| 研究課題/領域番号 |
23654179
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
層位・古生物学
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| 研究機関 | 独立行政法人海洋研究開発機構 |
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研究代表者 |
北里 洋 独立行政法人海洋研究開発機構, 海洋・極限環境生物圏領域, 領域長 (00115445)
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| 研究分担者 |
窪川 かおる 東京大学, 理学系研究科, 特任教授 (30240740)
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| 研究協力者 |
新村 芳人 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (90396979)
倉沢 篤史 独立行政法人海洋研究開発機構, 地球環境変動領域・物質循環研究プログラム・古海洋環境研究チーム, 研究支援パートタイマー
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| 研究期間 (年度) |
2011 – 2012
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| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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| 配分額 *注記 |
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2011年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
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| キーワード | 系統 / 進化 / 多様性 / 深海 / 堆積物 / 化石DNA / 海生生物 / DNA解析 / Bioinformatics |
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| 研究概要 |
嫌気的な海成堆積物中には化石化したDNAが保存されることがある。本研究では、深海掘削コア中から採取したDNA抽出物から、真核生物遺伝子断片の塩基配列を解析し、ゲノムレベルで海洋生物進化を検討した。
地球深部探査船「ちきゅう」で採取した掘削コアから、コンタミネーションのない遺伝子サンプリングを行い、数100bpから数1000bpの遺伝子断片を得た。DNA量は最小で0.6ng/ul/mg堆積物乾重量であった。BLAST検索にかけた結果、真核生物およびHypothetical geneで登録されている未知遺伝子が検出された。このことは、化石DNAが嫌気的環境下で保存されてきた可能性を示した。
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