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人工核酸を用いた新規ストランドインベーダーの開発

研究課題

研究課題/領域番号 23651128
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 ナノ材料・ナノバイオサイエンス
研究機関名古屋大学

研究代表者

浅沼 浩之  名古屋大学, 工学研究科, 教授 (20282577)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2012年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードDNA / ストランドインベージョン / インターカレーター / PNA / D-Threoninol / ストランドインベーダー / トレオニノール / Threoninol / 色素
研究概要

本研究では、D-Threoninol に色素などの機能性分子を導入したヌクレオチド・アナログ=Threoninol-Nucleotide (TN)を導入した DNA(TN-DNA)と、通常の未修飾のPNA を組み合わせた新たなストランドインベーダーの開発を目指した。DNA 二重鎖へのインベージョン活性を示すためには、二重鎖の安定性の序列が DNA/PNA, TN-DNA/DNA > DNA/DNA > TN-DNA/PNA を満たす必要がある。そこでこのような安定性の序列を満たすための機能性分子と TN の導入方法を検討した。その結果、電子吸引性基を導入した平面構造のインターカレーターが DNA 二重鎖を大きく安定化することを見出した。また TN を天然のヌクレオチド 2 残基毎に導入すると、PNA の二重鎖を阻害しつつ DNA との二重鎖形成を促進することも明らかにした。これらの結果に基づき、PNA と機能性分子としてアントラキノンを導入した TN-DNA の組み合わせることで、実際に DNA 二重鎖にストランドインベージョンすることを明らかにした。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (8件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Coherent Interactions of Dyes Assembled on DNA" (Review)2012

    • 著者名/発表者名
      Asanuma, H.; Fujii, T.; Kato, T.; Kashida, H
    • 雑誌名

      Photochem. Photobiol. C

      巻: 13 ページ: 124-135

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quencher-free linear probe with multiple fluorophores on acyclic scaffold2012

    • 著者名/発表者名
      Asanuma, H.; Akahane, M.; Kondo, N.; Osawa, T.; Kato, T.; Kashida, H.
    • 雑誌名

      Chem. Sci

      巻: 3 ページ: 3165-3169

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quencher-free linear probe with multiple fluorophores on acyclic scaffold2012

    • 著者名/発表者名
      Asanuma, H.; Akahane, M.; Kondo, N.; Osawa, T.; Kato, T.; Kashida, H.
    • 雑誌名

      Chem. Sci.

      巻: 3 号: 11 ページ: 3165-3169

    • DOI

      10.1039/c2sc20732j

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Coherent Interactions of Dyes Assembled on DNA (Review)2012

    • 著者名/発表者名
      Asanuma, H.; Fujii, T.; Kato, T.; Kashida, H.
    • 雑誌名

      J. Photochem. Photobiol. C

      巻: 13 号: 2 ページ: 124-135

    • DOI

      10.1016/j.jphotochemrev.2012.04.002

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 二重鎖の不安定化を伴わない高感度リニアプローブの設計」2013

    • 著者名/発表者名
      赤羽真理子、丹羽理恵、大澤卓矢、加藤智博、樫田啓、浅沼浩之
    • 学会等名
      日本化学会第93 春季年会
    • 発表場所
      草津
    • 年月日
      2013-03-25
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 二重鎖の不安定化を伴わない高感度リニアプローブの設計2013

    • 著者名/発表者名
      赤羽真理子・丹羽理恵・大澤卓矢・加藤智博・樫田啓・浅沼浩之
    • 学会等名
      日本化学会第93春季年会
    • 発表場所
      立命館大学(草津)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ステム構造が不要なリニア型核酸プローブによる DNA・RNA の高感度検出2012

    • 著者名/発表者名
      赤羽真理子、近藤展代、大澤卓矢、加藤智博、樫田啓、浅沼浩之
    • 学会等名
      第61回高分子討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2012-09-21
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ステム構造を必要としない高感度リニアプローブの設計2012

    • 著者名/発表者名
      浅沼浩之、赤羽真理子、近藤展代、大澤卓矢、加藤智博、樫田啓
    • 学会等名
      日本化学会第92 春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2012-03-28
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA 二重鎖内部における蛍光色素のエネルギー移動に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      加藤智博、樫田啓、浅沼浩之
    • 学会等名
      日本化学会第92 春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2012-03-28
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ステム構造が不要なリニア型核酸プローブによるDNA・RNAの高感度検出2012

    • 著者名/発表者名
      赤羽真理子・近藤展代・大澤卓矢・加藤智博・樫田啓・浅沼浩之
    • 学会等名
      第61回高分子討論会
    • 発表場所
      名古屋工業大学(名古屋)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ステム構造を必要としない高感度リニアプローブの設計

    • 著者名/発表者名
      浅沼浩之・赤羽真理子・近藤展代・大澤卓矢・加藤智博・樫田啓
    • 学会等名
      日本化学会第92春季年会
    • 発表場所
      神奈川(慶応義塾大学)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA二重鎖内部における蛍光色素のエネルギー移動に関する研究

    • 著者名/発表者名
      加藤智博・樫田啓・浅沼浩之
    • 学会等名
      日本化学会第92春季年会
    • 発表場所
      神奈川(慶応義塾大学)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.nubio.nagoya-u.ac.jp/seigyo1/index.html

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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