| 研究課題/領域番号 |
23657025
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
生態・環境
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| 研究機関 | 独立行政法人海洋研究開発機構 |
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研究代表者 |
井町 寛之 独立行政法人海洋研究開発機構, 海洋・極限環境生物圏領域, 主任研究員 (20361933)
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| 連携研究者 |
久保田 健吾 東北大学, 工学研究科, 助教 (80455807)
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| 研究期間 (年度) |
2011 – 2012
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| 研究課題ステータス |
完了 (2012年度)
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| 配分額 *注記 |
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2011年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
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| キーワード | ファージ / 宿主域 / 16S rRNA 遺伝子 / FISH 法 / 16S rRNA遺伝子 / FISH法 |
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| 研究概要 |
本研究課題では、以下の4 つのステップから構成される新規なファージの宿主域同定技術を開発した。(i) EdU (5-ethynyl-2'-deoxyuridine) で標識したファージを微生物叢に感染させ、宿主微生物を光らせる。(ii) 宿主微生物細胞をFACS で回収する。(iii) 回収した微生物細胞の16S rRNA 遺伝子を決定し、宿主微生物の同定をおこなう。(iv) その確認として、宿主微生物の16S rRNA に特異的なDNA プローブを用いたFISH 法とEdU によるファージ標識による2 重染色を行う。
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