012-12-14
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Imaging of temperature distribution in a living cell2012

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      日本生物物理学会第50回年会
    • 発表場所
      名古屋大学(名古屋市)
    • 年月日
      2012-09-22
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生細胞内マイクロRNAの蛍光イメージング2012

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第21回日本バイオイメージング学会学術集会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2012-08-28
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 生細胞イメージングによる生命機能解明2012

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第21回日本バイオイメージング学会学術集会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2012-08-27
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Imaging of endogenous mRNA in stress granules using linear antisense probe2012

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      FASEB Science Research Conferences
    • 発表場所
      Steamboat Springs, CO, USA
    • 年月日
      2012-06-26
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Temperature measurementin single living cells using a hydrophilic fluorescent nanogel thermometer2012

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      Biophysical Society 56th Annual Meeting
    • 発表場所
      サンディエゴ市(米国)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Real time imaging of endogenous mRNA using linear antisense probes in living cells2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      17th International Biophysics Congress
    • 発表場所
      北京市(中国)
    • 年月日
      2011-11-02
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamic association/dissociation and harboring of endogenous mRNAs in stress granules2011

    • 著者名/発表者名
      Junwei Zhang,岡部弘基
    • 学会等名
      17th International Biophysics Congress
    • 発表場所
      北京市(中国)
    • 年月日
      2011-11-02
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Real Time Imaging of Endogenous mRNA in Stress Granule Using Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      日本バイオイメージング学会第20回学術集会
    • 発表場所
      千歳科学技術大学(千歳市)
    • 年月日
      2011-09-01
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis on Dynamics of Endogenous mRNA in a Living Cells Using Linear Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      6th Tokyo RNA Club
    • 発表場所
      東京大学(文京区)
    • 年月日
      2011-06-30
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Real Time Imaging of Endogenous mRNA in Stress Granule Using Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第13回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 年月日
      2011-06-17
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis on Dynamics of Endogenous mRNA in a Living Cells Using Linear Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      6th Tokyo RNA Club(招待講演)
    • 発表場所
      東京大学(文京区)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Real Time Imaging of Endogenous mRNA in Stress Granule Using Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第13回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      京都国際会館(京都市)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Real Time Imaging of Endogenous mRNA in Stress Granule Using Antisense Probe2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      日本バイオイメージング学会第20回学術集会
    • 発表場所
      千歳科学技術大学(千歳市)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Real time imaging of endogenous mRNA using linear antisense probes in living cells2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      17th International Biophysics Congress
    • 発表場所
      北京(中国)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Dynamic association/dissociation and harboring of endogenous mRNAs in stress granules2011

    • 著者名/発表者名
      Junwei Zhang
    • 学会等名
      17th International Biophysics Congress
    • 発表場所
      北京(中国)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 生細胞内の温度イメージング

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第17回酸素ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      弘前大学医学部(弘前市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生細胞イメージングによる生命機能解明

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第21回日本バイオイメージング学会学術集会
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生細胞内マイクロRNAの蛍光イメージング

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第21回日本バイオイメージング学会学術集会
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Imaging of temperature distribution in a living cell

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      日本生物物理学会第50回年会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生きた細胞内の温度イメージング

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生きた細胞内の温度イメージング

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      分子化学研究所所長招聘研究会「2020年の光分子科学を語る」
    • 発表場所
      岡崎市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 定量的蛍光イメージングによる細胞機能解析

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第3回NMMSセミナー
    • 発表場所
      東京都文京区
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] IMAGING OF TEMPERATURE DISTRIBUTION IN A LIVING CELL

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      Biophysical Society 57th Annual Meeting
    • 発表場所
      Philadelphia, PA,USA
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Imaging of Temperature in a Living Cell

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      RSC Publishing-iCeMS Joint International Symposium Cell-Material Integration and Biomaterials Science
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生細胞内の温度計測

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 学会等名
      第90回日本生理学会大会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [図書] 観るだけでなく測る:定量的イメージングによる細胞機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 出版者
      バイオイメージング
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] 蛍光性ポリマー温度センサーを用いた生細胞内の温度測定とイメージング2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 出版者
      実験医学
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] 実験医学2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] バイオイメージング2013

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      日本バイオイメージング学会
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] 線形アンチセンスプローブを用いた生細胞内の内在性mRNAの蛍光イメージング2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 出版者
      実験医学
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] 実験医学2011

    • 著者名/発表者名
      岡部弘基
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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