| 研究課題/領域番号 |
23650150
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
生体生命情報学
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| 研究機関 | 東北大学 (2012)
東京大学 (2011) |
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研究代表者 |
長崎 正朗 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (90396862)
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| 研究期間 (年度) |
2011 – 2012
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| 研究課題ステータス |
完了 (2012年度)
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| 配分額 *注記 |
1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2012年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2011年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
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| キーワード | 次世代シーケンサ / 次世代シークエンサ / トランスクリプトーム / RNA-Seq / lincRNA / ベイズ法 / スーパーコンピュータ / 高性能シークエンサ / 数理統計モデル |
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| 研究概要 |
次世代シークエンサではさまざまな転写産物を同時に見ることができるが同じ領域から出る転写産物について実際にどの転写産物がどの程度出ているかを区別することが課題である。特に機能を行っているかどうか未知であるncRNAやmicroRNAの網羅的探索においてはより正確な転写産物の推定が重要である。本研究ではこれらの特性を生かした転写量推定アルゴリズムを開発した。また、スーパーコンピュータを用いてlincRNAおよびmRNAを抽出できる環境整備を本研究成果により実現することができた。
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