マイクロサテライト多型解析を応用したマラリア薬剤耐性アレル頻度の将来予測

• 研究課題/領域番号: 23590498
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 寄生虫学(含衛生動物学)
• 研究機関: 順天堂大学 (2012-2014); 東京女子医科大学 (2011)
• 研究代表者: 美田 敏宏 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (80318013)
• 研究期間 (年度): 2011-04-28 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2012年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: マラリア / 薬剤耐性 / 耐性遺伝子 / 予測モデル / シミュレーション / 数理モデル / 熱帯熱マラリア / 数理解析 / 耐性遺伝子頻度予測

研究成果の概要

マラリアはエイズ、結核と並ぶ世界３大感染症の一つである。グローバルな対策における最大の障壁は薬剤耐性マラリア原虫の出現と拡大である。本研究により、一点サンプリングによって得られたデータから薬剤耐性原虫の適応度が推定でき、将来耐性原虫の頻度が変化していく軌跡を予測することができるモデルを作成することができた。本解析モデルは様々な流行地に応用でき、頻回のサンプリングを必要とせずに耐性遺伝子頻度の未来予測を可能とする。

研究成果

• [雑誌論文] Patterns and dynamics of genetic diversity in Plasmodium falciparum: what past Human migrations tell us about malaria. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mita T*, Jombart, T.
  • 雑誌名: Parasitol Int. 巻: 64(3) 号: 3 ページ: 238-243
  • DOI: 10.1016/j.parint.2014.09.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Global distribution of polymorphisms associated with delayed Plasmodium falciparum parasite clearance following artemisinin treatment: genotyping of archive blood samples. (2014)
  • 著者名/発表者名: Murai K, Culleton R, Hisaoka T, Endo H, Mita T*.
  • 雑誌名: Parasitol Int. 巻: 64(3) 号: 3 ページ: 267-273
  • DOI: 10.1016/j.parint.2014.11.002
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Ordered accumulation of mutations conferring resistance to sulfadoxine-pyrimethamine in the Plasmodium falciparum parasite. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mita T*, Ohashi J, Venkatesan M, Marma AS., Plowe, CV, Tanabe, K.
  • 雑誌名: J Infect Dis 巻: 209 号: 1 ページ: 130-139
  • DOI: 10.1093/infdis/jit415
  • 査読あり
• [雑誌論文] Plasmodium falciparum: Genetic diversity and complexity of infections in an isolated village in western Thailand. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tanabe K, Zollnerc G, Vaughanc JA, Sattabongkotc J, Khuntiratc B, Honma H, Mita T, Tsuboi T, Coleman R
  • 雑誌名: Parasitol Int 巻: 未定
  • 査読あり
• [雑誌論文] Generation of Rodent Malaria Parasites with a High Mutation Rate by destructing Proofreading activity of DNA Polymerase (2014)
  • 著者名/発表者名: Honma H, Hirai M, Nakamura S, Hakimi H, Kawazu S, Palacpac N, Hisaeda H, Matsuoka H, Kawai S, Endo H, Yssunaga T, Ohashi J, Mita T, Horii T, Furusawa M, Tanabe K.
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 未定
  • 査読あり
• [雑誌論文] Plasmodium falciparum mitochondrial genetic diversity exhibits isolation-by-distance patterns supporting a sub-Saharan African origin. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tanabe K, Jombart T, Horibe S, Palacpac N, Honma H, Tachibana S, Nakamura M, Horii T, Kishinod H, Mita T*.
  • 雑誌名: Mitochondrion 巻: 13 号: 6 ページ: 630-636
  • DOI: 10.1016/j.mito.2013.08.008
  • 査読あり
• [雑誌論文] Travellers as Sentinels: Assaying the worldwide distribution of polymorphisms associated with ACT resistance in P. falciparum using malaria cases imported into Scotland. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hunja CW, Unger H, Ferreira P, Lumsden R, Morris R, Aman R, Alexander C, Mita T* & Culleton R.
  • 雑誌名: Int J Parasitol 巻: 43 号: 11 ページ: 885-889
  • DOI: 10.1016/j.ijpara.2013.07.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] A comprehensive survey of polymorphisms conferring anti-malarial resistance in Plasmodium falciparum across Pakistan. (2013)
  • 著者名/発表者名: Khattak A, Vankatesan M, Jacob C, Artimovich E, Nadeem M, Nighat F, Hombhanje F, Mita T, Malik S, Plowe C.
  • 雑誌名: Malaria J 巻: 12 号: 1 ページ: 300-300
  • DOI: 10.1186/1475-2875-12-300
  • 査読あり
• [雑誌論文] Within-population genetic diversity of Plasmodium falciparum vaccine candidate antigens reveals geographic distance from a Central sub-Saharan African origin. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tanabe K., Mita T., Palacpac N., Arisue N., Tougan T., Kawai S.,Jombart T., Kobayashi F., Horii T.
  • 雑誌名: Vaccine 巻: 31 号: 9 ページ: 1334-9
  • DOI: 10.1016/j.vaccine.2012.12.039
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale survey for novel genotypes of Plasmodium falciparum chloroquine-resistance gene pfcrt (2012)
  • 著者名/発表者名: Takahashi N, Tanabe K, Tsukahara T, Dzodzomenyo M, Dysoley L, Khamlome B, Sattabongkot J, Nakamura M, Sakurai M, Kobayashi J, Kaneko A, Endo H, Hombhanje F, Tsuboi T, Mita T
  • 雑誌名: Malaria Journal 巻: 11 号: 1 ページ: 92-92
  • DOI: 10.1186/1475-2875-11-92
  • NAID: 120006985384
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolution of <i>Plasmodium falciparum</i> drug resistance: implications for the development and containment of artemisinin resistance (2012)
  • 著者名/発表者名: Mita, T. Tanabe K
  • 雑誌名: Japanese Journal of Infectious Diseases 巻: 65 号: 6 ページ: 465-475
  • DOI: 10.7883/yoken.65.465
  • NAID: 130002588753
  • ISSN: 1344-6304, 1884-2836
  • 査読あり
• [雑誌論文] Geographic differentiation of polymorphism in the Plasmodium falciparum malaria vaccine candidate gene SERA5 (2012)
  • 著者名/発表者名: Tanabe K, Arisue N, 他12名
  • 雑誌名: Vaccine 巻: 30 号: 9 ページ: 1583-1593
  • DOI: 10.1016/j.vaccine.2011.12.124
  • 査読あり
• [雑誌論文] A large scale survey for novel genotypes of the Plasmodium falciparum chloroquine-resistant pfcrt gene. (2012)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, N.Mita, T.
  • 雑誌名: Malaria J 巻: 11
• [雑誌論文] Limited geographical origin and global spread of sulfadoxine-resistant dhps alleles in Plasmodium falciparum populations (2011)
  • 著者名/発表者名: Mita, T, Tanabe K
  • 雑誌名: J Infect Dis 巻: 204 号: 12 ページ: 1980-8
  • DOI: 10.1093/infdis/jir664
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of pyrimethamine- and chloroquine-resistant Plasmodium falciparum in Africa between 1984 and 1998 : genotyping of archive blood samples (2011)
  • 著者名/発表者名: Saito-Nakano, Y., Mita, T.
  • 雑誌名: Malaria J 巻: 10 号: 1 ページ: 388-388
  • DOI: 10.1186/1475-2875-10-388
  • 査読あり
• [雑誌論文] Recent increase of genetic diversity in Plasmodium vivax population in the Republic of K (2011)
  • 著者名/発表者名: Honma H., Mita T.
  • 雑誌名: Malaria J 巻: 10 号: 1 ページ: 257-257
  • DOI: 10.1186/1475-2875-10-257
  • 査読あり
• [雑誌論文] Worldwide sequence conservation of transmission-blocking vaccine candidate Pvs230 in Plasmodium vivax (2011)
  • 著者名/発表者名: Doi, M, Mita, T
  • 雑誌名: Vaccine 巻: 29 号: 26 ページ: 4308-15
  • DOI: 10.1016/j.vaccine.2011.04.028
  • 査読あり
• [学会発表] マラリアミューテーターを用いたピペラキン耐性原虫の迅速単離と耐性機構の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 池田美恵、平井誠、美田敏宏
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学 三鷹キャンパス
  • 年月日: 2015-03-21 – 2015-03-22
• [学会発表] ウガンダにおけるex vivo薬剤感受性試験を用いた熱帯熱マラリア原虫のクロロキン感受性の回復 (2015)
  • 著者名/発表者名: 櫻井美樹、Mawagali Betty Balikagala、矢代聖基、池田美恵、Ntege Edward、佐伯亜美、本間一、Palacpac Nirianne M.Q.、片岡正俊、坪井敬文、木村英作、遠藤弘良、堀井俊宏、美田敏宏
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学 三鷹キャンパス
  • 年月日: 2015-03-21 – 2015-03-22
• [学会発表] Temporal patterns of molecular marker associated with artemisinin resistance before and after the implementation of artemisinin derivatives in Myanmar (2015)
  • 著者名/発表者名: Win Zin Zayar、上村春樹、Wah Win Htike、Khin San San、北潔、美田敏宏
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学 三鷹キャンパス
  • 年月日: 2015-03-21 – 2015-03-22
• [学会発表] アルテミシニン耐性熱帯熱マラリア原虫出現以前の大規模検体を用いた耐性候補遺伝子Ｋ１３-propellerのベースライン多型解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 美田敏宏、高橋延之、遠藤弘良、大橋順
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学 三鷹キャンパス
  • 年月日: 2015-03-21 – 2015-03-22
• [学会発表] ウガンダにおけるRing Stage Survival Assayを用いたアルテミシニン感受性低下熱帯熱マラリア原虫のスクリーニング (2015)
  • 著者名/発表者名: 金子恵、池田美恵、Mawagali Betty Balikagala、櫻井美樹、矢代聖基、加納永将、佐伯亜美、Palacpac Nirianne M.Q.、片岡正俊、坪井敬文、木村英作、堀井俊宏、美田敏宏
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学 三鷹キャンパス
  • 年月日: 2015-03-21 – 2015-03-22
• [学会発表] ミューテーターマラリア原虫を用いた突然変異蓄積パターンの解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 本間一、平井誠、新倉保、美田敏宏、小林富美恵、堀井俊宏、遠藤弘良
  • 学会等名: 第84回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 杏林大学 三鷹キャンパス
  • 年月日: 2015-03-21 – 2015-03-22
• [学会発表] Interrelated paths for accumulation of mutations in the two malaria parasite genes for antifolate resistance: inference from population-genetics based approach. (2013)
  • 著者名/発表者名: Mita T.
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: 横浜
  • 招待講演
• [学会発表] Evolution of Plasmodium falciparum Pyrimethamine/Sufadoxine Resistance. (2013)
  • 著者名/発表者名: Mita T.
  • 学会等名: Forum Cheju 16
  • 発表場所: Seoul, Korea, Yeongon Campus Seoul National University.
  • 招待講演
• [学会発表] 薬剤耐性熱帯熱マラリア原虫の急速な選択は原虫集団の遺伝的多様性を低下させうるのか－パプア ニューギニアにおける検討 (2012)
  • 著者名/発表者名: 美田敏宏
  • 学会等名: 第53回日本熱帯医学会大会
  • 発表場所: 帯広
• [学会発表] Sulfadoxine/Pyrimethamine耐性をもたらす熱帯熱マラリア原虫dhfr/dhps遺伝子型はどのように進化していくのか (2012)
  • 著者名/発表者名: 美田敏宏
  • 学会等名: 第81回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 兵庫医科大学
• [学会発表] 高頻度突然変異発生マラリア原虫(マラリアミューテーター）のゲノムワイド解析と薬剤耐性研究への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 本間一、美田敏宏
  • 学会等名: 第81回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 兵庫医科大学
• [学会発表] 超加速変異型ネズミマラリア原虫の創出と、その順遺伝学への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 平井誠、美田敏宏
  • 学会等名: 第81回日本寄生虫学会大会
  • 発表場所: 兵庫医科大学
• [学会発表] Impact of an introduction of antimalarials combination therapy on the Plasmodium falciparum population in Papua New Guinea. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mita T.
  • 学会等名: Nagasaki Symposium on Malaria Biology 2011.(招待講演)
  • 発表場所: 長崎大学
• [学会発表] 熱帯マラリア原虫の進化と地理的拡散,「病原体と薬剤耐性-現状をどう捉え、どう向き合うか-」 (2011)
  • 著者名/発表者名: 美田敏宏
  • 学会等名: 第21回感染研シンポジウム(招待講演)
  • 発表場所: 国立感染症研究所
• [学会発表] 進化する薬剤耐性マラリア原虫：研究と対策の最前線 (2011)
  • 著者名/発表者名: 美田敏宏
  • 学会等名: 第71回日本寄生虫学会東日本支部大会(招待講演)
  • 発表場所: 杏林大学
• [学会発表] Limited geographical origin and global spread of sulfadoxine-resistant dhps alleles in Plasmodium falciparum populations. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mita T
  • 学会等名: International Union of Microbiological Societies 2011 Congress.
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター
• [学会発表] パプアニューギニアにおける抗マラリア薬の併用療法による熱帯熱マラリア原虫薬剤耐性遺伝子頻度の上昇． (2011)
  • 著者名/発表者名: 美田敏宏
  • 学会等名: 第52回日本熱帯医学会大会 第26回日本国際保健医療学会学術大会 合同大会
  • 発表場所: 東京大学
• [学会発表] アジア、太平洋、アフリカ地域におけるクロロキン耐性熱帯熱マラリア原虫の起源および拡散様式の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高橋延之, 美田敏宏
  • 学会等名: 第71回日本寄生虫学会東日本支部大会
  • 発表場所: 杏林大学
• [学会発表] 一次医療が普及したパプアニューギニア村落部におけるマラリア適正治療の現状 (2011)
  • 著者名/発表者名: 塚原高広,美田敏宏
  • 学会等名: 第71回日本寄生虫学会東日本支部大会
  • 発表場所: 東京大学
• [図書] 今日の治療指針2014 マラリア/バベシア 256-7 (2014)
  • 著者名/発表者名: 美田敏宏
  • 総ページ数: 2014
  • 出版者: 医学書院
• [図書] 検査値を読む2013：寄生虫卵・虫体検査．内科 111: 1049 (2013)
  • 著者名/発表者名: 美田敏宏、北潔
  • 総ページ数: 1621
  • 出版者: 南江堂