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汎用的シグナルペプチド配列最適化法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 23656522
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生物機能・バイオプロセス
研究機関名古屋大学

研究代表者

中野 秀雄  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (00237348)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2011年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード生物機能工学 / 微生物 / 分泌生産 / シグナルペプチド / 酵素 / 酵母 / ゲノムライブラリー
研究概要

組換え微生物中の外来タンパク質の分泌レベルは、シグナルペプチド(SP の)と標的タンパク質との組合せに強く依存し、各標的タンパク質に対する SP 配列の最適化は、原核生物と真核生物の両方で、異種発現の分泌タンパク質の生産性を最大化するために重要なステップである。本研究では、宿主ゲノムに由来するシグナルペプチドライブラリーを利用して、容易に標的タンパク質に融合 SP のライブラリーを作ることができる、新規なシグナルペプチド最適化ツール(SPOT)の開発を行った。本手法ではリモートカッター制限酵素と相同組換えを利用することで、通常必要な特定の介在配列を含まずに、ライブラリーを構築することができる。Aspergillus oryzae 由来のβ- ガラクトシダーゼを標的蛋白とし、がSaccharomyces secrevisiae,典型的な真核生物発現宿主からの分泌を検討したところ、比較的少数 SP ライブラリーから、効率よく優れた SP 配列をスクリーニングすることができた。さらに、それぞれの SP を SignalP ソフトウェアで分析した D スコアと、分泌効率の相関を調べたところ、D スコアが極端に低いものの分泌効率は低かった。このことは本ソフトウェアの使用することで、SP ライブラリーの品質を高めることができることをしめしている。本研究で開発した方法は、様々な宿主細胞中のタンパク質のさまざまな目的で使用することができ、タンパク質の異種分泌発現の向上に寄与できる。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2012 その他

すべて 学会発表 (4件)

  • [学会発表] 酵母シグナルペプチドライブラリーを用いたシグナルペプチド最適化ツールの開発2012

    • 著者名/発表者名
      原翔一、菅原知宏、佐原健彦、扇谷悟、河原崎泰昌、兒島孝明、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会 2012 大会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 酵母シグナルペプチドライブラリーを用いたシグナルペプチド最適化ツールの開発に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      原翔一、菅原知宏、佐原健彦、扇谷悟、河原崎泰昌、兒島孝明、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部第165回例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 酵母シグナルペプチドライブラリーを用いたシグナルペプチド最適化ツールの開発に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      原翔一
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部例会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 酵母シグナルペプチドライブラリーを用いたシグナルペプチド最適化ツールの開発

    • 著者名/発表者名
      原翔一、菅原知宏、佐原健彦、扇谷悟、河原崎泰昌、兒島孝明、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012大会
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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