心発生における転写因子-エピジェネティック因子による転写制御機構の解明

• 研究課題/領域番号: 23710224
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 二村 圭祐 大阪大学, 医学系研究科, 助教 (00462713)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2012年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2011年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: 疾患エピゲノミクス / 転写 / ゲノム / 心臓 / エピジェネティクス

研究概要

ゲノムにはおよそ 20,000 個の遺伝子が存在している。転写因子やエピジェネティック因子は遺伝子の選択を行う重要な因子である。これらの因子の異常によって先天性心疾患がおこる。しかし、これらの因子が心発生中にどの遺伝子を選択・制御しているか全く不明であった。今回、先天性心疾患の原因となる転写因子のゲノム上の存在領域を次世代シークエンサーによって同定し、これらの転写因子が制御している遺伝子群を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] The Transcription Factors Tbx18 and Wt1 Control the Epicardial Epithelial-Mesenchymal Transition through Bi-Directional Regulation of Slug in Murine Primary Epicardial Cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takeichi M
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 8 号: 2 ページ: e57829-e57829
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0057829
  • 査読あり
• [雑誌論文] Essential role for miR-196a in brown adipogenesis of white fat progenitor cells. (2012)
  • 著者名/発表者名: Mori M, Nakagami H, Rodriguez-Araujo G, Nimura K, Kaneda Y.
  • 雑誌名: PLoS Biol 巻: 10(4) 号: 4 ページ: e1001314-e1001314
  • DOI: 10.1371/journal.pbio.1001314
  • 査読あり
• [雑誌論文] Androgen-regulated transcriptional control of sialyltransferases in prostate cancer cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Nonomura N, Takayama H, et al
  • 雑誌名: PLoS One 巻: e31234 号: 2 ページ: 1570-1573
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0031234
  • 査読あり
• [雑誌論文] Androgen-Regulated Transcriptional Control of Sialyltransferases in Prostate Cancer Cells. (2012)
  • 著者名/発表者名: Hatano K, Miyamoto Y, Mori M, Nimura K, Nakai Y, Nonomura N, Kaneda Y
  • 雑誌名: PLos one 巻: 7
  • 査読あり
• [雑誌論文] PDGFRalpha-positive cells in bone marrow are mobilized by high mobility group box 1 (HMGB1) to regenerate injured epithelia. (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamai K, Yamazaki T, Chino T, Ishii M, Otsuru S, Kikuchi Y, Iinuma S, Saga K, Nimura K, Shimbo T, Umegaki N, Katayama I, Miyazaki J, Takeda J, McGrath JA, Uitto J, Kaneda Y.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 巻: 108(16) 号: 16 ページ: 6609-14
  • DOI: 10.1073/pnas.1016753108
• [雑誌論文] DNA methyltransferase 3b preferentially associates with condensed chromatin (2011)
  • 著者名/発表者名: Kashiwagi K., Nimura K., Ura K., Kaneda Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 39 号: 3 ページ: 874-888
  • DOI: 10.1093/nar/gkq870
  • 査読あり
• [雑誌論文] Immunogene therapy using immunomodulating HVJ-E vector augments anti-tumor effects in murine malignant glioma. (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsuda M, Nimura K, Shimbo T, Hamasaki T, Yamamoto T, Matsumura A, Kaneda Y.
  • 雑誌名: J Neurooncol. 巻: 103(1) 号: 1 ページ: 19-31
  • DOI: 10.1007/s11060-010-0355-x
• [雑誌論文] 心臓発生におけるエピジェネティックな転写制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 雑誌名: 生化学 巻: 83 ページ: 1043-1047
  • NAID: 10030345715
• [雑誌論文] ヒストン修飾による心臓転写因子の機能制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐(責任著者) 、金田安史
  • 雑誌名: Annual Review 循環器2011 ページ: 17-22
• [雑誌論文] PDGFRα-positive cells in bone marrow are mobilized by high mobility group box 1 (HMGB1) to regenerate injured epithelia. (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamai K, Yamazaki T, Chino T, Ishii M, Otsuru S, Kikuchi Y, Iinuma S, Saga K, Nimura K, Shimbo T, Umegaki N, Katayama I, Miyazaki J, Takeda J, McGrath J A, Uitto J, Kaneda Y
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 巻: 108
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA methyltransferase 3b preferentially associates with condensed chromatin. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kashiwagi K, Nimura K, Ura K, Kaneda Y
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 39
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic regulation of transcription in heart development (2011)
  • 著者名/発表者名: Nimura K
  • 雑誌名: 生化学 巻: 83
  • NAID: 10030345715
• [学会発表] 心発生における転写環境の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 若手ワークシ ップ@鬼怒川
  • 発表場所: 栃木
• [学会発表] 心発生における転写環境の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 若手ワークショップ＠鬼怒川
  • 発表場所: 栃木
• [学会発表] 心臓発生における転写制御機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 大阪大学生命機能研究科コロキウム
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2012-10-10
• [学会発表] Transcription regulation in heart development (2012)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 生命医薬情報学連合大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 心発生における転写環境の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 転写代謝システム班会議
  • 発表場所: 筑波
• [学会発表] A cardiac transcription factor links chromatin conformation to transcription termination (2012)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: EMBO Conferenece
  • 発表場所: ドイツ
• [学会発表] Transcription regulation in heart development (2012)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] A cardiac transcription factor links chromatin conformation to transcription termination (2012)
  • 著者名/発表者名: 二村圭祐
  • 学会等名: EMBO Conference
  • 発表場所: ドイツ