マルチオミクス解析を利用したがん幹細胞特異的スプライシングバリアント探索法の開発

• 研究課題/領域番号: 23701092
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 腫瘍診断学
• 研究機関: 静岡県立静岡がんセンター(研究所)
• 研究代表者: 畠山 慶一 静岡県立静岡がんセンター(研究所), その他部局等, 研究員 (20564157)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2012年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2011年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 癌 / バイオマーカー / オミクス / がん幹細胞 / スプライシング / Splicing variant / Proteomics / Transcriptmics / Cancer stem cell

研究概要

本申請は、マルチオミクス解析を利用してがん幹細胞特異的なバイオマーカーの新規探索技術を開発することを目的としている。本研究では、主に転写物を対象としたトランスクリプトミクスとタンパク質を対象としたプロテオミクスを主体とした解析を行っている。
この解析の結果、がん特異的な異常な転写物(スプライスバリアント)とそのバリアントから翻訳された異常なタンパク質(プロテインアイソフォーム)を同定することができた。

研究成果

• [雑誌論文] Novel protein isoforms of carcinoembryonic antigen are secreted from pancreatic, gastric and colorectal cancer cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Hatakeyama K, Wakabayashi-Nakao K, Ohshima K, Sakura N, Yamaguchi K, Mochizuki T
  • 雑誌名: BMC Res. Notes 巻: 6 号: 1 ページ: 381-381
  • DOI: 10.1186/1756-0500-6-381
  • 査読あり
• [雑誌論文] Placenta-specific novel splice variants of Rho GDP dissociation inhibitor β are highly expressed in cancerous cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hatakeyama K, Fukuda Y, Ohshima K, Terashima M, Yamaguchi K, MochizukiT
  • 雑誌名: BMC Res Notes 巻: 5 号: 1 ページ: 666-666
  • DOI: 10.1186/1756-0500-5-666
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel protein extraction approach using micro-sized chamber for evaluation of proteins eluted from formalin-fixed paraffin-embedded tissue sections (2012)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Kanako Wakabayashi-Nakao, Yutaka Aoki, Shun-ichiro Ogura, Ken Yamaguchi, Takashi Nakajima, Taka-Aki Sato, Tohru Mochizuki and Isamu Hayashi
  • 雑誌名: Proteome Science 巻: 10 号: 1 ページ: 19-25
  • DOI: 10.1186/1477-5956-10-19
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a novel protein isoform derived from cancer-related splicing variants using combined analysis of transcriptome and proteome. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hatakeyama K, Ohshima K, Fukuda Y, Ogura S, Terashima M, Yamaguchi K, Mochizuki T
  • 雑誌名: Proteomic 巻: 11 号: 11 ページ: 2275-2282
  • DOI: 10.1002/pmic.201100016
  • 査読あり
• [学会発表] Survivin expression in circulating tumor cells of patients with gastric cancer (2014)
  • 著者名/発表者名: Masanori Terashima, Keiichi Hatakeyama, Yushi Yamakawa, Norihiko Sugisawa, Yuichiro Miki, Rie Makuuchi, Hironobu Goto, Masanori Tokunaga, Yutaka Tanizawa, Etsuro Bando, Taiichi Kawamura, Keiichi Oshima and Toru Mochizuki
  • 学会等名: 2014 ASCO Gastrointestinal Cancers Symposium
  • 発表場所: San Francisco, CA
• [学会発表] Survivin expression in circulating tumor cells of patients with gastric cancer (2014)
  • 著者名/発表者名: Masanori Terashima, Keiichi Hatakeyama, Yushi Yamakawa, Norihiko Sugisawa, Yuichiro Miki, Rie Makuuchi, Hironobu Goto, Masanori Tokunaga, Yutaka Tanizawa, Etsuro Bando, Taiichi Kawamura, Keiichi Oshima, Toru Mochizuki
  • 学会等名: 2014 ASCO Gastrointestinal Cancers Symposium
  • 発表場所: San Francisco, California, USA
• [学会発表] Identification of novel protein isoforms in secretome using combined analysis of microarray and massspectrometry (2013)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Kanako Wakabayashi-Nakao, Yutaka Tanizawa, Masanori Terashima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 神奈川県,パシフィコ横浜
• [学会発表] Identification of the novel CEACAM5 protein isoforms ingastrointestinal cancer cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Kanako Nakao, Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 神奈川県,パシフィコ横浜
• [学会発表] Identification of novel protein isoforms in secretome using combined analysis of microarray and mass spectrometry (2013)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Kanako Wakabayashi-Nakao, Yutaka Tanizawa, Masanori Terashima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 神奈川県, パシフィコ横浜
• [学会発表] Identification of the novel CEACAM5 protein isoforms in gastrointestinal cancer cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Kanako Nakao, Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 神奈川県, パシフィコ横浜
• [学会発表] 胃癌における新規スプライシングバリアントの臨床病理学的検討 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山川雄士,谷澤豊,畠山慶一,坂東悦郎,川村泰一,徳永正則,絹笠祐介,上坂克彦,金本秀行,望月徹,寺島雅典
  • 学会等名: 第84回日本胃癌学会総会
  • 発表場所: 大阪府,大阪国際会議場
• [学会発表] Quantification of splicing variant expression levels in peripheral bloodof patients with gastric cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Kanako Wakabayashi-Nakao, Yutaka Tanizawa, Masanori Terashima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 北海道,ロイトン札幌,さっぽろ芸文館,札幌市教育文化会館
• [学会発表] 癌細胞から放出されるエクソソーム中のプロテオーム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大島啓一,畠山慶一,中尾香菜子,寺島雅典,山口建,望月徹
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 北海道,ロイトン札幌,さっぽろ芸文館,札幌市教育文化会館
• [学会発表] CEACAM4の甲状腺髄様癌における特異的発現 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中尾香菜子,畠山慶一,大島啓一,山口建,望月徹
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 北海道,ロイトン札幌,さっぽろ芸文館,札幌市教育文化会館
• [学会発表] 胃癌における新規スプライシングバリアントの臨床病理学的検討 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山川 雄士, 谷澤 豊, 畠山 慶一, 坂東悦郎, 川村泰一, 徳永正則 , 絹笠祐介, 上坂克彦, 金本秀行, 望月 徹, 寺島雅典
  • 学会等名: 第84回日本胃癌学会総会
  • 発表場所: 大阪国際会議場 (大阪府)
• [学会発表] Quantification of splicing variant expression levels in peripheral blood of patients with gastric cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Kanako Wakabayashi-Nakao, Yutaka Tanizawa, Masanori Terashima, Ken Yamaguchi, Tohru Mochizuki
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌, さっぽろ芸文館, 札幌市教育文化会館 (北海道)
• [学会発表] 癌細胞から放出されるエクソソーム中のプロテオーム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大島啓一, 畠山慶一, 中尾香菜子, 寺島雅典, 山口建, 望月徹
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌, さっぽろ芸文館, 札幌市教育文化会館 (北海道)
• [学会発表] CEACAM4の甲状腺髄様癌における特異的発現 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中尾香菜子, 畠山慶一, 大島啓一, 山口建, 望月徹
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌, さっぽろ芸文館, 札幌市教育文化会館 (北海道)
• [学会発表] Identification of a Novel Protein Isoform Derived from Cancer-related Splicing Variants Using a Proteomics Approach (2011)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Kanako Wakabayashi-Nakao, Masanori Terashima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 愛知県,名古屋国際会議場
• [学会発表] Novel Proteomic Approach for Identification of Protein Isoform Derived from Cancer-related SplicingVariants (2011)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Kanako Wakabayashi-Nakao, Masanori Terashima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: がん若手研究者ワークショップ文部科学省科学研究費新学術領域研究「がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動」
  • 発表場所: 長野県,アートランドホテル蓼科
• [学会発表] がん関連スプライシングバリアント由来の新規プロテインアイソフォームの同定に向けた新規プロテオーム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 畠山慶一,大島啓一,中尾香菜子,寺島雅典,山口建,望月徹
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年大会
  • 発表場所: 新潟県,朱鷺メッセ
• [学会発表] Identification of a Novel Protein Isoform Derived from Cancer-related Splicing Variants Using a Proteomics Approach (2011)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Kanako Wakabayashi-Nakao, Masanori Terashima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 愛知県, 名古屋国際会議場
• [学会発表] Novel Proteomic Approach for Identification of Protein Isoform Derived from Cancer-related Splicing Variants (2011)
  • 著者名/発表者名: Keiichi Hatakeyama, Keiichi Ohshima, Kanako Wakabayashi-Nakao, Masanori Terashima, Ken Yamaguchi and Tohru Mochizuki
  • 学会等名: がん若手研究者ワークショップ 文部科学省科学研究費新学術領域研究「がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動」
  • 発表場所: 長野県, アートランドホテル蓼科
• [学会発表] がん関連スプライシングバリアント由来の新規プロテインアイソフォームの同定に向けた新規プロテオーム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 畠山慶一, 大島啓一, 中尾香菜子, 寺島雅典, 山口建, 望月徹
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年大会
  • 発表場所: 新潟県, 朱鷺メッセ
• [産業財産権] CEACAM5遺伝子のスプライシングバリアント (2013)
  • 発明者名: 中尾香菜子,望月徹,畠山慶一
  • 権利者名: 静岡県
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2013-035758
  • 出願年月日: 2013-02-26
• [産業財産権] 甲状腺髄様がん判定方法 (2013)
  • 発明者名: 中尾香菜子,望月徹,畠山慶一
  • 権利者名: 静岡県
  • 産業財産権種類: 特許
  • 取得年月日: 2013-12-26
• [産業財産権] スプライスバリアント (2013)
  • 発明者名: 望月徹,畠山慶一
  • 権利者名: 静岡県
  • 産業財産権種類: 特許
  • 取得年月日: 2013-02-28
• [産業財産権] 甲状腺髄様がん判定方法 (2013)
  • 発明者名: 中尾香菜子, 望月徹, 畠山慶一
  • 権利者名: 中尾香菜子, 望月徹, 畠山慶一
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2013-04-25
  • 取得年月日: 2013-12-26
• [産業財産権] ＣＥＡＣＡＭ５遺伝子のスプライシングバリアント (2013)
  • 発明者名: 中尾香菜子, 望月徹, 畠山慶一
  • 権利者名: 中尾香菜子, 望月徹, 畠山慶一
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2013-035758
  • 出願年月日: 2013-02-26
• [産業財産権] 甲状腺髄様がん判定方法 (2012)
  • 発明者名: 中尾香菜子, 望月徹, 畠山慶一
  • 権利者名: 中尾香菜子, 望月徹, 畠山慶一
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2012-113732
  • 出願年月日: 2012-05-17
• [産業財産権] ホルマリン固定パラフィン包埋組織切片中の蛋白質の賦活化処理システム及び賦活化処理方法 (2011)
  • 発明者名: 青木豊,海野ゆかり,佐藤孝明,林勇,畠山慶一,小倉俊一郎
  • 権利者名: 静岡県,島津製作所
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2011-117334
  • 出願年月日: 2011-05-25
• [産業財産権] スプライシングバリアント (2011)
  • 発明者名: 望月 徹, 畠山 慶一
  • 権利者名: 静岡県
  • 産業財産権番号: 2011-179788
  • 出願年月日: 2011