大腸癌臨床検体を用いたリン酸化プロテオーム解析およびSRM/MRM法による検証

• 研究課題/領域番号: 23701093
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 腫瘍診断学
• 研究機関: 独立行政法人医薬基盤研究所
• 研究代表者: 白水 崇 独立行政法人医薬基盤研究所, 創薬基盤研究部, 研究員 (00582678)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 大腸癌 / プロテオミクス / バイオマーカー

研究概要

進行度の異なる大腸癌の臨床検体を用いた大規模リン酸化プロテオーム解析により、バイオマーカー候補および悪性化に関わる分子の探索を行った。解析条件の最適化により、これまで同定されなかった多くの分子が同定された。転移性株の解析結果との比較とパスウェイ解析により、バイオマーカー候補分子の絞り込みを行った。またin vitro浸潤能試験により、癌浸潤に関わる新規機能分子を同定した。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of Missing Proteins in the neXtProt Database and Unregistered Phosphopeptides in the PhosphoSitePlus Database As Part of the Chromosome-Centric Human Proteome Project. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takashi Shiromizu
  • 雑誌名: Journal of Proteome Research 巻: 印刷中 号: 6 ページ: 2414-2421
  • DOI: 10.1021/pr300825v
  • 査読あり
• [学会発表] Proteomic analysis of highly metastatic colorectal cancer cells established from orthotopic metastatic mouse model (2012)
  • 著者名/発表者名: 白水 崇
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 北海道
  • 年月日: 2012-09-19
• [学会発表] Quantitative proteomic profiling of orthotopic xenograft mouse model of colorectal cancer metastasis (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Shiromizu
  • 学会等名: HUPO2012 11th World Congress
  • 発表場所: Boston, MA in the United States
  • 年月日: 2012-09-09
• [学会発表] 同所性移植モデルによる大腸癌転移性株の定量的プロテオーム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 白水 崇
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2012年大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-07-26
• [学会発表] Proteomic analysis of highly metastatic colorectal cancer cells established from orthotopic metastatic mouse model. (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Shiromizu
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 北海道
• [学会発表] Quantitative proteomic profiling of orthotopic xenograft mouse model of colorectal cancer metastasis. (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Shiromizu
  • 学会等名: HUPO2012 11th World Congress
  • 発表場所: Boston, MA in the United States
• [学会発表] Phosphoproteomic analysis of human colorectal cancer tissues for exploring a novel cancer metastatic Biomarker (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水 崇
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] Phosphoproteomic analysis of clinical colon cancer specimen; Exploring a novel factor of cancer metastasis (2011)
  • 著者名/発表者名: Takashi Shiromizu
  • 学会等名: HUPO
  • 発表場所: スイス、ジュネーブ
  • 年月日: 2011-09-05
• [学会発表] Phosphoproteomic analysis of clinical colon cancer specimen for exploring a novel factor involved in cancer metastasis (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水 崇
  • 学会等名: 第9回日本プロテオーム学会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] 大規模リン酸化プロテオーム解析による癌転移に関わる新規リン酸化シグナルの探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水 崇
  • 学会等名: 第63回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: 北海道
  • 年月日: 2011-06-27
• [学会発表] Phosphoproteomic analysis of human colorectal cancer tissues for exploring a novel cancer metastatic biomarker (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Shiromizu, R. Narumi, T. Kuga, J. Adachi, H. Matsubara, M. Matsumoto, K. Nakayama, T. Tomonaga
  • 学会等名: 第70回 日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 大規模リン酸化プロテオーム解析による癌転移に関わる新規リン酸化シグナルの探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 白水崇，鳴海良平，久家貴寿，足立淳，松原久裕，松本雅紀，中山敬一，朝長毅
  • 学会等名: 第６３回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: 北海道