ソバアレルゲンとなる１３Ｓグロブリンサブユニットの解析

• 研究課題/領域番号: 23580020
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 作物学・雑草学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 田中 朋之 (勝部 朋之 / 田中 朋之(勝部朋之)) 京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (50224473)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2011年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: ソバ / 13Sグロブリン / 反復配列

研究概要

ソバ13Sグロブリンの多様性を明らかにするために、約14万種のクローンからなるゲノムライブラリーをスクリーニングして26種のBACクローンを単離した。その中から17種の13Sグロブリン遺伝子を同定して、塩基配列を日本DNAデータバンクに登録した。13Sグロブリンのα鎖に挿入された反復配列の多くは45bpを基本単位としていたのに対し、一部の反復配列はCGGまたはAGAの3bpを余分に有しており、それらが二次構造の変化に与える影響を明らかにした。一方、自殖性の近縁種ダッタンソバを用いて、13Sグロブリンのサブユニット組成が環境条件にどのように応答するのかを解析する実験系構築を試みた。

研究成果

• [雑誌論文] "反復配列を持たない13Sグロブリン"を低減化したソバ個体の育成-0回反復サブユニットの遺伝子識別技術の開発- (2014)
  • 著者名/発表者名: 田中朋之・中川真梨子・佐野まどか・安井康夫
  • 雑誌名: 作物研究 巻: 59(印刷中)
  • URL: http://ci.nii.ac.jp/vol_issue/nels/AA12344964_ja.html
  • 査読あり
• [雑誌論文] Diversification of 13S globulins, allergenic seed storage proteins, of common buckwheat (2014)
  • 著者名/発表者名: Sano, M., Nakagawa, M., Oishi, A., Yasui, Y., Katsube-Tanaka, T
  • 雑誌名: Food Chemistry 巻: 155 ページ: 192-198
  • DOI: 10.1016/j.foodchem.2014.01.047
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tandem repeat inserts in 13S globulin subunits, the major allergenic storage protein of common (2012)
  • 著者名/発表者名: Khan, N., Takahashi, Y., Katsube-Tanaka, T
  • 雑誌名: Food Chemistry 巻: 133 号: 1 ページ: 29-37
  • DOI: 10.1016/j.foodchem.2011.12.056
  • 査読あり
• [学会発表] "反復配列を持たない13Sグロブリン遺伝子"を欠失したソバ個体の探索 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田中朋之・中川真梨子・佐野まどか・安井康夫
  • 学会等名: 近畿作物・育種研究会第175回例会
  • 発表場所: 近畿大学,和歌山
  • 年月日: 2013-07-13
• [学会発表] Allergenic protein, 13S globulin, of common buckwheat diversified by the insertion of tandem repeat (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Katsube-Tanaka
  • 学会等名: The 2013 meeting of Korean Society of Crop Science
  • 発表場所: Pyeongchang, Korea
• [学会発表] ソバ13Sグロブリン遺伝子の多様性評価 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐野まどか・中川真梨子・安井康夫・田中朋之
  • 学会等名: 日本作物学会
  • 発表場所: 鹿児島大学,鹿児島
• [学会発表] Diversity of 13S globulin genes identified in a genomic DNA library of common buckwheat (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Katsube-Tanaka, M. Sano, M. Nakagawa, Y. Yasui
  • 学会等名: The 12th International Symposium on Buckwheat
  • 発表場所: Laško, Slovenia
• [学会発表] Allergenic protein, 13S globulin, of common buckwheat diversified by the insertion of tandem repeat (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Katsube-Tanaka
  • 学会等名: 2013 meeting of Korean Society of Crop Science
  • 発表場所: Pyeongchang, Korea
• [学会発表] Diversity of 13S globulin genes identified in a genomic DNA library of common buckwheat (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Katsube-Tanaka, M. Sano, M. Nakagawa, Y. Yasui
  • 学会等名: 12th International. Symposium on Buckwheat
  • 発表場所: Lasko, Slovenia
• [学会発表] ソバ13S グロブリン遺伝子の多様性評価 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐野まどか・中川真梨子・安井康夫・田中朋之
  • 学会等名: 日本作物学会第236回講演会
  • 発表場所: 鹿児島大学，鹿児島
• [学会発表] “反復配列を持たない13Sグロブリン遺伝子”を欠失したソバ個体の探索 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田中朋之・中川真梨子・佐野まどか・安井康夫
  • 学会等名: 近畿作物・育種研究会第175回例会
  • 発表場所: 近畿大学, 和歌山
• [学会発表] ゲノムライブラリーを用いたソバ13Sグロブリンにおける反復挿入配列の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐野まどか・中川真梨子・安井康夫・田中朋之
  • 学会等名: 日本作物学会
  • 発表場所: 東北大学,仙台
• [学会発表] ゲノムライブラリーを用いたソバ13Sグロブリンにおける反復挿入配列の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐野まどか・中川真梨子・安井康夫・田中朋之
  • 学会等名: 日本作物学会
  • 発表場所: 東北大学
• [学会発表] Analysis of the major seed storage protein, 13S globulin, in common buckwheat (Fagopyrum esculentum Moench) (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Katsube-Tanaka, N. Khan, Y. Takahashi, M. Nakagawa
  • 学会等名: The 7th Asian Crop Science Conference
  • 発表場所: Bogor, Indonesia
• [学会発表] Analysis of the major seed storage protein, 13S globulin, in common buckwheat (Fagopyrum esculentum Moench). (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Katsube-Tanaka, N. Khan, Y. Takahashi, M. Nakagawa.
  • 学会等名: ACSA2011 congress
  • 発表場所: インドネシア国ボゴール
• [図書] Methods in Molecular Boilogy, vol. 984, N. Volpi and F. Maccari (Eds.), Capillary Electrophoresis of Biomolecules, Capillary electrophoresis of seed strage proteins : the separation and identification of microheterogeneous rice glutelin subunits (2013)
  • 著者名/発表者名: Katsube-Tanaka T
  • 出版者: Humana Press (Springer)
• [備考]
  • URL: http://www.kais.kyoto-u.ac.jp/japanese/