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分子モーターの1分子トラジェクトリからポテンシャルを描く

研究課題

研究課題/領域番号 23654137
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 数理物理・物性基礎
研究機関中央大学

研究代表者

鳥谷部 祥一  中央大学, 理工学部, 助教 (40453675)

研究分担者 上野 博史  中央大学, 理工学部, 助教 (10546592)
研究期間 (年度) 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2011年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード分子モーター / 統計力学 / F1-ATPase / エネルギー変換
研究概要

分子モーターは,化学エネルギーを力学運動に変換するナノサイズの化学エンジンである.したがって,そのエネルギー論を議論することは,分子モーターの動作原理を理解するうえで本質的である.特に,回転分子モーターF1-ATPaseは生体内で自由エネルギー変換の中心的な役割を担い,そのエネルギー論は生物学的にも重要である.F1-ATPaseはほぼ100%の自由エネルギー変換効率を持つことが知られており,なぜこのような高効率を実現できるのか,非平衡熱力学の観点からも興味深い.我々は,1分子トラジェクトリのみから,分子モーターの力学ポテンシャルを見積もる方法をすでに開発している.本研究課題では,この方法をF1-ATPaseに応用し,F1-ATPaseの高効率な自由エネルギー変換機構の仕組みを解明しようと試みた.我々は,光学系の調整と高度な画像処理により,露光時間40usで1秒間に9000枚の画像をリアルタイムでPCに記録できるシステムを構築した.このシステムを用いてF1-ATPaseの極めて時間分解能の高い1分子トラジェクトリを測定し,上記の方法を用いて解析した.その結果,F1-ATPaseの化学状態ごとの力学ポテンシャル,力学ポテンシャルが切り替わる瞬間の回転軸の角度,回転によって生じる熱散逸量などを,1分子トラジェクトリのみから推定することに成功した.そして,化学状態がランダムに切り替わるのではなく,中心の回転軸が少し進んだところでのみ状態が切り替わることを発見した.これは,F1-ATPaseが,"Diffusion-and-catch"と"Power stroke"の2つの機構を巧みに利用してトルクを発生していることを示唆している.これが,F1-ATPaseが高効率性を実現している理由の1つだと推測される.このような知見はある程度予想されてはいたものの,実験データから導き出したのは初めてであり画期的な成果と言える.

報告書

(1件)
  • 2011 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2011

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Thermodynamic efficiency and mechanochemical coupling of F1-ATPase2011

    • 著者名/発表者名
      S.Toyabe, T.Watanabe-Nakayama, T.Okamoto, S.Kudo, E.Muneyuki
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Science, the Unitated States of America

      巻: 108 号: 44 ページ: 17951-17956

    • DOI

      10.1073/pnas.1106787108

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 情報と熱と悪魔-熱運動を利用する2011

    • 著者名/発表者名
      鳥谷部祥一
    • 雑誌名

      科学(岩波書店)

      巻: 81(招待論文) ページ: 1142-1145

    • NAID

      40019028246

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Single-molecule nonequilibrium thermodynamics of molecular motor2011

    • 著者名/発表者名
      S.Toyabe, H.Ueno, E.Muneyuki
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-16
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 情報-自由エネルギー変換と分子モーター2011

    • 著者名/発表者名
      鳥谷部祥一
    • 学会等名
      第63回コロイドおよび界面討論会
    • 発表場所
      京都大学吉田キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 情報-自由エネルギー変換と分子モーター2011

    • 著者名/発表者名
      鳥谷部祥一
    • 学会等名
      駒場物性セミナー
    • 発表場所
      東京大学駒場キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 1分子トラジェクトリから情報を絞り出す-F1モーターを例にとって-2011

    • 著者名/発表者名
      鳥谷部祥一
    • 学会等名
      第1回分子モーター討論会
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2011-06-20
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 情報と物理学の深い関係-マックスウェルの悪魔をめぐって-2011

    • 著者名/発表者名
      鳥谷部祥一
    • 学会等名
      東京大学物理学教室コロキウム
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス(招待講演)
    • 年月日
      2011-05-20
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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