精神発達分子同定のための次世代シーケンサーを用いた一卵性双生児比較ゲノム解析

• 研究課題/領域番号: 23659519
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 山梨大学
• 研究代表者: 久保田 健夫 山梨大学, 医学工学総合研究部, 教授 (70293511)
• 研究分担者: 豊田 敦 国立遺伝学研究所, 生物遺伝資源情報総合センター, 特任准教授 (10267495) ; 佐々木 征行 国立精神, 神経医療研究センター病院, 部長 (60235273)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2012年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2011年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: ゲノム / 遺伝子 / 精神発達障害 / 双生児 / 次世代シーケンサー / エピジェネティクス / エピゲノム / 自閉症 / 神経疾患 / 双子 / レット症候群 / 比較 / 精神発達 / シーケンサー

研究概要

精神・神経症状の重症度に差異を認めるレット症候群の一卵性双生児を対象に、ゲノム(配列あるいは修飾)の比較解析を行った。次世代シーケンサーによる配列解析の結果、ユニークな配列領域と繰り返し配列領域のいずれでも差異は認められなかった。一方、DNAチップを用いてのゲノムのDNAメチル化修飾を比較したところ、双子間で著しい差異が3遺伝子で見いだされ、これらは双子間の重症度差異に関係していると考えられた。

研究成果

• [雑誌論文] Comparison of genomic and epigenomic expression in monozygotic twins discordant for Rett syndrome (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyake K,Yang C,Minakuchi Y, OhoriK,Soutome M,HirasawaT,KazukiY, Adachi N,Suzuki S, Itoh M, Goto Y, Andoh T, KurosawaH, OshimuraM, SasakiM, Toyoda A, Kubota T
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] subtelomere deletion with congenital glaucoma, severe mental retardation, and growth impairment (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakane T, Nakamura K, Hata S, Kamiya Y, Sato H, Kubota T, Sugita K
  • 雑誌名: Pediatr Int 巻: Vol.55、No.3 ページ: 376-381
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of genomic and epigenomic expression in monozygotic twins discordant for Rett syndrome. (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyake K, et al.
  • 雑誌名: PloS ONE 巻: 印刷中
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic understanding of gene-environment interactions in psychiatric disorders: a new concept of clinical genetics. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, et al.
  • 雑誌名: Clin Epigenetics 巻: 4 号: 1 ページ: 1-1
  • DOI: 10.1186/1868-7083-4-1
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic Mechanisms and Therapeutic Perspectives for Neurodevelopmental Disorders. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Hirasawa T, Miyake K.
  • 雑誌名: Pharmaceuticals 巻: 5 ページ: 369-383
  • 査読あり
• [雑誌論文] Spread of X-chromosome inactivation into chromosome 15 is associated with Prader-Willi syndrome phenotype in a boy with a t(X;15)(p21.1;q11.2) translocation. (2012)
  • 著者名/発表者名: Sakazume S, et al.
  • 雑誌名: Hum Genet 巻: 131 号: 1 ページ: 121-130
  • DOI: 10.1007/s00439-011-1051-4
  • 査読あり
• [雑誌論文] Copy number variations due to large genomic deletion in X-linked chronic granulomatous disease (2012)
  • 著者名/発表者名: Arai, T., et al
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7 号: 2 ページ: e27782-e27782
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0027782
  • 査読あり
• [雑誌論文] The incidence of hypoplasia of the corpus callosum in patients with dup (X)(q28) involving MECP2 is associated with the location of distal breakpoints. (2012)
  • 著者名/発表者名: Honda S, et al.
  • 雑誌名: Am J Med Genet 巻: 158A 号: 6 ページ: 1292-1303
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.35321
  • 査読あり
• [雑誌論文] Spread of X-chromosome inactivation into chromosome 15 is associated with Prader-Willi syndrome phenotype in a boy with a t(X;15)(p21.1;q11.2) translocation. (2012)
  • 著者名/発表者名: Sakazume S, Ohashi H, Sasaki Y, Harada N, Nakanishi K, Sato H, Emi M, Endoh K, Sohma R, Kido Y, Nagai T, Kubota T.
  • 雑誌名: Hum Genet 巻: 131 ページ: 121-130
  • 査読あり
• [雑誌論文] Kubota T, Miyake K, Hirasawa T.Epigenetic understanding of gene-environment interactions in psychiatric disorders: a new concept of clinical genetics. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Miyake K, Hirasawa T
  • 雑誌名: Clin Epigenetics 巻: 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] The protocadherins, PCDHB1 and PCDH7, are regulated by MeCP2 in neuronal cells and brain tissues: implication for pathogenesis of Rett syndrome. (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyake K, Hirasawa T, Soutome M, Itoh M, Goto Y, Endoh K, Takahashi K, Kudo S, Nakawaga T, Yokoi S, Taira T, Inazawa J, Kubota T
  • 雑誌名: BMC Neurosci 巻: 12
  • 査読あり
• [学会発表] 母子分離ストレスによるマウス脳海馬領域のグルココルチコイド受容体の発現変化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 平澤孝枝、石田哲史、田原佑里子、三宅邦夫、久保田健夫
  • 学会等名: 第6回日本エピジェエティクス研究会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] エピゲノム解析より推定された受精後転座による派生染色体の形成. (2012)
  • 著者名/発表者名: 坂爪悟、永井敏郎、城戸康宏、大橋博文、久保田健夫
  • 学会等名: 第115回日本小児科学会学術集会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県）
• [学会発表] 母子分離ストレスによるマウス脳海馬領域のグルココルチコイド受容体の発現変化. (2012)
  • 著者名/発表者名: 平澤孝枝 石田哲史 田原佑里子 三宅邦夫 久保田健夫.
  • 学会等名: 第6回日本エピジェエティクス研究会
  • 発表場所: 学術総合センター（東京都）
• [学会発表] プラダーウィリー症候群の遺伝子検査：診断確定と治療法選択への貢献. (2012)
  • 著者名/発表者名: 久保田健夫、根元篤、中根貴弥.
  • 学会等名: 第19回日本遺伝子診療学会大会
  • 発表場所: 三井ガーデンホテル（千葉県）
• [学会発表] Validation of DOHaD theory using mouse model: Effect of nutritional condition on gene expression of neonate brain and liver. (2012)
  • 著者名/発表者名: Furuse T, Kohda T, Kushida T, Yamada I, Miura I, Ozaki A, Kaneda H, Kobayash K, Ishino F, Kubota T, Wakana S.
  • 学会等名: 第35回日本神経科学大会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（愛知県）
• [学会発表] 次世代シークエンサーにより、原因遺伝子の同定に至ったCVIDの1例. (2012)
  • 著者名/発表者名: 釜江智佳子、満生紀子、小原明、野口恵美子、久保田健夫、本間健一、小原収、今井耕輔、野々山恵章.
  • 学会等名: 第3回関東甲越免疫不全症研究会
  • 発表場所: ベルサール八重洲（東京都）
• [学会発表] ２型ICF症候群の原因遺伝子候補ZBTB24の機能解析． (2012)
  • 著者名/発表者名: 新田洋久、久保田健夫、古庄知己、高橋浩士、佐々木裕之．
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 京王プラザホテル（東京都）
• [学会発表] Mental stress in perinatal period causes metabolic dysregulation assocaited with the concept of Developmental Origins of health and diseases (DOHaD). (2012)
  • 著者名/発表者名: Hirasawa T, Tahara Y, Satoshi I, Obata C, Kubota T.
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県）
• [学会発表] No evidence of genetic difference for clinical severity between monozygotic twins with Rett syndrome. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Miyake K, Hirasawa T, Minakuchi Y, Toyoda A.
  • 学会等名: The American society of Human Genetics 62nd Annual Meeting
  • 発表場所: サンフランシスコ国際会議場（米国）
• [学会発表] 特別講演「エピジェネティクス～小児の発達に関わる新しい遺伝学的メカニズム～」. (2012)
  • 著者名/発表者名: 久保田健夫
  • 学会等名: 第71回東京矯正歯科学会大会
  • 発表場所: 有楽町朝日ホール（東京都）
  • 招待講演
• [学会発表] 基本講座 いまさら聞けない遺伝医学「エピジェネティクス、基本を教えて」. (2012)
  • 著者名/発表者名: 久保田健夫
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 京王プラザホテル（東京都）
  • 招待講演
• [学会発表] Idenfiticaiton of MeCP2-target synaptic molecules associated with pathogenesis of Rett syndrome (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyake K, Hirasawa T, Kubota T
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] The epigenetic regulation of glucocorticoid receptors in juvenile maternal separation stress (2011)
  • 著者名/発表者名: Hirasawa T, Ishida I, Miyake K, Endo A, Kubota T
  • 学会等名: The 32nd Naito Conference (Yamanashi)
  • 発表場所: Yamanashi
• [学会発表] Idenfiticaiton of MeCP2-target synaptic molecules associated with pathogenesis of Rett syndrome. (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyake K, Hirasawa T, Kubota T.
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
• [学会発表] レット症候群の治療にむけた研究展開. シンポジウム３「Rett症候群の治療に向けた研究展開」 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久保田健夫、三宅邦夫、平澤孝枝.
  • 学会等名: 第53回日本小児神経学会総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
• [図書] Chapter: Epigenetic Modulation of Human Neurobiological Disorders (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Miyake K, Hirasawa T, Onaka T, Yamasue H
  • 出版者: Elisevier(印刷中)
• [図書] The Mechanisms of DNA Replictaion (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Miyake K, Hirasawa T. Section 4
  • 出版者: Chromatin and Epigenetic Influences on DNA Replication, Chapter 13: The Mechanism of Epigenetic Modifications during DNA Replication
• [図書] Chapter: Epigenetic Modulation of Human Neurobiological Disorders. Chapter: Epigenetic Modulation of Human Neurobiological Disorders. In “Epigenetics in human disease”. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Miyake K, Hirasawa T, Onaka T, Yamasue H.
  • 総ページ数: 592
  • 出版者: Elisevier
• [図書] Section 4: Chromatin and Epigenetic Influences on DNA Replication, Chapter 13: The Mechanism of Epigenetic Modifications during DNA Replication. In "The Mechanisms of DNA Replictaion”. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Miyake K, Hirasawa T.
  • 総ページ数: 487
  • 出版者: Intech (Open Access Publisher)
• [図書] Neurodegenerative Diseases (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyake K, Hirasawa T, Koide T, Kubota T.
  • 出版者: Springer Science+Business Media, LLC Landes Bioscience
• [備考] (山梨大学医学部環境遺伝医学講座)
  • URL: http://www.epigenetmed.com
• [備考] 山梨大学 大学院医学工学総合研究部 環境遺伝医学講座
  • URL: http://www.epigenetmed.com/
• [備考]
  • URL: http://www.epigenetmed.com/