セミインタクト細胞リシール法を駆使した糖尿病態のエピジェネティクス変化可視化解析

• 研究課題/領域番号: 23657001
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 加納 ふみ 東京大学, 総合文化研究科, 助教 (10361594)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2011年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 病態モデル細胞 / エピジェネティクス / セミインタクト細胞リシール法 / 糖尿病 / ゲノム機能・発現 / セミインタクト細胞

研究概要

細胞質交換法セミインタクト細胞リシール法により、糖尿病モデル細胞を構築した。DNAメチル化のマーカーであるMeCP2の局在解析により、糖尿病モデル細胞ではMeCP2が核内に拡散しエピジェネティクスが改変されている可能性が示唆された。遺伝子発現変動解析からも、糖尿病モデル細胞特異的に発現上昇・減少する遺伝子群を抽出することができ、糖尿病態とエピジェネティクス改変が関連しうる因子探索法のプロトタイプを構築することができた。

研究成果

• [雑誌論文] PPARγ-induced PARylation promotes local DNA demethylation by production of 5-hydroxymethylcytosine (2013)
  • 著者名/発表者名: Katsunori Fujiki, Akihiro Shinoda, Fumi Kano, Ryuichiro Sato, Katsuhiko Shirahige & Masayuki Murata
  • 雑誌名: Nature Co㎜unications 巻: 4 号: 1 ページ: 2-262
  • DOI: 10.1038/ncomms3262
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Semi-Intact Cell System and Methods for Cell Resealing : a Novel Systems Biology Tool to Elucidate Protein Networks with Spatio-Templioral Information (2013)
  • 著者名/発表者名: Kano, F., Murata, M
  • 雑誌名: Advances in Systems Biology 巻: 2(1) ページ: 6-14
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Semi-Intact Cell System and Methods for Cell Resealing: a Novel Systems Biology Tool to Elucidate Protein Networks with Spatio-Templioral Information (2013)
  • 著者名/発表者名: Kano, F., Murata, M
  • 雑誌名: Advances in Systems Biology. 巻: 2 ページ: 6-14
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Resealed-Cell System for Analyzing Pathogenic Intracellular Events : Perturbation of Endocytic Pathways under Diabetic Conditions. (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumi Kano, et al.
  • 雑誌名: PLoS ONE. 巻: 7 号: 8 ページ: e44127-e44127
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0044127
  • 査読あり
• [雑誌論文] 哺乳動物細胞ゴルジ体の細胞周期依存的ディスアッセンブリー (2012)
  • 著者名/発表者名: 加納ふみ, 村田昌之
  • 雑誌名: 生体の科学 巻: 63巻 5号 ページ: 404-407
• [雑誌論文] 新しい機能を問われ出した小胞体-ゴルジ体中間区画 (ER-Golgi intermediate compartment : ERGIC) (2012)
  • 著者名/発表者名: 菅原太一, 加納ふみ, 村田昌之
  • 雑誌名: 生体の科学 巻: 63巻 5号 ページ: 424-425
• [雑誌論文] セミインタクト細胞リシール法を用いた 「病態モデル細胞」作製とその疾患研究への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 村田昌之, 加納ふみ
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: Vol.50(No.7) ページ: 510-517
  • NAID: 10030820324
• [雑誌論文] PKCd and e regulate the morphological integrity of the ER-Golgi intermediate compartment (ERGIC) but not the anterograde and retrograde transports via the Golgi apparatus (2012)
  • 著者名/発表者名: Sugawara, T., Nakatsu, D., Kii, H., Maiya, N., Adachi, A., Yamamoto, A., Kano, F., Murata, M
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Acta (Molecular Cell Research) 巻: 1823(4) ページ: 861-875
  • 査読あり
• [雑誌論文] Semi-intact cell system : Application to the nalysis of membrane trafficking beween the endoplasmic reticulum and the Golgi apparatus and of cell cycle-dependent changes in the morphology of these organelles (2012)
  • 著者名/発表者名: Murata, M., Kano, F
  • 雑誌名: in Crosstalk and Integration of Membrane Trafficking Pathways. (Weigert, R. ed.)
• [雑誌論文] PKCd and e regulate the morphological integrity of the ER-Golgi intermediate compartment (ERGIC) but not the anterograde and retrograde transports via the Golgi apparatus. (2012)
  • 著者名/発表者名: Sugawara, T., Nakatsu, D., Kii, H., Maiya, N., Adachi, A., Yamamoto, A., Kano, F., Murata, M.
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Acta (Molecular Cell Research) 巻: 1823 ページ: 861-875
  • 査読あり
• [雑誌論文] 哺乳動物細胞ゴルジ体の細胞周期依存的ディスアッセンブリー (2012)
  • 著者名/発表者名: 加納ふみ、村田昌之
  • 雑誌名: 生体の科学 巻: 63 ページ: 404-407
• [雑誌論文] 新しい機能を問われ出した小胞体-ゴルジ体中間区画 (ER-Golgi intermediate compartment: ERGIC) (2012)
  • 著者名/発表者名: 菅原太一、加納ふみ、村田昌之
  • 雑誌名: 生体の科学 巻: 63 ページ: 424-425
• [雑誌論文] セミインタクト細胞リシール法を用いた「病態モデル細胞」作製とその疾患研究への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 村田昌之、加納ふみ
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: 50 ページ: 510-517
  • NAID: 10030820324
• [学会発表] セミインタクト細胞リシール技術を用いた糖尿病モデル細胞の構築 (2013)
  • 著者名/発表者名: 野口 誉之, 堀内 雄太, 中津 大貴, 加納 ふみ, 村田 昌之
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 京都国際会議場
  • 年月日: 2013-10-29
• [学会発表] Disease model cell system : a novel proteomics tool to elucidate protein networks with spatio-temporal information (2013)
  • 著者名/発表者名: Fumi Kano, Daiki Nakatsu, Yoshiyuki Noguchi, Yuta Horiuchi, Masayuki Murata
  • 学会等名: The 12th Human Proteome Organization Congress
  • 発表場所: Yokohama, Japan
  • 年月日: 2013-09-16
• [学会発表] セミインタクト細胞リシール法を用いた病態モデル細胞の創成 (2013)
  • 著者名/発表者名: 加納ふみ, 村田昌之
  • 学会等名: 第65回日本細胞生物学会大会. シンポジウム 「細胞への蛋白質導入技術と蛋白質イメージング技術」
  • 発表場所: ウインクあいち
  • 年月日: 2013-06-19
• [学会発表] セミインタクト細胞リシール技術を用いた糖尿病モデル細胞の構築 : 病態依存的なエンドサイトーシス攪乱 (2013)
  • 著者名/発表者名: 堀内雄太, 加納ふみ, 野口誉之, 村田昌之
  • 学会等名: 第65回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2013-06-19
• [学会発表] セミインタクト細胞リシール法を用いた病態モデル細胞の創成 (2013)
  • 著者名/発表者名: 加納ふみ、村田昌之
  • 学会等名: 第６５回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: ウインクあいち（愛知県）
  • 招待講演
• [学会発表] セミインタクト細胞リシール技術を用いた糖尿病モデル細胞の構築：病態依存的なエンドサイトーシス攪乱 (2013)
  • 著者名/発表者名: 堀内雄太、加納ふみ、野口誉之、村田昌之
  • 学会等名: 第６５回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: ウインクあいち（愛知県）
• [学会発表] Disease model cell system: a novel proteomics tool to elucidate protein networks with spatio-temporal information (2013)
  • 著者名/発表者名: Fumi Kano, Daiki Nakatsu, Yoshiyuki Noguchi, Yuta Horiuchi, Masayuki Murata
  • 学会等名: The 12th Human Proteome Organization Congress
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県）
• [学会発表] セミインタクト細胞リシール技術を用いた糖尿病モデル細胞の構築 (2013)
  • 著者名/発表者名: 野口 誉之, 堀内 雄太, 中津 大貴, 加納 ふみ, 村田 昌之
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 京都国際会議場（京都府）
• [学会発表] A Resealed-Cell System for Analyzing Pathogenic Intracellular Events : Insight into Signal Transduction Cascade in Hyperlipidemic or Diabetic Cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Masayuki Murata, Fumi Kano
  • 学会等名: The 25th Annual and International Meeting of the Japanese Association for Animal Cell Technology (JAACT2012)
  • 発表場所: Nagoya Congress Center, Nagoya, Japan
  • 年月日: 2012-11-27
• [学会発表] A Resealed-Cell System for Analyzing Pathogenic Intracellular Events: Insight into Signal Transduction Cascade in Hyperlipidemic or Diabetic Cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Masayuki Murata, Fumi Kano
  • 学会等名: The 25th Annual and International Meeting of the Japanese Association for Animal Cell Technology (JAACT2012)
  • 発表場所: Nagoya Congress Center, Nagoya
  • 招待講演
• [図書] Semi-intact cell system: Application to the nalysis of membrane trafficking beween the endoplasmic reticulum and the Golgi apparatus and of cell cycle-dependent changes in the morphology of these organelles. in Crosstalk and Integration of Membrane Trafficking Pathways. (2012)
  • 著者名/発表者名: Murata, M., Kano, F.
  • 出版者: INTECH