エクソンスキッピング誘導効率を規定するシス因子の解明

• 研究課題/領域番号: 23591496
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 八木 麻理子 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (60362787)
• 研究分担者: 竹島 泰弘 神戸大学, 大学院医学研究科, 教授 (40281141) ; 粟野 宏之 神戸大学, 大学院医学研究科, 特命助教 (30437470)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2012年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2011年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: スプライシング / 国際情報研究 / 国際情報交流

研究概要

本研究では、私達が確立した、デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)の原因遺伝子であるジストロフィン遺伝子エクソン45のスキッピングを誘導するアンチセンスオリゴヌクレオチドを、異なる欠失変異を有するDMD由来の培養筋細胞に導入し、エクソン45のスキッピングの誘導効率が変異によって異なることを明らかにした。さらに、エクソン45スキッピング誘導効率を検討した変異の欠失断端を同定し、欠失断端領域のintronic splicing enhancer、intronic splicing silencer等のシス因子とエクソンスキッピング誘導効率について検討したが、その関連は明らかにはできなかった。

研究成果

• [雑誌論文] A novel splicing silencer generated by DMD exon 45 deletion junction could explain upstream exon 44 skipping that modifies dystrophinopathy (2014)
  • 著者名/発表者名: Dwianingsih EK, Malueka R, Nishida A, Lee T, Yagi M, Iijima K, Takeshima Y, Ito K, Matsuo M
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel splicing silencer generated by DMD exon 45 deletion junction could explain upstream exon 44 skipping that modifies dystrophinopathy. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ery Kus Dwianingsih, Rusdy Malueka, Atsuhiro Nishida, Tomoko Lee, Mariko Yagi, Kazumoto Iijima, Yasuhiro Takeshima, Kyoko Ito, Masafumi Matsuo.
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differences in carrier frequency between mothers of Duchenne and Becker muscular dystrophy patients. (2013)
  • 著者名/発表者名: Lee T, Takeshima Y, Kusunoki N, Awano H, Yagi M, Matsuo M, Iijima K.
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 59 号: 1 ページ: 46-51
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.119
  • NAID: 40019946811
  • 査読あり
• [雑誌論文] A prostaglandin D2 metabolite is elevated in the urine of Duchenne muscular dystrophy patients and increases further from 8 years old. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa T, Takeuchi A, Kakiuchi R, Lee T, Yagi M, Awano H, Iijima K, Takeshima Y, Urade Y, Matsuo M.
  • 雑誌名: Clin Chim Acta. 巻: 423 ページ: 10-14
  • DOI: 10.1016/j.cca.2013.03.031
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular characterization of an X(p21.2;q28) chromosomal inversion in a Duchenne muscular dystrophy patient with mental retardation reveals a novel long non-coding gene on Xq28. (2013)
  • 著者名/発表者名: Thu Tran TH, Zhang Z, Yagi M, Lee T, Awano H, Nishida A, Okinaga T, Takeshima Y, Matsuo M.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58 号: 1 ページ: 33-39
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.131
  • NAID: 10031145898
  • 査読あり
• [雑誌論文] Categorization of 77 dystrophin exons into 5 groups by a decision tree using indexes of splicing regulatory factors as decision markers (2012)
  • 著者名/発表者名: Rusdy Ghazali Malueka, Yutaka Takaoka, Mariko Yagi, Hiroyuki Awano, Tomoko Lee, Ery Kus Dwianingsih, Atsushi Nishida, Yasuhiro Takeshima, Masafumi Matsuo
  • 雑誌名: BMC Genetics 巻: 13(23) 号: 1 ページ: 23-23
  • DOI: 10.1186/1471-2156-13-23
  • 査読あり
• [雑誌論文] Optimizing RNA/ENA chimeric antisense oligonucleotides using in vitro splicing. (2012)
  • 著者名/発表者名: Takeshima Y, Yagi M, Matsuo M.
  • 雑誌名: Methods Mol Biol. 巻: 867 ページ: 131-141
  • DOI: 10.1007/978-1-61779-767-5_9
  • ISBN: 9781617797668, 9781617797675
  • 査読あり
• [雑誌論文] A G-to-T transversion at the splice acceptor site of dystrophin exon 14 shows multiple splicing outcomes that are not exemplified by transition mutations. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ota M, Takeshima Y, Nishida A, Awano H, Lee T, Yagi M, Matsuo M.
  • 雑誌名: Genet Test Mol Biomarkers. 巻: 16 号: 1 ページ: 3-8
  • DOI: 10.1089/gtmb.2010.0276
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Japanese child with geleophysic dysplasia caused by a novel mutation of FBN1. (2012)
  • 著者名/発表者名: Lee T, Takeshima Y, Okizuka Y, Hamahira K, Kusunoki N, Awano H, Yagi M, Sakai N, Matsuo M, Iijima K
  • 雑誌名: Gene 巻: 512 号: 2 ページ: 456-459
  • DOI: 10.1016/j.gene.2012.10.060
  • 査読あり
• [雑誌論文] Antisense oligonucleotide induced dystrophin exon 45 skipping at a low half-maximal effective concentration in a cell-free splicing system (2011)
  • 著者名/発表者名: Malueka RG, Yagi M, Awano H, Lee T, Dwianingsih EK, Nishida A, Takeshima Y, Matsuo M
  • 雑誌名: Nucleic Acid Ther 巻: 21(5) 号: 5 ページ: 347-53
  • DOI: 10.1089/nat.2011.0310
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chemical treatment enhances skipping of a mutated exon in the dystrophin gene (2011)
  • 著者名/発表者名: Nishida A, Kataoka N, Takeshima Y,Yagi M, Awano, H, Ota, M, Itoh K, Hagiwara M, and Matsuo M
  • 雑誌名: Nat Commun 巻: 2 号: 1 ページ: 308-308
  • DOI: 10.1038/ncomms1306
  • NAID: 120003001398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chemical treatment enhances skipping of a mutated exon in the dystrophin gene. (2011)
  • 著者名/発表者名: Nishida A, Kataoka N,
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 2 ページ: 308-308
  • 査読あり
• [雑誌論文] Antisense oligonucleotide induced dystrophin exon 45 skipping at a low half-maximal effective concentration in a cell-free splicing system. (2011)
  • 著者名/発表者名: Malueka RG
  • 雑誌名: Nucleic Acid Ther 巻: 21 ページ: 347-353
  • 査読あり
• [学会発表] ジストロフィン遺伝子スプライシングコンセンサス配列内変異によるスプライシング型の変化に関わる因子の検討 (2013)
  • 著者名/発表者名: 李知子、楠典子、八木麻理子、竹島泰弘、松尾雅文、飯島一誠
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第58回大会
  • 発表場所: 宮城県仙台市
• [学会発表] ジストロフィン遺伝子スプライシングコンセンサス配列内変異によるスプライシング型の変化 に関わる因子の検討 (2013)
  • 著者名/発表者名: 李知子、楠典子、八木麻理子、竹島泰弘、松尾雅文、飯島一誠、
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第５８回大会
  • 発表場所: 宮城県仙台市
• [学会発表] A small chemical, TG003, enhances skipping of mutated dystrophin exons : the third example revealing a decrease of exonic splicing enhancer density in common (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishida A, Takeshima Y, Kataoka N, Yagi M, Awano H, Lee T, Iijima K, Hagiwara M, Matsuo M
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics, the 62th Annual Meeting
  • 発表場所: San Francisco
• [学会発表] Duchenne/Becker型筋ジストロフィーにおけるジストロフィン遺伝子の微小変異の割合は増加傾向にある (2012)
  • 著者名/発表者名: 李知子、楠典子、粟野宏之、八木麻理子、竹島泰弘、松尾雅文、飯島一誠
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会57回大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Dystrophin gene mutations in three dystrophinopathy patients with severe cardiomyopathy (2012)
  • 著者名/発表者名: Awano H, Lee T, Yagi M, Takeshima Y, Matsuo M, Iijima K
  • 学会等名: Pediatric Academic Societies Annual Meeting
  • 発表場所: Boston
• [学会発表] A small chemical, TG003, enhances skipping of mutated dystrophin exons: the third example revealing a decrease of exonic splicing enhancer density in common. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishida A, Takeshima Y, Kataoka N, Yagi M, Awano H, Lee T, Iijima K, Hagiwara M, Matsuo M.
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics, the 62th Annual Meeting
  • 発表場所: San Francisco
• [学会発表] Duchenne/Becker型筋ジストロフィー兄弟例における心機能障害の検討 (2012)
  • 著者名/発表者名: 李知子、粟野宏之、八木麻理子、竹島泰弘、松尾雅文、飯島一誠
  • 学会等名: 第115回日本小児科学会学術集会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Duchenne型筋ジストロフィーにおける尿プロスタグランディンD2代謝産物の排泄の増加 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中川卓、李知子、粟野宏之、八木麻理子、松尾雅文、竹島泰弘
  • 学会等名: 第54回日本小児神経学会総会
  • 発表場所: 札幌
• [学会発表] Duchenne/Becker型筋ジストロフィーにおけるジストロフィン遺伝子の微小変異の割合は増加傾向にある (2012)
  • 著者名/発表者名: 李知子、楠典子、粟野宏之、八木麻理子、竹島泰弘、松尾雅文、飯島一誠
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] ベサフィブラートにより骨格筋症状が改善した極長鎖アシルCoA脱水素酵素欠損症の1例 (2012)
  • 著者名/発表者名: 八木麻理子、楠典子、李知子、粟野宏之、但馬剛、小林弘典、長谷川有紀、山口清次、竹島泰弘、飯島一誠
  • 学会等名: 第54回日本先天代謝異常学会
  • 発表場所: 岐阜
• [学会発表] Antisense RNA/Ethylene-bridged nucleic acid chimera induces exon 45 skipping in cultured myocytes from DMD patients with 6 different deletion mutaions (2011)
  • 著者名/発表者名: Yagi M, Lee T, Awano H, Takeshima Y, Matsuo M
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics 61th Annual Meeting
  • 発表場所: Montreal
• [学会発表] ジストロフィン遺伝子エクソンスキッピングを誘導する低分子化合物の同定と治療への応用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 八木麻理子、李知子、粟野宏之、伊東恭子、竹島泰弘、松尾雅文
  • 学会等名: 第53回日本小児神経学会総会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Antisense RNA/Ethylene-bridged nucleic acid chimera induces exon 45 skipping in cultured myocytes from DMD patients with 6 different deletion mutaions. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yagi M,
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics 61th Annual Meeting
  • 発表場所: Montreal
• [学会発表] MLPA法を用いたジストロフィン遺伝子解析のピットフォール (2011)
  • 著者名/発表者名: 粟野宏之
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第56回大会
  • 発表場所: 千葉
• [図書] Treatment of Duchenne muscular dystrophy by induction of exon skipping with antisense oligonucleotides In Fifty years of neuromuscular disorder research after discovery of creatine kinase as a diagnostic marker of muscular dystrophy. (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsuo M,
  • 出版者: IGAKU-SHOIN