リシークエンシングによる自己免疫性肝疾患のＨＬＡゲノム多様性解析

• 研究課題/領域番号: 23590969
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器内科学
• 研究機関: 信州大学
• 研究代表者: 梅村 武司 信州大学, 医学部, 准教授 (30419345)
• 連携研究者: 太田 正穂 信州大学, 医学部, 准教授 (50115333)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円); 2013年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2011年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
• キーワード: HLA / 自己免疫性肝炎 / 原発性胆汁性肝硬変 / 次世代シークエンサー / DNAタイピング

研究概要

自己免疫性肝炎と原発性胆汁性肝硬変患者におけるHLAの解析を行い、自己免疫性肝炎ではHLA-DRB1*04:05-DQB1*04:01とDRB1*15:01-DQB1*06:02ハプロタイプが、原発性胆汁性肝硬変ではDRB1*08:03-DQB1:06:01とDRB1*13:02-DQB1*06:04、DRB1*11:01-DQB1*03:01ハプロタイプが疾患感受性、抵抗性と関連を認めた。
さらに、自己免疫性肝炎では肝癌発生例、肝不全進行例と、原発性胆汁性肝硬変では肝硬変、肝移植症例と関連のあるHLAハプロタイプを確認し、HLAと両疾患の関連性を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] STAT4 gene polymorphisms are associated with susceptibility and ANA status in primary biliary cirrhosis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Joshita S, Umemura T, Nakamura M, Katsuyama Y, Shibata S, Kimura T, Morita S, Komatsu M, Matsumoto A, Yoshizawa K, Ishibashi H, Tanaka E, Ota M.
  • 雑誌名: Disease Markers 巻: Epub ページ: 727393-727393
  • DOI: 10.1155/2014/727393
  • NAID: 120007107427
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Association analysis of Toll-like receptor 4 polymorphisms in Japanese primary biliary cirrhosis (2013)
  • 著者名/発表者名: Morita, S, Joshita S, Umemura T, Ota M (12名)
  • 雑誌名: Human Immunology 巻: 74 ページ: 219-222
  • NAID: 120007100710
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association analysis of toll-like receptor 4 polymorphisms in Japanese primary biliary cirrhosis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Morita S
  • 雑誌名: Hum Immunol 巻: 74 号: 2 ページ: 219-222
  • DOI: 10.1016/j.humimm.2012.10.022
  • 査読あり
• [雑誌論文] HLA class II molecules confer both susceptibility and progression in Japanese patients with primary biliary cirrhosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Umemura T, Ota M(7名, 7番)
  • 雑誌名: Hepatology 巻: 55 ページ: 506-511
  • 査読あり
• [雑誌論文] Long-term outcome of Japanese patients with type 1 autoimmune hepatitis (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshizawa K, Umemura T(13名, 4番), Ota M(13名, 9番)
  • 雑誌名: Hepatology 巻: 56 ページ: 668-676
  • 査読あり
• [雑誌論文] Super high resolution for single molecule-sequence-based typing of classical HLA loci at the 8-digit level using next generation sequencers (2012)
  • 著者名/発表者名: Shiina T, Umemura T(17名), Ota M(17名)
  • 雑誌名: Tissue Antigens 巻: 80 ページ: 305-316
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human leukocyte antigen class II molecules confer both susceptibility and progression in Japanese patients with primary biliary cirrhosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Umemura K, Joshita S, Ichijo T, Yoshizawa K, Katsuyama Y, Tanaka E, Ota M
  • 雑誌名: Hepatology 巻: 55 号: 2 ページ: 506-511
  • DOI: 10.1002/hep.24705
  • NAID: 120007100712
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of IL28B gene polymorphism with development of hepatocellular carcinoma in Japanese patients with chronic hepatitis C virus infection (2012)
  • 著者名/発表者名: oshita S, Umemura T, Katsuyama Y, Ichikawa Y, Kimura T, Morita S, Kamijo A, Komatsu M, Ichijo T, Matsumoto A, Yoshizawa K, Kamijo N, Ota M, Tanaka E.
  • 雑誌名: Human Immunology 巻: 73 号: 3 ページ: 298-300
  • DOI: 10.1016/j.humimm.2011.12.021
  • NAID: 120007110479
  • 査読あり
• [雑誌論文] Super high resolution for single molecule-sequence-based typing of classical HLA loci at the 8-digit level using next generation sequencers. (2012)
  • 著者名/発表者名: Shiina T, Suzuki S, Ozaki Y, Taira H, Kikkawa E, Shigenari A, Oka A, Umemura T, Joshita S, Takahashi O, Hayashi Y, Paumen M, Katsuyama Y, Mitsunaga S, Ota M, Kulski JK, Inoko H
  • 雑誌名: Tissue Antigens. 巻: 80 号: 4 ページ: 305-16
  • DOI: 10.1111/j.1399-0039.2012.01941.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human leukocyte antigen class II haplotypes affect clinical characteristics and progression of type 1 autoimmune hepatitis in Japan
  • 著者名/発表者名: Umemura T, Ota M (9名, 9番)
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: (印刷中)
  • NAID: 120007100711
  • 査読あり
• [学会発表] SS-SBT法によるAIHおよびPBC疾患感受性遺伝子HLA-DRB1, -DQB1の遺伝子タイピング (2013)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、太田正穂(10名, 10番)
  • 学会等名: 第22回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 福島
• [学会発表] SS-SBT法によるAIHおよびPBC疾患感受性遺伝子HLA-DRB1の遺伝子タイピング (2013)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、城下智、田中榮司
  • 学会等名: 第49回日本肝臓学会総会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] SS-SBT法によるAIHおよびPBC疾患感受性遺伝子HLA-DRB1、-DQB1の遺伝子タイピング (2013)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、勝山善彦、山崎麻美、赤羽由紀、田中榮司、鈴木進悟、尾崎有紀、椎名隆、猪子英俊、太田正穂
  • 学会等名: 第22回 日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: コラッセふくしま（福島県福島市）
• [学会発表] SS-SBT法によるAIHおよびPBC疾患感受性遺伝子HLA-DRB1の遺伝子タイピングの検討 (2013)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、城下智、田中榮司
  • 学会等名: 第49回日本肝臓学会総会
  • 発表場所: 京王プラザホテル（東京都）
• [学会発表] Signal transducer and activator of transcription 4 gene polymorphisms are associated with production of antinuclear antibody in Japanese patients with primary biliary cirrhosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Joshita S, Umemura T, Ota M(7番, 7名)
  • 学会等名: The 63^<rd> Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] HLA-DRB1*09:01-DQB1*03:03 haplotype is associated with progression of primary biliary cirrhosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Umemura T, Ota M (6番, 6名)
  • 学会等名: The 63^<rd> Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] SS-SBT法によるAIHおよびPBC疾患感受性遺伝子HLA-DRB1の遺伝子タイピング (2012)
  • 著者名/発表者名: 勝山善彦、尾崎有紀、梅村武司、太田正穂(7名, 7番)
  • 学会等名: 第21回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 自己免疫性肝炎疾患感受性遺伝子の検索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、太田正穂(9名, 9番)
  • 学会等名: 第21回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] The future of Gastroenterology in Asia (2012)
  • 著者名/発表者名: Umemura T
  • 学会等名: 第98回日本消化器病学会総会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 自己免疫性肝炎疾患感受性遺伝子の検索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、勝山善彦、目黒明、城下智、吉澤要、田中榮司、益尾清恵、猪子英俊、太田正穂
  • 学会等名: 第21回 日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] SS-SBT 法による AIH および PBC 疾患感受性遺伝子 HLA-DRB 1 の遺伝子タイピング (2012)
  • 著者名/発表者名: 勝山善彦、尾崎有紀、梅村武司、鈴木進悟、椎名 隆、猪子英俊、太田正穂
  • 学会等名: 第21回 日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] HLA DRB1*09:01-DQB1*03:03 haplotype is Associated with Progression of Primary Biliary Cirrhosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Takeji Umemura, Satoru Joshita, Kaname Yoshizawa, Yoshihiko Katsuyama, Eiji Tanaka, Masao Ota
  • 学会等名: The 63rd Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] Signal transducer and activiator of transcription 4 gene polymorphisms are associated with production of antinuclear antibody in Japanese patients with primary biliary cirrhosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Satoru Joshita, Takeji Umemura, Minoru Nakamura, Yoshihiko Katsuyama, Kaname Yoshizawa, Eiji Tanaka, Masao Ota
  • 学会等名: The 63rd Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] The Future of Gastroenterology in Asia (2012)
  • 著者名/発表者名: Takeji Umemura
  • 学会等名: 第98回 日本消化病学会総会
  • 発表場所: Tokyo
• [学会発表] 原発性胆汁性肝硬変感受性とHLA (2011)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、城下 智、勝山善彦、一條哲也、吉澤 要、田中榮司、太田正穂
  • 学会等名: 第20回 日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 静岡市
• [学会発表] 原発性胆汁性肝硬変における HLA の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 梅村武司、城下 智、吉澤 要
  • 学会等名: 第15回日本肝臓学会大会
  • 発表場所: 福岡市