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紅藻由来光化学系II複合体の結晶化と構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 23657037
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 植物分子生物・生理学
研究機関岡山大学

研究代表者

沈 建仁  岡山大学, 大学院・自然科学研究科, 教授 (60261161)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 中途終了 (2011年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2011年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード光合成 / 光化学系II / 膜タンパク質 / 酸素発生 / 結晶化 / 結晶構造 / 水分解 / 紅藻
研究概要

本研究の目的は、好酸・好熱性紅藻Cyanidium caldariumから高い酸素発生能を持つ光化学系II複合体(PSII)を高純度に単離精製し、その結晶化を行い、X線結晶構造を解明することである。これまですでに同紅藻PSIIの結晶化に成功しており、SPring-8の放射光X線を用いて分解能3-5AのX線回折データを収集した。本研究では、結晶の質と分解能を向上させるため、結晶化条件の改善、結晶の抗凍結剤置換条件の改善、および結晶の脱水処理条件の最適化により、2.75A分解能を与える結晶の析出に成功し、SPring-8のX線を利用して同分解能でX線回折データを収集した。さらにさまざまな重原子化合物を用いて、重原子同型誘導体を作成し、X線回折データを収集した。得られたデータを解析した結果、3種類の重原子同型誘導体から位相情報を取得した。これらの位相情報を用いて、重原子同型置換法によって分析した結果、紅藻PSIIの初期電子密度図を得た。この電子密度図に基づき、初期のPSII構造を構築した。その結果、現在高分解能で構造が解析されている好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus vulcaflus由来PSIIでは存在しない酸素発生系の表在性サブユニット、PsbQ'の結合部位を同定することができた。さらに膜貫通領域でもシアノバクテリアPSIIでは存在しない新たなヘリックスの存在が示唆され、紅藻PSIIの構造がシアノバクテリアPSIIの構造と明らかに異なる点があることが示唆された。現在紅藻PSII構造の精密化を行っているが、本申請者が他の科研費課題の実施に専念するため、本課題は本来の研究期間より短縮して終了することになった。

報告書

(2件)
  • 2011 実施状況報告書   実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] Photosystem II and the unique role of bicarbonate : A historical perspective2012

    • 著者名/発表者名
      Shevela D., Eaton-Rye J.J., Shen J.-R., Govindjee
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta

      巻: 1817 号: 8 ページ: 1134-1151

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2012.04.003

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cationic state distribution over the chlorophyll d-containing P_D1/P_D2 pair in photosystem II2012

    • 著者名/発表者名
      Saito K., Shen J. -R., Ishikita H.
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta

      巻: 1817 ページ: 1191-1195

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deformation of chlorin rings in the Photosystem II crystal structure2012

    • 著者名/発表者名
      Saito K, Umena Y, Kawakami K, Shen JR, Kamiya N, Ishikita H
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 51 号: 21 ページ: 4290-4299

    • DOI

      10.1021/bi300428s

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structure and activation of substrate water molecules in the S_2 state of photosystem II studied by hyperfine sublevel correlation spectroscopy2012

    • 著者名/発表者名
      Milikisyants S., Chatterjee R., Coates C. S., Koua F. H. M., Shen J.-R., Lakshmi K. V.
    • 雑誌名

      Energy Environ. Sci.

      巻: 5 号: 7 ページ: 7747-7756

    • DOI

      10.1039/c2ee21210b

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proton-Coupled Electron-Transfer Processes in Photosystem II Probed by Highly Resolved g-Anisotropy of Redox-Active Tyrosine Y(Z)2011

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka H., Shen J.-R., Kawamori A., Nishiyama K., Ohba Y., Yamauchi S.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 133 ページ: 4655-4660

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural-functional role of chloride in photosystem II2011

    • 著者名/発表者名
      Rivalta I., Amin M., Luber S., Vassiliev S., Pokhrel R., Umena Y., Kawakami K., Shen J.-R., Kamiya N., Bruce D., Brudvig G. W., Gunner M. R., Batista V. S.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 50 ページ: 6312-6315

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] S1-state model of the O2-evolving complex of photosystem II2011

    • 著者名/発表者名
      Sandra Luber, Ivan Rivalta, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Gary W. Brudvig, and Victor S. Batista
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 50 ページ: 6308-6311

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distribution of the cationic state over the chlorophyll pair of photosystem II reaction center2011

    • 著者名/発表者名
      Saito K., Ishida T., Sugiura M., Kawakami K., Umena Y., Kamiya N., Shen J.-R., Ishikita H.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 133 ページ: 14379-14388

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 光化学系IIの高分解構造から見えてきた水分解の反応機構2012

    • 著者名/発表者名
      沈建仁, 梅名泰史, 川上恵典, 神谷信夫
    • 学会等名
      第59回日本生化学会近畿支部例会
    • 発表場所
      京都(招待講演)
    • 年月日
      2012-05-19
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 光合成酸素発生を可能にする光化学系IIの原子構造2012

    • 著者名/発表者名
      沈建仁, 梅名泰史, 川上恵典, 神谷信夫
    • 学会等名
      生化学会中国・四国支部2012年度支部会
    • 発表場所
      岡山(招待講演)
    • 年月日
      2012-05-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] High resolution structure of photosystem II and its implications for the mechanism of water-splitting2012

    • 著者名/発表者名
      Jian-Ren Shen
    • 学会等名
      Swedish Structural Biology Network 2012
    • 発表場所
      Tallberg, Sweden(基調講演)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Atomic structure of PSII that enables photosynthetic water-splitting2011

    • 著者名/発表者名
      Jian-Ren Shen
    • 学会等名
      Cordon Research Conference on Photosynthesis(招待講演)
    • 発表場所
      North Carolina, USA
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Atomic structure of photosystem II that enables photosynthetic water-splitting2011

    • 著者名/発表者名
      Jian-Ren Shen
    • 学会等名
      Botanikertagung 2011, International Botanical Congress of the Germany Botanical Society(招待講演)
    • 発表場所
      Berlin, Germany
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Atomic structure of PSII that enables photosynthetic water-splitting2011

    • 著者名/発表者名
      Jian-Ren Shen, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami and Nobuo Kamiya
    • 学会等名
      International Conference "Photosynthesis Research for Sustainability"(招待講演)
    • 発表場所
      Baku, Azerbaijan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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