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遺伝暗号解読の正確性を担うtRNAウォブル位修飾ウリジン生合成機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23710265
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ケミカルバイオロジー
研究機関東京大学

研究代表者

鈴木 健夫  東京大学, 大学院・工学系研究科, 講師 (90533125)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2011年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワード細胞内化学反応 / tRNA / 転写後修飾 / ミトコンドリア / デコーディング / 生合成 / ウォブル位 / ウリジン / LC/MS
研究概要

ヒトミトコンドリアtRNAウォブル位修飾ウリジンの修飾遺伝子であるhGTPBP3とhMTO1の機能解析を行った。2遺伝子産物は共にミトコンドリア局在性を示し、細胞内で複合体を形成していた。酵母の相同遺伝子欠損株を用いた相補実験の結果から、2遺伝子はヒト-酵母の組み合わせで修飾活性を発現しないこと、またhGTPBP3のC末端が修飾の形成に必要であることが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (17件) (うち査読あり 17件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (14件)

  • [雑誌論文] Decoding mechanism of non-universal genetic codes in Loligo bleekeri mitochondria2013

    • 著者名/発表者名
      Ohira T, Suzuki T (第2著者), 他5名
    • 雑誌名

      J . Biol. Chem

      巻: 288 号: 11 ページ: 7645-7652

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.439554

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of a putative methyltransferase SAV1081 from Staphylococcus aureus2013

    • 著者名/発表者名
      Kita, S., Tanaka, Y., Hirano, N., Kimura, S., Suzuki, T., Suzuki, T., Yao, M. and Tanaka, I.
    • 雑誌名

      Protein & Peptide Letters

      巻: 20 号: 5 ページ: 530-537

    • DOI

      10.2174/0929866511320050006

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Base methylations in the double-stranded RNA by a fused methyltransferase bearing unwinding activity2012

    • 著者名/発表者名
      Kimura S., Ikeuchi Y., Kitahara K., Sakaguchi Y., Suzuki T., Suzuki T.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: (掲載確定)(印刷中) 号: 9 ページ: 4071-4085

    • DOI

      10.1093/nar/gkr1287

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular basis of dihydrouridine formation on tRNA2011

    • 著者名/発表者名
      Yu F, Tanaka Y, Yamashita K, Suzuki T (第4著者), 他4名
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A

      巻: 108 号: 49 ページ: 19593-19598

    • DOI

      10.1073/pnas.1112352108

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Taurine-containing uridine modifications in tRNA anticodons are required to decipher non-universal genetic codes in ascidian mitochondria2011

    • 著者名/発表者名
      Suzuki T (第1著者), 他8名
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem

      巻: 286 号: 41 ページ: 35494

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.279810

    • URL

      https://pure.teikyo.jp/en/publications/70d6d0f7-88b7-4afe-a2b1-a2ea848a121b

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Loss of ribosomal RNA modification causes developmental defects in zebrafish2011

    • 著者名/発表者名
      Higa-Nakamine S, Suzuki T (第2著者) 他7名
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 40 号: 1 ページ: 391-398

    • DOI

      10.1093/nar/gkr700

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human Mitochondrial tRNAs : Biogenesis, Function, Structural Aspects, and Diseases2011

    • 著者名/発表者名
      Suzuki T, Nagao A and Suzuki T
    • 雑誌名

      Annu. Rev. Genet

      巻: 45 号: 1 ページ: 299-329

    • DOI

      10.1146/annurev-genet-110410-132531

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deficit of tRNA(Lys) modification by Cdkall causes the development of type 2 diabetes in mice2011

    • 著者名/発表者名
      Wei FY., Suzuki T., Watanabe S., Kimura S., Kaitsuka T., Fujimura A., Matsui H., Atta M., Michiue H., Fontecave M., Yamagata K., Suzuki T., Tomizawa K.
    • 雑誌名

      The Journal of Clinical Investigation

      巻: 121 号: 9 ページ: 3598-3608

    • DOI

      10.1172/jci58056

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Actin-binding protein ABP140 is a methyltransferase for 3-methylcytidine at position 32 of tRNAs in Saccharomyces cerevisiae2011

    • 著者名/発表者名
      Noma A, Yi S, Katoh T, Takai Y, Suzuki T and Suzuki T
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 17 号: 6 ページ: 1111-1119

    • DOI

      10.1261/rna.2653411

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human mitochondrial diseases caused by lack of taurine-modification in mitochondrial tRNAs2011

    • 著者名/発表者名
      Suzuki T, Nagao A and Suzuki T
    • 雑誌名

      Wiley Interdiscip Rev RNA

      巻: 2 号: 3 ページ: 376-386

    • DOI

      10.1002/wrna.65

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular basis of dihydrouridine formation on tRNA2011

    • 著者名/発表者名
      Futao Yu, Yoshikazu Tanaka, Keitaro Yamashita, Takeo Suzuki, Akiyoshi Nakamura, Nagisa Hirano, Tsutomu Suzuki, Min Yao, Isao Tanaka
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: 108 ページ: 19593-19598

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Taurine-containing uridine modifications in tRNA anticodons are required to decipher non-universal genetic codes in ascidian mitochondria2011

    • 著者名/発表者名
      Takeo Suzuki, Kenjyo Miyauchi, Tsutomu Suzuki, Shin-ichi Yokobori, Naoki Shigi, Akiko Kondow, Nono Takeuchi, Akihiko Yamagishi, and Kimitsuna Watanabe
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 286 ページ: 35494-8

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Loss of ribosomal RNA modification causes developmental defects in zebrafish2011

    • 著者名/発表者名
      Sayomi Higa-Nakamine, Takeo Suzuki, Tamayo Uechi, Anirban Chakraborty, Yukari Nakajima, Mikako Nakamura, Naoko Hirano, Tsutomu Suzuki and Naoya Kenmochi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research.

      巻: 40 ページ: 391-8

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human Mitochondrial tRNAs: Biogenesis, Function, Structural Aspects, and Diseases.2011

    • 著者名/発表者名
      Tsutomu Suzuki, Asuteka Nagao and Takeo Suzuki
    • 雑誌名

      Annu. Rev. Genet.

      巻: 45 ページ: 299-329

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deficit of Lys-tRNA Modification by Cdkal1 Causes the Development of Type 2 Diabetes in Mice2011

    • 著者名/発表者名
      FY Wei, T Suzuki, S Watanabe, S Kimura, T Kaitsuka, A Fujimura, H Matsui, M Atta, H Michiue, M Fontecave, K Yamagata, T Suzuki and K Tomizawa
    • 雑誌名

      J. Clin. Invest.

      巻: 121 ページ: 3598-608

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Actin-binding protein ABP140 is a methyltransferase for 3-methylcytidine at position 32 of tRNAs in Saccharomyces cerevisiae2011

    • 著者名/発表者名
      Akiko Noma, Sanghyun Yi, Takayuki Katoh, Yoshimi Takai, Takeo Suzuki and Tsutomu Suzuki
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 17 ページ: 1111-1119

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human mitochondrial diseases caused by lack of taurine-modification in mitochondrial tRNAs2011

    • 著者名/発表者名
      Tsutomu Suzuki, Asuteka Nagao and Takeo Suzuki
    • 雑誌名

      WIREs RNA

      巻: 2 ページ: 376-386

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Characterization of Human Homologues of MnmE and GidA, Required for an xm5U-type Uridine Modification at the Wobble Position of Mitochondrial tRNAs2011

    • 著者名/発表者名
      Takeo Suzuki et al
    • 学会等名
      RNA2011Kyoto
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Base methylations in the double-stranded RNA by a fused methyltransferase bearing unwinding activity in ribosome assembly2011

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Kimura,Yoshiho Ikeuchi,Kei Kitahara,Yuriko Sakaguchi,Takeo Suzuki,Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      MBSJ2011
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Native chemical structures of Escherichia coli tRNAs determined by mass spectrometric analysis2011

    • 著者名/発表者名
      Kenjyo Miyauchi,Satoshi Kimura,Yuriko Sakaguchi,Takeo Suzuki,Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      MBSJ2011
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] The third pathway of tRNA export requires the retrograde import of precursor tRNA from cytoplasm to nucleus for its maturation in Saccharomyces cerevisiae2011

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Ohira,Kenjyo Miyauchi,Yuriko Sakaguchi,Takeo Suzuki,Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      MBSJ2011
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] The acetylation of 18S rRNA is an essential modification to synthesize the small subunit of ribosome in Saccharomyces cerevisiae2011

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ito,Yu Akamatsu,Akiko Noma,Satoshi Kimura,Yoshiho Ikeuchi,Kenjyo Miyauchi,Yoshikazu Tanaka,Isao Tanaka,Takeo Suzuki,Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      MBSJ2011
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Biochemical characterization of 40S intermediate in the assembly of 50S ribosomal subunit in Escherichia coli2011

    • 著者名/発表者名
      Taiga Arai, Satishi Kimura, Yuriko Sakaguchi, Takeo Suzuki and Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      MBSJ2011
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Crystal structure of dihydrouridine synthase in complex with RNA reveals its tRNA recognition and reaction mechanisms2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshikazu Tanaka, Futao Yu, Keitaro Yamashita, Akiyoshi Nakamura, Takeo Suzuki, Nagisa Hirano, Tsutomu Suzuki, Min Yao, Isao Tanaka
    • 学会等名
      RNA2011Kyoto
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Base Methylations in the Double-stranded RNA by a Fused Methyltransferase Bearing Unwinding Activity2011

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Kimura, Yoshiho Ikeuchi, Kei Kitahara, Yuriko Sakaguchi, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      RNA2011Kyoto
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Necessity of tRNA introns for yeast growth2011

    • 著者名/発表者名
      Shunsuke Mori, Toshiya Endo, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki, Tohru Yoshihisa
    • 学会等名
      RNA2011Kyoto
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] In Vivo Reversal of a UV-induced Lesion on Mouse 28S rRNA2011

    • 著者名/発表者名
      Atsumi Miyata, Makoto Kitabatake, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki, Tomoko Sakata, Yohei Kobayashi, Shin Yonehara, Mutsuhito Ohno
    • 学会等名
      RNA2011Kyoto
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Unique characteristics of ascidian mitochondrial tRNAs: Existence of 5-taurinomethyluridine-containing tRNAs involved in deciphering the non-universal genetic codes and an initiator tRNA corresponding to AUG codon2011

    • 著者名/発表者名
      Takeo Suzuki, Kenjyo Miyauchi, Shin-ichi Yokobori, Naoki Shigi, Akiko Kondow, Nono Takeuchi, Tsutomu Suzuki, Akihiko Yamagishi, Kimitsuna Watanabe
    • 学会等名
      RNA2011Kyoto
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Alternative pathway of tRNA maturation in Saccharomyces cerevisiae

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Ohira, Kenjyo Miyauchi, Yuriko Sakaguchi, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      The 24th tRNA conference
    • 発表場所
      Olmue, Chile
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The acetylation of 18S rRNA is an essential modification to synthesize the small subunit of ribosome in Saccharomyces cerevisiae

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ito, Yu Akamatsu, Akiko Noma, Satoshi Kimura, Yoshiho Ikeuchi, Kenjyo Miyauchi, Yoshikazu Tanaka, Isao Tanaka, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      The 9th International Conference on Ribosome Synthesis
    • 発表場所
      Banff, Canada
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Insights into the functional role of the RlmE-mediated Um2552 formation in the late assembly of 50S subunit in Escherichia coli

    • 著者名/発表者名
      Taiga Arai, Satoshi Kimura, Yuriko Sakaguchi, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
    • 学会等名
      The 9th International Conference on Ribosome Synthesis
    • 発表場所
      Banff, Canada
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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