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慢性感染ウイルスとヒト免疫のバイオインフォマティクス解析

研究課題

研究課題/領域番号 23659232
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 ウイルス学
研究機関熊本大学

研究代表者

上野 貴将  熊本大学, エイズ学研究センター, 准教授 (10322314)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2011年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
キーワード感染防御 / ワクチン / ウイルス / 感染症 / 進化 / HIV / 免疫回避
研究概要

ヒト感染免疫学では、感染個体で見られた現象が、ウイルスに起因するか、ヒトに起因するか明確にすることが困難なケースが多い。本研究では、HIV -1 Nef の遺伝子多型性、機能的多型性と、感染者の病態について、北米のコホートを用いた包括的な解析を試みた。慢性感染者(46検体)の血漿から nef 遺伝子を増幅し、プロウイルスベクターに組み込み、感染性ウイルスを調製した。 Nef 依存的なウイルス感染性やウイルス複製能の昂進、CD4 や MHC クラス I の発現低下、CD74 分子の発現昂進などの機能を測定した。同時に、感染者のウイルス量、CD4 カウント、HLA クラス I アリルとの相関について解析を行った。その結果、慢性感染者の Nef は、遺伝的に変異性が著しく、機能変化が大きかった。中でも、ウイルス感染性、複製能、CD74 発現昂進は特に変化が大きく、ウイルス感染性は感染者の病態マーカーと相関していた

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Dynamic range of Nef functionsin chronic HIV-1 infection2013

    • 著者名/発表者名
      Philip Mwimanzi, Tristan J Markle,Yoko Ogata, Eric Martin, MichiyoTokunaga, Macdonald Mahiti, Xiaomei TKuang, Bruce D Walker, Zabrina L Brumme,Mark A Brockman and *Takamasa Ueno
    • 雑誌名

      Virology

      巻: 439 号: 2 ページ: 74-80

    • DOI

      10.1016/j.virol.2013.02.005

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Attenuation of multiple Neffunctions in HIV-1 elite controllers2013

    • 著者名/発表者名
      Philip Mwimanzi, Tristan J Markle,Eric Martin, Yoko Ogata, Xiaomei TKuang, Michiyo Tokunaga, MacdonaldMahiti, Florencia Pereyra, ToshiyukiMiura, Bruce D Walker, Zabrina L Brumme,Mark A Brockman and *Takamasa Ueno
    • 雑誌名

      Retrovirology

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1186/1742-4690-10-1

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] HLA class I down-regulation by HIV-1Nef: What might we learn from naturalsequence variants?2013

    • 著者名/発表者名
      Philip Mwimanzi, Tristan J. Markle,Takamasa Ueno, Mark A. Brockman
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 4 号: 9 ページ: 1711-1730

    • DOI

      10.3390/v4091711

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of naturally-arising HIV Nefmutations on cytotoxic T lymphocyterecognition and Nef's functionality inprimary macrophages2011

    • 著者名/発表者名
      Philip Mwimanzi, Zafrul Hasan, RanyaHassan, Shinya Suzu, Masafumi Takiguchiand*TakamasaUeno
    • 雑誌名

      etrovirology

      巻: 8 号: 1 ページ: 50-50

    • DOI

      10.1186/1742-4690-8-50

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Nef のウイルスレセプター発現低下機能と病態2012

    • 著者名/発表者名
      緒方陽子、Philip Mwimanzi、李小光、徳永美知代、Tristan Markle、三浦聡之、Bruce Walker 、Zabrina Brumme 、MarkBrockman、上野貴将
    • 学会等名
      第26回日本エイズ学会学術集会・総会
    • 発表場所
      慶應義塾大学日吉キャンパス(神奈川)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Modulation of HIV-1Nef-mediated HLA class Idown-regulation activity duringdisease progression2012

    • 著者名/発表者名
      M. Mahiti, P. Mwimanzi, Y. Ogata, M.Tokunaga, B. Walker, Z. Brumme, M.Brockman, T. Ueno
    • 学会等名
      13th KumamotoAIDS seminar Aso Resort GrandiovrioHotel
    • 発表場所
      Kumamoto, Japan
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] HIV-1 Nef の遺伝子多型性と機能的可塑性2012

    • 著者名/発表者名
      上野貴将
    • 学会等名
      第14回白馬シンポジウムin 京都
    • 発表場所
      京都市国際交流会館
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Nefのウイルスレセプター発現低下機能と病態2012

    • 著者名/発表者名
      緒方陽子
    • 学会等名
      第26回日本エイズ学会学術集会・総会
    • 発表場所
      慶應義塾大学日吉キャンパス
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Nef のウイルスレセプター発現低下機能と病態2011

    • 著者名/発表者名
      緒方陽子、大津家裕仁、Philip Mwimanzi、徳永美知代、Tristan Markle、三浦聡之、Bruce Walker 、Zabrina Brumme 、MarkBrockman、上野貴将
    • 学会等名
      一般演題「アクセサリー遺伝子-2」 第25回日本エイズ学会学術集会・総会
    • 発表場所
      ハイアットリージェンシー東京
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Impact of HLA class I-drivengenetic variability in HIV-1 accessorygenes2011

    • 著者名/発表者名
      Zafrul Hasan, J. Carlson, H. Gatanaga,A. Le, C. Brumme, S. Oka, Z. Brumme, T.Ueno
    • 学会等名
      2011 The Annual Meeting of theJapanese Society for Immunology
    • 発表場所
      Chiba,Makuhari Messe, Japan
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Subtle effect of HLA classI-driven selective forces on thevariability of HIV-1 accessory genes2011

    • 著者名/発表者名
      Zafrul Hasan, J. Carlson, H. Gatanaga,A. Le, C. Brumme, S. Oka, Z. Brumme, T.Ueno
    • 学会等名
      12th Kumamoto AIDS Seminar and GCOEJoint International Symposium
    • 発表場所
      HotelNikko Kumamoto and Aso ResortGrandvrio Hotel, Kumamoto, Japan
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Effect of HLA class I-mediatedselective pressure on HIV-1 accessorygenes2011

    • 著者名/発表者名
      Zafrul Hasan, J. Carlson, H. Gatanaga,A. Le, C. Brumme, S. Oka, Z. Brumme, T.Ueno
    • 学会等名
      International Union ofMicrobiological Societies 2011Congress: Virus and host response
    • 発表場所
      Sapporo Convention Center, Sapporo,Japan
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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