新規手法による葉緑体タンパク質複合体の網羅的検出

• 研究課題/領域番号: 23770035
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 植物分子生物・生理学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 高林 厚史 北海道大学, 低温科学研究所, 助教 (90546417)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: タンパク質複合体解析 / 光合成生物 / データベース / タンパク質複合体 / 光合成 / プロテオーム

研究概要

タンパク質は単体として機能するだけでなく、タンパク質同士が結合したタンパク質複合体としても機能する。そのため、タンパク質複合体を調べることは、個々のタンパク質の機能を調べるためだけでなく、細胞内機構を調べるためにも重要である。本研究では、新規手法により光合成生物のタンパク質複合体を網羅的に調べ、この手法の有用性を明らかにした。同時に、Webデータベース（PCoM-DB; http://pcomdb.lowtem.hokudai.ac.jp/proteins/top）を構築し、その結果の一部を公開した。今後、PCoM-DBデータベースを通じて本研究の解析データが幅広く利用されることに期待したい。

研究成果

• [雑誌論文] Functional analysis of light-harvesting-like protein 3 (LIL3) and its light-harvesting chlorophyll-binding motif in Arabidopsis (2014)
  • 著者名/発表者名: Takahashi K, Takabayashi A, Tanaka A, and Tanaka R
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 289 ページ: 987-999
  • NAID: 120005418077
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional Analysis of Light-harvesting-like Protein 3(LIL3) and Its Light-harvesting Chlorophyll-binding Motif in Arabidopsis (2014)
  • 著者名/発表者名: Kaori Takahashi, Atsushi Takabayashi, Ayumi Tanaka, Ryouichi Tanaka
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 289 号: 2 ページ: 987-999
  • DOI: 10.1074/jbc.m113.525428
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Evolutionary changes in chlorophyllide a oxygenase (CAO) structure contribute to the acquisition of a new light-harvesting complex in Micromonas (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunugi M, Takabayashi A, and Tanaka A
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 288 ページ: 19330-19341
  • NAID: 120005326743
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein co-migration database (PCoM -DB) for Arabidopsis thylakoids and Synechocystis cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Takabayashi A, Kadoya R, Kuwano M, Kurihara K, Ito H, Tanaka R, Tanaka A
  • 雑誌名: SpringerPlus 巻: 2 ページ: 148-148
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary changes in chlorophyllide a oxygenase (CAO) structure contribute to the acquisition of a new light-harvesting complex in Micromonas (2013)
  • 著者名/発表者名: Motoshi Kunugi, Atsushi Takabayashi, and Ayumi Tanaka
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 288 号: 27 ページ: 19330-19341
  • DOI: 10.1074/jbc.m113.462663
  • NAID: 120005326743
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein co-migration database (PCoM -DB) for Arabidopsis thylakoids and Synechocystis cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Takabayashi, Ryosuke Kadoya, Masayoshi Kuwano, Katsunori Kurihara, Hisashi Ito, Ryouichi Tanaka, Ayumi Tanaka
  • 雑誌名: SpringerPlus 巻: 2(148) 号: 1 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1186/2193-1801-2-148
  • 査読あり
• [雑誌論文] The oligomeric states of photosystems and light-harvesting complexes in the chlorophyll b-less mutant (2011)
  • 著者名/発表者名: Takabayashi A, Kuihara K, Kuwano M, Kasahara Y, Tanaka R, and Tanaka A
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: 52 ページ: 2103-2114
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the 7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase of the chlorophyll cycle in Arabidopsis (2011)
  • 著者名/発表者名: Megoro M, Ito H, Takabayashi A, Tanaka R, and Tanaka A
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: 23 ページ: 3442-3453
  • 査読あり
• [雑誌論文] Allocation of absorbed light energy in PSII to thermal dissipations in the presence or absence of PsbS subunits of Rice (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishida, S, Morita K, Kishine M, Takabayashi A, Murakami R, Takeda S, Shimamoto K, Sato F, and Endo T
  • 雑誌名: Plant & Cell Physiology 巻: 52 ページ: 1822-1831
  • NAID: 10030304785
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Oligomeric States of Photosystems and Light-harvesting Complexes in the Chlorophyll b-less Mutant. (2011)
  • 著者名/発表者名: Takabayashi, A., Kurihara, K., Kuwano, M., Kasahara, Y., Tanaka, R. and Tanaka, A.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 巻: 52(12) 号: 12 ページ: 2103-2114
  • DOI: 10.1093/pcp/pcr138
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the 7-Hydroxymethyl Chlorophyll a Reductase of the Chlorophyll Cycle in Arabidopsis. (2011)
  • 著者名/発表者名: Meguro, M., Ito, H., Takabayashi, A., Tanaka, R. and Tanaka, A.
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: 23(9) 号: 9 ページ: 3442-3453
  • DOI: 10.1105/tpc.111.089714
  • 査読あり
• [雑誌論文] Allocation of absorbed light energy in Photosystem II to thermal dissipations in the presence or absence of PsbS subunits of rice (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishda, 他8名
  • 雑誌名: Plant and Cell Physiology 巻: 52 号: 10 ページ: 1822-1831
  • DOI: 10.1093/pcp/pcr119
  • 査読あり
• [学会発表] 新規手法による葉緑体タンパク質複合体の網羅的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高林厚史、栗原克宜、田中亮一、田中歩
  • 学会等名: 植物生理学会
  • 発表場所: 京都産業大学
  • 年月日: 2012-03-18
• [学会発表] 新規手法による葉緑体タンパク質複合体の網羅的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高林厚史、栗原克宜、田中亮一、田中歩
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 京都産業大学（京都市）
• [学会発表] The application of BN-PAGE for comprehensive detection of the protein complexes in the chloroplast,シンポジウム「Basis, application and future of the blue-native PAGE in plant sciences」 (2011)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Takabayashi
  • 学会等名: 植物生理学会
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2011-03-20
• [備考] PCoM-DB
  • URL: http://pcomdb.lowtem.hokudai.ac.jp/proteins/top
• [備考] PCoM-DB
  • URL: http://pcomdb.lowtem.hokudai.ac.jp/proteins/top
• [備考] 生物適応研究室Webページ
  • URL: http://www.lowtem.hokudai.ac.jp/plantadapt/
• [備考] PCoM-DB
  • URL: http://pcomdb.lowtem.hokudai.ac.jp/proteins/top