切除不能大腸癌に対する抗癌剤感受性予測遺伝子による個別化医療の実践

• 研究課題/領域番号: 23591972
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器外科学
• 研究機関: 日本大学
• 研究代表者: 緑川 泰 日本大学, 医学部, 助教 (10292905)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2013年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2011年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: 大腸がん / マイクロアレイ / 薬剤感受性 / 遺伝子プロファイル / 機械学習法 / 個別化医療 / 切除不能大腸癌 / FOLFOX / ランダムフォレスト / 遺伝子発現解析 / 癌 / 核酸 / 薬剤反応性 / 遺伝子

研究概要

FOLFOX治療を受けた切除不能大腸がん患者83名をトレーニングセットとテストセットに分け、各がん組織からRNAを抽出したのち発現プロファイルを解析した。ランダムフォレストによる解析ではトレーニングセットを感度81.4%、特異度85.1%でFOLFOXの奏効率を予測し得た。さらにoutlierを除外することにより感度91.5%、特異度95.6%まで予測精度をあげることがあ可能であり、この予測モデルを用いてテストセット29例のFOLFOX感受性を予測したところ、69.2%の精度であった。遺伝子プロファイリングを用いた機械学習アルゴリズムによる薬剤感受性予測は個別化医療に有用と考えられた。

研究成果

• [雑誌論文] Mechanistic background and clinical applications of indocyanine green-fluorescence imaging of hepatocellular carcinoma Short running head : ICG-fluorescence imaging of HCC (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishizawa T, Masuda K, Urano Y, Kawaguchi Y, Satou S, Kaneko J, Hasegawa K, Shibahara J, Fukayama M, Tsuji S, Midorikawa Y, Aburatani H, Kokudo N.
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol 巻: 21 ページ: 440-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanistic background and clinical applications of indocyanine green fluorescence imaging of hepatocellular carcinoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishizawa T, Masuda K, Urano Y, Kawaguchi Y, Satou S, Kaneko J, Hasegawa K, Shibahara J, Fukayama M, Tsuji S, Midorikawa Y, Aburatani H, Kokudo N.
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol. 巻: 21 号: 2 ページ: 440-8
  • DOI: 10.1245/s10434-013-3360-4
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] MKK7 mediates miR-493-dependent suppression of liver metastasis of colon cancer cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakai H, Sato A, Aihara Y, Ikarashi Y, Midorikawa Y, Nakagama H, Okamoto K.
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 105 号: 4 ページ: 425-430
  • DOI: 10.1111/cas.12380
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Repeat liver resection for hepatocellular carcinoma complicating primary biliary cirrhosis (2013)
  • 著者名/発表者名: Mochizuki S, Nakayama H, Higaki T, Okubo T, Midorikawa Y, Moriguchi M, Aramaki O, Yamazaki S, Sugitani M, Takayama T.
  • 雑誌名: Int Surg 巻: 98 ページ: 424-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Accumulated phosphatidylcholine (16:0/16:1) in human colorectal cancer; possible involvement of LPCAT4 (2013)
  • 著者名/発表者名: Kurabe N, Hayasaka T, Ogawa M, Masaki N, Yoshimi Ide Y, Waki M, Nakamura T, Kurachi K, Kahyo T, Shinmura K, Midorikawa Y, Sugiyama Y, Setou M, Sugimura H.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 104 ページ: 1295-302
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hepatocellular carcinoma with sarcomatoid change without anticancer therapies (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshida N, Midorikawa Y, Kajiwara T, Yoshida N, Nakayama H, Sugitani M, Takayama T.
  • 雑誌名: Case Rep Gastroenterol 巻: 7 ページ: 169-74
  • 査読あり
• [雑誌論文] Good Candidates for a Third Liver Resection of Colorectal Metastasis (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki S, Takayama T, Okada S, Iwama A, Midorikawa Y, Moriguchi M, Nakayama H, Higaki T, Sugitani M.
  • 雑誌名: World J Surg 巻: 37 ページ: 84-84
  • 査読あり
• [雑誌論文] Marginal survival benefit in the treatment of early hepatocellular carcinoma (2013)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Takayama T, Shimada K, Nakayama H, Higaki T, Moriguchi M, Nara S, Tsuji S, Tanaka M.
  • 雑誌名: J Hepatol 巻: 58 ページ: 306-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Postoperative outcomes of patients with hepatocellular carcinoma negative for all virus-related markers (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamato I, Takayama T, Midorikawa Y, Higaki T, Nakayama H, Moriguchi M, Nakajima Y, Matsuoka S, Ogawa M, Moriyama M.
  • 雑誌名: Surg Today 巻: 43 ページ: 865-70
  • NAID: 10031189765
  • 査読あり
• [雑誌論文] Good Candidates for a Third Liver Resection of Colorectal Metastasis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki S, Takayama T, Okada S, Iwama A, Midorikawa Y, Moriguchi M, Nakayama H, Higaki T, Sugitani M.
  • 雑誌名: World J Suegery 巻: 37 号: 4 ページ: 847-853
  • DOI: 10.1007/s00268-012-1887-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Accumulated phosphatidylcholine (16:0/16:1) in human colorectal cancer; possible involvement of LPCAT4. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kurabe N, Hayasaka T, Ogawa M, Masaki N, Yoshimi Ide Y, Waki M, Nakamura T, Kurachi K, Kahyo T, Shinmura K, Midorikawa Y, Sugiyama Y, Setou M, Sugimura H.
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 104 号: 10 ページ: 1295-1302
  • DOI: 10.1111/cas.12221
  • 査読あり
• [雑誌論文] Marginal survival benefit in the treatment of early hepatocellular carcinoma. (2013)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y
  • 雑誌名: J Hepatolo 巻: 58 号: 2 ページ: 306-11
  • DOI: 10.1016/j.jhep.2012.09.026
  • 査読あり
• [雑誌論文] Criteria for prophylactic drainage tube removal in liver resection : the"3 x 3 rule" (2012)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki S, Takayama T, Moriguchi M, Mitsuka Y, Okada S, Midorikawa Y, Nakayama H, Higaki T.
  • 雑誌名: Br J surg 巻: 99 ページ: 1584-90
  • 査読あり
• [雑誌論文] miR-493 induction during carcinogenesis blocks metastatic settlement of colon cancer cells in liver (2012)
  • 著者名/発表者名: Okamoto K, Ishiguro T, Midorikawa Y, Ohata H, Izumiya M, Tsuchiya N, Sato A, Sakai H, Nakagama H.
  • 雑誌名: EMBO J 巻: 31 ページ: 1752-63
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic approach towards personalized anti-cancer drug therapy (2012)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Tsuji S, Takayama T, Aburatani H.
  • 雑誌名: Pharmacogenomics 巻: 13 ページ: 191-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Potential responders to FOLFOX therapy for colorectal cancer by Random Forests analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Tsuji S, Midorikawa Y, Takahashi T, Yagi K, Takayama T, Yoshida K, Sugiyama Y, Aburatani H.
  • 雑誌名: Br J Cancer 巻: 106 ページ: 126-32
  • 査読あり
• [雑誌論文] Caudate lobectomy (segmentectomy 1) (with video) (2012)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Takayama T.
  • 雑誌名: J Hepatobiliary Pancreat Sci. 巻: 19 ページ: 48-53
  • NAID: 10030241672
  • 査読あり
• [雑誌論文] Criteria for drain removal following liver resection. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki S
  • 雑誌名: Br J Surg 巻: 99 号: 11 ページ: 1584-90
  • DOI: 10.1002/bjs.8916
  • 査読あり
• [雑誌論文] Potential responders to FOLFOX therapy for colorectal cancer by Random Forests analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Tsuji S, Midorikawa Y, Takahashi T, Yagi K, Takayama T, Yoshida K, Sugiyama Y, Aburatani H
  • 雑誌名: British Journal of Cancer 巻: 106 ページ: 126-132
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic approach towards personalized anti-cancer drug therapy (2012)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Tsuji S, Takayama T, Aburatani H
  • 雑誌名: Pharmacogenomics 巻: 13 ページ: 191-199
  • 査読あり
• [雑誌論文] miR-493 induction during carcinogenesis blocks metastatic settlement of colon cancer cells in liver (2012)
  • 著者名/発表者名: Okamoto K, Ishiguro T, Midorikawa Y, Ohata H, Izumiya M, Tsuchiya N, Sato A, Sakai H, Nakagama H
  • 雑誌名: EMBO Journal 巻: 31 ページ: 1752-1763
  • 査読あり
• [雑誌論文] Post-transcriptional regulation of p21 in the determination of p53-dependent cellular fate by the tumor-suppressor miR-22 (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya N, Izumiya M, Ogata-Kawata H, Okamoto K, Fujiwara Y, Nakai M, Okabe A, Schetter AJ, Bowman ED, Midorikawa Y, Sugiyama Y, Aburatani H, Harris CC, Nakagama H.
  • 雑誌名: Cancer Res. 巻: 71 ページ: 4628-39
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tissue-specific demethylation in CpG-poor promoters during cellular differentiation (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagae G, Isagawa T, Shiraki N, Fujita T, Yamamoto S, Tsutsumi S, Nonaka A, Yoshiba S, Matsusaka K, Midorikawa Y, Ishikawa S, Soejima H, Fukayama M, Suemori H, Nakatsuji N, Kume S, Aburatani H.
  • 雑誌名: Hum Mol Genet 巻: 20 ページ: 2710-21
  • 査読あり
• [雑誌論文] Post-transcriptional regulation of p21 in the determination of p53-dependent cellular fate by the tumor-suppressor miR-22. (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya N, Izumiya M, Ogata-Kawata H, Okamoto K, Fujiwara Y, Nakai M, Okabe A, Schetter AJ, Bowman ED, Midorikawa Y, Sugiyama Y, Aburatani H, Harris CC, Nakagama H
  • 雑誌名: Cancer Resarch 巻: 71 ページ: 4628-4639
  • 査読あり
• [学会発表] Genome-wide analysis of stepwise hepatocarcinogenesis using next generation sequencer (2013)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Yamamoto S, Ueda H, Sonoda K, Tsuji S, Tatsuno K, Shibata T, Covington K, Morgan M, Wheeler D, Takayama T, Aburatani H.
  • 学会等名: AASLD The Liver Meeting
  • 発表場所: Washington DC
  • 年月日: 2013-11-02
• [学会発表] New epigenetic biomarker for colorectal cancer (2013)
  • 著者名/発表者名: Takane K, Midorikawa Y, Yagi K, Sakai A, Aburatani H, Takayama T, Kaneda A.
  • 学会等名: 104th, American Association for Cancer Research
  • 発表場所: Washington DC
  • 年月日: 2013-04-09
• [学会発表] Genome-wide analysis of stepwise hepatocarcinogenesis using next generation sequencer (2013)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Takayama T, Yamamoto S, Ueda H, Sonoda K, Takane K, Tsuji S, Nagae G, Tatsuno K, Morgan M, Wheeler D, Aburatani H.
  • 学会等名: 104th, American Association for Cancer Research
  • 発表場所: Washington DC
  • 年月日: 2013-04-09
• [学会発表] RNAシークエンシングエクソームシークエンスによる肝癌多段階発癌メカニズムの解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 緑川 泰
  • 学会等名: 第113回日本外科学会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Identification of mutation patterns using exome sequencing for stepwise progression of hepatocarcinogenesis (2013)
  • 著者名/発表者名: 緑川 泰
  • 学会等名: 第72回日本癌学会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Integrative analysis of genome-wide methylation and expression profiles for metastatic colorectal cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Tsuji S, Nagae G, Tadatoshi Takayama T, Sugiyama Y, Aburatani H.
  • 学会等名: 103rd, American Association for Cancer Research
  • 発表場所: Chicago
  • 年月日: 2012-04-03
• [学会発表] 包括的遺伝子発現及びメチル化プロファイルによる大腸癌肝転移についての統合解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 緑川 泰
  • 学会等名: 第67回日本消化器外科学会定期学術集会
  • 発表場所: 富山
• [学会発表] Integrative analysis of methylation and expression profiles for discovering functional key molecules in colorectal cancer. (2012)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌
• [学会発表] ランダムフォレストを用いたFOLFOX療法感受性予測による個別化医療への臨床応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 緑川 泰
  • 学会等名: 第23回日本消化器癌発生学会
  • 発表場所: 徳島
• [学会発表] Integrative Analysis of Genome-wide Methylation and Expression Profiles for Metastatic Colorectal Cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y
  • 学会等名: 104th American Association for Cancer Research Annual Meeting 2012
  • 発表場所: Chicago
• [学会発表] Integrative Analysis of Genome-wide Methylation and Expression Profiles for Metastatic Colorectal Cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Tsuji S, Nagae G, Takayama T, Sugiyama Y, Aburatani H
  • 学会等名: American Association for Cancer Research Annual Meeting
  • 発表場所: シカゴ
• [学会発表] Identification of potential responders to chemotherapy against colorectal cancer by predictor genes and activated pathways using Random Forests analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Midorikawa Y, Tsuji S, Takahashi T, Yagi K, Takayama T, Yoshida K, Sugiyama Y, Aburatani H.
  • 学会等名: 102nd, American Association for Cancer Research
  • 発表場所: Orland
  • 年月日: 2011-04-04
• [図書] アルゴリズムに沿った良方針肝癌治療の要点と盲点 (2013)
  • 著者名/発表者名: 緑川泰、高山忠利
  • 出版者: 文光堂東京
• [図書] 肝尾状葉切除肝胆膵脾手術アトラス (2013)
  • 著者名/発表者名: 緑川泰、高山忠利
  • 出版者: 金原出版東京
• [図書] メタボ肝癌の病態.メタボ肝癌 (2013)
  • 著者名/発表者名: 緑川泰、山本尚吾、高山忠利、油谷浩幸
  • 出版者: アークメディア東京
• [図書] ガイドラインと集学的治療肝癌診療Q&A (2013)
  • 著者名/発表者名: 緑川泰、高山忠利、田中正俊
  • 出版者: 中外医学社東京
• [図書] 肝癌診療Q&A (2013)
  • 著者名/発表者名: 緑川 泰
  • 出版者: 中外医学社
• [図書] メタボ肝癌 (2013)
  • 著者名/発表者名: 緑川 泰
  • 出版者: アークメディア
• [図書] 肝細胞癌のすべて2012 (2012)
  • 著者名/発表者名: 緑川 泰
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: アークメディア