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相同組換えに関わる分裂酵母Rad51‐Swi5‐Sfr1複合体の構造生物学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 23770105
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 構造生物化学
研究機関大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構 (2012)
東京大学 (2011)

研究代表者

桑原 直之  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 研究員 (70506253)

研究協力者 佐藤 衛  横浜市立大学, 大学院・生命ナノシステム科学研究科, 教授 (60170784)
池口 満徳  横浜市立大学, 大学院・生命ナノシステム科学研究科, 准教授 (60261955)
岩崎 博史  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (60232659)
清水 敏之  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 教授 (30273858)
研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2011年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワード相同組換え / DNA 修復 / メディエーター / DNA修復
研究概要

本研究では Swi5-Sfr1 複合体に注目し、この複合体および相互作用分子である Rad51 との超分子複合体の構造機能相関解析を行った。 Swi5 と Sfr1 の C 末端側領域の複合体の結晶構造を明らかにし、この複合体が Rad51 の活性化に必須である事を明らかにした。さらに X 線小角散乱解析など複数の解析手法を組み合わせる事で、Swi5-Sfr1 複合体が Rad51 フィラメントの溝に入り込む事で活性化することと、Sfr1 の天然変性領域が活性化に重要である事を明らかにした。本研究により、これら複合体が行う相同組み換えによる鎖交換反応の分子機構モデルを構築できた。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2013 2012 2011

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Structural basis for vitamin D receptor agonism by novel non-secosteroidal ligands2013

    • 著者名/発表者名
      Lisa Asano, Ichiaki Ito, Naoyuki Kuwabara, Tsuyoshi Waku, Junn Yanagisawa, Hiroyuki Miyachi, Toshiyuki Shimizu
    • 雑誌名

      FEBS lettters

      巻: 587 号: 7 ページ: 957-963

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.02.028

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterisation of an intrinsically disordered protein complex of Swi5-Sfr1 by ion mobility mass spectrometry and small-angle X-ray scattering2013

    • 著者名/発表者名
      Saikusa K, Kuwabara N, Kokabu Y, Inoue Y, Sato M, Iwasaki H, Shimizu T, Ikeguchi M, Akashi S
    • 雑誌名

      Analys

      巻: 138 号: 5 ページ: 1441-14499

    • DOI

      10.1039/c2an35878f

    • NAID

      120006557136

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mechanistic insights into the activation of Rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, the Swi5-Sfr1 complex2013

    • 著者名/発表者名
      N.Kuwabara, Y.Murayama, H.Hashimoto, Y.Kokabu, M.Ikeguchi, M.Sato, K.Mayanagi, Y.Tsutsui, H.Iwasaki,and T.Shimizu
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 20 号: 3 ページ: 440-449

    • DOI

      10.1016/j.str.2012.01.005

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs) have multiple binding points2012

    • 著者名/発表者名
      Kuwabara N, Oyama T, Tomioka D, Ohashi M, Yanagisawa J, Shimizu T, Miyachi H.
    • 雑誌名

      J. Med.Chem.

      巻: 55 号: 2 ページ: 893-902

    • DOI

      10.1021/jm2014293

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fission yeast Swi5-Sfr1 protein complex, an activator of Rad51 recombinase, forms an extremely elongated dogleg-shaped structure2011

    • 著者名/発表者名
      Kokabu Y, Murayama Y, Kuwabara N, Oroguchi T, Hashimoto H, Tsutsui Y, Nozaki N, Akashi S, Unzai S, Shimizu T, Iwasaki H, Sato M, Ikeguchi M
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 286 号: 50 ページ: 43569-43576

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.303339

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structural basis of the broad carbohydrates specificity of a fungal galectin from Agrocybe cylindricea2013

    • 著者名/発表者名
      Naoyuki Kuwabara, Dan Hu, Jun Hirabayashi, Ryuichi Kato
    • 学会等名
      物構研サイエンスフェスタ
    • 発表場所
      茨城県
    • 年月日
      2013-03-14
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural basis of the broad carbohydrates specificity of a fungal galectin from Agrocybe cylindricea2013

    • 著者名/発表者名
      Naoyuki Kuwabara, Dan Hu, Jun Hirabayashi, Ryuichi Kato
    • 学会等名
      物構研サイエンスフェスタ
    • 発表場所
      つくば国際会議場エポカル
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for vitamin D receptor agonism by novel nonsecosteroidal ligands2012

    • 著者名/発表者名
      Lisa Asano, Ichiaki Ito, Naoyuki Kuwabara, Junn Yanagisawa, Hiroyuki Miyachi, Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      AsCA 12
    • 発表場所
      オーストラリア アデレード
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Circular and Linear Dichroism analyses of Swi5/Sfr1/Rad51 complex2011

    • 著者名/発表者名
      Naoyuki Kuwabara
    • 学会等名
      New frontier of the research in Rad51 recombinase and its accessory proteins
    • 発表場所
      フランス パリ
    • 年月日
      2011-09-28
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural analysis of Swi5-Sfr1 complex, mediators for homologous recombination2011

    • 著者名/発表者名
      Naoyuki Kuwabara, Hiroshi Hashimoto, Yuichi Kokabu, Mitsunori Ikeguchi, Mamoru Sato, Kouta Mayanagi, Yasuto Murayama, Hiroshi Iwasaki, Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪府
    • 年月日
      2011-06-08
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Circular and Linear Dichroism analyses of Swi5/Sfr1/Rad51 complex2011

    • 著者名/発表者名
      N. Kuwabara
    • 学会等名
      New frontier of the research in Rad51 recombinase and its accessory proteins
    • 発表場所
      フランス、IBPC
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Strucutual analysis of Swi5-Sfr1 complex, mediators for homologous recombination.2011

    • 著者名/発表者名
      N. Kuwabara, H. Hashimoto, Y. Kokabu, M. Ikeguchi, M. Sato, K. Mayanagi, Y. Murayama, H. Iwasaki, T. Shimizu
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科 学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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