オミックス解析によるイネのいもち病侵入抵抗性関連因子の探索

• 研究課題/領域番号: 23580062
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 植物病理学
• 研究機関: 三重大学
• 研究代表者: 小林 一成 三重大学, 生命科学研究支援センター, 教授 (90205451)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2011年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: いもち病菌 / イネ / 侵入抵抗性 / 宿主特異性 / オミックス解析 / 次世代シーケンサー

研究概要

イネといもち病菌の相互関係において、侵入は宿主特異性を決定する最も重要な段階である。イネの侵入抵抗性は重要な防御応答であるが、その機構には不明な点が多い。本研究では、イネに対して病原性および非病原性のいもち病菌のゲノム構造を次世代シークエンサー解析により比較し、いもち病菌を接種したイネのトランスクリプトームおよびプロテオームを比較解析した。この結果、我々はいくつかの重要因子候補を特定することに成功した。これらの成果は、イネに強力な耐病性を付与するための基礎的知見となることが期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Microwounding is a pivotal factor for the induction of actin-dependent penetration resistance against fungal attack (2013)
  • 著者名/発表者名: Yuhko Kobayashi, Issei Kobayashi
  • 雑誌名: Planta 巻: 237 号: 5 ページ: 1187-1198
  • DOI: 10.1007/s00425-013-1837-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association studies using single nucleotide polymorphism markers developed by re-sequencing of the genomes of cultivated tomato (2013)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa K1, Fukuoka H, Matsunaga H, Kobayashi Y, Kobayashi I, Hirakawa H, Isobe S, Tabata S.
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 20 号: 6 ページ: 593-603
  • DOI: 10.1093/dnares/dst033
  • 査読あり
• [学会発表] Genome-wide changes of DNA methylation in regenerated rice lines (2014)
  • 著者名/発表者名: Furihata T., Kobayashi, Y., Yamada K., Kobayashi I
  • 学会等名: 第55回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: Univ. Toyama, (Toyama)
• [学会発表] Genome-wide changes of DNA methylation in regenerated rice lines. (2014)
  • 著者名/発表者名: Furihata T, Kobayashi Y, Yamada K, Kobayashi I
  • 学会等名: 第５５回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 富山市
• [学会発表] サイトカイニンはいもち病菌の宿主選択性を決定する (2013)
  • 著者名/発表者名: 漆崎慎吾、小林裕子、小林一成
  • 学会等名: 平成25年度日本植物病理学会大会
  • 発表場所: 岐阜市
• [学会発表] Genome-wide association study identifies agronomical trait loci in cultivated tomato (2013)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa K, Fukuoka H, Matsunaga H, Kobayashi Y, Kobayashi I, Hirakawa H, Isobe S, Tabata S
  • 学会等名: 3rd International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources
  • 発表場所: Jeju, Korea
• [学会発表] 日欧トマトF1品種の全ゲノム配列比較による網羅的SNP検索 (2013)
  • 著者名/発表者名: 福岡浩之, 大山暁男, 熊谷真彦, 伊藤龍太郎, 水野聖士, 根来里美, 布目 司, 宮武宏治, 山口博隆, 小林裕子, 片寄裕一, 沼 寿隆, 小林一成, 伊藤 剛
  • 学会等名: 日本育種学会2013年秋季大会（124回）
  • 発表場所: 鹿児島市
• [学会発表] サイトカイニンはいもち病菌の宿主選択性を決定する (2013)
  • 著者名/発表者名: 漆崎慎吾、小林裕子、小林一成
  • 学会等名: 平成２５年度日本植物病理学会大会
  • 発表場所: 岐阜市
• [学会発表] イネのいもち病圃場抵抗性遺伝子OsXK2bの単離と機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 村上竜也、小林裕子、小林一成
  • 学会等名: 平成２５年度日本植物病理学会大会
  • 発表場所: 岐阜市
• [学会発表] Omics Analysis of nonhost resistance to blast fungi in rice (2012)
  • 著者名/発表者名: Odani A., Kobayashi Y., Urushizaki S., Kobayashi I
  • 学会等名: Third International Workshop on Regional Innovation Studies (IWRIS2012)
  • 発表場所: Mie Univ. (Tsu)
• [学会発表] Activation of defense pathways by artificial manipulation of actin cytoskeleton in rice (2012)
  • 著者名/発表者名: Maeda M., Kobayashi Y., Urushizaki S., Kobayashi I
  • 学会等名: Third International Workshop on Regional Innovation Studies (IWRIS2012)
  • 発表場所: Mie Univ. (Tsu)
• [学会発表] Comparative genome structure analysis and screening of pathogenicity related genes of Magnaporthe isolates by SOLiD4 whole genome resequencing (2012)
  • 著者名/発表者名: Urushizaki S., Kobayashi Y., Kobayashi I
  • 学会等名: XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions
  • 発表場所: Kyoto International Conference Center (Kyoto)
• [学会発表] Comparative Genome Structure Analysis and Screening of Pathogenicity Related Genes of Magnaporthe Isolates by SOLiD4 Whole Genome Resequencing (2012)
  • 著者名/発表者名: Shingo Urushizaki, Yuhko Kobayashi, Issei Kobayashi
  • 学会等名: XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions, Kyoto
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] Identification and functional analysis of novel rice blast field resistance gene, OsXK2 (2012)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Murakami, Yuhko Kobayashi, Issei Kobayashi
  • 学会等名: XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] Omics Analysis of Nonhost Resistance to Blast Fungi in Rice (2012)
  • 著者名/発表者名: Ayano Odani, Yuhko Kobayashi, Shingo Urushizaki, Issei Kobayashi
  • 学会等名: Third International Workshop on Regional Innovation Studies (IWRIS2012)
  • 発表場所: Tsu
• [学会発表] Activation of Defense Pathways by Artificial Manipulation of Actin Cytoskeleton in Rice (2012)
  • 著者名/発表者名: Misa Maeda, Yuhko Kobayashi, Shingo Urushizaki, Issei Kobayashi
  • 学会等名: Third International Workshop on Regional Innovation Studies (IWRIS2012)
  • 発表場所: Tsu
• [学会発表] Identification and Functional Analysis of Novel Rice Blast Field Resistance Gene, OsXK2b (2012)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Murakami, Yuhko Kobayashi, Issei Kobayashi
  • 学会等名: Third International Workshop on Regional Innovation Studies (IWRIS2012)
  • 発表場所: Tsu
• [学会発表] Comparative genome structure analysis of Magnaporthe isolates by SOLiD whole genome resequencing (2011)
  • 著者名/発表者名: Urushizaki S., Kobayashi Y., Kobayashi I
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたいもち病菌非宿主抵抗性関連遺伝子の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 漆崎慎吾、小林裕子、小林一成
  • 学会等名: 平成23年度日本植物病理学会関西部会
  • 発表場所: 高松市
  • 年月日: 2011-10-02
• [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたいもち病菌非宿主抵抗性関連遺伝子の探索
  • 著者名/発表者名: 漆崎慎吾・小林裕子・小林一成
  • 学会等名: 平成２３年度日本植物病理学会関西部会
  • 発表場所: 高松市
• [学会発表] Comparative genome structure analysis of Magnaporthe isolates by SOLiD whole genome resequencing
  • 著者名/発表者名: Urushizaki S, Kobayashi Y, Kobayashi I
  • 学会等名: 第３４回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜市
• [学会発表] Identifcation and functional analysis of novel rice blast feld resistance gene, OsXK2b
  • 著者名/発表者名: Murakami T, Kobayashi Y, Kobayashi I
  • 学会等名: 第３４回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜市
• [学会発表] イネいもち病菌の菌糸伸長を抑制する圃場抵抗性様遺伝子の単離と機能解明
  • 著者名/発表者名: 小林一成、村上達也、小林裕子
  • 学会等名: 第１９回育種学会中部地区談話会(招待講演)
  • 発表場所: 津市