高運動習性モデルラットの表現型形成機序の解明を目指した原因遺伝子の迅速同定

• 研究課題/領域番号: 23650406
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: スポーツ科学
• 研究機関: 徳島大学
• 研究代表者: 井本 逸勢 (橘 逸勢) 徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 教授 (30258610)
• 研究分担者: 中屋 豊 徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 教授 (50136222) ; 二川 健 徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 教授 (20263824)
• 連携研究者: 田嶋 敦 徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 准教授 (10396864)
• 研究期間 (年度): 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2011年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
• キーワード: 高運動習性ラット / ゲノム / 次世代シーケンサー / 連鎖解析

研究概要

Wistar系ラットから樹立された高運動習性動物モデルであるSPORTS(Spontaneously Running Tokushima-Shikoku)ラットを対象に、高運動習性の表現型形成の分子基盤を解明することを目的に、次世代シーケンサーを用いた全エクソン配列解析、連鎖解析、ならびにデータベースを用いた選択アルゴリズムから新規に構築するラットゲノム解析パイプラインを駆使することで、未同定の原因遺伝子のスクリーニングを行い、候補遺伝子群を得るとともに、モデルラットの表現型関連遺伝子のスクリーニングツールとシステムを確立した。

研究成果

• [雑誌論文] The incidence of hypoplasia of the corpus callosum in patients with dup (X)(q28) involving MECP2 is associated with the location of distal breakpoints. (2012)
  • 著者名/発表者名: Honda S, et al.
  • 雑誌名: Am J Med Genet 巻: 158A 号: 6 ページ: 1292-1303
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.35321
  • 査読あり
• [雑誌論文] SIX1 promotes epithelial-mesenchymal transition in colorectal cancer through ZEB1 activation (2012)
  • 著者名/発表者名: Ono H, Imoto I, Kozaki K, Tsuda H, Matsui T, Kurasawa Y, Muramatsu T, Sugihara K, Inazawa J
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 31 号: 47 ページ: 4923-4934
  • DOI: 10.1038/onc.2011.646
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deletion at chromosome 10p11.23-p12.1 defines characteristic phenotypes with marked midface retrusion (2012)
  • 著者名/発表者名: Okamoto N, Hayashi S, Masui A, Kosaki R, Oguri I, Hasegawa T, Imoto I, Makita Y, Hata A, Moriyama K, Inazawa J
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57(3) 号: 3 ページ: 191-196
  • DOI: 10.1038/jhg.2011.154
  • 査読あり
• [雑誌論文] Japanese Mental Retardation Consortium. Concomitant microduplications of MECP2 and ATRX in male patients with severe mental retardation (2012)
  • 著者名/発表者名: Honda S, Satomura S, Hayashi S, Imoto I, Nakagawa E, Goto Y, Inazawa J
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57(1) 号: 1 ページ: 73-77
  • DOI: 10.1038/jhg.2011.131
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel intragenic duplications and mutations of CASK in patients with mental retardation and microcephaly with pontine and cerebellar hypoplasia(MICPCH) (2012)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Okamoto N, Chinen Y, Takanashi J, Makita Y, Hata A, Imoto I, Inazawa J
  • 雑誌名: Hum Genet 巻: 131(1) ページ: 99-110
  • URL: http://www.springerlink.com/content/t41q770m17509j15/?MUD=MP
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel intragenic duplications and mutations of CASK in patients with mental retardation and microcephaly with pontine and cerebellar hypoplasia (MICPCH) (2012)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, et al
  • 雑誌名: Human Genet 巻: 131 ページ: 99-110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stabilization of phenotypic plasticity through mesenchymal-specific DNA hypermethylation in cancer cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurasawa Y
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 12.31(15) 号: 15 ページ: 1963-74
  • DOI: 10.1038/onc.2011.373
  • 査読あり
• [雑誌論文] HECT-type ubiquitin ligase ITCH targets lysosomal-associated protein multispanning transmembrane 5(LAPTM5) and prevents LAPTM5-mediated cell death (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishihara T, Inoue J, Kozaki K, Imoto I, Inazawa J
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 286(51) ページ: 44086-94
  • URL: http://www.jbc.org/content/286/51/44086.long
  • 査読あり
• [雑誌論文] miR-152 is a tumor suppressor microRNA that is silenced by DNA hypermethylation in endometrial cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsuruta T, Kozaki K, Uesugi A, Furuta M, Hirasawa A, Imoto I, Susumu N, Aoki D, Inazawa J
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 71(20) ページ: 6450-62
  • URL: http://cancerres.aacrjournals.org/content/71/20/6450.long
  • 査読あり
• [雑誌論文] The tumor suppressive microRNA miR-218 targets the mTOR component Rictor and inhibits AKT phosphorylation in oral cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Uesugi A, Kozaki K, Tsuruta T, Furuta M, Morita K, Imoto I, Omura K, Inazawa J
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 71(17) ページ: 5765-78
  • URL: http://cancerres.aacrjournals.org/content/71/17/5765.long
  • 査読あり
• [雑誌論文] HECT-type ubiquitin ligase ITCH targets lysosomal-associated protein multispanning transmembrane 5 (LAPTM5) and prevents LAPTM5-mediated cell death (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishihara T, et al
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 286 ページ: 44086-94
  • 査読あり
• [雑誌論文] miR-152 is a tumor suppressor microRNA that is silenced by DNA hypermethylation in endometrial cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsuruta T, et al
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 71 ページ: 6450-62
  • 査読あり
• [雑誌論文] The tumor suppressive microRNA miR-218 targets the mTOR component Rictor and inhibits AKT phosphorylation in oral cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Uesugi A, et al
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 71 ページ: 5765-78
  • 査読あり
• [図書] メディカルサイエンス遺伝子検査学(IV染色体検査法-1染色体分染法-2染色法) (2011)
  • 著者名/発表者名: 井本逸勢
  • 出版者: 近代出版
• [備考] ホームページ
  • URL: http://plaza.umin.ac.jp/awahg/
• [備考] 徳島大学・大学院ヘルスバイオサイエンス研究部・人類遺伝学
  • URL: http://www.tokushima-u.ac.jp/med/culture/jinruiiden/
• [備考]
  • URL: http://plaza.umin.ac.jp/awahg/
• [備考]
  • URL: http://www.tokushima-u.ac.jp/med/culture/jinruiiden/