• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

非アルコール性脂肪肝炎から肝癌発症機序の次世代シークエンサーを用いた解析

研究課題

研究課題/領域番号 23701082
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 腫瘍診断学
研究機関京都大学

研究代表者

北本 卓也  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 特定技術職員 (10456882)

研究協力者 堀田 紀久子  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 特定助教 (30360639)
北本 綾  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 教務補佐員 (30381627)
研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードゲノムワイド相関解析 / 非アルコール性脂肪肝炎 / 次世代シークエンサー / PNPLA3 / SAMM50 / PARVB / 次世代シークエンス / 異所性脂肪蓄積
研究概要

392 人の非アルコール性脂肪肝炎(NAFLD)と JSNP のデータベース(934 人)でゲノムワイド相関解析(GWAS)を行い、別の 172 人の NAFLD と 1012 人のコントロールで再現性を確認した。 PNPLA3領域に存在する rs738409 が NAFLD と最も強く相関し、脂肪蓄積や AST、ALT とも強い相関を示した。 SAMM50 遺伝子上の SNP は中性脂肪の低下やフェリチンやヒアルロン酸と強い相関を示した。 PARVB 遺伝子上の SNP は組織の線維化や NAS と強い相関を示した。 NAFLD 感受性領域であるPNPLA3 領域(約 150kb)に関して、19 人の NAFLD と 9 人のコントロールで long PCR を行い次世代シークエンサーで解析した。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] <i>NUDT3</i> rs206936 is associated with body mass index in obese Japanese women2013

    • 著者名/発表者名
      Kitamoto A, Kimoto T, Mizusawa S, Teranishi H, So R, Matsuo T, Nakata Y, Hyogo H, Ochi H, Nakamura T, Kamohara S, Miyatake N, Kotani K, Komatsu R, Itoh N, Mineo I, Wada J, Yoneda M, Nakajima A, Funahashi T, Miyazaki S, Tokunaga K, Masuzaki H, Ueno T, Chayama K, Hamaquchi K, Yamada K, Hanafusa T, Okikawa S, Sakata T, Tanaka K, Matsuzawa Y, Nako K, Sekine A, Hotta K
    • 雑誌名

      Endocrine Journal

      巻: 60 号: 8 ページ: 991-1000

    • DOI

      10.1507/endocrj.EJ13-0100

    • NAID

      10031195769

    • ISSN
      0918-8959, 1348-4540
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide scan revealed that polymorphisms in the PNPLA3, SAMM50, and PARVB genes are associated with development and progression of nonalcoholic fatty liver disease in Japan2013

    • 著者名/発表者名
      Kitamoto T, Kitamoto A, Yoneda M, Hyogo H, Ochi H, Nakamura T, Teranishi H, Mizusawa S, Ueno T, Chayama K, Nakajima A, Nakao K, Sekine A, Hotta K.
    • 雑誌名

      Hum Genet

      巻: (印刷中)

    • NAID

      120005474457

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Replication Study of 15 Recently Published Loci for Body Fat Distribution in the Japanese Population2013

    • 著者名/発表者名
      Hotta K
    • 雑誌名

      Journal of Atherosclerosis and Thrombosis

      巻: 20 号: 4 ページ: 336-350

    • DOI

      10.5551/jat.14589

    • NAID

      130004444671

    • ISSN
      1340-3478, 1880-3873
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide scan revealed that polymorphisms in the PNPLA3, SAMM50, and PARVB genes are associated with development and progression of nonalcoholic fatty liver disease in Japan.2013

    • 著者名/発表者名
      Kitamoto T
    • 雑誌名

      Human Genetics

      巻: 3 号: 7 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1007/s00439-013-1294-3

    • NAID

      120005474457

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association between type 2 diabetes genetic susceptibility loci and visceral and subcutaneous fat area as determined by computed tomography2012

    • 著者名/発表者名
      Hotta K, et al (last)
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: (In press) 号: 5 ページ: 305-310

    • DOI

      10.1038/jhg.2012.21

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic variations in the CYP17A1 and NT5C2 genes are associated with a reduction in visceral and subcutaneous fat areas in Japanese women2012

    • 著者名/発表者名
      Hotta K, et al (last)
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: 57 号: 1 ページ: 46-51

    • DOI

      10.1038/jhg.2011.127

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Computed tomography analysis of the association between the SH2B1 rs7498665 single-nucleotide polymorphism and visceral fat area2011

    • 著者名/発表者名
      Hotta K, et al (last)
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: 56 号: 10 ページ: 716-719

    • DOI

      10.1038/jhg.2011.86

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of variations in the FTO, SCG3 and MTMR9 genes with metabolic syndrome in a Japanese population2011

    • 著者名/発表者名
      Hotta K, et al (last)
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: 56 号: 9 ページ: 716-719

    • DOI

      10.1038/jhg.2011.74

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた薬物代謝関連遺伝子群のターゲットリシーケンス2012

    • 著者名/発表者名
      北本綾
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第57回大会
    • 発表場所
      東京都京王プラザホテル
    • 年月日
      2012-10-25
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた薬物代謝関連遺伝子群のターゲットリシーケンス2012

    • 著者名/発表者名
      北本綾
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第57回大会
    • 発表場所
      東京都 京王プラザホテル
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 薬物代謝関連遺伝子群の高密度、高精度な遺伝子型決定法の確立2011

    • 著者名/発表者名
      北本綾
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第56回大会
    • 発表場所
      千葉県幕張メッセ
    • 年月日
      2011-11-11
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] PNPLA3遺伝子上のrs738409と非アルコール性脂肪肝炎とのケース・コントロール相関解析2011

    • 著者名/発表者名
      堀田紀久子、北本卓也、北本綾、米田正人、中島淳、上野登隆、兵庫秀幸、越智秀典、茶山一彰、関根章博、中尾一和
    • 学会等名
      第54回日本糖尿病学会年次学術集会
    • 発表場所
      北海道 さっぽろ芸術文化の館
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 薬物代謝関連遺伝子群の高密度、高精度な遺伝子型決定法の確立2011

    • 著者名/発表者名
      北本綾、北本卓也、水澤精穂、寺西啓、堀田紀久子、上嶋健治、小杉眞司、中尾一和、関根章博
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第56回大会
    • 発表場所
      千葉県 幕張メッセ
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi