オーミクス実験データ解釈におけるボトルネックの解消

• 研究課題/領域番号: 23710231
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: システムゲノム科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 岩崎 渉 東京大学, 大学院理学系研究科, 准教授 (50545019)
• 研究期間 (年度): 2011-04-28 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2014年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
• キーワード: バイオインフォマティクス / オーミクス / データ解釈 / データベース / ゲノム / ネットワーク / データ可視化 / テキストマイニング

研究成果の概要

爆発的なペースでオーミクス実験データが蓄積し続ける中、研究者がそれらのデータを論文や様々なデータベースの内容に照らし合わせつつ仮説を構築するステップが生命科学研究における深刻なボトルネックとなっている。本研究では、論文データベースおよび近年様々なプロジェクトで整備されてきたデータベース群のデータをネットワークの形式で表現することで、膨大なオーミクス実験データの解釈を支援するための情報技術開発を行った。

研究成果

• [雑誌論文] GroupTracker: Video Tracking System for Multiple Animals under Severe Occlusion. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsukasa Fukunaga, Shoko Kubota, Shoji Oda, and Wataru Iwasaki.
  • 雑誌名: Computational Biology and Chemistry 巻: in press ページ: 39-45
  • DOI: 10.1016/j.compbiolchem.2015.02.006
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Computational Ethology：バイオインフォマティクスと動物行動学の融合 (2015)
  • 著者名/発表者名: 福永津嵩，岩崎渉．
  • 雑誌名: 領域融合レビュー 巻: 4 ページ: e003
  • DOI: 10.7875/leading.author.4.e003
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Tepidicaulis marinus gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium reducing nitrate to nitrous oxide strictly under microaerobic conditions. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mio Takeuchi, Takao Yamagishi, Yoichi Kamagata, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Taiki Katayama, Satoshi Hanada, Hideyuki Tamaki, Katsumi Marumo, Hiroto Maeda, Munetomo Nedachi, Wataru Iwasaki, Yuichi Suwa, and Susumu Sakata.
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, published online (2015) 巻: in press 号: Pt_6 ページ: 1749-1754
  • DOI: 10.1099/ijs.0.000167
  • 査読あり
• [雑誌論文] CapR : revealing structural specificities of RNA-binding protein target recognition using CLIP-seq data (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsukasa Fukunaga, Haruka Ozaki, Goro Terai, Kiyoshi Asai, Wataru Iwasaki and Hisanori Kiryu
  • 雑誌名: Genome Biology 巻: 15 号: 1
  • DOI: 10.1186/gb-2014-15-1-r16
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] MetaMetaDB: A Database and Analytic System for Investigating Microbial Habitability. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ching-chia Yang and Wataru Iwasaki
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 9 号: 1 ページ: e87126-e87126
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0087126
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] BioHackathon series in 2011 and 2012 : penetration of ontology and linked data in life science domains (2014)
  • 著者名/発表者名: Katayama T, Komiyama Y, et al.
  • 雑誌名: Journal of Biomedical Semantics 巻: 5 号: 1 ページ: 5-5
  • DOI: 10.1186/2041-1480-5-5
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] CLOCK-controlled polyphonic regulations of circadian rhythms through canonical and non-canonical E-boxes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hikari Yoshitane, Haruka Ozaki, Hideki Terajima, Ngoc-Hien Du, Yutaka Suzuki, Taihei Fujimori, Naoki Kosaka, Shigeki Shimba, Sumio Sugano, Toshihisa Takagi, Wataru Iwasaki, and Yoshitaka Fukada.
  • 雑誌名: Molecular and Cellular Biology 巻: 34 号: 10 ページ: 1776-1787
  • DOI: 10.1128/mcb.01465-13
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Functional characterization of flavobacteria rhodopsins reveals a unique class of light-driven chloride pump in bacteria. (2014)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Yohei Kumagai, Hana Kim, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Wataru Iwasaki, Edward F. DeLong, and Kazuhiro Kogure.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 巻: 111 号: 18 ページ: 6732-6737
  • DOI: 10.1073/pnas.1403051111
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crossing Borders for Science. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sebastian J. Schultheiss, Joshua SungWoo Yang, Wataru Iwasaki, Shu-Hsi Lin, Angela Jean, and Magali Michaut
  • 雑誌名: PLOS Computational Biology 巻: 10 号: 3 ページ: e1003519-e1003519
  • DOI: 10.1371/journal.pcbi.1003519
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Complete genome sequence of Winogradskyella sp. strain PG-2, a proteorhodopsin-containing marine flavobacterium. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yohei Kumagai, Susumu Yoshizawa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Wataru Iwasaki, and Kazuhiro Kogure.
  • 雑誌名: Genome Announcements, 2, . (2014) 巻: 2 号: 3
  • DOI: 10.1128/genomea.00490-14
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Methylocaldum marinum sp. nov., a novel thermotolerant methane oxidizing bacterium isolated from marine sediments. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mio Takeuchi, Yoichi Kamagata, Kenshiro Oshima, Satoshi Hanada, Hideyuki Tamaki, Katsumi Marumo, Hiroto Maeda, Munetomo Nedachi, Masahira Hattori, Wataru Iwasaki, and Susumu Sakata.
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 64 号: Pt_9 ページ: 3240-3246
  • DOI: 10.1099/ijs.0.063503-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Parallel selection on gene copy number variations through evolution of three-spined stickleback genomes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shotaro Hirase, Haruka Ozaki, and Wataru Iwasaki.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 号: 1 ページ: 735-735
  • DOI: 10.1186/1471-2164-15-735
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Discovery of osmotic sensitive transcription factors in fish intestine via a transcriptomic approach. (2014)
  • 著者名/発表者名: Marty Kwok-Shing Wong, Haruka Ozaki, Yutaka Suzuki, Wataru Iwasaki, and Yoshio Takei.
  • 雑誌名: BMC Genomics, 15, 1134. (2014) 巻: 15 号: 1 ページ: 1134-1134
  • DOI: 10.1186/1471-2164-15-1134
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] NGSデータ解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 尾崎遼，岩崎渉．
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 32 ページ: 3197-3202
• [雑誌論文] Evolutionary origin of the Scombridae (tunas and mackerels) : members of a Paleogene adaptive radiation with 14 other pelagic fish families (2013)
  • 著者名/発表者名: Miya, M., Friedman, M., Satoh, T.P., Takeshima, H., Sado, T., Iwasaki, W., Yamanoue, Y., Nakatani, M., Mabuchi, K., Inoue, J.G., Poulsen, J.Y., Fukunaga, T., Sato, Y. and Nishida, M
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 8 号: 9 ページ: e73535-e73535
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0073535
  • 査読あり
• [雑誌論文] MitoFish and MitoAnnotator : a mitochondrial genome database of fish with an accurate and automatic annotation pipeline (2013)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki, W., Fukunaga T., Isagozawa R., Yamada K., Maeda Y., Satoh T.P., Sado T., Mabuchi K., Takeshima H., Miya, M. and Nishida M
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 30 号: 11 ページ: 2531-2540
  • DOI: 10.1093/molbev/mst141
  • 査読あり
• [雑誌論文] From β- to α-Proteobacteria: the Origin and Evolution of Rhizobial Nodulation Genes nodIJ. (2013)
  • 著者名/発表者名: Seishiro Aoki, Motomi Ito, and Wataru Iwasaki.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 30 号: 11 ページ: 2494-2508
  • DOI: 10.1093/molbev/mst153
  • 査読あり
• [雑誌論文] ENCODEプロジェクトで明らかになったこと (2013)
  • 著者名/発表者名: 尾崎遼，岩崎渉
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: 32 ページ: 101-106
  • NAID: 40019538138
  • 査読あり
• [雑誌論文] Integration of interactive, multi-scale network navigation approach with Cytoscape for functional genomics in the big data era (2012)
  • 著者名/発表者名: Thanet Praneenararat, Toshihisa Takagi, and Wataru Iwasaki
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 13(Suppl 7) 号: Suppl 7 ページ: S24-S24
  • DOI: 10.1186/1471-2164-13-s7-s24
  • 査読あり
• [雑誌論文] 水圏生物学における次世代シーケンサー活用の現状と応用可能性への展望 (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐藤行人，八谷剛史，岩崎渉
  • 雑誌名: 水産育種 巻: 41 ページ: 17-32
  • NAID: 40019232266
• [雑誌論文] Interactive, multiscale navigation of large and complicated biological networks (2011)
  • 著者名/発表者名: Thanet Praneenararat, Toshihisa Takagi, Wataru Iwasaki
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 27 号: 8 ページ: 1121-1127
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btr083
  • 査読あり
• [雑誌論文] 文献管理・文献推薦 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉，山本泰智，高木利久．
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 29 ページ: 2556-2562
• [学会発表] MetaMetaDB:微生物ゲノムと環境を簡便に結びつけるデータベース (2015)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉，楊靜佳
  • 学会等名: 第9回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 神戸大学六甲第二キャンパス（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-03-06
• [学会発表] 定量生物学と情報生物学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 定量生物学の会第七回年会
  • 発表場所: 九州大学筑紫キャンパス（福岡県春日市）
  • 年月日: 2015-01-11
  • 招待講演
• [学会発表] 微生物の生息環境の多様性とその進化：MetaMetaDBによる解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉，楊 靜佳
  • 学会等名: 環境微生物系学会合同大会2014
  • 発表場所: 浜松アクトシティコングレスセンター（静岡県浜松市）
  • 年月日: 2014-10-24
• [学会発表] CLOCKによる古典的・非古典的E-boxを介した概日時計の“多声的”制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: Hikari Yoshitane, Haruka Ozaki, Hideki Terajima, Ngoc-Hien Du, Yutaka Suzuki, Taihei Fujimori, Naoki Kosaka, Shigeki Shimba, Sumio Sugano, Toshihisa Takagi, Wataru Iwasaki, and Yoshitaka Fukada.
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会2014年年会／第3回生命医薬情報学連合大会
  • 発表場所: 仙台国際センター（宮城県仙台市）
  • 年月日: 2014-10-03
• [学会発表] Fundamental bottlenecks in big-data biology (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-27
  • 招待講演
• [学会発表] バイオインフォマティクスから時空間解析へ (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 日本学術会議学術フォーラム 生命情報ビッグデータ時代における新しい生命科学
  • 発表場所: 日本学術会議講堂（東京都港区）
  • 年月日: 2014-08-29
  • 招待講演
• [学会発表] MetaMetaDB: Microbial Habitability解析のためのメタ・メタゲノムデータベース (2013)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉、楊靜佳
  • 学会等名: 第29回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学郡元キャンパス，鹿児島
• [学会発表] バイオインフォマティクスから迫るアーキアの正体と多様性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第29回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学郡元キャンパス，鹿児島
  • 招待講演
• [学会発表] Cell-free synthesis, purifications, and crystallization of Proteorhodopsins (2013)
  • 著者名/発表者名: Toshiaki Hosaka, Susumu Yoshizawa, Tomomi Kumura-Someya, Masakatsu Hato, Wataru Iwasaki, Kazuhiro Kogure, Shigeyuki Yokoyama, and Mikako Shirouzu
  • 学会等名: 7th International Conference on Structural Genomics
  • 発表場所: 京王プラザホテル札幌，北海道
• [学会発表] MetaMetaDB: From metagenomes to the habitats of microbes (2013)
  • 著者名/発表者名: Ching-chia Yang and Wataru Iwasaki
  • 学会等名: NGS現場の会第三回研究会
  • 発表場所: 神戸国際会議場，兵庫
• [学会発表] 空と海と陸をめぐる微生物の「旅」 (2013)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉，町山麻子，平岡聡史，藤井和史，伊知地稔，井上健太郎，木暮一啓
  • 学会等名: NGS現場の会第三回研究会
  • 発表場所: 神戸国際会議場，兵庫
• [学会発表] トランスクリプトーム時系列解析で迫る広塩性魚の浸透圧調節メカニズムの進化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 尾崎遼，Marty Wong，竹井祥郎，岩崎渉
  • 学会等名: NGS現場の会第三回研究会
  • 発表場所: 神戸国際会議場，兵庫
• [学会発表] MitoAnnotator : 超高速シーケンサー時代のミトコンドリアゲノムアノテーションシステム (2013)
  • 著者名/発表者名: 福永津嵩，岩崎渉
  • 学会等名: NGS現場の会第三回研究会
  • 発表場所: 神戸国際会議場，兵庫
• [学会発表] 次世代シーケンサーによる魚類ミトコンドリアゲノミクス: Parallel Tag Sequencingのプロトコル確立 (2013)
  • 著者名/発表者名: 平瀬祥太朗，武島弘彦，西田睦，岩崎渉
  • 学会等名: NGS現場の会第三回研究会
  • 発表場所: 神戸国際会議場，兵庫
• [学会発表] Gaussian mixture model-based multiple objects tracking for analysis of animal social behaviors (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsukasa Fukunaga and Wataru Iwasaki
  • 学会等名: Bioinformatics Week in Odaiba (BiWO2013)
  • 発表場所: 産業総合技術研究所臨海副都心センター，東京
• [学会発表] 次世代シーケンシングによる魚類の大量ミトコンドリアゲノム分析法の確立 (2013)
  • 著者名/発表者名: 武島弘彦，平瀬祥太朗，岩崎渉，田畑諒一，渡辺勝敏，西田睦
  • 学会等名: 2013年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 宮崎観光ホテル，宮崎
• [学会発表] 高性能自動アノテーションパイプラインMitoAnnotatorの実装による魚類ミトコンドリアゲノムデータベースMitoFishの充実 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西田睦，福永津嵩，砂子澤遼太，山田浩一郎，佐藤崇，佐土哲也，宮正樹，武島弘彦，馬渕浩司，前田泰伸，岩崎渉
  • 学会等名: 2013年度日本魚類学会年会
  • 発表場所: 宮崎観光ホテル，宮崎
• [学会発表] MitoFish and MitoAnnotator: A Mitochondrial Genome Database of Fish with an Accurate and Automatic Annotation Pipeline (2013)
  • 著者名/発表者名: Wataru Iwasaki, Tsukasa Fukunaga, Ryota Isagozawa, Koichiro Yamada, Yasunobu Maeda, Takashi P. Satoh, Tetsuya Sado, Kohji Mabuchi, Hirohiko Takeshima, Masaki Miya, and Mutsumi Nishida
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会2013年年会／第2回生命医薬情報学連合大会
  • 発表場所: タワーホール船堀，東京
• [学会発表] Novel marine moderately thermophilic microbes isolated from microbial consortium depends on methane (2013)
  • 著者名/発表者名: Mio Takeuchi, Katsumi Marumo, Hiroto Maeda, Munetomo Nedachi, Kenshiro Oshima, Taiki Katayama, Takao Yamagishi, Wataru Iwasaki, Yoichi Kamagata, Satoshi Hanada, Hideyuki Tamaki, Masahira Hattori, Yuichi Suwa, and Susumu Sakata
  • 学会等名: The 5th Taiwan-Korea-Japan International Symposium on Microbial Ecology
  • 発表場所: National Central University, Jhongli, Taiwan
• [学会発表] MetaMetaDB: Revealing all the habitats of microbes (2013)
  • 著者名/発表者名: Ching-chia Yang and Wataru Iwasaki
  • 学会等名: The 5th Taiwan-Korea-Japan International Symposium on Microbial Ecology
  • 発表場所: National Central University, Jhongli, Taiwan
• [学会発表] 鹿児島湾海底堆積物中に生息するメタンを基盤とする新規中温性微生物群の生理学的・遺伝学的特徴の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹内美緒，丸茂克美，根建宗具，前田広人，鎌形洋一，大島健志郎，岩崎渉，片山泰樹，山岸昂夫，花田智，坂田将
  • 学会等名: 第29回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学郡元キャンパス，鹿児島
• [学会発表] 海水淡水化逆浸透膜に発生したバイオフィルムのメタゲノミクス (2013)
  • 著者名/発表者名: 伊知地稔，町山麻子，高橋唯，千浦博，伊藤世人，北出有，花田茂久，田中祐之，岩崎渉，木暮 一啓
  • 学会等名: 第29回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学郡元キャンパス，鹿児島
• [学会発表] 次世代シーケンシングによるアユの集団ミトコンドリアゲノミクスへのアプローチ (2013)
  • 著者名/発表者名: 武島弘彦，平瀬祥太朗，岩崎渉，井口恵一朗，西田睦
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド，兵庫
• [学会発表] ChIP-Seqデータからの結合モチーフの列挙とその応用 (2013)
  • 著者名/発表者名: 尾崎遼，岩崎渉，高木利久
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド，兵庫
• [学会発表] インタラクティブ・マルチスケール・ネットワーク・ナビゲーション (2013)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉，タネート プラーニーナラーラト，高木利久
  • 学会等名: 第５２回 人工知能学会 分子生物情報研究会（SIG-MBI）・第１７回オープンバイオ研究会
  • 発表場所: 北陸先端科学技術大学院大学(能美)
• [学会発表] 大規模な生命科学データを解釈するためのバイオインフォマティクス技術 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会・沖縄セミナー
  • 発表場所: 独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構，恩納
• [学会発表] 微生物ゲノムはどのように進化してきたのか？ (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第５回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会(招待講演)
  • 発表場所: ろうきん研修所富士センター，駿東郡小山町
• [学会発表] 大規模ゲノム解析から読み解く生命システムの進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第27回微生物生態学会若手交流会(招待講演)
  • 発表場所: 京都大学，京都
• [学会発表] 超高速遺伝子配列解読技術とバイオインフォマティクス (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第48回海中海底工学フォーラム(招待講演)
  • 発表場所: 東京大学柏キャンパス，柏
• [学会発表] 文献管理＋文献推薦＝TogoDoc (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第3回研究会
  • 発表場所: 基礎生物学研究所，岡崎
• [学会発表] 期待値最大化法に基づいたゲノム進化過程の再構築 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 共同利用重点型研究による研究集会 「ゲノム多様性と進化の統計数理」
  • 発表場所: 統計数理研究所，東京
• [学会発表] 系統推定結果の表現と認識 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第155回農林交流センターワークショップ(招待講演)
  • 発表場所: 農林水産省農林水産技術会議事務局筑波事務所，つくば
• [学会発表] TogoDoc server/client system: smart recommendation and efficient management of life science literature. (2011)
  • 著者名/発表者名: Wataru Iwasaki, Yasunori Yamamoto, and Toshihisa Takagi.
  • 学会等名: The 2011 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics / Chem-Bio Informatics Society Annual Meeting 2011 (CBI/JSBi2011)
  • 発表場所: Kobe International Conference Center, Kobe, Japan
• [学会発表] 文献管理と文献推薦を一体化する生命科学研究者のための統合文献ソリューション (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: SPARC Japan セミナー2011(招待講演)
  • 発表場所: 国立情報学研究所，東京
• [学会発表] NGSを用いた転写制御の時系列解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 次世代シークエンサ現場の会第一回研究会
  • 発表場所: 熱海ニューフジヤホテル，熱海
• [学会発表] Wheel Tree: Intuitive Representation of Multiple Phylogenetic Topologies. (2011)
  • 著者名/発表者名: Wataru Iwasaki and Toshihisa Takagi.
  • 学会等名: 2011 Annual Meeting of Society for Molecular Biology and Evolution
  • 発表場所: Kyoto University, Kyoto, Japan
• [学会発表] TogoDoc: Paper Recommendation and Management. (2011)
  • 著者名/発表者名: Wataru Iwasaki, Yasunori Yamamoto, and Toshihisa Takagi.
  • 学会等名: 5th Asian Young Researchers Conference for Computational and Omics Biology
  • 発表場所: University of Sciences and Technology, Daejeon, Korea.
• [学会発表] バイオインフォマティクスからの系統樹可視化
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 日本生物地理学会第68回年次大会
  • 発表場所: 立教大学，東京
  • 招待講演
• [学会発表] バイオインフォマティクスの利用と考え方
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会
  • 発表場所: 東京大学大気海洋研究所，千葉
  • 招待講演
• [学会発表] 系統推定結果の表現と認識
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第176回農林交流センターワークショップ
  • 発表場所: 農林水産省農林水産技術会議事務局筑波事務所，茨城
  • 招待講演
• [学会発表] 次世代ＤＮＡシーケンサデータ解析分野のバイオインフォマティクス人材の見つけ方
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド，兵庫
  • 招待講演
• [学会発表] 生命の振る舞いと成り立ちに迫るためのバイオインフォマティクス
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第５回研究会
  • 発表場所: 東京大学検見川セミナーハウス，千葉
• [学会発表] 微生物生態系インフォマティクスの世界観
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: NGiME (Next Generation in Microbial Ecology) 勉強会
  • 発表場所: 愛媛大学，愛媛
  • 招待講演
• [学会発表] 微生物ゲノム・メタゲノム、ChIP-Seq
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 次世代シーケンサー研究推進のためのデータ解析ワークショップ（NGSワークショップ）
  • 発表場所: つくば国際会議場，茨城
  • 招待講演
• [学会発表] MitoAnnotator: An accurate and automatic mitochondrial genome annotation pipeline
  • 著者名/発表者名: Tsukasa Fukunaga and Wataru Iwasaki
  • 学会等名: 7th Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB)
  • 発表場所: 産業総合技術研究所臨海副都心センター，東京
• [学会発表] What underlies repeated gains and losses of osmoregulatory abilities in teleost fishes?
  • 著者名/発表者名: 尾崎遼，Marty Wong，竹井祥郎，岩崎渉
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第５回研究会
  • 発表場所: 東京大学検見川セミナーハウス，千葉
• [学会発表] 大規模比較ゲノム解析が明らかにするプロテオロドプシンを持つ海洋細菌のゲノム進化
  • 著者名/発表者名: 熊谷洋平，吉澤晋，木暮一啓，岩崎渉
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第５回研究会
  • 発表場所: 東京大学検見川セミナーハウス，千葉
• [学会発表] 微生物の津波土壌への適応および進化
  • 著者名/発表者名: 平岡聡史，町山麻子，岩崎渉
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第５回研究会
  • 発表場所: 東京大学検見川セミナーハウス，千葉
• [学会発表] バイオイメージインフォマティクスから探る魚類の社会性行動
  • 著者名/発表者名: 福永津嵩，岩崎渉
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第５回研究会
  • 発表場所: 東京大学検見川セミナーハウス，千葉
• [学会発表] 大規模比較ゲノム解析が明らかにするプロテオロドプシンを持つ海洋細菌のゲノム進化
  • 著者名/発表者名: 熊谷洋平，吉澤晋，木暮一啓，岩崎渉
  • 学会等名: 第8回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学世田谷キャンパス，東京
• [学会発表] 微生物の津波土壌への適応および進化
  • 著者名/発表者名: 平岡聡史，町山麻子，岩崎渉
  • 学会等名: 第8回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学世田谷キャンパス，東京
• [学会発表] メタゲノムデータの比較をab initioに行う手法の開発
  • 著者名/発表者名: 尾崎遼，岩崎渉，高木利久
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜バイオ大学(長浜)
• [学会発表] 遺伝子の旅と地球の変動
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会 第４回研究会
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(岡崎)
• [学会発表] 生命科学データの表現と解釈
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 産業技術総合研究所生命情報工学研究センターHPCIセミナー
  • 発表場所: 産業技術総合研究所生命情報工学研究センター(東京)
  • 招待講演
• [学会発表] 時計タンパク質CLOCKのChIP-Seq解析と概日性トランスクリプトーム解析
  • 著者名/発表者名: 吉種光，尾崎遼，寺嶋秀騎，ゴク・ヒエンズ，岩崎渉，鈴木穣，深田吉孝
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡)
• [学会発表] 時計タンパク質CLOCKのChIP-Seq解析と概日性トランスクリプトーム解析
  • 著者名/発表者名: 吉種光，尾崎遼，寺嶋秀騎，ゴク・ヒエンズ，岩崎渉，鈴木穣，深田吉孝
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡)
• [学会発表] ゲノムインフォマティクスは系統分類学にパラダイムシフトを引き起こすか？
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第32回日本微生物系統分類研究会年次大会
  • 発表場所: 産業技術総合研究所 つくばセンター(つくば)
  • 招待講演
• [学会発表] 系統推定結果の表現と認識
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第166回農林交流センターワークショップ
  • 発表場所: 農林水産省農林水産技術会議事務局筑波事務所（つくば）
  • 招待講演
• [学会発表] この広い地球とバイオインフォマティクス
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 生命医薬情報学連合大会シンポジウム
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京）
  • 招待講演
• [学会発表] Integration of interactive, multi-scale network navigation approach with Cytoscape for functional genomics in the big data era
  • 著者名/発表者名: Thanet Praneenararat, Toshihisa Takagi, and Wataru Iwasaki
  • 学会等名: 11th International Conference on Bioinformatics
  • 発表場所: Bangkok, Thailand
• [学会発表] Bioinformatics for eco-systems biology
  • 著者名/発表者名: Wataru Iwasaki
  • 学会等名: The 28th Annual meeting of the Japanese Society of Microbial Ecology
  • 発表場所: 豊橋技術科学大学（豊橋）
  • 招待講演
• [学会発表] この青い惑星で微生物はどのように進化してきたのか？
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第１６回 微研部員会主催セミナー
  • 発表場所: 大阪大学微生物病研究所（大阪）
  • 招待講演
• [学会発表] How can bioinformatics open up new fields in marine microbiology?
  • 著者名/発表者名: Wataru Iwasaki
  • 学会等名: CREST International Workshop on Aquatic Microbial Ecology
  • 発表場所: 東京大学大気海洋研究所（柏）
• [備考]
  • URL: http://iwasakilab.bi.s.u-tokyo.ac.jp/iwasaki/publications.html
• [備考] 海洋細菌で見つけた新しい光エネルギー利用機構 －塩化物イオンを輸送するポンプの発見－
  • URL: http://www.aori.u-tokyo.ac.jp/research/news/2014/20140408.html