モデル生物を利用した野生集団に保持される遺伝的変異の機能解析

• 研究課題/領域番号: 23657015
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 生態・環境
• 研究機関: 独立行政法人国立科学博物館
• 研究代表者: 池田 啓 独立行政法人国立科学博物館, 植物研究部, 研究員 (70580405)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 分子生態 / フィトクロム / 野生変異

研究概要

野生集団が持つ遺伝的変異の機能を解析するために、ミヤマタネツケバナ(Cardamine nipponica)の野生集団に複数のアミノ酸置換を伴った対立遺伝子を持つPHYEに着目した。まず、大腸菌でタンパク質を発現させるためのベクターにPHYEを挿入することに成功した。特に、特定のアミノ酸置換の影響を評価するために、対立遺伝子の間で異なるアミノ酸残基を入れ替えたキメラ配列のコンストラクトを構築することができた。また、植物(シロイヌナズナ)に遺伝子導入し、強発現するためのベクターにPHYEを挿入することに成功した。当初の目的であるタンパク質や植物体における機能解析を終えることができなかったが、これらの成果は今後の研究で野生集団が持つ変異の機能を明らかにするために有効な進展である。

研究成果

• [雑誌論文] A multilocus sequencing approach reveals the cryptic phylogeographic history of Phyllodoce nipponica Makino (Ericaceae) (2013)
  • 著者名/発表者名: Ikeda H, Setoguchi H
  • 雑誌名: Biological Journal of Linnean Society 巻: -
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolution of an alpine endemic plant at the arctic-alpine range periphery following Pleistocene climatic oscillations (2012)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, H., Carlsen, T., Fujii, N., Brochmann, C, Setoguchi, H.
  • 雑誌名: New Phytologist 巻: 194 号: 2 ページ: 583-594
  • DOI: 10.1111/j.1469-8137.2012.04061.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] A multilocus sequencing approach reveals the cryptic phylogeographic history of Phyllodoce nipponica Makino (Ericaceae).
  • 著者名/発表者名: Ikeda Hajime, Setoguchi Hiroaki
  • 雑誌名: Biological Journal of Linnean Society 巻: (出版中)
  • 査読あり
• [学会発表] Recent colonization of a coastal plant into inland habitats at an ancient freshwater lake, Lake Biwa : multilocus sequencing and a demographic history of Lathyrus japonicus (Fabaceae) (2012)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuki Tatsuo, Ikeda Hajime, Setoguchi Hiroaki
  • 学会等名: 1st Joint Congress on Evolutionary Biology
  • 発表場所: Ottawa, Canada
• [学会発表] Molecular evolution of photoreceptor genes between sister species (2012)
  • 著者名/発表者名: Ikeda Hajime, Gustafsson Lovisa, Brochmann Christian, Setoguchi Hiroaki
  • 学会等名: 1st Joint Congress on Evolutionary Biology
  • 発表場所: Ottawa, Canada
• [学会発表] 周極-高山植物における種分化と光受容体の分子進化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 池田啓, 岡義人, Lovisa Gustafsson, Christian Brochmann, 長谷あきら, 瀬戸口浩彰
  • 学会等名: 日本植物学会第76回大会
  • 発表場所: 兵庫県立大学
• [学会発表] Recent colonization of a coastal plant into inland habitats at an ancient freshwater lake, Lake Biwa: multilocus sequencing and a demographic history of Lathyrus japonicus (Fabaceae) (2012)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuki, T. H. Ikeda and H. Setoguchi
  • 学会等名: 1st Joint Congress on Evolutionary Biology
  • 発表場所: Ottawa
• [学会発表] Molecular evolution of photoreceptor genes between sister species (2012)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, H. L. Gustafsson, C. Brochmann and H. Setoguchi
  • 学会等名: 1st Joint Congress on Evolutionary Biology
  • 発表場所: Ottawa
• [学会発表] 周極－高山植物における種分化と光受容体の分子進化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 池田啓，岡義人，Lovisa Gustafsson, Christian Brochmann,長谷あきら，瀬戸口浩彰
  • 学会等名: 日本植物学会第76回大会
  • 発表場所: 兵庫県立大学
• [学会発表] ツガザクラ（Phyllodoce nipponica）における核遺伝子と葉緑体の矛盾した地理構造 (2012)
  • 著者名/発表者名: 池田啓
  • 学会等名: 日本植物分類学会第11回大会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] RhododendronのESTマーカーを用いたツツジ科イワヒゲ(Cassiope lycopodioides ) の系統地理 (2011)
  • 著者名/発表者名: 池田啓，東広之，瀬戸口浩彰
  • 学会等名: 日本植物学会第75回大会
  • 発表場所: 東京