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プラスチドRNA編集酵素の生化学的同定

研究課題

研究課題/領域番号 23657032
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 植物分子生物・生理学
研究機関京都大学

研究代表者

鹿内 利治  京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (70273852)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2011年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード葉緑体 / RNA / PPRタンパク質 / 翻訳 / 光合成 / シロイヌナズナ / RNA編集 / PPR / 遺伝学
研究概要

PGR3は葉緑体局在の27のPPRモチーフからなるタンパク質で、petLオペロンmRNAの安定化とpetLとndhAの翻訳に関わる。各PPRモチーフの機能を特異的に破壊する変異を導入し、二つの標的RNA に対する機能の影響を調べた。N末側のPPRモチーフは、異なるセットのモチーフを活用することで、二つの標的RNA の認識に寄与しており、一方、C末側のPPRモチーフは翻訳に必須で、RNAの二次構造を変えることで、翻訳装置を呼び込むことが示唆された。このC末の機能は、RNA編集に関わるPPRタンパク質のものと類似し、同様にRNAの二次構造を変えることで編集装置を呼び込むモデルが考えられる。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Mutagenesis of Individual Pentatricopeptide Repeat Motifs Affects RNA Binding Activity and Reveals Functional Partitioning of Arabidopsis PROTONGRADIENT REGULATION32013

    • 著者名/発表者名
      Fujii S, Sato N, Shikanai T
    • 雑誌名

      Plant Cell

      巻: 25 号: 8 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1105/tpc.113.112193

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Function of PPR proteins in plastid gene expression2013

    • 著者名/発表者名
      Shikanai T, Fujii S
    • 雑誌名

      RNA Biology

      巻: 10 号: 9 ページ: 1-11

    • DOI

      10.4161/rna.25207

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two interacting proteins are necessary for the editing of the NdhD-1 site in Arabidopsis plastids.2012

    • 著者名/発表者名
      Boussardon C., Salone V., Avon A., Berthom R., Hammani K., Okuda K., Shikanai T., Small I., and Lurin C.
    • 雑誌名

      Plant Cell

      巻: 24 号: 9 ページ: 3684-3694

    • DOI

      10.1105/tpc.112.099507

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A pentatricopeptide repeat protein acts as a site-specificity factor at multiple RNA editing sites with unrelated cis-acting elements in plastids2012

    • 著者名/発表者名
      Okuda K. and Shikanai T
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 40 号: 11 ページ: 5052-5064

    • DOI

      10.1093/nar/gks164

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Composition and physiological function of the chloroplast NADH dehydrogenase-like complex in Marchantia polymorpha2012

    • 著者名/発表者名
      Ueda M., Kuniyoshi T., Yamamoto Y., Sugimoto K., Ishizaki K., Kohchi T., Nishimura Y. and Shikanai T
    • 雑誌名

      Plant J.

      巻: 72 号: 4 ページ: 683-693

    • DOI

      10.1111/j.1365-313x.2012.05115.x

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PGR 5-dependent cyclic electron transport around PSI contributes to the redox homeostasis in chloroplasts rather than CO_2 fixation and biomass production in rice2012

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa Y, Yamamoto H, Okegawa Y, Wada S, Sato N, Taira Y, Sugimoto K, Makino A and Shikanai T
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: 53 号: 12 ページ: 2117-2126

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs153

    • NAID

      10031145641

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A pentatricopeptide repeat protein acts as a site-specificity factor at multiple RNA editing sites with unrelated cis-acting elements in plastids.2012

    • 著者名/発表者名
      Okuda K. and Shikanai T.
    • 雑誌名

      Nucl. Acids Res.

      巻: 40 ページ: 5052-5064

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-234-2_13

    • ISBN
      9781617792335, 9781617792342
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The pentatricopeptide repeat protein OTP87 is essential for RNA editing of nad7 and atp1 transcripts in Arabidopsis mitochondria2011

    • 著者名/発表者名
      Hammani K, des Francs-Small CC, Takenaka M, Tanz SK, Okuda K, Shikanai T, Brennicke A, Small I.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 286 号: 24 ページ: 2136-2171

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.230516

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PROTON GRADIENT REGULATION 3 recognizes multiple targets with limited similarity and mediates translation and RNA stabilization in plastids2011

    • 著者名/発表者名
      Cai W, Okuda K, Peng L, Shikanai T
    • 雑誌名

      Plant J

      巻: 67 号: 2 ページ: 318-327

    • DOI

      10.1111/j.1365-313x.2011.04593.x

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 巨大RNA結合タンパク質ファミリーによる転写制御システム2014

    • 著者名/発表者名
      藤井壮太, 佐藤望, 鹿内利治
    • 学会等名
      第16回オルガネラワークショップ
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      2014-03-17
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Toward understanding the chloroplast post-transcriptional RNA regulation by the pentatricopeptide repeat proteins2013

    • 著者名/発表者名
      Fujii S and Shikanai T
    • 学会等名
      JST-CREST International Symposium
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2013-12-12
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Serial point-mutations into pentatricopeptide repeat motifs reveal functional partitioning PGR32013

    • 著者名/発表者名
      Fujii S., Sato, N. and Shikanai T.
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Toward understanding the chloroplast post-transcriptional RNA regulation by the pentatricopeptide repeat protein

    • 著者名/発表者名
      Fujii S and Shikanai T
    • 学会等名
      JST-CREST International Symposium
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] Why do plants edit RNA in plant organelles? C.E. Bullerwell (ed.) Organelle Genetics2012

    • 著者名/発表者名
      Shikanai T
    • 出版者
      Springer-Verlag Berlin Heidelberg
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] In vitro RNA-binding assay for studying trans-factor for RNA editing in chloroplasts, Chloroplast Research in Arabidopsis : Method and Protocols, volume 1, methods in molecular biology, vol 7742011

    • 著者名/発表者名
      Shikanai T. and Okuda K(R.P. Javis (ed.))
    • 出版者
      Springer Science+Business Media
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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