初経年齢・閉経年齢・月経周期に関するゲノムワイド関連解析

• 研究課題/領域番号: 23710316
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ジェンダー
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 谷川 千津 東京大学, 医科学研究所, 助教 (30422421)
• 連携研究者: 松田 浩一 東京大学, 医科学研究所, 准教授 (90401257)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 科学技術 / 医療 / 生命 / ゲノムワイド関連解析

研究概要

初潮年齢は遺伝因子環境因子の両方に影響を受けるが、日本人における初潮年齢関連遺伝子は明らかとなっていない。我々は15000人の日本人女性の情報を元に、全ゲノム解析関連解析を行い、LIN28B遺伝子上のSNPが初潮年齢と強い関連を示すことを明らかとした。さらに既報のSNPについて検討し、TMEM38Bと初潮年齢の強い関連も確認された。我々の研究成果は、遺伝因子が日本人女性においても初潮年齢に影響をおよぼすことを示したはじめての報告である。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of a functional variant in the MICA promoter whichregulates MICA expression and increases HCV-related hepatocellular carcinoma risk (2013)
  • 著者名/発表者名: P.H. Yi Lo, Y. Urabe, V. Kumar, C. Tanikawa, K. Koike, N. Kato, D. Miki, K. Chayama, M. Kubo, Y. Nakamura, K. Matsuda
  • 雑誌名: PloS one 巻: 8
• [雑誌論文] Impact of four loci on serum tamsulosin hydrochloride concentration (2013)
  • 著者名/発表者名: R. Takata, K. Matsuda, J. Sugimura, W. Obara, T. Fujioka, K. Okihara, N. Takaha, T. Miki, S. Ashida, K. Inoue, C. Tanikawa, T. Shuin, S. Sasaki, Y. Kojima, K. Kohri, M. Kubo, M. Yamaguchi, Y. Ohnishi, Y. Nakamura
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58 ページ: 21-26
  • NAID: 10031145896
• [雑誌論文] A genome-wide association study of HCV-induced liver cirrhosis in the Japanese population identifies novel susceptibility loci at the MHC region (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Urabe, H. Ochi, N. Kato, V. Kumar, A. Takahashi, R. Muroyama, N. Hosono, M. Otsuka, R. Tateishi, P.H. Lo, C. Tanikawa, M. Omata, K. Koike, D. Miki, H. Abe, N.Kamatani, J. Toyota, H. Kumada, M. Kubo, K. Chayama, Y. Nakamura, K. Matsuda
  • 雑誌名: Journal of hepatology 巻: 58 ページ: 875-82
• [雑誌論文] Impact of four loci on serum tamsulosin hydrochloride concentration (2013)
  • 著者名/発表者名: Takata Ryo, Matsuda Koichi, Sugimura Jun, Obara Wataru, Fujioka Tomoaki, Okihara Koji, Takaha Natsuki, Miki Tsuneharu, Ashida Shingo, Inoue Keiji, Tanikawa Chizu, Shuin Taro, Sasaki Shoichi, Kojima Yoshiyuki, Kohri Kenjiro, Kubo Michiaki, Yamaguchi Masao, Ohnishi Yozo, Nakamura Yusuke
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 58 号: 1 ページ: 21-26
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.126
  • NAID: 10031145896
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a Functional Variant in the MICA Promoter Which Regulates MICA Expression and Increases HCV-Related Hepatocellular Carcinoma Risk. (2013)
  • 著者名/発表者名: Lo PH, Urabe Y, Kumar V, Tanikawa C, Koike K, Kato N, Miki D, Chayama K, Kubo M, Nakamura Y, Matsuda K.
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 8 号: 4 ページ: e61279-e61279
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0061279
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide association study of HCV-induced liver cirrhosis in the Japanese populationidentifies novel susceptibility loci at the MHC region (2013)
  • 著者名/発表者名: Otsuka M
  • 雑誌名: J Hepatol 巻: I(n press) 号: 5 ページ: 875-882
  • DOI: 10.1016/j.jhep.2012.12.024
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide association study identifies two susceptibility loci for duodenal ulcer in the Japanese population (2012)
  • 著者名/発表者名: C. Tanikawa, Y. Urabe, K. Matsuo, M. Kubo, A. Takahashi, H. Ito, K. Tajima, N. Kamatani, Y. Nakamura, K. Matsuda
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 44
• [雑誌論文] Soluble MICA and a MICA variation as possible prognostic biomarkers for HBV-induced hepatocellular carcinoma. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kumar V, et. al.
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 7 号: 9 ページ: e44743-e44743
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0044743
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide association study identifies two susceptibility loci for duodenal ulcer in the Japanese population. (2012)
  • 著者名/発表者名: Tanikawa C, Urabe Y, Matsuo K, Kubo M, Takahashi A, Ito H, Tajima K, Kamatani N, Nakamura Y, Matsuda K.
  • 雑誌名: Nat Genet. 巻: 44 号: 4 ページ: 430-434
  • DOI: 10.1038/ng.1109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of histone modification and chromatin structure by the p53-PADI4 pathway (2012)
  • 著者名/発表者名: Tanikawa C, Espinosa M, Suzuki A, Masuda K, Yamamoto K, Tsuchiya E, Ueda K, Daigo Y, Nakamura Y, Matsuda K.
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 3 号: 1 ページ: 676-676
  • DOI: 10.1038/ncomms1676
  • 査読あり
• [雑誌論文] CLCA2 as a p53-inducible senescence mediator (2012)
  • 著者名/発表者名: C.Tanikawa, H.Nakagawa, Y.Furukawa, Y.Nakamura, K.Matsuda
  • 雑誌名: Neoplasia 巻: 14 号: 2 ページ: 141-149
  • DOI: 10.1593/neo.111700
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide association study of nephrolithiasis in the Japanese population identifies novel susceptible Loci at 5q35.3, 7p14.3, and 13q14.1. (2012)
  • 著者名/発表者名: Urabe Y, Tanikawa C, Takahashi A, Okada Y, Morizono T, Tsunoda T, Kamatani N, Kohri K, Chayama K, Kubo M, Nakamura Y, Matsuda K.
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 8 号: 3 ページ: 134-42
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1002541
  • 査読あり
• [雑誌論文] Common variants on 14q32 and 13q12 are associated with DLBCL susceptibility (2011)
  • 著者名/発表者名: V.Kumar, K.Matsuo, A.Takahashi, N.Hosono, T.Tsunoda, N.Kamatani, S.Y.Kong, H.Nakagawa, R.Cui, C.Tanikawa, M.Seto, Y.Morishima, M.Kubo, Y.Nakamura, K.Matsuda
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 56 号: 6 ページ: 436-439
  • DOI: 10.1038/jhg.2011.35
  • NAID: 10030659704
  • 査読あり
• [雑誌論文] Common variant in 6q26-q27 is associated with distal colon cancer in an Asian population (2011)
  • 著者名/発表者名: R.Cui, Y.Okada, S.G.Jang, J.L.Ku, J.G.Park, Y.Kamatani, N.Hosono, T.Tsunoda, V.Kumar, C.Tanikawa, N.Kamatani, R.Yamada, M.Kubo, Y.Nakamura, K.Matsuda
  • 雑誌名: Gut 巻: 60 号: 6 ページ: 799-805
  • DOI: 10.1136/gut.2010.215947
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome wide association study of age at menarche in the Japanese population
  • 著者名/発表者名: C. Tanikawa, Y. Okada, A. Takahashi, K. Oda, N. Kamatani, M. Kubo, Y. Nakamura, K. Matsuda
  • 雑誌名: PloS one 巻: (in press)
• [雑誌論文] Impact of PSCA variation on gastric ulcer susceptibility
  • 著者名/発表者名: C. Tanikawa, K. Matsuo, M. Kubo, A. Takahashi, H. Ito, H. Tanaka, Y. Yatabe, K. Yamao, N. Kamatani, K. Tajima, Y. Nakamura, K. Matsuda
  • 雑誌名: PloS one 巻: (in press)
• [学会発表] A genome-wide association study identifies two susceptibility loci for duodenal ulcer in the Japanese population (2012)
  • 著者名/発表者名: Chizu Tanikawa, Yuji Urabe, Keitaro Matsuo, Hidemi Ito, Kazuo Tajima,Yusuke Nakamura,Koichi Matsuda
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2012-09-19
• [学会発表] p53-PADI4経路によるヒストン修飾およびクロマチン構造の制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: Chizu Tanikawa, Yataro Daigo, Yusuke Nakamura, Koichi Matsuda
  • 学会等名: 日本癌学会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
• [学会発表] Regulation of histone modification and chromatin structure by p53-PADI4 pathway
  • 著者名/発表者名: Chizu Tanikawa, Koichi Matsuda, Yusuke Nakamura
  • 学会等名: 103th AACR Annual Meeting
  • 発表場所: McCormick Place, Chicago, USA
• [学会発表] A genome-wide association study identifies two susceptibility loci for duodenal ulcer in the Japanese population
  • 著者名/発表者名: Chizu Tanikawa, Yuji Urabe, Keitaro Matsuo, Hidemi Ito, Kazuo Tajima,Yusuke Nakamura, Koichi Matsuda
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ホテルロイトン札幌
• [学会発表] The role of histone citrullination through p53/PADI4 network in carcinogenesis.
  • 著者名/発表者名: Chizu Tanikawa, Koichi Matsuda, Yusuke Nakamura
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ホテルロイトン札幌
• [学会発表] The role of histone citrullination through p53/PADI4 network in carcinogenesis.
  • 著者名/発表者名: Chizu Tanikawa, Yusuke Nakamura, Koichi Matsuda
  • 学会等名: 第9回 日米癌合同会議
  • 発表場所: ハイアットリージェンシー、マウイ 米国
• [備考]
  • URL: http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/nakamura/matsuda/index.html
• [備考]
  • URL: http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/nakamura/matsuda/R%20s.html