深海・地殻環境中に高頻度出現する新奇・未培養真菌群の実態とその生態学的意義の解明

• 研究課題/領域番号: 23770098
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 独立行政法人海洋研究開発機構
• 研究代表者: 長野 由梨子 独立行政法人海洋研究開発機構, 海洋・極限環境生物圏領域, 研究員 (30512917)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2011年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: 真菌類 / 深海 / メタン冷湧水域 / Cryptomycota / 真菌 / メタン冷湧水 / 化学合成生態系 / 地殻 / 極限環境 / 真核微生物

研究概要

本研究では、メタン冷湧水域、深度1万mの海溝域、鯨骨域といった特殊な深海環境から、300株以上に及ぶ真菌の分離に成功した。また、single cell genomicsや次世代シーケンサー等による網羅的な真菌多様性解析により、数多くの新規真菌群が深海環境中に存在する事を明らかにした。中でもメタン冷湧水域の堆積物中から高頻度に検出された原始的な真菌群は、非常に新規性の高いグループである事が示唆された。本研究を通して多くの新規真菌の分離、新規未培養真菌群の検出、深海からのみ分離が報告されている真菌のEST解析に成功し、これまで謎に包まれていた深海環境中の真菌の多様性やその生態について解明が進んだ。

研究成果

• [雑誌論文] Fungal diversity in deep-sea extreme environments (2012)
  • 著者名/発表者名: Nagano, Y. & Nagahama, T.
  • 雑誌名: Fungal Ecology 巻: 5巻 号: 4 ページ: 463-471
  • DOI: 10.1016/j.funeco.2012.01.004
  • 査読あり
• [雑誌論文] Screening and Phylogenetic Analysis of Deep-Sea Bacteria Capable of Metabolizing Lignin-Derived Aromatic Compounds (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Ohta*., S. Nishi, T. Haga, T. Tsubouchi, R. Hasegawa, M. Konishi, Y. Nagano, Y. Tsuruwaka, Y. Shimane, K. Mori, K. Usui, E. Suda, K. Tsutsui, A. Nishimoto, Y. Fujiwara, T. Maruyama, Y. Hatada
  • 雑誌名: Open Journal of Marine Science 巻: 2 号: 04 ページ: 177-187
  • DOI: 10.4236/ojms.2012.24021
  • 査読あり
• [雑誌論文] Unique substrate specificity of a thermostable glycosyl hydrolase from uncultured Anaerolinea, derived from bacterial mat on a subsurface geothermal water stream (2012)
  • 著者名/発表者名: Masaaki KONISHI, Shinro NISHI, Hideto TAKAMI, Yasuhiro SHIMANE, Yuriko NAGANO, Kozue MORI, Yukari OHTA, Yuji HATADA
  • 雑誌名: Biotechnology letters 巻: 34 号: 10 ページ: 1887-1893
  • DOI: 10.1007/s10529-012-0983-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Abdel‐Wahab, M. A. & Miyazaki, M.Molecular evidence that deep‐branching fungi are major fungal components in deep‐sea methane cold‐seep sediments (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagahama, T., Takahashi, E., Nagano,Y.
  • 雑誌名: Environmental Microbiology 巻: 13巻 号: 8 ページ: 2359-2370
  • DOI: 10.1111/j.1462-2920.2011.02507.x
  • 査読あり
• [学会発表] Cryptic fungal diversity in deep-sea environments (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, and Nagahama T
  • 学会等名: AMC2013& 13^<th> IMFMS, China National Convention Center (CNCC)
  • 発表場所: Beijing, China
  • 年月日: 2013-08-21
  • 招待講演
• [学会発表] 深海の未知なる多様性"泳ぐカビ" (2013)
  • 著者名/発表者名: 長野由梨子、長濱統彦
  • 学会等名: 菌学会関東支部年次大会
  • 発表場所: 日本大学、千葉県
  • 年月日: 2013-04-20
  • 招待講演
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea environments (2012)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, Nagahama T, Konishi M, Shimane Y, Mori K, Ohta Y, Hatada Y
  • 学会等名: 13th International Deep-sea Biology Symposium
  • 発表場所: Museum of New Zealand, Wellington, New Zealand(口頭発表)
  • 年月日: 2012-12-05
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea environments (2012)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, Nagahama T, Konishi M, Mori K, Shimane Y, Ohta Y, Hatada Y
  • 学会等名: BMS 2012 Fungal Interactions
  • 発表場所: University of Alicante, Alicante, Spain
  • 年月日: 2012-09-06
  • 招待講演
• [学会発表] 深海極限環境中の真菌多様性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長野由梨子、長濱統彦、小西正朗、森梢、嶋根康広、大田ゆかり、秦田勇二
  • 学会等名: 第52回高圧討論会
  • 発表場所: 沖縄キリスト教学院、沖縄県(ポスター発表)
  • 年月日: 2011-11-09
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea environments (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y
  • 学会等名: Joint Symposium between MBRC (KIOST) & JAMSTEC
  • 発表場所: KIOST, Seoul, Korea
  • 年月日: 2011-10-17
  • 招待講演
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea methane cold-seep ecosystems (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, Takishita K, Nagahama T, Watanabe H, Mori K, Konishi M, Ohta Y and Hatada Y
  • 学会等名: The 3rd World Conference on Marine Biodiversity
  • 発表場所: Aberdeen Exhibition and Conference Centre, Aberdeen, U.K.(ポスター発表)
  • 年月日: 2011-09-28
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea methane cold-seep ecosystems (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, Takishita K, Nagahama T, Watanabe H, Mori K, Tsuruwaka Y, Konishi M, Ohta Y, Hatada Y
  • 学会等名: IUMS 2011
  • 発表場所: Sapporo Convention Center, Sapporo, Japan
  • 年月日: 2011-09-09
  • 招待講演
• [学会発表] 深海・地殻内極限環境における真菌類の多様性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長野由梨子、長濱統彦、秦田勇二
  • 学会等名: 第14回マリンバイオテクノロジー学会
  • 発表場所: グランシップ、静岡県
  • 年月日: 2011-05-28
  • 招待講演
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea methane cold-seep ecosystems (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, Takishita K, Nagahama T, Watanabe H, Mori K, Tsuruwaka Y, Konishi M, Ohta Y, Hatada Y
  • 学会等名: IUMS 2011(招待講演)
  • 発表場所: Sapporo Convention Center, Sapporo, Japan
• [学会発表] 深海・地殻内極限環境における真菌類の多様性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長野由梨子、長濱統彦、秦田勇二
  • 学会等名: 第１４回マリンバイオテクノロジー学会(招待講演)
  • 発表場所: グランシップ、静岡県
• [学会発表] 深海極限環境中の真菌多様性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長野由梨子、長濱統彦、小西正朗、 森梢、 嶋根康広、大田ゆかり、秦田勇二
  • 学会等名: 第５２回高圧討論会
  • 発表場所: 沖縄キリスト教学院、沖縄県
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea methane cold-seep ecosystems (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, Takishita K, Nagahama T, Watanabe H, Mori K, Konishi M, Ohta Y and Hatada Y
  • 学会等名: The 3rd World Conference on Marine Biodiversity
  • 発表場所: Aberdeen Exhibition and Conference Centre, Aberdeen, U.K.
• [学会発表] Cryptic fungal diversity in deep-sea environments.
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, and Nagahama T
  • 学会等名: AMC2013& 13th IMFMS
  • 発表場所: China National Convention Center (CNCC), Beijing, China
  • 招待講演
• [学会発表] 深海の未知なる多様性“泳ぐカビ”
  • 著者名/発表者名: 長野由梨子、長濱統彦
  • 学会等名: 菌学会関東支部年次大会
  • 発表場所: 日本大学、千葉県
  • 招待講演
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea environments
  • 著者名/発表者名: Yuriko Nagano, Takahiko Nagahama, Masaaki Konishi, Kozue Mori, Yasuhiro Shimane, Yukari Ohta, Yuji Hatada
  • 学会等名: BMS Annual Scientific Meeting 2012 Fungal Interactions
  • 発表場所: Alicante, Spain
  • 招待講演
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea environments
  • 著者名/発表者名: Yuriko Nagano
  • 学会等名: 2012 Joint Symposium between MBRC(KIOST) & JAMSTEC
  • 発表場所: KOIST, Seoul, Korea
  • 招待講演
• [学会発表] Fungal diversity in deep-sea environments
  • 著者名/発表者名: Yuriko Nagano, Takahiko Nagahama, Masaaki Konishi, Yasuhiro Shimane, Kozue Mori, Yukari Ohta, Yuji Hatada
  • 学会等名: 13th International Deep-sea Biology Symposium
  • 発表場所: Wellington, New Zealand
• [図書] Cold-adapted yeasts in deep-sea environments. Cold-adapted Yeasts : Biodiversity, Adaptation Strategies and Biotechnological Significance (2014)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, Nagahama T and Fumiyoshi Abe
  • 出版者: Springer
• [図書] Cold-adapted yeasts in deep-sea environmentsCold-adapted Yeasts: Biodiversity, Adaptation Strategies and Biotechnological Significance (2014)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, Nagahama T, Fumiyoshi Abe.
  • 出版者: Springer
• [図書] Cultured and uncultured fungal diversity in deep-sea environments. Biology of marine fungi (2012)
  • 著者名/発表者名: Nagano Y, and Nagahama T
  • 出版者: Springer
• [図書] Cultured and Uncultured Fungal Diversity in Deep-Sea Environments (Chapter 9 in BIOLOGY OF MARINE FUNGI) (2012)
  • 著者名/発表者名: Takahiko Nagahama, Yuriko Nagano
  • 総ページ数: 15
  • 出版者: Springer