次世代高速シークエンサーと高密度マイクロアレイを用いた遺伝性疾患病 因遺伝子の同定

• 研究課題/領域番号: 23659513
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 松原 洋一 東北大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (00209602)
• 研究分担者: 新堀 哲也 東北大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (40436134) ; 呉 繁夫 東北大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (10205221)
• 研究協力者: 青木 洋子 東北大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (80332500)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円); 2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 遺伝性疾患 / 遺伝子解析 / シークエンス

研究概要

新しい遺伝子解析機器である次世代高速シークエンサーと高密度マイクロアレイを用いて、これまで原因不明であった遺伝性疾患の病因遺伝子を探索した。その結果、筋萎縮や筋力低下をきたすミオパチーの病因遺伝子を明らかにすることができた。また、先天奇形症候群や内分泌疾患でもこれまでに知られていない新しい病因遺伝子を解明した。以上の成果は、各疾患の病態解明に役立つとともに、将来的には治療法の開発に有用と考えられる。

研究成果

• [雑誌論文] Exome sequencing identifies a novel TTN mutation in a family with hereditary myopathy with early respiratory failure (2013)
  • 著者名/発表者名: Izumi R, Niihori T, Aoki Y, Suzuki N, Kato M, Warita H, Takahashi T, Tateyama M, Nagashima T, Funayama R, Abe K, Nakayama K, Aoki M, Matsubara Y
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58(5) 号: 5 ページ: 259-66
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.9
  • NAID: 10031177220
  • 査読あり
• [雑誌論文] A case of almost unilateral focal dermal hypoplasia resulting from a novel mutation in the PORCN gene (2013)
  • 著者名/発表者名: Asano M, et al.
  • 雑誌名: Acta Derm Venereol 巻: 93 号: 1 ページ: 120-121
  • DOI: 10.2340/00015555-1399
  • 査読あり
• [雑誌論文] A young man with progressive subcortical lesions and optic nerve atrophy (2012)
  • 著者名/発表者名: Komatsuzaki S, Sakamoto O, Fuse N, Uematsu M, Matsubara Y, Ohura T. Clinical Reasoning
  • 雑誌名: Neurology 巻: 79(7) 号: 7
  • DOI: 10.1212/wnl.0b013e3182648bb6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Casitas B-cell lymphoma mutation in childhood T -cell acute lymphoblastic leukemia (2012)
  • 著者名/発表者名: Saito Y, Aoki Y, Muramatsu H, Makishima H, Maciejewski JP, Imaizumi M, Rikiishi T, Sasahara Y, Kure S, Niihori T, Tsuchiya S, Kojima S, Matsubara Y
  • 雑誌名: Leuk Res 巻: 36(8) 号: 8 ページ: 1009-15
  • DOI: 10.1016/j.leukres.2012.04.018
  • 査読あり
• [雑誌論文] Daily serial hemodynamic data during pregnancy and seasonal variation: The BOSHI study (2012)
  • 著者名/発表者名: Metoki H, Ohkubo T, Obara T, Akutsu K, Yamamoto M, Ishikuro M, Sakurai K, Iwama N, Katagiri M, Sugawara J, Hirose T, Sato M, Kikuya M, Yagihashi K, Matsubara Y, Yaegashi N, Mori S, Suzuki M, Imai Y
  • 雑誌名: variation : the BOSHI study. Clin Exp Hypertens 巻: 34 号: 4 ページ: 290
  • DOI: 10.3109/10641963.2012.681086
  • 査読あり
• [雑誌論文] Costello and CFC syndrome study group in Japan. Prevalence and clinical features of Costello syndrome and cardio-facio-cutaneous syndrome in Japan: findings from a nationwide epidemiological survey (2012)
  • 著者名/発表者名: Abe Y, Aoki Y, Kuriyama S, Kawame H, Okamoto N, Kurosawa K, Ohashi H, Mizuno S, Ogata T, Kure S, Niihori T, Matsubara Y
  • 雑誌名: Am J Med GenetA 巻: 158A(5) ページ: 1083-1094
  • 査読あり
• [雑誌論文] Homozygous c. 14576G> A Variant of<I> RNF213</I> Predicts Early-Onset and Severe Form of Moyamoya Disease (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S, Miyake N, Touho H, Nishimura-T, A, Kondo Y, Okada ; I, Tsurusaki ; Y, Doi H, Sakai H, Saitsu ; H, Shimojima K, Yamamoto T, Higurashi M, Kawahara, N, Kawauchi, H, Nagasaka, K, Okamoto N, Mori, T, Koyano S, Kuroiwa Y, Taguri M, Morita S, Matsuba S, Kure S, Matsumoto N
  • 雑誌名: Neurology 巻: 78(11) 号: 11 ページ: 803-10
  • DOI: 10.1212/wnl.0b013e318249f71f
  • 査読あり
• [雑誌論文] Simple and rapid genetic testing for citrin deficiency by screening 11 prevalent mutations in SLC25A13 (2012)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi A, Arai-Ichinoi N, Sakamoto O, Matsubara Y, Saheki T, Kobayashi K, Ohura T, Kure S
  • 雑誌名: Mol Genet Metab 巻: 105(4) 号: 4 ページ: 553-8
  • DOI: 10.1016/j.ymgme.2011.12.024
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in genes encoding the glycine cleavage system predispose to neural tube defects in mice and humans (2012)
  • 著者名/発表者名: Narisawa A
  • 雑誌名: Hum Mol Genet 巻: 21 号: 7 ページ: 1496-1503
  • DOI: 10.1093/hmg/ddr585
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human variome project country nodes: Documenting genetic information within a country (2012)
  • 著者名/発表者名: Patrinos GP, et al.
  • 雑誌名: Hum Mutat. 巻: 33(11) 号: 11 ページ: 1513-1519
  • DOI: 10.1002/humu.22147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prevalence and clinical features of Costello syndrome and cardio-facio-cutaneous syndrome in Japan (2012)
  • 著者名/発表者名: Abe Y, Aoki Y, Ogata T, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet A 巻: (accepted)(Epub ahead of print) 号: 5 ページ: 1083-1094
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.35292
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in genes encoding the glycine cleavage system predispose to neural tube defects in mice and humans (2012)
  • 著者名/発表者名: Narisawa A ほか
  • 雑誌名: Hum Mol Genet 巻: 21 ページ: 1496-1503
  • 査読あり
• [雑誌論文] Homozygous c.14576G>A variant in RNF213 is the strong predictor for early-onset and severe form of Moyamoya disease (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyatake S ほか
  • 雑誌名: Neurology 巻: 78 ページ: 803-810
  • 査読あり
• [雑誌論文] Implantable cardioverter defibrillator for progressive hypertrophic cardiomyopathy in a patient with LEOPARD syndrome and a novel PTPN11 mutation Gln510His (2011)
  • 著者名/発表者名: Wakabayashi Y, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet A 巻: 155A(10) 号: 10 ページ: 2529-2533
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.34194
  • 査読あり
• [雑誌論文] HRAS mutants identified in Costello syndrome patients can induce cellular senescence possible implications for the pathogenesis of Costello syndrome (2011)
  • 著者名/発表者名: Niihori T, Ihara K, 他22名
  • 雑誌名: Hum Genet 巻: 56(10) 号: 10 ページ: 707-15
  • DOI: 10.1038/jhg.2011.85
  • NAID: 10030661239
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association between cancer risk anddrug-metabolizing enzyme gene (CYP2A6, CYP2A13, CYP4B1, SULT1A1, GSTM1, and GSTT1) polymorphisms in cases of lung cancer in Japan (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamaki Y, Arai T, Sugimura H, Sasaki T, Honda M, Muroi Y, Matsubara Y, Kanno S, Ishikawa M, Hirasawa N, Hiratsuka M
  • 雑誌名: Drug Metab Pharmacokinet 巻: 26(5) ページ: 516-522
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional characterization of CYP2B6 allelic variants in demethylation of antimalarial artemether (2011)
  • 著者名/発表者名: Honda M, Muroi Y, Tamaki Y, Saigusa D, Suzuki N, Tomioka Y, Matsubara Y, Oda A, Hirasawa N, Hiratsuka M
  • 雑誌名: Drug Metab Dispos 巻: 39(10) ページ: 1860-1865
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel single nucleotide polymorphism of the CYP2A13 gene in Japanese individuals (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamaki Y, Honda M, Muroi Y, Arai T, Sugimura H, Matsubara Y, Kanno S, Ishikawa M, Hirasawa N, Hiratsuka M
  • 雑誌名: Drug Metab Pharmacokinet 巻: 26(5) ページ: 544-547
  • NAID: 130004463219
  • 査読あり
• [雑誌論文] Implications of prenatal diagnosis of the fetus with both interstitial deletion and a small marker ring originating from chromosome 5 (2011)
  • 著者名/発表者名: Ohashi H, et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet A 巻: 155A(1) 号: 1 ページ: 192-196
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.33764
  • 査読あり
• [雑誌論文] A familial case of LEOP ARD syndrome associated with a high-functioning autism spectrum disorder (2011)
  • 著者名/発表者名: Watanabe Y, Yano S, Niihori T, Aoki Y, Matsubara Y, Yoshino M, Matsuishi T
  • 雑誌名: Brain Dev 巻: 33(7) 号: 7 ページ: 576-9
  • DOI: 10.1016/j.braindev.2010.10.006
  • NAID: 10031121955
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide association study identifies RNF213 as the first Moyamoya disease gene (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamada F, et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 56(1) 号: 1 ページ: 34-40
  • DOI: 10.1038/jhg.2010.132
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cardio-facio-cutaneous syndrome with infantile spasms and delayed myelination (2011)
  • 著者名/発表者名: Aizaki K, Sugai K, Saito Y, Nakagawa E, Sasaki M, Aoki Y, Matsubara Y
  • 雑誌名: Brain Dev 巻: 33(2) 号: 2 ページ: 166-169
  • DOI: 10.1016/j.braindev.2010.03.008
  • NAID: 10029560675
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide association study identifies RNF213 as the first Moyamoya disease gene (2011)
  • 著者名/発表者名: Kamada F ほか
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 56 ページ: 34-40
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutation (variation) databases and registries: a rationale for coordination of efforts (2011)
  • 著者名/発表者名: Auerbach AD ほか
  • 雑誌名: Nature Rev Genet 巻: 12 ページ: 881-881
  • 査読あり
• [雑誌論文] HRAS mutants identified in Costello syndrome patients can induce cellular senescence: possible implications for the pathogenesis of Costello syndrome (2011)
  • 著者名/発表者名: Niihori T ほか
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 56 ページ: 707-715
  • NAID: 10030661239
  • 査読あり
• [学会発表] Noonan症候群類縁疾患と小児血液腫瘍におけるCBLの分子遺伝学的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 齋藤由佳、青木洋子、村松秀樹、今泉益栄、力石健、笹原洋二、呉繁夫、新堀哲也、小島勢二、松原洋一
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Noonan 症候群類縁疾患と小児血液腫瘍におけるCBL の分子遺伝学的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 齋藤 由佳
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 東北大学病院遺伝科の現状 (2012)
  • 著者名/発表者名: 飯倉 立夏
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Epidemiological features of Costello syndrome and cardio-facio-cutaneous syndrome: findings from the first nationwide survey (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Abe, Y. Aoki, S. Kuriyama, H. Kawame, N. Okamoto, K. Kurosawa, H. Ohashi, S. Mizuno, T. Ogata, S. Kure, T. Niihori, Y. Matsubara
  • 学会等名: 12th International Congress of Human Genetics
  • 発表場所: モントリオール、カナダ
• [学会発表] Identification of a susceptibility gene for Moyamoya disease, RNF213 by a genome-wide association study (2011)
  • 著者名/発表者名: S. Kure, F. Kamada, Y. Aoki ,Y. Abe S, Komatsuzaki, A. Kikuch, J.Kanno, T. Niihori, M. Fuji-mura,Y. Mashimo, M. Ono, N. Ishii, Y. Owada, Y. Suzuki, A. Hata,T. Tominaga, Y. Matsubara
  • 学会等名: 12th International Congress of Human Genetics
  • 発表場所: モントリオール、カナダ
• [備考] 遺伝病学分野ホームページ
  • URL: http://www.medgen.med.tohoku.ac.jp/